We protect your health through science

Investigation

Immune Pathogenesis and Viral Reservoir

Research Lines

Content with Investigacion Patogenia Inmune y Reservorio Viral .

​​​Líneas de investigación prioritariaslogo2.jpg

1.    Estudio de los procesos de latencia y reactivación del VIH-1: principales mecanismos homeostáticos responsables de la latencia proviral y la generación de los reservorios virales que imposibilitan la erradicación de la enfermedad.
2.    Estudio de dianas terapéuticas para impedir la replicación viral activa durante la infección aguda o primaria y para interferir con la renovación del reservorio viral: análisis de fármacos inhibidores de las kinasas de linfocitos PKC o kinasas de la familia Src como p56Lck.
3.    Análisis de los mecanismos de transactivación responsables de la replicación viral activa en linfocitos T CD4+: mecanismos virales implicados en reactivación del provirus.
4.    Estudio de mecanismos que impidan la infección y replicación viral eficaz en células del reservorio viral secundario como son los monocitos/macrófagos.
5.    Análisis de la resistencia a la infección por VIH-1 en linfocitos T CD4+ aislados de pacientes con distrofia muscular de cintura escapulohumeral/pélvica 1F (LGMD1F), que portan un defecto en el gen de la transportina-3 (tnpo3).
6.    Estudio de la sinergia NF-B/Tat para la identificación de nuevas dianas terapéuticas.
7.    Estudio de cambios de expresión en el transcriptoma y modificaciones postraduccionales en el proteoma de linfocitos T CD4+ que expresan Tat intracelular y su impacto sobre la estructura del citoesqueleto celular: mecanismo potencial de supervivencia de los reservorios virales.
8.    Análisis de los mecanismos de degradación de p65/RelA (NF-B) y su importancia en la infección por VIH-1.

9.    Estudio de las modificaciones en el metabolismo del RNA inducidas por la expresión intracelular de Tat y su papel en los mecanismos de supervivencia celular y aumento de la replicación viral.

 

Otras líneas de investigación

1.    Estudio de la respuesta humoral y celular desarrollada en pacientes con Long COVID o COVID persistente.
2.    Análisis de biomarcadores predictivos de gravedad en pacientes con distintas presentaciones de COVID-19.
3.    Estudio de la respuesta inmune frente a la infección natural por SARS-CoV-2 o por la vacunación frente al COVID-19 desarrollada por pacientes con enfermedades oncohematológicas en estado de inmunodeficiencia.
4.    Definición de biomarcadores predictivos de recaída en pacientes con leucemia mieloide crónica que hayan interrumpido el tratamiento con inhibidores de tirosina kinasas.

Research projects

Content with Investigacion Patogenia Inmune y Reservorio Viral .

​1. Título del proyecto: Estudio del efecto de la inmunoterapia y el tratamiento antirretroviral a largo plazo sobre la evolución del reservorio del VIH durante la infección crónica: Búsqueda de nuevas estrategias para una cura funcional.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Plan Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación 2021-2023.
Financiación: 275.000€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/09/2023 – 31/08/2027
Expediente contrato/proyecto: PID2022-141317OB-I00 (MPY 345/23)

logo proyecto 1.jpg
 
2. Título del proyecto: Estudio longitudinal de la evolución de parámetros inmunológicos en personas con COVID persistente: definición de biomarcadores de persistencia.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Acción Estratégica en Salud Intramural.
Financiación: 92.000€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/01/2023 – 31/12/2025
Expediente contrato/proyecto: PI22CIII/00059 (MPY 354/22)

3. Título del proyecto: Nuevas estrategias terapéuticas basadas en inhibidores de tirosina kinasas para la eliminación del reservorio latente del VIH-1.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, Convocatoria del Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad.
Financiación: 157.300€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/06/2020 – 31/05/2023
Contratación de personal: 1 licenciado en prácticas (2 años)
Expediente contrato/proyecto: PID2019-110275RB-I00 (MPY 274/20)
 logo proyecto 3.jpg

