Immune Pathogenesis and Viral Reservoir
Research Lines
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Legionella
Desde su creación hasta la actualidad, La Unidad de Legionella tiene como principal función dar apoyo científico-técnico a la Administración General del Estado, a las Comunidades Autónomas y al Sistema Nacional de Salud en el campo de la prevención y control de la legionelosis, así como llevar a cabo investigaciones científicas en el contexto de la legionelosis. Además, la Unidad de Legionella también actúa como Laboratorio de Referencia de España frente al European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), siendo miembro de la red europea de vigilancia de la legionelosis, “European Legionnaires’ Disease Surveillance Network (ELDSNet). Finalmente, la unidad también realiza una actividad docente, participando en cursos de formación especializada, así como en Máster Universitarios.
Principales líneas de investigación
Vigilancia microbiológica
Búsqueda de marcadores moleculares con capacidad de predecir el riesgo de una instalación de provocar legionelosis. Factores de virulencia de Legionella spp.
Estudio de la capacidad formadora de biofilms de Legionella spp. Colonización y dispersión.
Búsqueda de marcadores fenotípicos capaces de discriminar especies del Género Legionella; grupos y subgrupos de Legionella pneumophila.
Diferentes estructuras de biofilms en función de la cepa formadora de Legionella pneumophila. En verde la biomasa bacteriana, en rojo el exopolisacárido de la matriz extracelular.
Apoyo al Sistema Nacional de Salud de la Unidad de Legionella
La Unidad de Legionella tambien desarrolla actividades con el fin de proporcionar asistencia al sistema nacional de salud a traves de la oferta disponible en la cartera de servicios del CNM, así como a través de programas de vigilancia microbiológica.
Research projects
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1: Título del proyecto: Búsqueda de biomarcadores de patogenicidad en Legionella spp con interés predictivo de riesgo de infección.
Investigador principal: Fernando González Camacho
Entidad financiadora: ISCIII (AESI). Referencia: MPY 341/22
Periodo: 01/01/2023 - 31/12/2025
Publications
Immunogenicity of a third dose with mRNA-vaccines in the ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination regimen against SARS-CoV-2 variants.
García-Pérez J, Borobia AM, Pérez-Olmeda M, Portolés A, Castaño L, Campins-Artí M, Bertrán MJ, Bermejo M, Arribas JR, López A, Ascaso-Del-Rio A, Arana-Arri E, Fuentes Camps I, Vilella A, Cascajero A, García-Morales MT, Castillo de la Osa M, Pérez Ingidua C, Lora D, Jiménez-Santana P, Pino-Rosa S, Gómez de la Cámara A, De La Torre-Tarazona E, Calonge E, Cruces R, Belda-Iniesta C, Alcamí J, Frías J, Carcas AJ, Díez-Fuertes F. iScience. 2024; 27(9):110728
PUBMED DOILonger intervals between SARS-CoV-2 infection and mRNA-1273 doses improve the neutralization of different variants of concern
García-Pérez J, Bermejo M, Ramírez-García A, De La Torre-Tarazona HE, Cascajero A, Castillo de la Osa M, Jiménez P, Aparicio Gómez M, Calonge E, Sancho-López A, Payares-Herrera C, Layunta Acero R, Vicente-Izquierdo L, Avendaño-Solá C, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, Díez-Fuertes F. J Med Virol. 2023; 95(3):e28679
PUBMED DOIImmune response and reactogenicity after immunization with two-doses of an experimental COVID-19 vaccine (CVnCOV) followed by a third-fourth shot with a standard mRNA vaccine (BNT162b2): RescueVacs multicenter cohort study
