Hepatitis C and VIH/VHC coinfection
Research Lines
Content with Investigacion .
Hepatitis
- Diseño de métodos diagnósticos para el estudio de los virus de las hepatitis (VH) A, B, C, D, E: Diseñamos sistemas de PCR para su detección y caracterización.
- Evaluación de métodos diagnósticos de los VH. Colaboramos con empresas para estudios de sensibilidad y especificidad de equipos diagnósticos.
- Estudios de Seroprevalencia de los virus de las hepatitis.
- Epidemiología genómica de genomas completos de VHA, VHB, VHC, VHD y VHE en colaboración con el ECDC. Estudios de trazabilidad del VHE.
- Caracterización molecular de virus de las hepatitis mediante secuenciación masiva: a) VHB: mutantes de escape HBsAg (prevalencia y efectos en la detección del HBsAg). Estudio de mutaciones en epítopos de estimulación inmune y mutaciones asociadas a evolución clínica desfavorable.
- b) VHC: resistencias a los antivirales de acción directa. Análisis molecular de subtipos poco frecuentes.
c) Estudios filogenéticos del VHD.
d) Análisis genómico del VHE.
e) Investigación etiológica de hepatitis no filiadas mediante estudios de metagenómica.
- b) VHC: resistencias a los antivirales de acción directa. Análisis molecular de subtipos poco frecuentes.
Research projects
Content with Investigacion .
1. Proyecto CIBEREPS 2022. Microbiological and genomic investigation of hepatitis in children by metagenomic approach in case and control subjects (IP: Ana Avellón).
2023-2024. En colaboración con el Hospital San Joan de Deu de Barcelona.
2. MPY 501-19: Tracking hepatitis E virus infection by means of epidemiological research and whole genome sequencing. Project TrazHE. (IP: Ana Avellón). 2020-2024.
3. Proyecto CIBEREPS 2021 Metagenomic sequencing to identify viral aetiologies in undiagnosed paediatric cases of meningitis and encephalitis (IP: D. Tarragó). 2021-2022.
4. MPY 383/19 (PEJ2018-004446-A). Ayudas para la promoción de empleo joven e implantación de la garantía juvenil en I+D+I. análisis de la complejidad de secuencias de los virus de la hepatitis A, B, C; D y E (VHA, VHB, VHC, VHD y VHE) mediante técnicas de secuenciación masiva. (IP: Ana Avellón). 2020-2021.
5. MPY 1285/16 Movilidad "Salvador de Madariaga" programa estatal de promoción de talento y su empleabilidad. (IP: Ana Avellón). 2016.
Publications
Mycobacterium mageritense meningitis in an immunocompetent patient with an intrathecal catheter.
9. Muñoz-Sanz A, Rodríguez Vidigal FF, Vera-Tome A, Jimenez MS. Mycobacterium mageritense meningitis in an immunocompetent patient with an intrathecal catheter. Enfer Infecc Microbiol Clin. 2013; 31:59-6
PUBMED DOIMeasles virus genotype D4 strains with non-standard length M-F non-coding region circulated during the major outbreaks of 2011-2012 in Spain.
2. Gil H, Fernández-García A*, Mosquera MM, Hübschen JM, Castellanos AM, de Ory F, Masa-Calles J, Echevarría JE.Measles virus genotype D4 strains with non-standard length M-F non-coding region circulated during the major outbreaks of 2011-2012 in Spain. PLoS One. 2018 Jul. 16;13(7):e0199975. * Corresponding author.
PUBMED DOIIsolation, antigenicity and immunogenicity of Lleida Bat Lyssavirus
3. Banyard AC, Selden D, Wu G; Thorne L, Jennings D, Marston D, Finke S, Freuling CM, Mueller T, Echevarria JE, Fooks AR. Isolation, antigenicity and immunogenicity of Lleida Bat Lyssavirus. Journal of General Virology, 2018. 99(12):1590-1599
PUBMED DOIShift within age-groups of mumps incidence, hospitalizations and severe complications in a highly vaccinated population
6. López-Perea N, Masa-Callesa J, Torres de Miera MV, Fernández-García A, Echevarría JE, de Ory F, Martínez de Aragón MV. Shift within age-groups of mumps incidence, hospitalizations and severe complications in a highly vaccinated population. Spain, 1998–2014. Vaccine, 2017, 35(34): 4339-4345.
PUBMED DOIThe Complexity of Antibody Responses Elicited against the Respiratory Syncytial Virus Glycoproteins in Hospitalized Children Younger than 2 Years
2. Trento A, Rodriguez-Fernandez R, Gonzalez-Sanchez MI, Gonzalez-Martinez F, Mas V, Vazquez M, et al. The Complexity of Antibody Responses Elicited against the Respiratory Syncytial Virus Glycoproteins in Hospitalized Children Younger than 2 Years. Front Microbiol. 2017;8:2301.
PUBMED DOIPotent single-domain antibodies that arrest respiratory syncytial virus fusion protein in its prefusion state.
3. Rossey I, Gilman MS, Kabeche SC, Sedeyn K, Wrapp D, Kanekiyo M, et al. Potent single-domain antibodies that arrest respiratory syncytial virus fusion protein in its prefusion state. Nat Commun. 2017;8:14158.
PUBMED DOI