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Investigación

Micología

Líneas de investigación

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Serología

​El laboratorio de Arbovirus y Enfermedades Víricas Importadas (AEVI) del CNM desarrolla su trabajo dentro de la línea de investigación “Virus emergentes transmitidos por vector y/o reservorio, de importancia en salud pública”, que se sustenta en las áreas de epidemiología molecular, desarrollo metodológico, detección en vectores y reservorios y, otros aspectos relacionados con estas zoonosis con una aplicación clara hacia la investigación, prevención, preparación, control y respuesta a las amenazas o brotes causados por  estos virus.
Arbovirus como Dengue, Chikungunya o Zika son virus endémicos en todo el cordón tropical/sub-tropical del planeta en continua expansión a latitudes más lejanas debido al calentamiento global y a la dispersión y colonización de nuevos hábitats llevada a cabo por sus vectores artrópodos y son transportados a otras zonas del planeta a través de pacientes virémicos por lo que si, como ocurre en España, se cuenta con vectores transmisores establecidos, se puede propiciar el establecimiento de circulación autóctona. Además de estos virus exóticos, en España circulan endémicamente los arbovirus Toscana, West Nile y el virus de la Fiebre hemorrágica de Crimea-Congo, entre otros.
La OMS elaboró un listado en 2019 con las 10 amenazas para la Salud Global que consideraron más importantes, entre las que se  encuentran los virus Dengue, Ébola y Zika. El principal temor es que la falta de preparación cause una epidemia. Además, algunos de estos virus como Dengue y Chikungunya son considerados también “Enfermedades Tropicales Desatendidas” que ponen en peligro la salud de muchas personas en países empobrecidos sin que se estudien con los recursos necesarios.


La importancia para la salud pública de estos patógenos, y la necesidad de prepararse frente a ellos, se refleja también en la lista de actividades prioritarias de investigación y desarrollo de la OMS que actualmente incluye, entre otros, el Ébola, el virus de la Fiebre Hemorrágica de Crimea Congo, el virus de Zika y la enfermedad por el virus de Nipah,  debido a la amenaza que suponen para la Salud Pública por su potencial epidémico o porque no hay medidas de control suficientes. Además del peligro real que representan en zonas endémicas, algunos de los virus mencionados (Ébola, Zika, West Nile, Crimea-Congo y Dengue) han supuesto, y continúan siendo, una amenaza para nuestro país habiendo producido casos esporádicos o brotes localizados de infección autóctona. El riesgo para España de las enfermedades transmitidas por vectores está aumentando de manera muy clara como se ha podido observar en los últimos años, y la previsión es que siga aumentando.
Todos estos virus son virus zoonóticos emergentes y nuestro grupo de investigación lleva décadas trabajando en diferentes aspectos en relación con estos patógenos. El riesgo de emergencia y expansión de estos virus se basa de sus ciclos complejos de transmisión, por lo que nuestros estudios se basan tanto en el ser humano, como en los reservorios y los vectores que los transmiten. De esta base, parten transversalmente las líneas de actuación que van enfocadas a estudios de epidemiología molecular, desarrollo metodológico, detección de virus en vectores y hospedadores, caracterización de los mismos y estudios de competencia vectorial, con una aplicación dirigida hacia la investigación, prevención y respuesta a las amenazas o brotes causados por estos virus. El trabajo que desarrollamos se articula en torno a 3 objetivos principales:

Objetivo 1. Búsqueda y caracterización de virus emergentes en vectores y/o reservorios. Se lleva a cabo mediante herramientas moleculares incluyendo las nuevas estrategias de NGS, de virus emergentes en vectores y reservorios. De los virus detectados se realiza una caracterización molecular y serológica, llevando a cabo estudios de epidemiología molecular y de relaciones genéticas y antigénicas con virus relacionados.

