Bacterial Taxonomy
Research Lines
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Arbovirus y Enfermedades víricas importadas
El laboratorio de Arbovirus y Enfermedades Víricas Importadas (AEVI) del CNM desarrolla su trabajo dentro de la línea de investigación “Virus emergentes transmitidos por vector y/o reservorio, de importancia en salud pública”, que se sustenta en las áreas de epidemiología molecular, desarrollo metodológico, detección en vectores y reservorios y, otros aspectos relacionados con estas zoonosis con una aplicación clara hacia la investigación, prevención, preparación, control y respuesta a las amenazas o brotes causados por estos virus.
Arbovirus como Dengue, Chikungunya o Zika son virus endémicos en todo el cordón tropical/sub-tropical del planeta en continua expansión a latitudes más lejanas debido al calentamiento global y a la dispersión y colonización de nuevos hábitats llevada a cabo por sus vectores artrópodos y son transportados a otras zonas del planeta a través de pacientes virémicos por lo que si, como ocurre en España, se cuenta con vectores transmisores establecidos, se puede propiciar el establecimiento de circulación autóctona. Además de estos virus exóticos, en España circulan endémicamente los arbovirus Toscana, West Nile y el virus de la Fiebre hemorrágica de Crimea-Congo, entre otros.
La OMS elaboró un listado en 2019 con las 10 amenazas para la Salud Global que consideraron más importantes, entre las que se encuentran los virus Dengue, Ébola y Zika. El principal temor es que la falta de preparación cause una epidemia. Además, algunos de estos virus como Dengue y Chikungunya son considerados también “Enfermedades Tropicales Desatendidas” que ponen en peligro la salud de muchas personas en países empobrecidos sin que se estudien con los recursos necesarios.
La importancia para la salud pública de estos patógenos, y la necesidad de prepararse frente a ellos, se refleja también en la lista de actividades prioritarias de investigación y desarrollo de la OMS que actualmente incluye, entre otros, el Ébola, el virus de la Fiebre Hemorrágica de Crimea Congo, el virus de Zika y la enfermedad por el virus de Nipah, debido a la amenaza que suponen para la Salud Pública por su potencial epidémico o porque no hay medidas de control suficientes. Además del peligro real que representan en zonas endémicas, algunos de los virus mencionados (Ébola, Zika, West Nile, Crimea-Congo y Dengue) han supuesto, y continúan siendo, una amenaza para nuestro país habiendo producido casos esporádicos o brotes localizados de infección autóctona. El riesgo para España de las enfermedades transmitidas por vectores está aumentando de manera muy clara como se ha podido observar en los últimos años, y la previsión es que siga aumentando.
Todos estos virus son virus zoonóticos emergentes y nuestro grupo de investigación lleva décadas trabajando en diferentes aspectos en relación con estos patógenos. El riesgo de emergencia y expansión de estos virus se basa de sus ciclos complejos de transmisión, por lo que nuestros estudios se basan tanto en el ser humano, como en los reservorios y los vectores que los transmiten. De esta base, parten transversalmente las líneas de actuación que van enfocadas a estudios de epidemiología molecular, desarrollo metodológico, detección de virus en vectores y hospedadores, caracterización de los mismos y estudios de competencia vectorial, con una aplicación dirigida hacia la investigación, prevención y respuesta a las amenazas o brotes causados por estos virus. El trabajo que desarrollamos se articula en torno a 3 objetivos principales:
Objetivo 1. Búsqueda y caracterización de virus emergentes en vectores y/o reservorios. Se lleva a cabo mediante herramientas moleculares incluyendo las nuevas estrategias de NGS, de virus emergentes en vectores y reservorios. De los virus detectados se realiza una caracterización molecular y serológica, llevando a cabo estudios de epidemiología molecular y de relaciones genéticas y antigénicas con virus relacionados.