4. Título del proyecto: Identification of predictive biomarkers associated with immune responses against SARS-CoV-2 (Work Package 4, dentro de la Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora frente a la pandemia por SARS-CoV2 en España).
Investigadoras principales: María Teresa Coiras López (Investigadora principal Work package 4); Inmaculada Casas Flecha (coordinadora proyecto general).
Agencia financiadora: FONDO–COVID19, en el marco del Real Decreto-ley 8/2020, de 17 de marzo, de medidas urgentes extraordinarias para hacer frente al impacto económico y social de la enfermedad COVID-19
Financiación: 23.000€ (WP4); 325.909€ (proyecto general)
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/03/2020 – 01/11/2021
Contratación de personal: 1 licenciado por obra y servicio (6 meses)
Expediente contrato/proyecto: COV20_00679 (MPY 222/20)

5. Título del proyecto: Identification of predictive biomarkers associated with immune responses against SARS-CoV-2 (Work Package 4, dentro de la Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora frente a la pandemia por SARS-CoV2 en España).
Investigadoras principales: María Teresa Coiras López (Investigadora principal Work package 4); Inmaculada Casas Flecha (coordinadora proyecto general).
Agencia financiadora: CHIESI ESPAÑA, S.A.U.
Financiación: 50.000€ (donación específica al WP4, aceptada por el ISCIII el 09/07/2020)
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 09/07/20 – 01/11/2021
Expediente contrato/proyecto: COV20_00679 (MPY 222/20)

6. Título del proyecto: Tyrosine Kinase inhibition: The New Front in HIV Cure Efforts
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: NIH Research Project Grant Program (R01).
Financiación: 598.181,47€
Entidades participantes: ISCIII/Universidad de Utah
Duración: 31/10/2018 - 31/10/2024
Contratación de personal: 1 contrato de doctor por la Ley de la Ciencia (4,5 años); 1 contrato de licenciado por obra y servicio (3 años)
Expediente contrato/proyecto: R01-AI143567 (MPY 230/19)

7. Título del proyecto: Estudio de compuestos inhibidores de tirosina kinasas para impedir la formación del reservorio latente del VIH-1 en linfocitos T CD4+
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Convocatoria del Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad.
Financiación: 157.300€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/12/2016 - 31/12/2019
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (2,5 años)
Expediente contrato/proyecto: SAF2016-78480-R (MPY 1361/16)
 logo proyecto 7.jpg


8. Título del proyecto: PKC theta y Lck como potenciales dianas terapéuticas para la disminución del reservorio viral durante la infección aguda por VIH-1 en linfocitos T CD4.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Convocatoria del Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad.
Financiación: 163.350€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/01/2014 - hasta: 30/09/2017
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (2 años)
Expediente contrato/proyecto: SAF2013-44677-R (MPY 1250/14)
 logo proyecto 7.jpg

9. Título del proyecto: Dasatinib preserves the activity of the antiviral factor SAMHD1 in human CD4+ T cells: potential use for the control of HIV-1 replication in patients with acute (primary) infection and prevention of the establishment of viral reservoirs.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Bristol-Myers Squibb (BMS). Non-Clinical Research Proposal
Financiación: 74.000€
Entidades participantes: ISCIII, BMS
Duración: 01-01-14 - 31-12-14
Expediente contrato/proyecto: AI471-041

10. Título del proyecto: Análisis de fármacos inhibidores selectivos de la protein kinasa C (PKC) theta para el bloqueo de la replicación del VIH durante la infección primaria.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: ISCIII
Financiación: 63.104€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/12/2012 - hasta: 30/09/2015
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (2 años)
Expediente contrato/proyecto: MPY 1371/12

11. Título del proyecto: Análisis de fármacos inhibidores selectivos de la protein kinasa C (PKC) theta para el bloqueo de la replicación del VIH durante la infección primaria.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Sanidad, Servicios Sociales e Igualdad.
Financiación: 51.510€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/03/2012 - hasta: 01/10/2013
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (1 año)
Expediente contrato/proyecto: EC11-285 (MPY 1046/12)