Ascaso-Del-Rio A, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Arana-Arri E, Vergara I, Pérez-Ingidua C, Bermejo M, Castillo de la Osa M, Imaz-Ayo N, Riaño Fernández I, Astasio González O, Díez-Fuertes F, Meijide S, Arrizabalaga J, Hernández Gutiérrez L, de la Torre-Tarazona HE, Mariano Lázaro A, Vargas-Castrillón E, Alcamí J, Portolés A; RescueVac study Group. EClinicalMedicine. 2022; 51:101542
PUBMED DOIImmunogenic dynamics and SARS-CoV-2 variant neutralisation of the heterologous ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination: Secondary analysis of the randomised CombiVacS study
García-Pérez J, González-Pérez M, Castillo de la Osa M, Borobia AM, Castaño L, Bertrán MJ, Campins M, Portolés A, Lora D, Bermejo M, Conde P, Hernández-Gutierrez L, Carcas A, Arana-Arri E, Tortajada M, Fuentes I, Ascaso A, García-Morales MT, Erick de la Torre-Tarazona H, Arribas JR, Imaz-Ayo N, Mellado-Pau E, Agustí A, Pérez-Ingidua C, Gómez de la Cámara A, Ochando J, Belda-Iniesta C, Frías J, Alcamí J, Pérez-Olmeda M; CombiVacS study Group. EClinicalMedicine. 2022; 50:101529
PUBMED DOITranscriptomic Evidence of the Immune Response Activation in Individuals With Limb Girdle Muscular Dystrophy Dominant 2 (LGMDD2) Contributes to Resistance to HIV-1 Infection
Diez-Fuertes F, López-Huertas MR, García-Pérez J, Calonge E, Bermejo M, Mateos E, Martí P, Muelas N, Vílchez JJ, Coiras M, Alcamí J, Rodríguez-Mora S. Front Cell Dev Biol. 2022; 10:839813
PUBMED DOIImmunogenicity and reactogenicity of BNT162b2 booster in ChAdOx1-S-primed participants (CombiVacS): a multicentre, open-label, randomised, controlled, phase 2 trial
Borobia AM, Carcas AJ, Pérez-Olmeda M, Castaño L, Bertran MJ, García-Pérez J, Campins M, Portolés A, González-Pérez M, García Morales MT, Arana-Arri E, Aldea M, Díez-Fuertes F, Fuentes I, Ascaso A, Lora D, Imaz-Ayo N, Barón-Mira LE, Agustí A, Pérez-Ingidua C, Gómez de la Cámara A, Arribas JR, Ochando J, Alcamí J, Belda-Iniesta C, Frías J; CombiVacS Study Group. Lancet. 2021; 398(10295):121-130
PUBMED DOIBroth microdilution protocol for determining antimicrobial susceptibility of Legionella pneumophila to clinically relevant antimicrobials
Sewell M, Farley C, Portal EAR, Lindsay D, Ricci ML, Jarraud S, Scaturro M, Descours G, Krøvel AV, Barton R, Boostom I, Ure R, Kese D, Gaia V, Golob M, Paukner S, Ginevra C, Afshar B, Nadarajah S, Wybo I, Michel C, Echahdi F, González-Rubio JM, González-Camacho F, Mentasti M, Flountzi AS, Petzold M, Moran-Gilad J, Uldum S, Winchell J, Wooton M, Bernard K, Jones LC, Chalker VJ, Spiller OB. J Microbiol Methods. 2025 Jan;228:107071.
PUBMED DOIEpidemiology, molecular characterisation and antimicrobial susceptibility of Neisseria gonorrhoeae isolates in Madrid, Spain, in 2016
María D. Guerrero-Torres, María B. Menéndez, Carmen S. Guerras, Estela Tello, Juan Ballesteros, Petunia Clavo, Teresa Puerta, Mar Vera, Oskar Ayerdi, Juan C. Carrio, Inmaculada Monzo, Jorge del Romero, Julio A. Vázquez, Raquel Abad. 20. María D. Guerrero-Torres, María B. Menéndez, Carmen S. Guerras, Estela Tello, Juan Ballesteros, Petunia Clavo, Teresa Puerta, Mar Vera, Oskar Ayerdi, Juan C. Carrio, Inmaculada Monzo, Jorge del Romero, Julio A. Vázquez, Raquel Abad. Epidemiol Infect. 2019 Sep 24;147:e274
PUBMED DOIThe global meningitis genome partnership
