El Laboratorio de Referencia e Investigación en Micología del Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III es el laboratorio de referencia de Micología para toda España. Además, mantiene varias líneas de investigación, entre las que destacan: Identificación de levaduras y hongos filamentosos, estudio de los mecanismos de resistencia de los hongos a los antifúngicos, estandarización de las pruebas de sensibilidad a los antifúngicos de los hongos patógenos, correlación in vivo-in vitro con modelos experimentales y pacientes, epidemiología molecular de la infección fúngica nosocomial, determinación de niveles de antifúngicos y diagnóstico rápido de las micosis invasoras mediante técnicas de diagnóstico rápido como PCR en Tiempo Real. El grupo de Investigadores constituye un equipo multidisciplinar con capacidad de formar y producir conocimiento científico de calidad, en el área de micología médica. Durante los últimos años se han leído 5 tesis doctorales en el departamento y actualmente el laboratorio cuenta con tres becarios pre-doctorales y dos postdoctorales. Además, cada año acogemos 3-5 estudiantes que desarrollan sus proyectos fin de Master o Grado y rotantes de la especialidad de Microbiología Clínica de distinta procedencia Nacional. Todos ellos participan en un programa de formación que comprende sesiones bibliográficas, teóricas y reuniones científicas que les permiten adquirir una formación global de la micología.