12. Título del proyecto: Papel de PKC theta en la infección por VIH-1 y búsqueda de nuevas dianas terapéuticas.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Fundación para la Investigación y Prevención del SIDA en España (FIPSE), convocatoria XI. Premio FIPSE como joven investigadora del año, (30/05/11)
Financiación: 129.746€
Entidades participantes: ISCIII/Universidad Rey Juan Carlos (URJC)
Duración: 15/01/2011 - 15/07/2014
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (3 años)
Expediente contrato/proyecto: 360924/10 (MPY 1044/11)

13. Título del proyecto: Análisis de las modificaciones postraduccionales inducidas por la expresión intracelular de la proteina Tat del VIH-1 en linfocitos T y efecto sobre el metabolismo del RNA.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, convocatoria 2010.
Financiación: 67.760€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/12/2010 - 31/12/2013
Expediente contrato/proyecto: SAF2010-18388 (MPY 1401/10)

14. Título del proyecto: Papel de PKC theta en la infección por VIH-1 y búsqueda de nuevas dianas terapéuticas
Investigadoras principales: María Teresa Coiras López (ISCIII); Gema Díaz Gil (URJC)
Agencia financiadora: CAM-URJC (Programa de creación y consolidación de grupos de investigación cofinanciada por la Universidad Rey Juan Carlos y la Comunidad de Madrid, convocatoria 2009)
Financiación: 18.900€
Entidades participantes: ISCIII y URJC
Duración: 01/01/2011 - 31/12/2011
Expediente contrato/proyecto: CCG10-URJC/SAL-5020.

15. Título del proyecto: Estudio de la degradación de p65/RelA en linfocitos T humanos.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Fundación para la Investigación y Prevención del SIDA en España (FIPSE), convocatoria VIII.
Financiación: 36.139€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/01/2008 – 01/01/2011
Expediente contrato/proyecto: 36633/07 (MPY 1471/07)

Publications

Sort
Category

Systematic analysis of intracellular trafficking motifs located within the cytoplasmic domain of simian immunodeficiency virus glycoprotein gp41

Postler TS, Bixby JG, Desrosiers RC, Yuste E; PLoS One. 2014 Dec 5;9(12):e114753

PUBMED DOI

Evolution of broadly cross-reactive HIV-1-neutralizing activity: therapy-associated decline, positive association with detectable viremia, and partial restoration of B-cell subpopulations

Ferreira CB, Merino-Mansilla A, Llano A, Perez I, Crespo I, Llinas L, Garcia F, Gatell JM, Yuste E, Sanchez-Merino V; J Virol. 2013 Nov;87(22):12227-36

PUBMED DOI

Human immunodeficiency virus type 1 and related primate lentiviruses engage clathrin through Gag-Pol or Gag

Popov S, Strack B, Sanchez-Merino V, Popova E, Rosin H, Gottlinger HG; J Virol. 2011 Apr;85(8):3792-801

PUBMED DOI

Definition of the viral targets of protective HIV-1-specific T cell responses

Mothe B, Llano A, Ibarrondo J, Daniels M, Miranda C, Zamarreno J, Bach V, Zuniga R, Perez-Alvarez S, Berger CT, Puertas MC, Martinez-Picado J, Rolland M, Farfan M, Szinger JJ, Hildebrand WH, Yang OO, Sanchez-Merino V, Brumme CJ, Brumme ZL, Heckerman D, Allen TM, Mullins JI, Gomez G, Goulder PJ, Walker BD, Gatell JM, Clotet B, Korber BT, Sanchez J, Brander C; J Transl Med. 2011 Dec 7;9:208

PUBMED DOI

Broadly cross-neutralizing antibodies in HIV-1 patients with undetectable viremia

Medina-Ramirez M, Sanchez-Merino V, Sanchez-Palomino S, Merino-Mansilla A, Ferreira CB, Perez I, Gonzalez N, Alvarez A, Alcocer-Gonzalez JM, Garcia F, Gatell JM, Alcami J, Yuste E; J Virol. 2011 Jun;85(12):5804-13.