Rodgers E, Bentley SD, Borrow R, Bratcher HB, Brisse S, Brueggemann AB, Caugant DA, Findlow J, Fox L, Glennie L, Harrison LH, Harrison OB, Heyderman RS, van Rensburg MJ, Jolley KA, Kwambana-Adams B, Ladhani S, LaForce M, Levin M, Lucidarme J, MacAlasdair N, Maclennan J, Maiden MCJ, Maynard-Smith L, Muzzi A, Oster P, Rodrigues CMC, Ronveaux O, Serino L, Smith V, van der Ende A, Vázquez J, Wang X, Yezli S, Stuart JM. J Infect. 2020; 81(4): 510-520
PUBMED DOIThe importance of microbiology reference laboratories and adequate funding for infectious disease surveillance
Shaw D, Torreblanca RA, Amin-Chowdhury Z, Bautista A, Bennett D, Broughton K, Casanova C, Choi EH, Claus H, Corcoran M, Cottrell S, Cunney R, Cuypers L, Dalby T, Davies H, de Gouveia L, Deghmane AE, Desmet S, Domenech M, Drew R, Plessis MD, Duarte C, Fuursted K, Golden A, Almeida SCG, Henares D, Henriques-Normark B, Hilty M, Hoffmann S, Humphreys H, Jacobsson S, Johnson C, Jolley KA, Kawabata A, Kozakova J, Kristinsson KG, Krizova P, Kuch A, Ladhani S, Lâm TT, Ayala MEL, Lindholm L, Litt D, Maiden MCJ, Martin I, Martiny D, Mattheus W, McCarthy ND, Meehan M, Meiring S, Mölling P, Morfeldt E, Morgan J, Mulhall R, Muñoz-Almagro C, Murdoch D, Musilek M, Novakova L, Oftadeh S, Perez-Arguello A, Pérez-Vázquez MD, Perrin M, Prevost B, Roberts M, Rokney A, Ron M, Sanabria OM, Scott KJ, Sempere J, Siira L, de Lemos APS, Sintchenko V, Skoczyńska A, Slotved HC, Smith AJ, Taha MK, Toropainen M, Tzanakaki G, Vainio A, van der Linden MPG, van Sorge NM, Varon E, Moreno JV, Vohrnova S, von Gottberg A, Yuste J, Brueggemann AB. Lancet Digit Health. 2025 Apr;7(4):e275-e281.
PUBMED DOIAntimicrobial resistance and epidemiological aspects of Neisseria gonorrhoeae in the province of Lleida, Spain (2017-2024).
Cumplido A, Aramburu J, Font M, Montes M, Abad R, López E, Bernet A, Mormeneo S, Prats I, García M, Sánchez E, Bellés A. Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2025 Mar;43(3):156-161.
PUBMED DOIExploring the sequence diversity and surface expression of Factor H-Binding Protein among invasive serogroup B meningococcal strains from selected European countries
Clark SA, Willerton L, Claus H, Carannante A, Stefanelli P, Abad R, Vázquez JA, Borrow R. Hum Vaccin Immunother. 2024 Dec 31;20(1):2427471
PUBMED DOIResultado falso negativo en diversas PCR multiplex y monoplex en un episodio de bacteriemia por Neisseria meningitidis. Implicaciones diagnósticas, terapéuticas y epidemiológicas [False negative result in both multiplex and monoplex PCR in a case of Neisseria meningitidis bacteremia. Diagnostic, therapeutic and epidemiological implications]
Monforte ML, Cebollada R, Escobar MJ, Abad R, Aspiroz C. Rev Esp Quimioter. 2024 Oct;37(5):427-428
PUBMED DOIGlobal Meningococcal Initiative: Insights on antibiotic resistance, control strategies and advocacy efforts in Western Europe
Borrow R, Campbell H, Caugant DA, Cherkaoui A, Claus H, Deghmane AE, Dinleyici EC, Harrison LH, Hausdorff WP, Bajanca-Lavado P, Levy C, Mattheus W, Mikula-Pratschke C, Mölling P, Sáfadi MA, Smith V, van Sorge NM, Stefanelli P, Taha MK, Toropainen M, Tzanakaki G, Vázquez J. . J Infect. 2024; 89(6): 106335
PUBMED DOIMeningococcal disease in the Middle East: A report from the Global Meningococcal Initiative
Al-Abri SS, Abuhasan MY, Albayat SSA, Bai X, Bastaki H, Borrow R, Caugant DA, Dbaibo G, Deghmane AE, Dinleyici EC, Ghuneim N, Sheek-Hussein M, Lucidarme J, Leng S, Koliou MG, Sáfadi MAP, Salman JA, Al-Sanouri T, Smith V, Taha MK, Vázquez J, Wright C, Yezli S. J Infect. 2024; 88(2):71-76.
