Bacterial Taxonomy
Research projects
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PROYECTOS VIGENTES
Título del proyecto: "Vesículas extracelulares y otras moléculas de parásitos para el tratamiento de la enfermedad inflamatoria intestinal: PARATREAT-IBD"
Referencia: Proyecto PID2022-137661OB-I00 (MPY 341/23) financiado por MCIN/AEI /10.13039/501100011033/ y por FEDER Una manera de hacer Europa
Fecha Inicio: 01/12/2023
Fecha Fin: 31/08/2026
Financiación: 162.500 Euros
Investigador principal: Javier Sotillo
Agencia Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. MICINN.
Título del proyecto: "Desarrollo de nuevos métodos diagnósticos y de seguimiento de la infección por schistosoma haematobium"
Referencia: PI23CIII00034 / MPY 386/23
Fecha Inicio: 01/01/2024
Fecha Fin: 31/12/2026
Financiación: 131.500 Euros
Investigador principal: Javier Sotillo
Agencia Financiadora: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII/AESI)
Título del proyecto: "Desarrollo de herramientas para el control de la teniosis / cisticercosis en zonas endémicas y vigilancia de las helmintosis humanas emergentes en España"
Referencia: PI22CIII/00010
Fecha Inicio: 01/01/2023
Fecha Fin: 31/12/2025
Financiación: 80.000 Euros
Investigador principal: María Jesús Perteguer
Agencia Financiadora: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII/AESI)
PROYECTOS PASADOS
Título del proyecto: "PERITAS: Molecular epidemiological studies on pathways of transmission and longlasting capacity building to prevent cystic echinococcosis infection."
Coordinador: Adriano Casulli. IP of ISCIII: Maria J. Perteguer.
Entidad financiadora: EULAC Health JOINT CALL on Research and Innovation 016-2017
Periodo: 01/03/2019-31/12/2022.
Cuantía total: 1.083.580 €.
Título del proyecto: "Producción de antígenos y controles positivos recombinantes para el desarrollo y la estandarización de nuevos ensayos serológicos aplicados al diagnóstico y control de helmintosis olvidadas. "
Investigador principal: María Jesús Perteguer.
Entidad financiadora: ISCIII-AESI. Instituto de Salud Carlos III
Periodo: 02/11/2018 - 31/06/2022.
Cuantía total: 78.050 €.
Título del proyecto: "Diagnóstico serológico diferencial de helmintiasis asociadas a eosinofilia: desarrollo de ensayos multianalito (xMAP) con antígenos recombinantes de especies de interés clínico"
Investigador principal: María Jesús Perteguer.
Entidad financiadora: ISCIII-AESI. Instituto de Salud Carlos III
Periodo: 01/01/2015 - 31/12/2018 .
Cuantía total: 91.000 €.
Publications
A Q Fever Outbreak with a High Rate of Abortions at a Dairy Goat Farm: Coxiella burnetii Shedding, Environmental Contamination, and Viability
3. Álvarez-Alonso R, Basterretxea M, Barandika JF, Hurtado A, Idiazabal J, Jado I, Beraza X, Montes M, Liendo P, García-Pérez AL. A Q Fever Outbreak with a High Rate of Abortions at a Dairy Goat Farm: Coxiella burnetii Shedding, Environmental Contamination, and Viability. Appl Environ Microbiol. 2018 Oct 1;84(20).
PUBMED DOIIrruptive mammal host populations shape tularemia epidemiology.
4. Luque-Larena, Juan J.; Mougeot, Francois; Arroyo, Beatriz; Dolors Vidal, Ma; Rodriguez-Pastor, Ruth; Escudero, Raquel; Anda, Pedro; Lambin, Xavier. Irruptive mammal host populations shape tularemia epidemiology. Plos Pathogens. 13 - 11, Public Library Science, 01/11/2017.
PUBMED DOIEnvironmental sampling coupled with real-time PCR and genotyping to investigate the source of a Q fever outbreak in a work setting.
5. Hurtado A, Alonso E, Aspiritxaga I, López Etxaniz I, Ocabo B, Barandika JF, Fernández-Ortiz DE Murúa JI, Urbaneja F, Álvarez-Alonso R, Jado I, García-Pérez AL. Environmental sampling coupled with real-time PCR and genotyping to investigate the source of a Q fever outbreak in a work setting. Epidemiol Infect. 2017 Jul;145(9):1834-1842.