PUBMED DOI

Vector-mediated gene transfer engenders long-lived neutralizing activity and protection against SIV infection in monkeys

Johnson PR, Schnepp BC, Zhang J, Connell MJ, Greene SM, Yuste E, Desrosiers RC, Clark KR; Nat Med. 2009 Aug;15(8):901-6

PUBMED DOI

Identification and characterization of HIV-1 CD8+ T cell escape variants with impaired fitness

Sanchez-Merino V, Farrow MA, Brewster F, Somasundaran M, Luzuriaga K; J Infect Dis. 2008 Jan 15;197(2):300-8

PUBMED DOI

Glycosylation of gp41 of simian immunodeficiency virus shields epitopes that can be targets for neutralizing antibodies

Yuste E, Bixby J, Lifson J, Sato S, Johnson W, Desrosiers R*. 2008. J Virol 82:12472-86.

PUBMED DOI

Simian immunodeficiency virus engrafted with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)-specific epitopes: replication, neutralization, and survey of HIV-1-positive plasma

Yuste E, Sanford HB, Carmody J, Bixby J, Little S, Zwick MB, Greenough T, Burton DR, Richman DD, Desrosiers RC, Johnson WE*. 2006. J Virol 80:3030-41.

PUBMED DOI

Balancing selection and the evolution of functional polymorphism in Old World monkey TRIM5alpha

Newman RM, Hall L, Connole M, Chen GL, Sato S, Yuste E, Diehl W, Hunter E, Kaur A, Miller GM, Johnson WE; Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Dec 12;103(50):19134-9

PUBMED DOI

Virion envelope content, infectivity, and neutralization sensitivity of simian immunodeficiency virus

Yuste E, Johnson W, Pavlakis GN, Desrosiers RC; J Virol. 2005 Oct;79(19):12455-63.

PUBMED DOI

HIV-1-specific CD8+ T cell responses and viral evolution in women and infants

Sanchez-Merino V, Nie S, Luzuriaga K*. 2005. J Immunol 175:6976-86.

PUBMED DOI

Modulation of Env content in virions of simian immunodeficiency virus: correlation with cell surface expression and virion infectivity

Yuste E, Reeves JD, Doms RW, Desrosiers RC*. 2004. J Virol 78:6775-85.

PUBMED DOI

The Association of HIV-1 Neutralization in Aviremic Children and Adults with Time to ART Initiation and CD4+/CD8+ Ratios

Sanchez-Merino V, Martin-Serrano M, Beltran M, Lazaro-Martin B, Cervantes E, Oltra M, Sainz T, Garcia F, Navarro ML, Yuste E; Vaccines (Basel). 2023 Dec 20;12(1):8;

PUBMED DOI

High-Resolution Melting Assay to Detect the Mutations That Cause the Y132F and G458S Substitutions at the ERG11 Gene Involved in Azole Resistance in Candida parapsilosis

Nuria Trevijano-Contador, Elena López-Peralta, Jorge López-López, Alejandra Roldán, Cristina de Armentia, Óscar Zaragoza. Mycoses 2024 Nov;67(11):e13811

PUBMED DOI

Broad Protection against Invasive Fungal Disease from a Nanobody Targeting the Active Site of Fungal β-1,3-Glucanosyltransferases

Redrado-Hernández S, Macías-León J, Castro-López J, Belén Sanz A, Dolader E, Arias M, González-Ramírez AM, Sánchez-Navarro D, Petryk Y, Farkaš V, Vincke C, Muyldermans S, García-Barbazán I, Del Agua C, Zaragoza O, Arroyo J, Pardo J, Gálvez EM, Hurtado-Guerrero R. Angew Chem Int Ed Engl. 2024 Aug 19;63(34):e202405823.

PUBMED DOI

Toward the consensus of definitions for the phenomena of antifungal tolerance and persistence in filamentous fungi.

