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Investigation
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Neumococos
Vigilancia epidemiológica de los serotipos y genotipos que causan enfermedad neumocócica invasiva (ENI) en España. Caracterización molecular de factores de virulencia de neumococo. Identificación y caracterización de proteínas de neumococo candidatas a vacuna. Evaluación de mecanismos de evasión de la respuesta inmune en Streptococcus pneumoniae. Impacto de los biofilms bacterianos en la persistencia del tracto respiratorio. Mecanismos de cronicidad de aislados clínicos de neumococo en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica.
Research projects
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1: Título del proyecto: Desarrollo de enzibióticos para combatir infecciones en pacientes con fibrosis quística provocadas por los patógenos Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus: CF-TREAT
Referencia: CPP2022-009574 / MPY 375/23
Agencia Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. MICINN.
Fecha Inicio: 01/12/2023
Fecha Fin: 30/11/2026
Financiación: 238.938 Euros
Investigadores principales: Roberto Díez Martínez, José E. Yuste Lobo y Pilar García Suárez
2: Título del proyecto: Desarrollo de enzibióticos para combatir infecciones humanas producidas por Enterococcus faecium resistente a vancomicina (ANTI‐VRE).
Proyecto CPP2021-009054 financiado por MICIU/AEI /10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/ PRTR
Investigadores principales: Roberto Díez Martínez, Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech
Periodo: 18/11/2022 - 17/11/2025
Cuantía total: 231.455 €
3: Título del proyecto: Mecanismos de virulencia en patógenos respiratorios.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, Agencia Estatal de Investigación (Convocatoria «Proyectos I+D+I» 2020 - Modalidades «Retos Investigación» y «Generación de Conocimiento»). Referencia: PID2020-119298RB-I00
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Periodo: 01/09/2021 - 30/08/2024
Cuantía total: 121.000 €
4: Título del proyecto: Efectividad de la vacuna antineumocócica conjugada 13-valente frente a la hospitalización por neumonía adquirida en la comunidad en adultos de 60 años o mayores, mediante un estudio de casos y controles modificado. Estudio CIBELES.
Investigadores principales: Jose Yuste Lobo y Ángel Gil de Miguel
Entidad financiadora: PFIZER. Referencia: MVP 249/20
Periodo: 23/02/2021 - 22/02/2025
Cuantía total: 168.000 €
5: Título del proyecto: Evolution of Invasive Pneumococcal Disease in Spain with special focus on the pathogenesis of serotypes 3, 8, 11A, 19A, 22F and 33F. Investigadores principales: Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech.
Entidad financiadora: Merck Sharp & Dohme USA. Referencia: MVP 132/21
Período: 16/06/2021 - 15/12/2023
Cuantía total: 157.448€
6: Título del proyecto: Mecanismos de patogenicidad y protección en bacterias Gram-positivas causantes de enfermedad respiratoria y bacteriemia
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Entidad financiadora: MINECO. Referencia: SAF2017-83388-R
Periodo: 31/12/2017 - 30/06/2021
Cuantía total: 145.200 €
7: Título del proyecto: Characterization of susceptibility to cefditoren investigating penicillin resistant clinical isolates of Streptococcus pneumoniae.
Investigadores: Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech Lucas
Entidad financiadora: Tedec Meiji Farma, S.A. Referencia: MVP 119/20
Periodo: 11/07/2020 – 10-07-2022
Cuantía total: 76.517 €
8: Título del proyecto: Impact of clinical isolates of serotypes 22F and 33F in the epidemiology and pathogenesis of Streptococcus pneumoniae.
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Entidad financiadora: Merck Sharp & Dohme España, S.A. Referencia: MVE 213/18
Periodo: 10/05/2018 - 30/05/2021
Cuantía total: 157.604 €
Publications
Botulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997-2019
Peñuelas M, Guerrero-Vadillo M, Valdezate S, Zamora MJ, Leon-Gomez I, Flores-Cuéllar Á, Carrasco G, Díaz-García O, Varela C. (2022). Botulism in Spain: Epidemiology and Outcomes of Antitoxin Treatment, 1997-2019. Toxins (Basel). 20;15(1):2
PUBMED DOIInvasive Streptococcus pyogenes disease in Spain: a microbiological and epidemiological study covering the period 2007-2019
Villalón P, Sáez-Nieto JA, Rubio-López V, Medina-Pascual MJ, Garrido N, Carrasco G, Pino-Rosa S, Valdezate S. (2021). Invasive Streptococcus pyogenes disease in Spain: a microbiological and epidemiological study covering the period 2007-2019. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2021 Nov;40(11):2295-2303
PUBMED DOIRevisiting the Ancylostoma caninum secretome provides new information on hookworm-host interactions.