PUBMED DOIAntimicrobial-resistant Neisseria gonorrhoeae in Europe in 2020 compared with in 2013 and 2018: a retrospective genomic surveillance study.
Golparian D, Cole MJ, Sánchez-Busó L, Day M, Jacobsson S, Uthayakumaran T, Abad R, Bercot B, Caugant DA, Heuer D, Jansen K, Pleininger S, Stefanelli P, Aanensen DM, Bluemel B, Unemo M; Euro-GASP study group. Lancet Microbe. 2024 May;5(5):e478-e488.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
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Almudena Cascajero Díaz
Técnico de laboratorio
ORCID code: 0000-0002-9654-3100
Técnico Superior de Actividades Técnicas y Profesionales (Unidades de Inmunopatología del SIDA y Legionella, Centro Nacional de Microbiología). Clinical Diagnostic Laboratory Technician by IES Renacimiento de Madrid.
Experience in cloning techniques and characterization of neutralizing antibodies and participation in different projects on the pathogenesis of HIV by studying the viral envelope and the mechanisms of resistance to antiretroviral drugs. This experience has subsequently allowed me to participate in 5 multicenter clinical studies studying the immune response against different variants of SARS-CoV-2.
Since 2021, I also participate as a laboratory technician in the Legionella Unit as a support to the Spanish National Health System through the microbiological surveillance of the disease to contribute to the prevention and control of legionellosis.
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Laura del Estal Gómez
Ayudante de investigación
ORCID code: 0009-0000-2773-8986
Graduada en Biología Sanitaria por la Universidad de Alcalá. Máster Universitario en Microbiología Aplicada a la Salud Pública e Investigación en Enfermedades Infecciosas.
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Caroline Stephanie Crisóstomo Vergara
Técnico de Laboratorio
ORCID code: 0009-0008-0525-1737
Técnico de Laboratorio. Técnico superior de Laboratorio Clínico y Biomédico por la Escuela Técnica de Enseñanzas Especializadas de Madrid. Máster en Microbiología Clínica por el Instituto Europeo de Química, Física y Biología de Madrid.
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Fernando González Camacho
Científico Titular
ORCID code: 0000-0003-3175-9004
Licenciado en Ciencias Biológicas por la Universidad de Salamanca y Doctor por la Universidad Autónoma de Madrid. Actualmente, es Científico Titular de plantilla en el Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII). Responsable de la Unidad de Legionella del Laboratorio de Referencia e Investigación en Enfermedades Bacterianas transmitidas por agua y alimentos.
A nivel europeo es sustituto (Alternate) al National Focal Point para la enfermedad del legionario en el ECDC y es OCP (Operational Contact Point) en microbiología para la legionelosis en la European Legionnaires' Disease Surveillance Network (ELDSNet).
Coordina las líneas de investigación del laboratorio que se desarrollan en tres perspectivas diferentes: en las instalaciones colonizadas, estudios sobre la resistencia a los tratamientos y su persistencia; en la clínica, sobre factores de virulencia y su interacción con el sistema inmune; y en la vigilancia microbiológica, sobre la mejorar de los métodos de caracterización del microorganismo.
Es Investigador Principal en el proyecto “Búsqueda de biomarcadores de patogenicidad en Legionella spp con interés predictivo de riesgo de infección".
Es miembro de distintas sociedades científicas como son la Sociedad Española de Salud Ambiental (SESA), Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC) y la European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID).
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Juana María González Rubio
Científica Titular
ORCID code: 0000-0001-6979-2964
La Dra. Juana María González Rubio es Licenciada en Bioquímica por la Universidad de Salamanca y Doctora por la Facultad de Medicina de la Universidad Autónoma de Madrid. Actualmente, es Científico Titular de plantilla en el Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), donde trabaja en la Unidad de Legionella del Laboratorio de Referencia e Investigación en Enfermedades Bacterianas transmitidas por agua y alimentos.