Amich J, Bromley M, Goldman GH, Valero C. mBio. 2025 Feb 25:e0347524

PUBMED DOI

Fungal burden assessment in hospital zones with different protection degrees

García-Gutiérrez L, Baena Rojas B, Ruiz M, Hernández Egido S, Ruiz-Gaitán AC, Laiz L, Pemán J, Cuétara-García MS, Mellado E & Martin-Sanchez PM. Build Environ, Volume 269, 1 February 2025, 112454

DOI

Distribution of Aspergillus Species and Prevalence of Azole Resistance in clinical and environmental Samples from a Spanish Hospital during a three-year study period

Lucio J, Alcazar-Fuoli L, Gil H, Cano-Pascual S, Hernandez-Egido S, Cuetara MS and Mellado E. Mycoses. 2024 Apr;67(4):e13719.

PUBMED DOI

Importance of the Aspergillus fumigatus mismatch repair protein Msh6 in antifungal resistance development

Lucio J, Gonzalez-Jimenez I, Roldan A, Amich J, Alcazar-Fuoli L and Mellado E. J Fungi (Basel). 2024 Mar 12;10(3):210

PUBMED DOI

List of staff

Additional Information

Contact Information

María Teresa Coiras

918223782
mcoiras@isciii.es

generic email: pirv.isciii@gmail.com

 

Scientific Societies

 

•    Spanis Society for Infectious Diseases and Clinical Microbiology (SEIMC).
•    AIDS Study Group (GeSIDA) of SEIMC.
•    PIRV is member of the Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC, group CB21/13/00015).

 

Other links

 

You can follow the activity of our group in Twitter (X), Instagram and Linkedin.

 

Collaboration in other projects

Project Title: Rectal microbiota as a factor associated with vulnerability to repeated sexually transmitted infections.  Microsex Studio
Principal investigators: Vicente Estrada Pérez (San Carlos Clinical Hospital)
Financing agency: Strategic Action in Health (AES) 2023
Participating entities: San Carlos Clinical Hospital, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026. Contract/project file: PI23/01545

Project title: Prospective, observational, longitudinal, multicenter study to evaluate clinical efficacy, safety and immunogenicity developed in individuals with Philadelphia-negative Chronic Myeloproliferative Neoplasms treated with JAK inhibitors after receiving full vaccination with Adjuvanted Herpes Zoster Subunit vaccine (Shingrix)
Principal investigators: Valentín García Gutiérrez (Hospital Univ Ramón y Cajal)
Funding agency: GSK Glaxo Smithkline
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024 – 12/31/2024

Project title: Infection in Solid Organ Transplant recipients: correlation with immune function. Identification of predictive biomarkers and feasibility evaluation with CD45RAneg cell therapy
Principal investigators: Alejandro Luna de Abia, Jesús Fortún (Univ Ramón y Cajal Hospital)
Financing agency: Strategic Health Action (AES) 2023
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026
Contract/project file: PI23/01924

Project title: Evaluation of the levels of the System associated with BLyS in patients with post-infectious syndromes and dysautonomic alterations of the heart rhythm
Principal researcher: Pablo Guisado
Funding agency: Spanish Society of Internal Medicine SEMI.
Participating entities: ISCIII, Quironsalud Research Institute for Research and Innovation
Duration 2023-2025

Project title: HIV Open Science (dissemination project)
Principal researcher: Eva Poveda
Financing agency: Spanish Foundation for Science and Technology (FECYT), Call for aid for the Promotion of Scientific, Technological and Innovation Culture.
Participating entities: ISCIII, Fundación Biomédica Galicia Sur, IrsiCaixa, Hospital Vall d’Hebron, Hospital de la Princesa, Fundación Imagina Más, Institute of Biomedicine of Seville (IBIS), Case Western Reserve University (Cleveland, Ohio)
Duration 2023-2024
Contract/project file: 17715

Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV (Annual renewal).
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2023 – 04/01/2024
Contract/project file: 1,013,006

Project title: Clinical and microbiological impact of the monkeypox virus outbreak in patients in Spain (2022): multicenter project MONKPOX-ESP22, Work package 4, virological research.
Principal researcher: Anabel Negredo (WP4 coordinator); Maria Paz Sánchez Seco (general coordinator)
Financing agency: CIBERINFEC/CIBERESP ISCIII Strategic Action.
Participating entities: ISCIII
Duration July 2022 - May 2023
Contract/project file: MONKPOX-ESP22