Objetivo 2. Desarrollo metodológico para detección, identificación y caracterización de virus emergentes. Los métodos desarrollados pueden transferirse al SNS, explotarse comercialmente y/o utilizarse en la Cartera de Servicios del CNM. Estos desarrollos moleculares, y/o serológicos, refuerzan al CNM en su papel como Laboratorio Nacional de Referencia de Zoonosis, con un aporte de herramientas útiles y necesarias para la detección y caracterización de estos agentes. De igual forma, el desarrollo de herramientas tipo flujo lateral, las denominadas “Point Of Care” es una de las necesidades que pretendemos dar solución.

Objetivo 3. Eco-epidemiología de viriasis emergentes.  Debido a los complejos ciclos biológicos de los arbovirus, el estudio de las especies de vectores implicados en nuestro país, así como el origen y evolución de los agentes circulantes, es crucial a la hora de entenderlos y responder a las amenazas que generan. Para ello estudiamos la presencia de estos virus tanto en muestras humanas como de vectores y posibles hospedadores, lo que nos permite, con un enfoque de “Una Salud”, entender los mecanismos que controlan su circulación y que puedan estar implicados en su patogenicidad.

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CD45 expression discriminates waves of embryonic megakaryocytes in the mouse.

Cortegano, I., Serrano, N., Ruiz, C., Rodríguez, M., Prado, C., Alía, M., Hidalgo, A., Cano, E., de Andrés B. and Gaspar, ML. 2018. Haematologica, 104(9):1853-1865

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Hypervirulent Klebsiella pneumoniae: Epidemiology outside Asian countries, antibiotic resistance association, methods of detection and clinical management

12. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae: Epidemiology outside Asian countries, antibiotic resistance association, methods of detection and clinical management. Autores: García-Cobos S, Oteo-Iglesias J, Pérez-Vázquez M. Revista: Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2025 Feb;43(2):102-109.

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Vector-mediated gene transfer engenders long-lived neutralizing activity and protection against SIV infection in monkeys

Johnson PR, Schnepp BC, Zhang J, Connell MJ, Greene SM, Yuste E, Desrosiers RC, Clark KR; Nat Med. 2009 Aug;15(8):901-6

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Listeriosis outbreak caused by contaminated stuffed pork, Andalusia, Spain, July to October 2019

Fernández-Martínez NF, Ruiz-Montero R, Briones E, Baños E, García San Miguel Rodríguez-Alarcón L, Chaves JA, Abad R, Varela C; LISMOAN team; Lorusso N. Euro Surveill . 2022 Oct;27(43):2200279

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Resistance gene pool to co-trimoxazole in non-susceptible Nocardia strains

Valdezate S, Garrido N, Carrasco G, Villalón P, Medina-Pascual MJ, Saéz-Nieto JA. (2015). Resistance gene pool to co-trimoxazole in non-susceptible Nocardia strains. Front Microbiol. 2015 Apr 28;6:376

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A novel typing method for Streptococcus pneumoniae using selected surface proteins

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Podocytes as new cellular targets of hemoglobin toxicity in massive intravascular hemolysis.

Rubio-Navarro A, Sanchez-Niño MD, Guerrero-Hue M, García-Caballero C, Gutiérrez E, Yuste C, Sevillano A, Praga M, Egea J, Román E, Cannata P, Ortega R, Cortegano I, de Andrés B, Gaspar ML, Cadenas S, Ortiz A, Egido J, Moreno JA. Podocytes as new cellular targets of hemoglobin toxicity in massive intravascular hemolysis. 2018. J.Pathol. 244(3):296-310.

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Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae in COVID-19 Intensive Care Patients: Identification of IncL-VIM-1 Plasmid in Previously Non-Predominant Sequence Types.

13. Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae in COVID-19 Intensive Care Patients: Identification of IncL-VIM-1 Plasmid in Previously Non-Predominant Sequence Types. Autores: Cañada-García JE, Ramírez de Arellano E, Jiménez-Orellana M, Viedma E, Sánchez A, Alhambra A, Villa J, Delgado-Iribarren A, Bautista V, Lara N, García-Cobos S, Aracil B, Cercenado E, Pérez-Vázquez M, Oteo-Iglesias J. Revista: Antibiotics (Basel). 2023 Jan 6;12(1):107.

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Identification and characterization of HIV-1 CD8+ T cell escape variants with impaired fitness

Sanchez-Merino V, Farrow MA, Brewster F, Somasundaran M, Luzuriaga K; J Infect Dis. 2008 Jan 15;197(2):300-8

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Pertactin-Deficient Bordetella pertussis with Unusual Mechanism of Pertactin Disruption, Spain, 1986-2018

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Genomic Background and Phylogeny of cfiA-Positive Bacteroides fragilis Strains Resistant to Meropenem-EDTA

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An increase in negative supercoiling in bacteria reveals topology-reacting gene clusters and a homeostatic response mediated by the DNA topoisomerase I gene

Ferrándiz MJ, Martín-Galiano AJ, Arnanz C, Camacho-Soguero I, Tirado-Vélez JM, de la Campa AG. 2016. Nucl Acids Res. 44:7292-7303 (2016).

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14. Emergence of NDM-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in Spain: phylogeny, resistome, virulence and plasmids encoding blaNDM-like genes as determined by WGS. Autores: Pérez-Vázquez M, Sola Campoy PJ, Ortega A, Bautista V, Monzón S, Ruiz-Carrascoso G, Mingorance J, González-Barberá EM, Gimeno C, Aracil B, Sáez D, Lara N, Fernández S, González-López JJ, Campos J, Kingsley RA, Dougan G, Oteo-Iglesias J; Spanish NDM Study Group. Revista: J Antimicrob Chemother. 2019 Dec 1;74(12):3489-3496.

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Glycosylation of gp41 of simian immunodeficiency virus shields epitopes that can be targets for neutralizing antibodies

Yuste E, Bixby J, Lifson J, Sato S, Johnson W, Desrosiers R*. 2008. J Virol 82:12472-86.

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Large Increase in Azithromycin-Resistant Neisseria gonorrhoeae in Northern Spain

Carballo R, Povoa MC, Abad R, Navarro C, Martin E, Alvarez M, Salgado A, Potel C. Microb Drug Resist. 2022 Jan;28(1):81-86

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Epidemiology of the Acinetobacter-derived cephalosporinase, carbapenem-hydrolysing oxacillinase and metallo-beta-lactamase genes, and of common insertion sequences, in epidemic clones of Acinetobacter baumannii from Spain

Villalón P, Valdezate S, Medina-Pascual MJ, Carrasco G, Vindel A, Saez-Nieto JA. Epidemiology of the Acinetobacter-derived cephalosporinase, carbapenem-hydrolysing oxacillinase and metallo-beta-lactamase genes, and of common insertion sequences, in epidemic clones of Acinetobacter baumannii from Spain. J Antimicrob Chemother. 2013;68(3):550-3.

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Reactive oxygen species contribute to the bactericidal effects of the fluoroquinolone moxifloxacin in Streptococcus pneumoniae

Ferrándiz MJ, Martín-Galiano AJ, Arnanz C, Zimmerman T, de la Campa AG. Antimicrob Agents Chemother. 60:409-417 (2016).

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Altered Marginal Zone and innate-like B cells in aged SAMP8 mice with defective IgG1 responses

Cortegano, I., Rodriguez, M., Martin, I., Prado, C., Ruiz, C., Hortigüela, R., Alia, M., Vilar, M., Mira, H., Cano, E., de Andrés, B., and Gaspar, ML. Cell death & disease (2017) 8, e3000

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Rapid cross-border emergence of NDM-5-producing Escherichia coli in the European Union/European Economic Area, 2012 to June 2022

