Bacterial Taxonomy
Research Lines
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Neumococos
Vigilancia epidemiológica de los serotipos y genotipos que causan enfermedad neumocócica invasiva (ENI) en España. Caracterización molecular de factores de virulencia de neumococo. Identificación y caracterización de proteínas de neumococo candidatas a vacuna. Evaluación de mecanismos de evasión de la respuesta inmune en Streptococcus pneumoniae. Impacto de los biofilms bacterianos en la persistencia del tracto respiratorio. Mecanismos de cronicidad de aislados clínicos de neumococo en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica.
Research projects
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1: Título del proyecto: Desarrollo de enzibióticos para combatir infecciones en pacientes con fibrosis quística provocadas por los patógenos Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus: CF-TREAT
Referencia: CPP2022-009574 / MPY 375/23
Agencia Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. MICINN.
Fecha Inicio: 01/12/2023
Fecha Fin: 30/11/2026
Financiación: 238.938 Euros
Investigadores principales: Roberto Díez Martínez, José E. Yuste Lobo y Pilar García Suárez
2: Título del proyecto: Desarrollo de enzibióticos para combatir infecciones humanas producidas por Enterococcus faecium resistente a vancomicina (ANTI‐VRE).
Proyecto CPP2021-009054 financiado por MICIU/AEI /10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/ PRTR
Investigadores principales: Roberto Díez Martínez, Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech
Periodo: 18/11/2022 - 17/11/2025
Cuantía total: 231.455 €
3: Título del proyecto: Mecanismos de virulencia en patógenos respiratorios.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, Agencia Estatal de Investigación (Convocatoria «Proyectos I+D+I» 2020 - Modalidades «Retos Investigación» y «Generación de Conocimiento»). Referencia: PID2020-119298RB-I00
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Periodo: 01/09/2021 - 30/08/2024
Cuantía total: 121.000 €
4: Título del proyecto: Efectividad de la vacuna antineumocócica conjugada 13-valente frente a la hospitalización por neumonía adquirida en la comunidad en adultos de 60 años o mayores, mediante un estudio de casos y controles modificado. Estudio CIBELES.
Investigadores principales: Jose Yuste Lobo y Ángel Gil de Miguel
Entidad financiadora: PFIZER. Referencia: MVP 249/20
Periodo: 23/02/2021 - 22/02/2025
Cuantía total: 168.000 €
5: Título del proyecto: Evolution of Invasive Pneumococcal Disease in Spain with special focus on the pathogenesis of serotypes 3, 8, 11A, 19A, 22F and 33F. Investigadores principales: Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech.
Entidad financiadora: Merck Sharp & Dohme USA. Referencia: MVP 132/21
Período: 16/06/2021 - 15/12/2023
Cuantía total: 157.448€
6: Título del proyecto: Mecanismos de patogenicidad y protección en bacterias Gram-positivas causantes de enfermedad respiratoria y bacteriemia
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Entidad financiadora: MINECO. Referencia: SAF2017-83388-R
Periodo: 31/12/2017 - 30/06/2021
Cuantía total: 145.200 €
7: Título del proyecto: Characterization of susceptibility to cefditoren investigating penicillin resistant clinical isolates of Streptococcus pneumoniae.
Investigadores: Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech Lucas
Entidad financiadora: Tedec Meiji Farma, S.A. Referencia: MVP 119/20
Periodo: 11/07/2020 – 10-07-2022
Cuantía total: 76.517 €
8: Título del proyecto: Impact of clinical isolates of serotypes 22F and 33F in the epidemiology and pathogenesis of Streptococcus pneumoniae.
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Entidad financiadora: Merck Sharp & Dohme España, S.A. Referencia: MVE 213/18
Periodo: 10/05/2018 - 30/05/2021
Cuantía total: 157.604 €
Publications
Efficacy and safety assessment of a TRAF6-targeted nanoimmunotherapy in atherosclerotic mice and non-human primates.