Project title: Biomarkers and underlying immunopathological mechanisms of post COVID-19 condition.
Principal investigator: Gemma Moncunill Piñas (IP); Marta Massanella (coIP); María Teresa Coiras López (co-PI)
Financing agency: CIBERINFEC Strategic Action.
Participating entities: ISCIII, IS-Global, IrsiCaixa
Duration 07/28/2022-07/29/2024
Contract/project file: IM22/INF/5

Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV.
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2022 – 04/01/2023
Contract/project file: 1,013,006

Project title: Characterization of the immune response developed after vaccination with COVID-19 in patients with hematological malignancies.
Principal researcher: Valentín García Gutiérrez
Funding agency: Ministry of Science and Innovation, PI21 - Health research projects (AES 2021). Health research project modality.
Participating entities: ISCIII, Ramón y Cajal University Hospital
Duration 01/01/2022 – 12/31/2024
Contract/project file: PI21_00877

Contact Information

María Teresa Coiras

918223782
mcoiras@isciii.es

generic email: pirv.isciii@gmail.com

 

Scientific Societies

 

•    Spanis Society for Infectious Diseases and Clinical Microbiology (SEIMC).
•    AIDS Study Group (GeSIDA) of SEIMC.
•    PIRV is member of the Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC, group CB21/13/00015).

 

Other links

 

You can follow the activity of our group in Twitter (X), Instagram and Linkedin.

 

Collaboration in other projects

Project Title: Rectal microbiota as a factor associated with vulnerability to repeated sexually transmitted infections.  Microsex Studio
Principal investigators: Vicente Estrada Pérez (San Carlos Clinical Hospital)
Financing agency: Strategic Action in Health (AES) 2023
Participating entities: San Carlos Clinical Hospital, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026. Contract/project file: PI23/01545

Project title: Prospective, observational, longitudinal, multicenter study to evaluate clinical efficacy, safety and immunogenicity developed in individuals with Philadelphia-negative Chronic Myeloproliferative Neoplasms treated with JAK inhibitors after receiving full vaccination with Adjuvanted Herpes Zoster Subunit vaccine (Shingrix)
Principal investigators: Valentín García Gutiérrez (Hospital Univ Ramón y Cajal)
Funding agency: GSK Glaxo Smithkline
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024 – 12/31/2024

Project title: Infection in Solid Organ Transplant recipients: correlation with immune function. Identification of predictive biomarkers and feasibility evaluation with CD45RAneg cell therapy
Principal investigators: Alejandro Luna de Abia, Jesús Fortún (Univ Ramón y Cajal Hospital)
Financing agency: Strategic Health Action (AES) 2023
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026
Contract/project file: PI23/01924

Project title: Evaluation of the levels of the System associated with BLyS in patients with post-infectious syndromes and dysautonomic alterations of the heart rhythm
Principal researcher: Pablo Guisado
Funding agency: Spanish Society of Internal Medicine SEMI.
Participating entities: ISCIII, Quironsalud Research Institute for Research and Innovation
Duration 2023-2025

Project title: HIV Open Science (dissemination project)
Principal researcher: Eva Poveda
Financing agency: Spanish Foundation for Science and Technology (FECYT), Call for aid for the Promotion of Scientific, Technological and Innovation Culture.
Participating entities: ISCIII, Fundación Biomédica Galicia Sur, IrsiCaixa, Hospital Vall d’Hebron, Hospital de la Princesa, Fundación Imagina Más, Institute of Biomedicine of Seville (IBIS), Case Western Reserve University (Cleveland, Ohio)
Duration 2023-2024
Contract/project file: 17715

Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV (Annual renewal).
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2023 – 04/01/2024
Contract/project file: 1,013,006

Project title: Clinical and microbiological impact of the monkeypox virus outbreak in patients in Spain (2022): multicenter project MONKPOX-ESP22, Work package 4, virological research.
Principal researcher: Anabel Negredo (WP4 coordinator); Maria Paz Sánchez Seco (general coordinator)
Financing agency: CIBERINFEC/CIBERESP ISCIII Strategic Action.
Participating entities: ISCIII
Duration July 2022 - May 2023
Contract/project file: MONKPOX-ESP22