Morante T, Shepherd C, Constantinoiu C, Loukas A, Sotillo J. Revisiting the Ancylostoma caninum secretome provides new information on hookworm-host interactions. Proteomics. 2017 Dec;17(23-24).
PUBMED DOIHookworm secreted extracellular vesicles interact with host cells and prevent inducible colitis in mice.
Eichenberger RM, Ryan S, Jones L, Buitrago G, Polster R, Montes de Oca M, Zuvelek J, Giacomin PR, Dent LA, Engwerda CR, Field MA, Sotillo J, Loukas A. Hookworm secreted extracellular vesicles interact with host cells and prevent inducible colitis in mice. Front Immunol. 2018 Apr 30;9:850.
PUBMED DOIHDP2: a ribosomal DNA (NTS-ETS) sequence as a target for species-specific molecular diagnosis of intestinal taeniasis in humans.
Flores MD, Gonzalez LM, Hurtado C, Motta YM, Domínguez-Hidalgo C, Merino FJ, Perteguer MJ, Gárate T. HDP2: a ribosomal DNA (NTS-ETS) sequence as a target for species-specific molecular diagnosis of intestinal taeniasis in humans. Parasit Vectors. 2018 Feb 27;11(1):117. doi: 10.1186/s13071-018-2646-6.
PUBMED DOIAntibody responses to chimeric peptides derived from parasite antigens in mice and other animal species.
Orbegozo-Medina RA, Martínez-Sernández V, Folgueira I, Mezo M, González-Warleta M, Perteguer MJ, Romarís F, Leiro JM, Ubeira FM. Antibody responses to chimeric peptides derived from parasite antigens in mice and other animal species. Mol Immunol. 2018 Dec 17;106:1-11.
PUBMED DOIComparison of T24H-his, GST-T24H and GST-Ts8B2 recombinant antigens in western blot, ELISA and multiplex bead-based assay for diagnosis of neurocysticercosis.
Hernández-González A, Noh J, Perteguer MJ, Gárate T, Handali S. Comparison of T24H-his, GST-T24H and GST-Ts8B2 recombinant antigens in western blot, ELISA and multiplex bead-based assay for diagnosis of neurocysticercosis. Parasit Vectors. 2017 May 15;10(1):237.
PUBMED DOICharacterization of Trichuris muris secreted proteins and extracellular vesicles provides new insights into host-parasite communication.
Eichenberger RM, Talukder MH, Field MA, Wangchuk P, Giacomin P, Loukas A, Sotillo J. Characterization of Trichuris muris secreted proteins and extracellular vesicles provides new insights into host-parasite communication. J Extracell Vesicles. 2018 Jan 21;7(1):1428004.
PUBMED DOIEvaluation of onchocerciasis seroprevalence in Bioko Island (Equatorial Guinea) after years of disease control programmes.
Hernández-González A, Moya L, Perteguer MJ, Herrador Z, Nguema R, Nguema J, Aparicio P, Benito A, Gárate T. Evaluation of onchocerciasis seroprevalence in Bioko Island (Equatorial Guinea) after years of disease control programmes. Parasit Vectors. 2016 Sep 20;9(1):509.
PUBMED DOIChanges in protein expression after treatment with Ancylostoma caninum excretory/secretory products in a mouse model of colitis.
Sotillo J, Ferreira I, Potriquet J, Laha T, Navarro S, Loukas A, Mulvenna J. Changes in protein expression after treatment with Ancylostoma caninum excretory/secretory products in a mouse model of colitis. Sci Rep. 2017 Feb 13;7:41883.
PUBMED DOIFasciola spp: Mapping of the MF6 epitope and antigenic analysis of the MF6p/HDM family of heme-binding proteins.
Martínez-Sernández V, Perteguer MJ, Mezo M, González-Warleta M, Gárate T, Valero MA, Ubeira FM. Fasciola spp: Mapping of the MF6 epitope and antigenic analysis of the MF6p/HDM family of heme-binding proteins. PLoS One. 2017 Nov 21;12(11):e0188520.
PUBMED DOIAn alternative host model of a mixed fungal infection by azole susceptible and resistant Aspergillus spp strains
15. Alcazar-Fuoli L, Buitrago M, Gomez-Lopez A, Mellado E. An alternative host model of a mixed fungal infection by azole susceptible and resistant Aspergillus spp strains. Virulence. 2015;6(4):376-84. doi: 10.1080/21505594.2015.1025192. PMID: 26065322.