3. Lameijer M, Binderup T, van Leent M, Senders M, Fay F. Seijkens T, Kroon J, Stroes E, Kjaer A, Ochando J, Reiner T, Pérez-Medina C, Calcagno C, Fischer E, Zhang B, Temel R, Swirski F, Nahrendorf M, Fayad Z, Lutgens E, Mulder W and Duivenvoorden R. Efficacy and safety assessment of a TRAF6-targeted nanoimmunotherapy in atherosclerotic mice and non-human primates. Nature Biomedical Engineering. 2018. 2: 279–292.
PUBMED DOINeutrophil derived CSF1 induces macrophage polarization and promotes transplantation tolerance.
4. Braza MS, Conde P, Garcia MR, Cortegano I, Brahmachary M, Pothula V, Fay F, Boros P, Werner SW, Ginhoux F, Mulder WJ, and Ochando J. Neutrophil derived CSF1 induces macrophage polarization and promotes transplantation tolerance. Am J Transplant. 2018.
PUBMED DOIDC-SIGN(+) Macrophages Control the Induction of Transplantation Tolerance
9. Conde P, Rodriguez M, van der Touw W, Jimenez A, Burns M, Miller J, Brahmachary M, Chen HM, Boros P, Rausell-Palamos F, Yun TJ, Riquelme P, Rastrojo A, Aguado B, Stein-Streilein J, Tanaka M, Zhou L, Zhang J, Lowary TL, Ginhoux F, Park CG, Cheong C, Brody J, Turley SJ, Lira SA, Bronte V, Gordon S, Heeger PS, Merad M, Hutchinson J, Chen SH, Ochando J. 2015. DC-SIGN(+) Macrophages Control the Induction of Transplantation Tolerance. Immunity. 16;42(6):1143-58.
PUBMED DOIProteomic characterisation of bovine and avian purified protein derivatives and identification of specific antigens for serodiagnosis of bovine tuberculosis
2.- Proteomic characterisation of bovine and avian purified protein derivatives and identification of specific antigens for serodiagnosis of bovine tuberculosis. Antonio Infantes-Lorenzo, Jose; Moreno, Inmaculada; Angeles Risalde, Maria; et ál. CLINICAL PROTEOMICS Volumen: 14 Número de artículo: 36 Fecha de publicación: NOV 2 2017
PUBMED DOIFunctional and structural characterization of four mouse monoclonal antibodies to complement C3 with potential therapeutic and diagnostic applications.
3.- Functional and structural characterization of four mouse monoclonal antibodies to complement C3 with potential therapeutic and diagnostic applications. Subias Hidalgo, Marta; Yebenes, Hugo; Rodriguez-Gallego, Cesar; et ál..EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY Volumen: 47 Número: 3 Páginas: 504-515 Fecha de publicación: MAR 2017
PUBMED DOIImmunoproteomic characterisation of Mycoplasma mycoides subspecies capri by mass spectrometry analysis of two- dimensional electrophoresis spots and western blot
5.- Immunoproteomic characterisation of Mycoplasma mycoides subspecies capri by mass spectrometry analysis of two- dimensional electrophoresis spots and western blot. Churchward, Colin P.; Rosales, Ruben S.; Gielbert, Adriana; et ál..JOURNAL OF PHARMACY AND PHARMACOLOGY Volumen: 67 Número: 3 Número especial: SI Páginas: 364-371 Fecha de publicación: MAR 2015
PUBMED DOIEfficacy of low doses of amphotericin B plus allicin against experimental visceral leishmaniasis.