Project title: Biomarkers and underlying immunopathological mechanisms of post COVID-19 condition.
Principal investigator: Gemma Moncunill Piñas (IP); Marta Massanella (coIP); María Teresa Coiras López (co-PI)
Financing agency: CIBERINFEC Strategic Action.
Participating entities: ISCIII, IS-Global, IrsiCaixa
Duration 07/28/2022-07/29/2024
Contract/project file: IM22/INF/5

Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV.
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2022 – 04/01/2023
Contract/project file: 1,013,006

Project title: Characterization of the immune response developed after vaccination with COVID-19 in patients with hematological malignancies.
Principal researcher: Valentín García Gutiérrez
Funding agency: Ministry of Science and Innovation, PI21 - Health research projects (AES 2021). Health research project modality.
Participating entities: ISCIII, Ramón y Cajal University Hospital
Duration 01/01/2022 – 12/31/2024
Contract/project file: PI21_00877

The current director of CNM is Dr. José Miguel Rubio Muñoz.

Dr. José Miguel Rubio has a degree in Biological Sciences from the Universidad Autónoma de Madrid (1986) and a PhD in Biological Sciences from the same university (1992). He carried out his doctoral thesis at the Department of Genetics of the Universidad Autónoma de Madrid, as Associate Professor (1988-1989), and at the School of Biology of the University of East Anglia in Norwich, UK, as Senior Research Assistant (1989-1992).

During his postdoctoral period he obtained a grant from the European Commission within the Human Capital and Mobility Program to be carried out at the University of “La Sapienza” in Rome, Italy and the Institute of Molecular Biology and Biotechnology in Crete, Greece (1993-1994). Subsequently, he made a further stay funded by the WHO and the university itself at the Department of Entomology, Wageningen University, The Netherlands (1994-1996).

Since 1997 he has been a member of the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), where he joined the Department of Parasitology of the National Center of Microbiology, as an EU-INCO postdoctoral fellow and later with a grant from the Autonomous Community of Madrid (CAM). She was part of the founding group of the National Center for Tropical Medicine (2003-2006) and of the 24/7 Alerts and Emergencies Unit (2006-2018) and is currently Head of the Malaria and Emerging Parasitosis Unit of the National Microbiology Center and is part, as research staff, of the Center for Biomedical Research Network on Infectious Diseases (CIBERINFEC/ISCIII).

During his scientific career he has been Visiting Scientist at the Leonidas e Marie Dean Center (FIOCRUZ-AMAZONAS, Manaus, Brazil) and is an External Consultant of the Parasitology Departments of Cairo University (Egypt) and the Medical Research Center (MRC) of Kuala Lumpur (Malaysia).  He also belongs or has belonged to different national and international committees:  Member of the expert group for malaria control of the European Centre for Disease Control (ECDC) since 2011; Expert-Evaluator for health programs of the European Commission since 2004; Spanish Representative (commissioned by ISCIII and MSC) in the Technical Scientific Committee of the TDR (WHO) 2007-2008; Spanish Deputy Focal Point for microbiology at the European Centre for Disease Control (ECDC) from 2012 to 2020; and, member of the Research Ethics Committee of ISCIII until 2019.

In this period he has published more than 100 articles in international indexed journals, 10 book chapters and has been co-editor of two books in the area of malaria, tropical medicine and neglected diseases. He has participated in 58 competitively funded research projects, 20 of them international, having been the principal investigator in 8 national and 11 international projects as PI of the project or WP leader. In addition, he has led five agreements with companies. Currently he has been awarded four sexenios of research, being presented this year 2025 to the fifth. In the teaching field, he participates in different postgraduate programs in the areas of microbiology and parasitology, having directed seven doctoral theses and more than 20 Master's or Degree final projects, both nationally and internationally. ​​​​​

El laboratorio de Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos ofrece una amplia cartera de servicios al Sistema Nacional de Salud, las cuales pueden solicitarse en cnm-laboratorios.isciii.es. Jefe del Laboratorio: Jesús Oteo Iglesias (Punto focal Nacional de Resistencia antibiótica).