PUBMED DOIEffect of pneumococcal conjugate vaccines and SARS-CoV-2 on antimicrobial resistance and the emergence of Streptococcus pneumoniae serotypes with reduced susceptibility in Spain, 2004-20: a national surveillance study
Sempere J, Llamosí M, López Ruiz B, Del Río I, Pérez-García C, Lago D, Gimeno M, Coronel P, González-Camacho F, Domenech M, Yuste J. Effect of pneumococcal conjugate vaccines and SARS-CoV-2 on antimicrobial resistance and the emergence of Streptococcus pneumoniae serotypes with reduced susceptibility in Spain, 2004-20: a national surveillance study. Lancet Microbe. 2022 Oct;3(10):e744-e752.
PUBMED DOISeconeolitsine, the Novel Inhibitor of DNA Topoisomerase I, Protects against Invasive Pneumococcal Disease Caused by Fluoroquinolone-Resistant Strains
Tirado-Vélez JM, Carreño D, Sevillano D, Alou L, Yuste J, de la Campa AG. Seconeolitsine, the Novel Inhibitor of DNA Topoisomerase I, Protects against Invasive Pneumococcal Disease Caused by Fluoroquinolone-Resistant Strains. Antibiotics. 2021 May 13;10(5):573.
PUBMED DOIMinilungs from Human Embryonic Stem Cells to Study the Interaction of Streptococcus pneumoniae with the Respiratory Tract
Sempere J, Rossi SA, Chamorro-Herrero I, González-Camacho F, de Lucas MP, Rojas-Cabañeros JM, Taborda CP, Zaragoza Ó, Yuste J, Zambrano A. Minilungs from Human Embryonic Stem Cells to Study the Interaction of Streptococcus pneumoniae with the Respiratory Tract. Microbiol Spectr. 2022 Jun 29;10(3):e0045322
PUBMED DOIA national longitudinal study evaluating the activity of cefditoren and other antibiotics against non-susceptible Streptococcus pneumoniae strains during the period 2004-20 in Spain
Sempere J, González-Camacho F, Domenech M, Llamosí M, Del Río I, López-Ruiz B, Gimeno M, Coronel P, Yuste J. A national longitudinal study evaluating the activity of cefditoren and other antibiotics against non-susceptible Streptococcus pneumoniae strains during the period 2004-20 in Spain. J Antimicrob Chemother. 2022 Mar 31;77(4):1045-1051.
PUBMED DOINationwide Trends of Invasive Pneumococcal Disease in Spain From 2009 Through 2019 in Children and Adults During the Pneumococcal Conjugate Vaccine Era
de Miguel S, Domenech M, González-Camacho F, Sempere J, Vicioso D, Sanz JC, Comas LG, Ardanuy C, Fenoll A, Yuste J. Nationwide Trends of Invasive Pneumococcal Disease in Spain From 2009 Through 2019 in Children and Adults During the Pneumococcal Conjugate Vaccine Era. Clin Infect Dis. 2021 Dec 6;73(11):e3778-e3787
PUBMED DOIPulmonary BCG induces lung-resident macrophage activation and confers long-term protection against tuberculosis
7. Mata E, Tarancón R, Guerrero C, Moreo E, Moreau F, Uranga S, Gomez AB, Marinova D, Domenech M, Gonzalez-Camacho F, Monzon M, Badiola J, Dominguez-Andres J, Yuste J, Anel A, Peixoto A, Martin C, Aguilo N. Pulmonary BCG induces lung-resident macrophage activation and confers long-term protection against tuberculosis. Sci Immunol. 2021 Sep 24;6(63):eabc2934
PUBMED DOIContent with Investigacion .
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Aída Úbeda Trillo
Técnico de Laboratorio
Técnico superior en laboratorio de diagnóstico clínico en 2019. Lleva vinculada a la Unidad de Neumococos desde 2023 como técnico de laboratorio contratada. Anteriormente estuvo contratada en el Servicio de Microbiología y Urgencias del Hospital Infanta Sofía de Madrid.