Dentro del laboratorio, realiza las actividades propias del Programa de Vigilancia Microbiológica de Legionella, y lleva las líneas de investigación del laboratorio sobre la caracterización de biofilms y la puesta a punto de nuevas técnicas para la caracterización de Legionella. También forma parte del equipo investigador del proyecto “Búsqueda de marcadores de patogenicidad para el análisis de riesgos en las instalaciones".
Anteriormente, ha trabajado en la Unidad de Biomonitorización humana del Centro Nacional de Sanidad Ambiental (ISCIII) participando en diferentes proyectos de investigación relacionados con la Sanidad Ambiental, siendo el último más destacado el proyecto “HBM4EU" en el que ha trabajado hasta junio de 2023.
List of staff
Additional Information
Contact Information
María Teresa Coiras
918223782
mcoiras@isciii.es
generic email: pirv.isciii@gmail.com
Scientific Societies
• Spanis Society for Infectious Diseases and Clinical Microbiology (SEIMC).
• AIDS Study Group (GeSIDA) of SEIMC.
• PIRV is member of the Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC, group CB21/13/00015).
Other links
You can follow the activity of our group in Twitter (X), Instagram and Linkedin.
Collaboration in other projects
Project Title: Rectal microbiota as a factor associated with vulnerability to repeated sexually transmitted infections. Microsex Studio
Principal investigators: Vicente Estrada Pérez (San Carlos Clinical Hospital)
Financing agency: Strategic Action in Health (AES) 2023
Participating entities: San Carlos Clinical Hospital, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026. Contract/project file: PI23/01545
Project title: Prospective, observational, longitudinal, multicenter study to evaluate clinical efficacy, safety and immunogenicity developed in individuals with Philadelphia-negative Chronic Myeloproliferative Neoplasms treated with JAK inhibitors after receiving full vaccination with Adjuvanted Herpes Zoster Subunit vaccine (Shingrix)
Principal investigators: Valentín García Gutiérrez (Hospital Univ Ramón y Cajal)
Funding agency: GSK Glaxo Smithkline
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024 – 12/31/2024
Project title: Infection in Solid Organ Transplant recipients: correlation with immune function. Identification of predictive biomarkers and feasibility evaluation with CD45RAneg cell therapy
Principal investigators: Alejandro Luna de Abia, Jesús Fortún (Univ Ramón y Cajal Hospital)
Financing agency: Strategic Health Action (AES) 2023
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026
Contract/project file: PI23/01924
Project title: Evaluation of the levels of the System associated with BLyS in patients with post-infectious syndromes and dysautonomic alterations of the heart rhythm
Principal researcher: Pablo Guisado
Funding agency: Spanish Society of Internal Medicine SEMI.
Participating entities: ISCIII, Quironsalud Research Institute for Research and Innovation
Duration 2023-2025
Project title: HIV Open Science (dissemination project)
Principal researcher: Eva Poveda
Financing agency: Spanish Foundation for Science and Technology (FECYT), Call for aid for the Promotion of Scientific, Technological and Innovation Culture.
Participating entities: ISCIII, Fundación Biomédica Galicia Sur, IrsiCaixa, Hospital Vall d’Hebron, Hospital de la Princesa, Fundación Imagina Más, Institute of Biomedicine of Seville (IBIS), Case Western Reserve University (Cleveland, Ohio)
Duration 2023-2024
Contract/project file: 17715
Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV (Annual renewal).
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2023 – 04/01/2024
Contract/project file: 1,013,006
Project title: Clinical and microbiological impact of the monkeypox virus outbreak in patients in Spain (2022): multicenter project MONKPOX-ESP22, Work package 4, virological research.
Principal researcher: Anabel Negredo (WP4 coordinator); Maria Paz Sánchez Seco (general coordinator)
Financing agency: CIBERINFEC/CIBERESP ISCIII Strategic Action.
Participating entities: ISCIII
Duration July 2022 - May 2023
Contract/project file: MONKPOX-ESP22
Project title: Biomarkers and underlying immunopathological mechanisms of post COVID-19 condition.