Objetivo 2. Desarrollo metodológico para detección, identificación y caracterización de virus emergentes. Los métodos desarrollados pueden transferirse al SNS, explotarse comercialmente y/o utilizarse en la Cartera de Servicios del CNM. Estos desarrollos moleculares, y/o serológicos, refuerzan al CNM en su papel como Laboratorio Nacional de Referencia de Zoonosis, con un aporte de herramientas útiles y necesarias para la detección y caracterización de estos agentes. De igual forma, el desarrollo de herramientas tipo flujo lateral, las denominadas “Point Of Care” es una de las necesidades que pretendemos dar solución.
Objetivo 3. Eco-epidemiología de viriasis emergentes. Debido a los complejos ciclos biológicos de los arbovirus, el estudio de las especies de vectores implicados en nuestro país, así como el origen y evolución de los agentes circulantes, es crucial a la hora de entenderlos y responder a las amenazas que generan. Para ello estudiamos la presencia de estos virus tanto en muestras humanas como de vectores y posibles hospedadores, lo que nos permite, con un enfoque de “Una Salud”, entender los mecanismos que controlan su circulación y que puedan estar implicados en su patogenicidad.
Research projects
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Concesión del Proyecto de la Convocatoria 2019 de RETOS-COLABORACIÓN: Desarrollo de kits diagnósticos mediante PCR multiplex en tiempo real en formato líquido y gelificado para la detección de enfermedades víricas y sepsis. RTC2019-007023-1 / MPY 292/20. IPs: Inmaculada Casas y Giovanni Fedele. 2020-2023. 442.653 €. Investigadoras colaboradoras: Mª Paz Sánchez-Seco, Ana Vázquez, Anabel Negredo.
Título del Proyecto: VIRUS DE LA FIEBRE HEMORRÁGICA DE CRIMEA-CONGO EN ESPAÑA: PAPEL DE LAS AVES MIGRATORIAS Y GARRAPATAS EN LA DIVERSIDAD VIRAL Y SUS EFECTOS EN LAS PRESENTACIONES CLÍNICAS EN EL HOMBRE
Entidad financiadora: ISCIII. Expediente: PI21CIII/0001 Centro: CNM
Duración desde: 01/01/2022 hasta: 31/12/2024
Investigador principal: Mª Paz Sánchez-Seco Financiación: 171.190,84 €
Título del Proyecto: Development of New Technologies to Track Emerging Infectious Threats in Wildlife and the Environment (NEXTHREAT)
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Convocatoria Proyectos de I+D+i en líneas estratégicas, en colaboración público-privada 2021. Expediente: Proyecto PLEC2021-007968 financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/ PRTR. Centro: ISCIII
Duración desde: 20/12/2021 hasta: 30/09/2025
Investigador principal: Ana Vázquez Financiación: 301.191 €
Título del Proyecto: Measuring the real impact of West Nile virus infection in Spain
Entidad financiadora: Convocatoria Intramural de Proyectos de Investigación 2022 pertenecientes a CIBERESP. Expediente: ESP22PI05/2022 Centro: ISCIII
Duración desde: 01/05/2022 hasta: 01/05/2024
Investigador principal: Ana Vázquez Financiación: 48.000 €
Título del Proyecto: Microsoft Premonition
Entidad financiadora: ISCIII. Expediente: MPY241-22 Centro: ISCIII
Duración desde: 01/07/2022 hasta: 30/06/2024
Investigador principal: Ana Vázquez Financiación: 160.000 €
Título del Proyecto: CIBER (Centro de Investigación Biomédica En Red) de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC). CB21/13/00110.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III. Centro: CNM, ISCIII
Duración desde: 01/01/2022 hasta:
Investigador principal: Mª Paz Sánchez-Seco Financiación: 60.000 €/año
Título del Proyecto: Acción Estratégica Monkeypox
Entidad financiadora: CIBER (Centro de Investigación Biomédica En Red) de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC). Instituto de Salud Carlos III. Centro: Multicéntrico
Duración desde: 01/09/2022 hasta: 15/04/2023
Investigador principal: Mª Paz Sánchez-Seco Financiación: 214.000 €