6.- Efficacy of low doses of amphotericin B plus allicin against experimental visceral leishmaniasis. Corral, M. Jesus; Serrano, Dolores R.; Moreno, Inmaculada; et ál..JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY Volumen: 69 Número: 12 Páginas: 3268-3274 Fecha de publicación: DEC 2014
PUBMED DOIA Novel Antibody against Human Factor B that Blocks Formation of the C3bB Proconvertase and Inhibits Complement Activation in Disease Models
7.- A Novel Antibody against Human Factor B that Blocks Formation of the C3bB Proconvertase and Inhibits Complement Activation in Disease Models. Subias, Marta; Tortajada, Agustin; Gastoldi, Sara; et ál..JOURNAL OF IMMUNOLOGY Volumen: 193 Número: 11 Páginas: 5567-5575 Fecha de publicación: DEC 2014
PUBMED DOIDetection of anti-Leishmania infantum antibodies in sylvatic lagomorphs from an epidemic area of Madrid using the indirect immunofluorescence antibody test
8.- Detection of anti-Leishmania infantum antibodies in sylvatic lagomorphs from an epidemic area of Madrid using the indirect immunofluorescence antibody test. Moreno, Inmaculada; Alvarez, Julio; Garcia, Nerea; et ál..VETERINARY PARASITOLOGY Volumen: 199 Número: 3-4 Páginas: 264-267 Fecha de publicación: 2014
PUBMED DOIEvidence of Leishmania infantum Infection in Rabbits (Oryctolagus cuniculus) in a Natural Area in Madrid, Spain.
9.- Evidence of Leishmania infantum Infection in Rabbits (Oryctolagus cuniculus) in a Natural Area in Madrid, Spain. Garcia, Nerea; Moreno, Inmaculada; Alvarez, Julio; et ál..BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL Número de artículo: 318254 Fecha de publicación: 2014
PUBMED DOIMucus-Activatable Shiga Toxin Genotype stx2d in Escherichia coli O157:H7
2. Sánchez, S., Llorente, M.T., Herrera-León, L., Ramiro, R., Nebreda, S., Remacha, M.A., Herrera-León, S. Mucus-activatable shiga toxin genotype stx2d in Escherichia coli O157:H7. (2017) Emerging Infectious Diseases, 23 (8), pp. 1431-1433.
PUBMED DOIMultinational outbreak of travel-related Salmonella Chester infections in europe, summers 2014 and 2015
3. Fonteneau, L., Da Silva, N.J., Fabre, L., Ashton, P., Torpdahl, M., Müller, L., Bouchrif, B., El Boulani, A., Valkanou, E., Mattheus, W., Friesema, I., Herrera Leon, S., Varela Martínez, C., Mossong, J., Severi, E., Grant, K., Weill, F., Gossner, C.M., Bertrand, S., Dallman, T., Le Hello, S. Multinational outbreak of travel-related Salmonella Chester infections in europe, summers 2014 and 2015. (2017) Eurosurveillance, 22 (7).
PUBMED DOIProspective use of whole genome sequencing (WGS) detected a multi-country outbreak of Salmonella Enteritidis
4. Inns, T., Ashton, P.M., Herrera-Leon, S., Lighthill, J., Foulkes, S., Jombart, T., Rehman, Y., Fox, A., Dallman, T., De Pinna, E., Browning, L., Coia, J.E., Edeghere, O., Vivancos, R. Prospective use of whole genome sequencing (WGS) detected a multi-country outbreak of Salmonella Enteritidis (2017) Epidemiology and Infection, 145 (2), pp. 289-298.
PUBMED DOIPlasmid-mediated quinolone resistance in different diarrheagenic Escherichia coli pathotypes responsible for complicated, noncomplicated, and traveler's diarrhea cases.
5. Herrera-Leon, S., Llorente, M.T., Sanchez, S. Plasmid-mediated quinolone resistance in different diarrheagenic Escherichia coli pathotypes responsible for complicated, noncomplicated, and traveler's diarrhea cases. (2016) Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 60 (3), pp. 1950-1951.
PUBMED DOIMolecular Epidemiology and Antibiotic Susceptibility of Vibrio cholerae Associated with a Large Cholera Outbreak in Ghana in 2014.