Principal investigator: Gemma Moncunill Piñas (IP); Marta Massanella (coIP); María Teresa Coiras López (co-PI)
Financing agency: CIBERINFEC Strategic Action.
Participating entities: ISCIII, IS-Global, IrsiCaixa
Duration 07/28/2022-07/29/2024
Contract/project file: IM22/INF/5
Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV.
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2022 – 04/01/2023
Contract/project file: 1,013,006
Project title: Characterization of the immune response developed after vaccination with COVID-19 in patients with hematological malignancies.
Principal researcher: Valentín García Gutiérrez
Funding agency: Ministry of Science and Innovation, PI21 - Health research projects (AES 2021). Health research project modality.
Participating entities: ISCIII, Ramón y Cajal University Hospital
Duration 01/01/2022 – 12/31/2024
Contract/project file: PI21_00877
Contact Information
María Teresa Coiras
918223782
mcoiras@isciii.es
generic email: pirv.isciii@gmail.com
Scientific Societies
• Spanis Society for Infectious Diseases and Clinical Microbiology (SEIMC).
• AIDS Study Group (GeSIDA) of SEIMC.
• PIRV is member of the Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC, group CB21/13/00015).
Other links
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Collaboration in other projects
Project Title: Rectal microbiota as a factor associated with vulnerability to repeated sexually transmitted infections. Microsex Studio
Principal investigators: Vicente Estrada Pérez (San Carlos Clinical Hospital)
Financing agency: Strategic Action in Health (AES) 2023
Participating entities: San Carlos Clinical Hospital, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026. Contract/project file: PI23/01545
Project title: Prospective, observational, longitudinal, multicenter study to evaluate clinical efficacy, safety and immunogenicity developed in individuals with Philadelphia-negative Chronic Myeloproliferative Neoplasms treated with JAK inhibitors after receiving full vaccination with Adjuvanted Herpes Zoster Subunit vaccine (Shingrix)
Principal investigators: Valentín García Gutiérrez (Hospital Univ Ramón y Cajal)
Funding agency: GSK Glaxo Smithkline
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024 – 12/31/2024
Project title: Infection in Solid Organ Transplant recipients: correlation with immune function. Identification of predictive biomarkers and feasibility evaluation with CD45RAneg cell therapy
Principal investigators: Alejandro Luna de Abia, Jesús Fortún (Univ Ramón y Cajal Hospital)
Financing agency: Strategic Health Action (AES) 2023
Participating entities: IRYCIS, ISCIII
Duration: 01/01/2024-12/31/2026
Contract/project file: PI23/01924
Project title: Evaluation of the levels of the System associated with BLyS in patients with post-infectious syndromes and dysautonomic alterations of the heart rhythm
Principal researcher: Pablo Guisado
Funding agency: Spanish Society of Internal Medicine SEMI.
Participating entities: ISCIII, Quironsalud Research Institute for Research and Innovation
Duration 2023-2025
Project title: HIV Open Science (dissemination project)
Principal researcher: Eva Poveda
Financing agency: Spanish Foundation for Science and Technology (FECYT), Call for aid for the Promotion of Scientific, Technological and Innovation Culture.
Participating entities: ISCIII, Fundación Biomédica Galicia Sur, IrsiCaixa, Hospital Vall d’Hebron, Hospital de la Princesa, Fundación Imagina Más, Institute of Biomedicine of Seville (IBIS), Case Western Reserve University (Cleveland, Ohio)
Duration 2023-2024
Contract/project file: 17715
Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV (Annual renewal).
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2023 – 04/01/2024
Contract/project file: 1,013,006
Project title: Clinical and microbiological impact of the monkeypox virus outbreak in patients in Spain (2022): multicenter project MONKPOX-ESP22, Work package 4, virological research.
Principal researcher: Anabel Negredo (WP4 coordinator); Maria Paz Sánchez Seco (general coordinator)
Financing agency: CIBERINFEC/CIBERESP ISCIII Strategic Action.
Participating entities: ISCIII
Duration July 2022 - May 2023
Contract/project file: MONKPOX-ESP22
Project title: Biomarkers and underlying immunopathological mechanisms of post COVID-19 condition.