Título del Proyecto: INVESTIGACION Y VIGILANCIA INTEGRADA DE LOS ARBOVIRUS EMERGENTES WEST NILE, TOSCANA Y DENGUE EN ALGUNAS ZONAS DE ESPAÑA
Entidad financiadora: ISCIII Expediente: PI19CIII/00014 Centro: ISCIII
Duración desde: 01/01/2020 hasta: 01/01/2022
Investigador principal: Ana Vázquez Financiación: 122.000 €
Título del Proyecto: RED TEMÁTICA DE INVESTIGACIÓN COOPERATIVA EN ENFERMEDADES TROPICALES
Entidad financiadora: ISCIII Expediente: RD16CIII/0003/0003. Centro: ISCIII
Duración desde: 2017 hasta: 2021
Investigador principal: Mª Paz Sánchez-Seco Financiación: 195.000 €
Título del Proyecto: INVESTIGACIÓN APLICADA AL DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO DE LOS VIRUS ZIKA, DENGUE Y CHIKUNGUNYA
Entidad financiadora: ISCIII Expediente: PI16CIII/00037 Centro: ISCIII
Duración desde: 01/01/2017 hasta: 31/12/2020 (Incluida prórroga de un año)
Investigador principal: Mª Paz Sánchez-Seco Financiación: 145.000 €
Título del Proyecto: SHARP: Strengthened International HeAlth Regulations and Preparedness in the EU
Entidad financiadora: UE Centro: ISCIII
Duración desde: 01/10/2019 hasta: 01/10/2020
Investigador principal: Mª Paz Sánchez-Seco Financiación: 22.000 €
Publications
Vaccination with LytA, LytC, or Pce of Streptococcus pneumoniae Protects against Sepsis by Inducing IgGs That Activate the Complement System
Corsini B, Aguinagalde L, Ruiz S, Domenech M, Yuste J. Vaccination with LytA, LytC, or Pce of Streptococcus pneumoniae Protects against Sepsis by Inducing IgGs That Activate the Complement System. Vaccines. 2021 Feb 23;9(2):186.
PUBMED DOIAn increase in negative supercoiling in bacteria reveals topology-reacting gene clusters and a homeostatic response mediated by the DNA topoisomerase I gene
Ferrándiz MJ, Martín-Galiano AJ, Arnanz C, Camacho-Soguero I, Tirado-Vélez JM, de la Campa AG. 2016. Nucl Acids Res. 44:7292-7303 (2016).
PUBMED DOITyrosine kinase 2 modulates splenic B cells through type I IFN and TLR7 signaling.
Bodega-Mayor I, Delgado-Wicke P, Arrabal A, Alegría-Carrasco E, Nicolao-Gómez A, Jaén-Castaño M, Espadas C, Dopazo A, Martín-Gayo E, Gaspar ML, de Andrés B, Fernández-Ruiz E. Cell Mol Life Sci. 2024 Apr 29;81(1):199.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
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Horacio Gil Gil
Research Scientist
ORCID code: 0000-0002-7114-6686
Degree in Veterinary Medicine in 1995 and PhD in Veterinary Medicine in 2002 from the University of Zaragoza. He did his PhD thesis at NEIKER Tecknalia (Derio, Vizcaya) and the National Center for Microbiology of Instituto de Salud Carlos III (CNM-ISCIII, Majadahonda, Madrid) on the biological cycle of Lyme disease in the Basque Country. After that, he developed his postdoctoral training in different aspects of the pathogenesis of tularemia at the Center for Infectious Diseases, Stony Brook University, New York (USA) for 3 years. In December 2005, he joined the Reference and Research Laboratory in Special Pathogens of the CNM-ISCIII where he developed diagnostic, reference and research activities, in Bartonella, Leptospira and pathogens of interest in bioterrorism. Between 2014-2016 he participated in the European Program for the Training of Microbiologists in Public Health (EUPHEM), organized by the European Centre for Disease Prevention and Control. During this program, he participated in an international mission for the investigation of a cholera outbreak in Ghana, proposed by the Bernhard Nocht Institute for Tropical Diseases in Hamburg (Germany). In December 2016, he worked as a laboratory consultant for the World Health Organization at their office in Phnom Penh (Cambodia). Subsequently, he worked one year with Médecins Sans Frontières as director and quality manager of the TB laboratory in Nukus (Uzbekistan).