PUBMED DOIDensity-Dependent Prevalence of Francisella tularensis in Fluctuating Vole Populations, Northwestern Spain
6. Rodriguez-Pastor, Ruth; Escudero, Raquel; Vidal, Dolors; Mougeot, Francois; Arroyo, Beatriz; Lambin, Xavier; Maria Vila-Coro, Ave; Rodriguez-Moreno, Isabel; Anda, Pedro; Luque-Larena, Juan J.Density-Dependent Prevalence of Francisella tularensis in Fluctuating Vole Populations, Northwestern Spain. Emerging Infectious Diseases. 23 - 8, pp. 1377 - 1379. Centers Disease Control, 01/08/2017.
PUBMED DOIGenotypes of Coxiella burnetii in wildlife: disentangling the molecular epidemiology of a multi-host pathogen
7. González-Barrio D, Jado I, Fernández-de-Mera IG, Del Rocio Fernández-Santos M, Rodríguez-Vargas M, García-Amil C, Beltrán-Beck B, Anda P, Ruiz-Fons F. Genotypes of Coxiella burnetii in wildlife: disentangling the molecular epidemiology of a multi-host pathogen. Environ Microbiol Rep. 2016 Oct;8(5):708-714.
PUBMED DOIDevelopment of Improved Serodiagnostics for Tularemia by Use of Francisella tularensis Proteome Microarrays
8. Nakajima, Rie; Escudero, Raquel; Molina, Douglas M.; Rodriguez-Vargas, Manuela; Randall, Arlo; Jasinskas, Algis; Pablo, Jozelyn; Felgner, Philip L.; AuCoin, David P.; Anda, Pedro; Davies, D. Huw. Towards Development of Improved Serodiagnostics for Tularemia by Use of Francisella tularensis Proteome Microarrays. Journal of Clinical Microbiology. 2016 Jul;54(7):1755-1765.
PUBMED DOIInterruption of onchocerciasis transmission in Bioko Island: Accelerating the movement from control to elimination in Equatorial Guinea
5. Herrador Z, Garcia B, Ncogo P, Perteguer MJ, Rubio JM, Rivas E, Cimas M, Ordoñez G, de Pablos S, Hernández-González A, Nguema R, Moya L, Romay-Barja M, Garate T, Barbre K, Benito A. Interruption of onchocerciasis transmission in Bioko Island: Accelerating the movement from control to elimination in Equatorial Guinea. PLoS Negl Trop Dis. 2018 May 3;12(5):e0006471.
PUBMED DOILAMP kit for diagnosis of non-falciparum malaria in Plasmodium ovale infected patients
7. Thuy-Huong Ta-Tang, Sergio L. B. Luz, Francisco J. Merino, Isabel de Fuentes, Rogelio López-Vélez, Tatiana A. P. Almeida, Marta Lanza, Cláudia M. M. Abrahim, and José M. Rubio (2016). Atypical Mansonella ozzardi Microfilariae from an Endemic Area of Brazilian Amazonia. Am. J. Trop. Med. Hyg 95(3), 2016, pp. 633–636.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
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Esther Calonge Errejón
Titulado en Actividades técnicas y profesionales y facultativo en laboratorio de diagnóstico
ORCID code: 0000-0003-2175-5237
Licenciada en Ciencias Biológicas y Doctora en Biología Molecular por la Universidad Complutense de Madrid. Investigadora en el campo de las enfermedades infecciosas y la patogénesis del VIH-1, desde la unidad de Inmunopatología del SIDA del Centro Nacional de Microbiología, centrando su actividad investigadora principalmente en estudios genéticos del VIH-1. Miembro científico de la plataforma Host Genetics en IP-lab.
Actualmente investigadora en el laboratorio de Serología Viral del CNM en el Instituto de Salud Carlos III. Facultativa especialista acreditada para la emisión de resultados diagnósticos. Desde que forma parte del laboratorio de Serología ha participado como miembro del grupo de trabajo en estudios de enorme relevancia como el estudio ENE-COVID, CombiVacs y el ENE-COVID Senior con el procesamiento de cerca de 100 mil muestras así como estudios de seroprevalencia en enfermedades infecciosas y emergentes. Responsable técnico de la validación de paneles de la OMS para diversas enfermedades infecciosas y de kits de diagnóstico para distintas empresas biotecnológicas. Tienen también formación especializada en calidad y acreditación según normas ISO.