Principal investigator: Gemma Moncunill Piñas (IP); Marta Massanella (coIP); María Teresa Coiras López (co-PI)
Financing agency: CIBERINFEC Strategic Action.
Participating entities: ISCIII, IS-Global, IrsiCaixa
Duration 07/28/2022-07/29/2024
Contract/project file: IM22/INF/5
Project title: Identification of immunological biomarkers associated with the cellular and humoral immune response related to vaccination against SARS-CoV-2 in patients with HIV.
Principal investigator: Rafael Rodríguez Rosado
Funding agency: Alfonso X El Sabio University-Santander Universities. XIII Call for Research Projects.
Participating entities: ISCIII, Severo Ochoa University Hospital
Duration 04/01/2022 – 04/01/2023
Contract/project file: 1,013,006
Project title: Characterization of the immune response developed after vaccination with COVID-19 in patients with hematological malignancies.
Principal researcher: Valentín García Gutiérrez
Funding agency: Ministry of Science and Innovation, PI21 - Health research projects (AES 2021). Health research project modality.
Participating entities: ISCIII, Ramón y Cajal University Hospital
Duration 01/01/2022 – 12/31/2024
Contract/project file: PI21_00877
The current director of CNM is Dr. José Miguel Rubio Muñoz.
Dr. José Miguel Rubio has a degree in Biological Sciences from the Universidad Autónoma de Madrid (1986) and a PhD in Biological Sciences from the same university (1992). He carried out his doctoral thesis at the Department of Genetics of the Universidad Autónoma de Madrid, as Associate Professor (1988-1989), and at the School of Biology of the University of East Anglia in Norwich, UK, as Senior Research Assistant (1989-1992).
During his postdoctoral period he obtained a grant from the European Commission within the Human Capital and Mobility Program to be carried out at the University of “La Sapienza” in Rome, Italy and the Institute of Molecular Biology and Biotechnology in Crete, Greece (1993-1994). Subsequently, he made a further stay funded by the WHO and the university itself at the Department of Entomology, Wageningen University, The Netherlands (1994-1996).
Since 1997 he has been a member of the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), where he joined the Department of Parasitology of the National Center of Microbiology, as an EU-INCO postdoctoral fellow and later with a grant from the Autonomous Community of Madrid (CAM). She was part of the founding group of the National Center for Tropical Medicine (2003-2006) and of the 24/7 Alerts and Emergencies Unit (2006-2018) and is currently Head of the Malaria and Emerging Parasitosis Unit of the National Microbiology Center and is part, as research staff, of the Center for Biomedical Research Network on Infectious Diseases (CIBERINFEC/ISCIII).
During his scientific career he has been Visiting Scientist at the Leonidas e Marie Dean Center (FIOCRUZ-AMAZONAS, Manaus, Brazil) and is an External Consultant of the Parasitology Departments of Cairo University (Egypt) and the Medical Research Center (MRC) of Kuala Lumpur (Malaysia). He also belongs or has belonged to different national and international committees: Member of the expert group for malaria control of the European Centre for Disease Control (ECDC) since 2011; Expert-Evaluator for health programs of the European Commission since 2004; Spanish Representative (commissioned by ISCIII and MSC) in the Technical Scientific Committee of the TDR (WHO) 2007-2008; Spanish Deputy Focal Point for microbiology at the European Centre for Disease Control (ECDC) from 2012 to 2020; and, member of the Research Ethics Committee of ISCIII until 2019.
In this period he has published more than 100 articles in international indexed journals, 10 book chapters and has been co-editor of two books in the area of malaria, tropical medicine and neglected diseases. He has participated in 58 competitively funded research projects, 20 of them international, having been the principal investigator in 8 national and 11 international projects as PI of the project or WP leader. In addition, he has led five agreements with companies. Currently he has been awarded four sexenios of research, being presented this year 2025 to the fifth. In the teaching field, he participates in different postgraduate programs in the areas of microbiology and parasitology, having directed seven doctoral theses and more than 20 Master's or Degree final projects, both nationally and internationally.
El laboratorio de Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos ofrece una amplia cartera de servicios al Sistema Nacional de Salud, las cuales pueden solicitarse en cnm-laboratorios.isciii.es. Jefe del Laboratorio: Jesús Oteo Iglesias (Punto focal Nacional de Resistencia antibiótica).