6. Eibach, D., Herrera-León, S., Gil, H., Hogan, B., Ehlkes, L., Adjabeng, M., Kreuels, B., Nagel, M., Opare, D., Fobil, J.N., May, J. Molecular Epidemiology and Antibiotic Susceptibility of Vibrio cholerae Associated with a Large Cholera Outbreak in Ghana in 2014. (2016) PLoS Neglected Tropical Diseases, 10 (5).
PUBMED DOIWhat’s in a name? Species-wide whole-genome sequencing resolves invasive and noninvasive lineages of Salmonella enterica serotype Paratyphi B
7. Connor, T.R., Owen, S.V., Langridge, G., Connell, S., Nair, S., Reuter, S., Dallman, T.J., Corander, J., Tabing, K.C., Le Hello, S., Fookes, M., Doublet, B., Zhou, Z., Feltwell, T., Ellington, M.J., Herrera, S., Gilmour, M., Cloeckaert, A., Achtman, M., Parkhill, J., Wain, J., De Pinna, E., Weill, F.-X., Peters, T., Thomson, N. What’s in a name? Species-wide whole-genome sequencing resolves invasive and noninvasive lineages of Salmonella enterica serotype Paratyphi B (2016) mBio, 7 (4).
PUBMED DOIInvasive salmonella infections among children from Rural Mozambique, 2001-2014
9. Mandomando, I., Bassat, Q., Sigaúque, B., Massora, S., Quintó, L., Ácacio, S., Nhampossa, T., Vubil, D., Garrine, M., Macete, E., Aide, P., Sacoor, C., Herrera-León, S., Ruiz, J., Tennant, S.M., Menéndez, C., Alonso, P.L. Invasive salmonella infections among children from Rural Mozambique, 2001-2014 (2015) Clinical Infectious Diseases, 61, pp. S339-S345.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
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Almudena Cascajero Díaz
Técnico de laboratorio
ORCID code: 0000-0002-9654-3100
Técnico Superior de Actividades Técnicas y Profesionales (Unidades de Inmunopatología del SIDA y Legionella, Centro Nacional de Microbiología). Clinical Diagnostic Laboratory Technician by IES Renacimiento de Madrid.
Experience in cloning techniques and characterization of neutralizing antibodies and participation in different projects on the pathogenesis of HIV by studying the viral envelope and the mechanisms of resistance to antiretroviral drugs. This experience has subsequently allowed me to participate in 5 multicenter clinical studies studying the immune response against different variants of SARS-CoV-2.
Since 2021, I also participate as a laboratory technician in the Legionella Unit as a support to the Spanish National Health System through the microbiological surveillance of the disease to contribute to the prevention and control of legionellosis.
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Laura del Estal Gómez
Ayudante de investigación
ORCID code: 0009-0000-2773-8986
Graduada en Biología Sanitaria por la Universidad de Alcalá. Máster Universitario en Microbiología Aplicada a la Salud Pública e Investigación en Enfermedades Infecciosas.
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Caroline Stephanie Crisóstomo Vergara
Técnico de Laboratorio
ORCID code: 0009-0008-0525-1737
Técnico de Laboratorio. Técnico superior de Laboratorio Clínico y Biomédico por la Escuela Técnica de Enseñanzas Especializadas de Madrid. Máster en Microbiología Clínica por el Instituto Europeo de Química, Física y Biología de Madrid.
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Fernando González Camacho
Científico Titular
ORCID code: 0000-0003-3175-9004
Licenciado en Ciencias Biológicas por la Universidad de Salamanca y Doctor por la Universidad Autónoma de Madrid. Actualmente, es Científico Titular de plantilla en el Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII). Responsable de la Unidad de Legionella del Laboratorio de Referencia e Investigación en Enfermedades Bacterianas transmitidas por agua y alimentos.
A nivel europeo es sustituto (Alternate) al National Focal Point para la enfermedad del legionario en el ECDC y es OCP (Operational Contact Point) en microbiología para la legionelosis en la European Legionnaires' Disease Surveillance Network (ELDSNet).