In 2019, he joined the HIV Variability and Biology Unit at CNM-ISCIII, where he developed different reference and research activities, including his contribution to the molecular epidemiological surveillance of HIV-1 in Spain and the study of HIV-1 antiretroviral resistance. Since September 2022 he has been leading the Human Papillomavirus Unit at the CNM-ISCIII. -
Alicia Inés García Señán
Predoctoral Student UNED
Degree in Pharmacy in 2013 from the Complutense University of Madrid. She completed specialized health training in Microbiology and Parasitology at the Complejo Asistencial Universitario de Salamanca (2014-2018). During this period he studied a master's degree in Tropical Diseases at the University of Salamanca (2016). She has developed her professional activity as a clinical microbiologist at the Hospital de Santa Bárbara (Soria) (2018), Hospital Universitario Vall d'Hebrón (Barcelona) (2019-2022), and Hospital Central de la Defensa (Gómez Ulla) C.S.V.E, since 2022. In September 2024 she has started PhD studies at the Human Papillomavirus Unit of the CNM-ISCIII.
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Manuela Rodríguez Vargas
Técnico de Laboratorio
List of staff
Additional Information
The research objectives focus on the areas of Bacterial Taxonomy and Microbiology in Public Health:
- Identification of pathogenic bacteria that are difficult to assign taxonomically
- Description of new species
- Study of bacterial population biology through typing
- Epidemiology of antimicrobial resistance and virulence factors for certain bacterial pathogens in different nosocomial/community settings.
These objectives are addressed from the perspective of polyphasic taxonomy (phenotypic and genotypic taxonomy) through the study of targets for genus/species assignment and phylogenetic analyses. The analysis of the virulome and resistome of certain species is approached from the perspective of complete genome sequencing.
Research on invasive infection by Streptococcus pyogenes and other beta-hemolytic streptococci has been carried out since 1994, through the Surveillance Program of the National Center for Microbiology. The typing of invasive S. pyogenes strains circulating in Spain includes determination of: serotype (emm-type); the genetic profile of streptococcal pyrogenic exotoxins; the antimicrobial resistance phenotype; and the genotypes of epidemiologically related strains and/or outbreaks.
The research objectives focus on the areas of Bacterial Taxonomy and Microbiology in Public Health:
- Identification of pathogenic bacteria that are difficult to assign taxonomically
- Description of new species
- Study of bacterial population biology through typing
- Epidemiology of antimicrobial resistance and virulence factors for certain bacterial pathogens in different nosocomial/community settings.
These objectives are addressed from the perspective of polyphasic taxonomy (phenotypic and genotypic taxonomy) through the study of targets for genus/species assignment and phylogenetic analyses. The analysis of the virulome and resistome of certain species is approached from the perspective of complete genome sequencing.
Research on invasive infection by Streptococcus pyogenes and other beta-hemolytic streptococci has been carried out since 1994, through the Surveillance Program of the National Center for Microbiology. The typing of invasive S. pyogenes strains circulating in Spain includes determination of: serotype (emm-type); the genetic profile of streptococcal pyrogenic exotoxins; the antimicrobial resistance phenotype; and the genotypes of epidemiologically related strains and/or outbreaks.