Dispone de dos programas de Vigilancia oficiales y gratuitos que engloban los ensayos ofertados ya sea como aislamientos individuales o mediante estudio de brotes. El Laboratorio utiliza asimismo técnicas de PCR en tiempo real para la detección de genes de resistencia, estas técnicas se han adaptado a un formato multiplex que permite detectar varios genes en la misma reacción. En los últimos años se han incluido metodologías basadas en la secuenciación de genomas completos para el análisis de bacterias multiresistentes (WGS).

Programa de vigilancia de Haemophilus influenzae. Responsables: María Pérez Vázquez (Punto focal Nacional de Haemophilus influenzae) y Belén Aracil. Laboratorio encargado de la identificación, estudio de sensibilidad y análisis genotípico de aislados de Haemophilus influenzae, centrándose esencialmente en la patología invasiva debida este patógeno. 

Programa de vigilancia de Resistencia a Antibióticos. Responsables: María Pérez Vázquez  y Belén Aracil (Punto focal Nacional de Resistencia antibiótica). Laboratorio encargado de la identificación, el estudio de sensibilidad antibiótica, y el diagnóstico fenotípico y genotípico de los diferentes mecanismos de resistencia a antibióticos fundamentalmente en enterobacterias y gram-negativos no fermentadores y Enterococcus spp.

Estudio de brotes. Responsables: Belén Aracil y María Pérez Vázquez. El programa incluye la caracterización de brotes nosocomiales y clones emergentes de alto riesgo mediante diferentes técnicas moleculares (tabla resumen). Éstas, nos permiten realizar estudios filogenéticos con el fin de obtener una información detallada acerca la relación entre los diferentes aislados y su trazabilidad. El objetivo final es generar datos que se transfieren a los hospitales como ayuda para la prevención o control de la propagación del brote.

Acreditación y Calidad. Responsable: Belén Aracil. El laboratorio Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos ha sido de los primeros en el ISCIII en la utilización de técnicas acreditadas por la Entidad Nacional de Acreditaciones (ENAC). Este laboratorio consiguió la primera acreditación homologada de técnicas diagnósticas en 2012, programa que ha sido ampliado, de manera que en la actualidad más de la mitad de las técnicas ofrecidas al Sistema Nacional de Salud están debidamente acreditadas por ENAC.

Técnicos responsables de las técnicas realizadas en el Laboratorio: Noelia Lara Fuella y Verónica Bautista Sánchez.

En la siguiente imagen se resumen las técnicas ofrecidas al Sistema Nacional de Salud.

PROGRAMAS NOMBRE CARTERA SERVICIO PATÓGENO DETERMINACIÓN, DETECCIÓN, ANÁLISIS MÉTODOS

Programa de vigilancia de Haemophilus

Programa de vigilancia de resistencia a antibióticos.

Identificación bacteriana

Haemophilus sp.

Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus spp

Identificación bacteriana

Bioquímicos

MALDI TOF

Secuenciación de RNAr

Identificación capsular

Haemophilus influenzae

 

Identificación capsular fenotípica y genotípica

Aglutinación serológica en latex

PCR ind/multiplex

Determinación de Sensibilidad

Haemophilus sp.

Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus

 

Determinación de Sensibilidad

Microdilución                

Tiras epsilon               

Kirby Bauer

Métodos fenotípicos de detección de mecanismos de resistencia

Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores,

 

Métodos fenotípicos de detección de mecanismos de resistencia

Discos y tabletas combinados con inhibidores                

Tiras combinadas     

Test de Hodge modificado

CabaNP                               

Inmunocromatografía CBP

Métodos genotípicos de detección de mecanismos de resistencia

Haemophilus sp.

Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus

 

ADN, PCR y secuenciación

PCR ind/multiplex

Análisis comparativo de las secuencias

Tipificación molecular/análisis filogenéticos

Haemophilus sp.

Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus

 

Corte enzimas de restricción, electroforesis

ADN, PCR y secuenciación

Preparación de librerías y secuenciación y análisis de genomas completos

 

PFGE

 

MLST

 

WGS