Autora de numerosos artículos científicos de alto índice de impacto. Revisora en revistas de prestigio internacional y evaluadora en convocatorias de proyectos I+D para la FCSAI. Ha participado como científico investigador en numerosos proyectos de I+D en el campo de las enfermedades infecciosas financiados a través de convocatorias competitivas de entidades públicas y privadas
Profesora en el Máster Universitario en Microbiología aplicada a Salud Pública e Investigación en Enfermedades Infecciosas, Universidad de Alcalá Henares y tutora de trabajos fin de Master (TFMs). -
Mayte Pérez Olmeda
Científico Titular
ORCID code: 0000-0002-7504-5321
Mayte Pérez Olmeda (Madrid, 1972) es doctora en Biología por la Universidad Complutense de Madrid (UCM) (2003) y Científico Titular del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) (2008). Actualmente es responsable del Laboratorio de Serología del Centro Nacional de Microbiología del ISCIII y de la Calidad del Laboratorio y del proceso de acreditación de ensayos (ENAC).
En su experiencia investigadora cuenta con el reconocimiento de 3 sexenios y 4 quinquenios de investigación.
Su actividad investigadora ha estado siempre dirigida al conocimiento de la patogénesis del VIH y en la coinfección del VIH con las hepatitis víricas (VHB y VHC). En los últimos años y desde su incorporación al Laboratorio de Serología compagina la Referencia e Investigación de diferentes patógenos relacionados con las enfermedades infecciosas y/o emergentes.
Es autora de más de 90 artículos, más de la mitad de ellos publicados en revistas del primer cuartil (68% D1) (H-index:24). Ha escrito un libro de divulgación científica sobre VIH “VIH La investigación contra la gran epidemia del siglo XX” y ha participado como ponente en diferentes congresos y reuniones científicas.
Es y ha sido Investigadora Principal y Colaborador Científico de numerosos Proyectos de Investigación nacionales e internacionales.
Actualmente forma parte del Comité Coordinador de Colaboraciones Científicas del estudio ENE-COVID, del Comité de Bioseguridad del ISCIII, del Comité de Seguridad y Salud del ISCIII y de la Comisión de Seguridad del ISCIII. Además, participa activamente en diferentes grupos de trabajo como el del Biobanco del ISCIII.
Ha participado y participa en diferentes comités y redes de investigación de:
a. Ámbito internacional:
• Punto operativo de contacto del ECDC en aspectos microbiológicos para Sarampión, Parotiditis, Rubeola, Varicela y tosferina.
• EURL IVD. Laboratorio validador de inmunoensayos frente a CMV y EBV.
b. Iniciativas de ámbito nacional.
• Red de investigación en Sida (RIS) investigadora y coordinadora de Work Packages (WPs).
• Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), con participación en diferentes WPs.En la trayectoria profesional ha dirigido distintos grupos de trabajo tanto para investigación como para referencia. En los últimos años ha coordinado el trabajo serológico de los estudios de enorme relevancia como el estudio ENE-COVID, CombiVacs, RecueVacs y el ENE-COVID Senior. Así mismo, forma parte de diferentes grupos de trabajo para la elaboración de informes y documentos relacionados con la vigilancia de diferentes enfermedades infecciosas y/o emergentes:
• Grupo de Trabajo para el Plan de eliminación de sarampión y rubeola (Ministerio de Sanidad).
• Programas de vigilancia en Enfermedades Infecciosas como la rabia, tétanos, difteria, bordetella, micoplasma, sarampión, rubeola, parotiditis, citomegalovirus, herpes simple, varicela zóster, chlamydia, rickettsia conorii, legionella y Herpes 8 y enfermedades transmitidas por vector.
• Miembro del Focal Points MMR (ECDC).Ha participado activamente en la organización de congresos y reuniones.
Compagina su labor de investigación y referencia con la docencia. Desde el 2023 es directora del Máster en Microbiología aplicada a la Salud Pública e Investigación en Enfermedades Infecciosas (UAH/ISCIII) en el que también colabora como docente y coordinadora de materias desde el 2014. En este Máster ha sido tutora y miembro del tribunal de diferentes TFMs.