Dispone de dos programas de Vigilancia oficiales y gratuitos que engloban los ensayos ofertados ya sea como aislamientos individuales o mediante estudio de brotes. El Laboratorio utiliza asimismo técnicas de PCR en tiempo real para la detección de genes de resistencia, estas técnicas se han adaptado a un formato multiplex que permite detectar varios genes en la misma reacción. En los últimos años se han incluido metodologías basadas en la secuenciación de genomas completos para el análisis de bacterias multiresistentes (WGS).
Programa de vigilancia de Haemophilus influenzae. Responsables: María Pérez Vázquez (Punto focal Nacional de Haemophilus influenzae) y Belén Aracil. Laboratorio encargado de la identificación, estudio de sensibilidad y análisis genotípico de aislados de Haemophilus influenzae, centrándose esencialmente en la patología invasiva debida este patógeno.
Programa de vigilancia de Resistencia a Antibióticos. Responsables: María Pérez Vázquez y Belén Aracil (Punto focal Nacional de Resistencia antibiótica). Laboratorio encargado de la identificación, el estudio de sensibilidad antibiótica, y el diagnóstico fenotípico y genotípico de los diferentes mecanismos de resistencia a antibióticos fundamentalmente en enterobacterias y gram-negativos no fermentadores y Enterococcus spp.
Estudio de brotes. Responsables: Belén Aracil y María Pérez Vázquez. El programa incluye la caracterización de brotes nosocomiales y clones emergentes de alto riesgo mediante diferentes técnicas moleculares (tabla resumen). Éstas, nos permiten realizar estudios filogenéticos con el fin de obtener una información detallada acerca la relación entre los diferentes aislados y su trazabilidad. El objetivo final es generar datos que se transfieren a los hospitales como ayuda para la prevención o control de la propagación del brote.
Acreditación y Calidad. Responsable: Belén Aracil. El laboratorio Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos ha sido de los primeros en el ISCIII en la utilización de técnicas acreditadas por la Entidad Nacional de Acreditaciones (ENAC). Este laboratorio consiguió la primera acreditación homologada de técnicas diagnósticas en 2012, programa que ha sido ampliado, de manera que en la actualidad más de la mitad de las técnicas ofrecidas al Sistema Nacional de Salud están debidamente acreditadas por ENAC.
Técnicos responsables de las técnicas realizadas en el Laboratorio: Noelia Lara Fuella y Verónica Bautista Sánchez.
En la siguiente imagen se resumen las técnicas ofrecidas al Sistema Nacional de Salud.
| PROGRAMAS | NOMBRE CARTERA SERVICIO | PATÓGENO | DETERMINACIÓN, DETECCIÓN, ANÁLISIS | MÉTODOS |
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Programa de vigilancia de Haemophilus Programa de vigilancia de resistencia a antibióticos. |
Identificación bacteriana |
Haemophilus sp. Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus spp |
Identificación bacteriana |
Bioquímicos MALDI TOF Secuenciación de RNAr |
| | Identificación capsular |
Haemophilus influenzae
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Identificación capsular fenotípica y genotípica |
Aglutinación serológica en latex PCR ind/multiplex |
| | Determinación de Sensibilidad |
Haemophilus sp. Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus
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Determinación de Sensibilidad |
Microdilución Tiras epsilon Kirby Bauer |
| | Métodos fenotípicos de detección de mecanismos de resistencia |
Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores,
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Métodos fenotípicos de detección de mecanismos de resistencia |
Discos y tabletas combinados con inhibidores Tiras combinadas Test de Hodge modificado CabaNP Inmunocromatografía CBP |
| | Métodos genotípicos de detección de mecanismos de resistencia |
Haemophilus sp. Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus
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ADN, PCR y secuenciación |
PCR ind/multiplex Análisis comparativo de las secuencias |
| | Tipificación molecular/análisis filogenéticos |
Haemophilus sp. Enterobacterias, gram-negativos no fermentadores, Enterococcus
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Corte enzimas de restricción, electroforesis ADN, PCR y secuenciación Preparación de librerías y secuenciación y análisis de genomas completos |
PFGE
MLST
WGS |