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José Enrique Yuste Lobo
Científico Titular
ORCID code: 0000-0001-7996-0837
Licenciado en Farmacia en 1998 y Doctor en 2002 por la Universidad Complutense de Madrid. Realizó su tesis doctoral en el laboratorio de neumococos del Centro Nacional de Microbiología del ISCIII. Posteriormente trabajó durante 5 años en Londres, primero como Investigador Asociado en el Centre for Molecular Microbiology and Infection Biology de Imperial College hasta 2003 y luego en el Centre for Respiratory Research de University College hasta 2007. Tras esta etapa posdoctoral en Reino Unido, trabajó durante 3 años como Investigador Senior en el Centro de Investigaciones Biológicas del CSIC hasta 2010. Desde entonces trabaja como Científico Titular en la Unidad de Neumococos del CNM-ISCIII, siendo el responsable científico del laboratorio desde el año 2016. Es investigador principal del grupo CIBER de Enfermedades Respiratorias (CIBERES) CB06/06/0003 (https://www.ciberes.org/grupos/grupo-de-investigacion?id=18143)
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Mirian Domenech Luchas
Investigadora posdoctoral
ORCID code: 0000-0002-0942-8180
Licenciada en Ciencias Biológicas en 2005 y Doctora en 2012 por la Universidad Complutense de Madrid. Realizó su tesis doctoral en el Centro de Investigaciones Biológicas del CSIC bajo la dirección del Profesor Ernesto García y la Dra. Miriam Moscoso caracterizando el biofilm neumocócico y estudiando distintos antimicrobianos para prevenir y tratar las infecciones producidas por neumococo y otros patógenos. Posteriormente ha trabajado como investigadora junior para el CIBER de Enfermedades Respiratorias y para la empresa Investigación y Proyectos Microbiológicos realizando estudios sobre biofilms de patógenos respiratorios. A finales del 2018 se incorporó a la Unidad de Neumococos del Centro Nacional Microbiología del ISCIII, donde participa en las distintas labores de investigación y referencia de la Unidad y es profesora ayudante Doctor de la Facultad de Biología de la Universidad Complutense de Madrid.
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Julio Sempere García
Investigador Posdoctoral
ORCID code: 0000-0001-9340-6867
Graduado en Bioquímica por la Universidad Complutense de Madrid, donde posteriormente cursó estudios de Máster en Microbiología y Parasitología. Actualmente realiza el programa de doctorado en Microbiología y Parasitología. Lleva asociado a la Unidad de Neumococos desde 2017, donde realizó las prácticas extracurriculares de grado y posteriormente realizó su trabajo de fin de grado (2018) y trabajo de fin de máster (2019). En 2022 obtuvo el grado de Doctor y actualmente investiga biofilms de bacterias Gram positivas, la matriz de estos y cómo interaccionan con el sistema inmune. También trabaja en la interacción de diferentes cápsulas de Streptococcus pneumoniae con el sistema inmune y patogénesis de serotipos emergentes incluidos en las futuras vacunas antineumocócicas.
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Covadonga Pérez García
Contratada predoctoral FPU
ORCID code: 0000-0002-5295-6480
Graduada en Biología por la Universidad Complutense de Madrid, donde posteriormente cursó estudios de Máster en Microbiología y Parasitología. Lleva vinculada a la Unidad de Neumococos desde 2019, donde realizó las prácticas extracurriculares de grado y posteriormente realizó su trabajo de fin de grado (2020) y trabajo de fin de máster (2021). En 2022 obtuvo beca predoctoral del programa FPU y actualmente investiga mecanismos de patogenicidad y protección de serotipos emergentes de neumococo.
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Erick Joan Vidal Alcántara
Ayudante de Investigación
ORCID code: 0000-0001-8946-3754
Graduado en Biología por la Universidad Complutense de Madrid, y posteriormente cursó estudios de Máster en Microbiología aplicada a salud pública e investigación en enfermedades infecciosas por la Universidad de Alcalá de Henares. Lleva vinculado a la Unidad de Neumococos desde 2022 como ayudante de investigación y es personal de plantilla.
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Inés Pareja Cerbán
Estudiante predoctoral CIBERES
ORCID code: 0009-0006-8015-7367
Graduada en Bioquímica por la Universidad de Málaga. Es contratada predoctoral del CIBER de Enfermedades Respiratorias (CIBERES) y en nuestro grupo está realizando su Tesis Doctoral en la caracterización de factores de virulencia de aislados prevalentes así como en el estudio y caracterización de nuevos antimicrobianos frente a bacterias respiratorias.
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Mirella Llamosí Fornés
Contratada predoctoral
ORCID code: 0000-0002-4369-9558
Graduada en Biología por la Universidad Complutense de Madrid, donde posteriormente cursó estudios de Máster en Microbiología y Parasitología. Está realizando su Tesis Doctoral en el campo de la resistencia antibiótica así como en la búsqueda y caracterización de nuevos antimicrobianos con especial interés en lograr compuestos activos frente a infecciones producidas por biofilms.