Coordina las líneas de investigación del laboratorio que se desarrollan en tres perspectivas diferentes: en las instalaciones colonizadas, estudios sobre la resistencia a los tratamientos y su persistencia; en la clínica, sobre factores de virulencia y su interacción con el sistema inmune; y en la vigilancia microbiológica, sobre la mejorar de los métodos de caracterización del microorganismo.
Es Investigador Principal en el proyecto “Búsqueda de biomarcadores de patogenicidad en Legionella spp con interés predictivo de riesgo de infección".
Es miembro de distintas sociedades científicas como son la Sociedad Española de Salud Ambiental (SESA), Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC) y la European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID).
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Juana María González Rubio
Científica Titular
ORCID code: 0000-0001-6979-2964
La Dra. Juana María González Rubio es Licenciada en Bioquímica por la Universidad de Salamanca y Doctora por la Facultad de Medicina de la Universidad Autónoma de Madrid. Actualmente, es Científico Titular de plantilla en el Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), donde trabaja en la Unidad de Legionella del Laboratorio de Referencia e Investigación en Enfermedades Bacterianas transmitidas por agua y alimentos.
Dentro del laboratorio, realiza las actividades propias del Programa de Vigilancia Microbiológica de Legionella, y lleva las líneas de investigación del laboratorio sobre la caracterización de biofilms y la puesta a punto de nuevas técnicas para la caracterización de Legionella. También forma parte del equipo investigador del proyecto “Búsqueda de marcadores de patogenicidad para el análisis de riesgos en las instalaciones".
Anteriormente, ha trabajado en la Unidad de Biomonitorización humana del Centro Nacional de Sanidad Ambiental (ISCIII) participando en diferentes proyectos de investigación relacionados con la Sanidad Ambiental, siendo el último más destacado el proyecto “HBM4EU" en el que ha trabajado hasta junio de 2023.
List of staff
Additional Information
The research objectives focus on the areas of Bacterial Taxonomy and Microbiology in Public Health:
- Identification of pathogenic bacteria that are difficult to assign taxonomically
- Description of new species
- Study of bacterial population biology through typing
- Epidemiology of antimicrobial resistance and virulence factors for certain bacterial pathogens in different nosocomial/community settings.
These objectives are addressed from the perspective of polyphasic taxonomy (phenotypic and genotypic taxonomy) through the study of targets for genus/species assignment and phylogenetic analyses. The analysis of the virulome and resistome of certain species is approached from the perspective of complete genome sequencing.
Research on invasive infection by Streptococcus pyogenes and other beta-hemolytic streptococci has been carried out since 1994, through the Surveillance Program of the National Center for Microbiology. The typing of invasive S. pyogenes strains circulating in Spain includes determination of: serotype (emm-type); the genetic profile of streptococcal pyrogenic exotoxins; the antimicrobial resistance phenotype; and the genotypes of epidemiologically related strains and/or outbreaks.
The research objectives focus on the areas of Bacterial Taxonomy and Microbiology in Public Health:
- Identification of pathogenic bacteria that are difficult to assign taxonomically
- Description of new species
- Study of bacterial population biology through typing
- Epidemiology of antimicrobial resistance and virulence factors for certain bacterial pathogens in different nosocomial/community settings.
These objectives are addressed from the perspective of polyphasic taxonomy (phenotypic and genotypic taxonomy) through the study of targets for genus/species assignment and phylogenetic analyses. The analysis of the virulome and resistome of certain species is approached from the perspective of complete genome sequencing.
Research on invasive infection by Streptococcus pyogenes and other beta-hemolytic streptococci has been carried out since 1994, through the Surveillance Program of the National Center for Microbiology. The typing of invasive S. pyogenes strains circulating in Spain includes determination of: serotype (emm-type); the genetic profile of streptococcal pyrogenic exotoxins; the antimicrobial resistance phenotype; and the genotypes of epidemiologically related strains and/or outbreaks.