En esta línea docente también es miembro del Programa de Doctorado en Ciencias Biomédicas y Salud Pública de IMIENS-UNED UNED/ISCIII desde 2020.
Participa en eventos de divulgación científica como la semana de la ciencia en el ISCIII. -
María Ángeles Murillo
Ayudante de Investigación I+D+i
Tiene una amplia experiencia en inmunoensayos, técnicas moleculares y en la recepción de muestras. Ha trabajado en diferentes laboratorios del CNM como el laboratorio de Retrovirus ampliando su experiencia a los métodos moleculares. Tiene también formación especializada en calidad y acreditación según normas ISO.
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Isabel Pérez Grajera
Técnico de Laboratorio
Graduada en Ciencias del Medioambiente (UNED) y titulación de Técnico Superior de Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Tiene amplia experiencia en inmunoensayos, técnicas moleculares y en la recepción de muestras. Ha trabajado en otros laboratorios del CNM de virología y bacteriología. Tiene también formación especializada en calidad y acreditación según normas ISO.
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María Castillo de la Osa
Técnico de Laboratorio
Graduada en Biología (Universidad Alcalá de Henares), titulación de Técnico Superior de Laboratorio de Diagnóstico Clínico (IES Moratalaz) y Máster en Microbiología aplicada a la Salud Pública e Investigación en Enfermedades Infecciosas (Universidad Alcalá de Henares). Tiene amplia experiencia en diversas técnicas de Serología, Biología molecular y celular, Microbiología y en la recepción de muestras y manejo de la base de datos. Tiene también formación especializada en calidad y acreditación según normas ISO.
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Lucía Barbero Herranz
Técnico de laboratorio
Titulada como Técnico Superior de Laboratorio Clínico y Biomédico (IES Renacimiento) y Técnico de animalario (UNED). Ha realizado prácticas en la Bioincubadora del Hospital de Fuenlabrada y posee formación, en análisis microbiológicos, Bioconjugados, Bioseguridad y prevención de RL, y personal sanitario ante la violencia de género. Actualmente tiene un contrato de Plan de Empleo Juvenil del Ministerio de Ciencia e Innovación.
List of staff
Additional Information
The research objectives focus on the areas of Bacterial Taxonomy and Microbiology in Public Health:
- Identification of pathogenic bacteria that are difficult to assign taxonomically
- Description of new species
- Study of bacterial population biology through typing
- Epidemiology of antimicrobial resistance and virulence factors for certain bacterial pathogens in different nosocomial/community settings.
These objectives are addressed from the perspective of polyphasic taxonomy (phenotypic and genotypic taxonomy) through the study of targets for genus/species assignment and phylogenetic analyses. The analysis of the virulome and resistome of certain species is approached from the perspective of complete genome sequencing.
Research on invasive infection by Streptococcus pyogenes and other beta-hemolytic streptococci has been carried out since 1994, through the Surveillance Program of the National Center for Microbiology. The typing of invasive S. pyogenes strains circulating in Spain includes determination of: serotype (emm-type); the genetic profile of streptococcal pyrogenic exotoxins; the antimicrobial resistance phenotype; and the genotypes of epidemiologically related strains and/or outbreaks.
The research objectives focus on the areas of Bacterial Taxonomy and Microbiology in Public Health:
- Identification of pathogenic bacteria that are difficult to assign taxonomically
- Description of new species
- Study of bacterial population biology through typing
- Epidemiology of antimicrobial resistance and virulence factors for certain bacterial pathogens in different nosocomial/community settings.
These objectives are addressed from the perspective of polyphasic taxonomy (phenotypic and genotypic taxonomy) through the study of targets for genus/species assignment and phylogenetic analyses. The analysis of the virulome and resistome of certain species is approached from the perspective of complete genome sequencing.
Research on invasive infection by Streptococcus pyogenes and other beta-hemolytic streptococci has been carried out since 1994, through the Surveillance Program of the National Center for Microbiology. The typing of invasive S. pyogenes strains circulating in Spain includes determination of: serotype (emm-type); the genetic profile of streptococcal pyrogenic exotoxins; the antimicrobial resistance phenotype; and the genotypes of epidemiologically related strains and/or outbreaks.