List of staff
Additional Information
Participation in research networks
Network Biomedical Research Center in Infectious Diseases
Participation: Member of the research team (Víctor Sánchez Merino); Coordinator of the "Preventive Vaccines against HIV-1" working group, HIV Program (Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 2023 - Present
Code: CIBERINFEC, group CB21/13/00015
AIDS Research Network
Participation: Member of the research team (Víctor Sánchez Merino); Head of the bNAbs Detection and Characterization Working Group, Vaccine Program (Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 01/01/2017-12/31/2021
Code: RETICS; RD16CIII/0002/0001
AIDS Research Network
Participation: Member of the research team (Víctor Sánchez Merino); Head of the Vaccine Development Working Group, Immunopathogenesis Program (Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 01/01/2013-12/31/2017
Code: RETICS; RD12/0017
AIDS Research Network
Participation: Members of the research team (Víctor Sánchez Merino and Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 04/04/2008-12/31/2013
Code: RETICS; RD12/0017
Supervised doctoral theses
Development of immunogens and vaccination strategies to optimize the induction of broad-spectrum neutralizing antibodies against HIV-1. Student: Carolina Beltrán Pávez. Thesis co-director: Víctor Sánchez Merino; Eloísa Yuste Herranz. Implementation entity: IDIBAPS / ISCIII / Universitat de Barcelona. Defense date: 11/26/2018. Grade obtained: Excellent Cum Laude
Characterization of the neutralizing response of patients with recent HIV-1 infection and isolation of antibodies. Student: Amanda Fabra García. Thesis co-director: Víctor Sánchez Merino; Eloísa Yuste Herranz. Implementation entity: IDIBAPS / Universitat de Barcelona. Defense date: 07/20/2017. Grade obtained: Excellent Cum Laude
Broadly neutralizing antibody responses against HIV-1: Characterization and design of new immunogens. Student: Carolina Barbosa Ferreira. Thesis co-director: Víctor Sánchez Merino; Eloísa Yuste Herranz. Implementation entity: IDIBAPS / Universitat de Barcelona. Defense date: 02/25/2013. Qualification obtained: Excellent Cum Laude (European Doctorate)
Participation in research networks
Network Biomedical Research Center in Infectious Diseases
Participation: Member of the research team (Víctor Sánchez Merino); Coordinator of the "Preventive Vaccines against HIV-1" working group, HIV Program (Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 2023 - Present
Code: CIBERINFEC, group CB21/13/00015
AIDS Research Network
Participation: Member of the research team (Víctor Sánchez Merino); Head of the bNAbs Detection and Characterization Working Group, Vaccine Program (Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 01/01/2017-12/31/2021
Code: RETICS; RD16CIII/0002/0001
AIDS Research Network
Participation: Member of the research team (Víctor Sánchez Merino); Head of the Vaccine Development Working Group, Immunopathogenesis Program (Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 01/01/2013-12/31/2017
Code: RETICS; RD12/0017
AIDS Research Network
Participation: Members of the research team (Víctor Sánchez Merino and Eloísa Yuste Herranz)
Funding agency: ISCIII
Duration: 04/04/2008-12/31/2013
Code: RETICS; RD12/0017
Supervised doctoral theses
Development of immunogens and vaccination strategies to optimize the induction of broad-spectrum neutralizing antibodies against HIV-1. Student: Carolina Beltrán Pávez. Thesis co-director: Víctor Sánchez Merino; Eloísa Yuste Herranz. Implementation entity: IDIBAPS / ISCIII / Universitat de Barcelona. Defense date: 11/26/2018. Grade obtained: Excellent Cum Laude
Characterization of the neutralizing response of patients with recent HIV-1 infection and isolation of antibodies. Student: Amanda Fabra García. Thesis co-director: Víctor Sánchez Merino; Eloísa Yuste Herranz. Implementation entity: IDIBAPS / Universitat de Barcelona. Defense date: 07/20/2017. Grade obtained: Excellent Cum Laude
Broadly neutralizing antibody responses against HIV-1: Characterization and design of new immunogens. Student: Carolina Barbosa Ferreira. Thesis co-director: Víctor Sánchez Merino; Eloísa Yuste Herranz. Implementation entity: IDIBAPS / Universitat de Barcelona. Defense date: 02/25/2013. Qualification obtained: Excellent Cum Laude (European Doctorate)