15. Rapid cross-border emergence of NDM-5-producing Escherichia coli in the European Union/European Economic Area, 2012 to June 2022. Autores: Linkevicius M, Bonnin RA, Alm E, Svartström O, Apfalter P, Hartl R, Hasman H, Roer L, Räisänen K, Dortet L, Pfennigwerth N, Hans JB, Tóth Á, Buzgó L, Cormican M, Delappe N, Monaco M, Giufrè M, Hendrickx AP, Samuelsen Ø, Pöntinen AK, Caniça M, Manageiro V, Oteo-Iglesias J, Pérez-Vázquez M, Westmo K, Mäkitalo B, Palm D, Monnet DL, Kohlenberg A. Revista: Euro Surveill. 2023 May;28(19):2300209.

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Simian immunodeficiency virus engrafted with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)-specific epitopes: replication, neutralization, and survey of HIV-1-positive plasma

Yuste E, Sanford HB, Carmody J, Bixby J, Little S, Zwick MB, Greenough T, Burton DR, Richman DD, Desrosiers RC, Johnson WE*. 2006. J Virol 80:3030-41.

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Molecular characterization of invasive serogroup B Neisseria meningitidis isolates from Spain during 2015-2018: Evolution of the vaccine antigen factor H binding protein (FHbp)

Abad R, García-Amil C, Navarro C, Martín E, Martín-Díaz A, Vázquez JA. J Infect. 2021 Apr;82(4):37-44

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The fluoroquinolone levofloxacin triggers the transcriptional activation of iron transport genes that contribute to cell death in Streptococcus pneumoniae.

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The formation of titan cells in Cryptococcus neoformans depends on the mouse strain and correlates with induction of Th2-type responses

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Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae From Transplanted Patients in Brazil: Phylogeny, Resistome, Virulome and Mobile Genetic Elements Harboring blaKPC-2 or blaNDM-1.

16. Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae From Transplanted Patients in Brazil: Phylogeny, Resistome, Virulome and Mobile Genetic Elements Harboring blaKPC-2 or blaNDM-1. Autores: Raro OHF, da Silva RMC, Filho EMR, Sukiennik TCT, Stadnik C, Dias CAG, Oteo Iglesias J, Pérez-Vázquez M. Revista: Front Microbiol. 2020 Jul 15;11:1563.

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Balancing selection and the evolution of functional polymorphism in Old World monkey TRIM5alpha

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High susceptibility to zoliflodacin and conserved target (GyrB) for zoliflodacin among 1209 consecutive clinical Neisseria gonorrhoeae isolates from 25 European countries, 2018.

Unemo M, Ahlstrand J, Sánchez-Busó L, Day M, Aanensen D, Golparian D, Jacobsson S, Cole MJ, Torreblanca RA, Ásmundsdóttir LR, Balla E, De Baetselier I, Bercot B, Carannante A, Caugant D, Borrego MJ, Buder S, Cassar R, Cole M, Dam A, Eder C, Hoffmann S, Hunjak B, Jeverica S, Kirjavainen V, Maikanti-Charalambous P, Miriagou V, Mlynarczyk-Bonikowska B, Pakarna G, Patterson L, Pavlik P, Perrin M, Shepherd J, Stefanelli P, Unemo M, Jelena V, Zákoucká H. J Antimicrob Chemother. 2021 Feb 10:dkab024

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Fluoroquinolone-resistant pneumococci: dynamics of serotypes and clones in Spain in 2012 compared with those from 2002 and 2006

Domenech A, Tirado-Vélez JM, Fenoll A, Ardanuy C, Yuste J, Liñares J, de la Campa AG. Antimicrob Agents Chemother. 58:2393-2399 (2014).

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DNGR-1+ dendritic cells are located in meningeal and choroid plexus membranes of the non-injured brain.

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Dissemination of extensively drug-resistant NDM-producing Providencia stuartii in Europe linked to patients transferred from Ukraine, March 2022 to March 2023

17. Dissemination of extensively drug-resistant NDM-producing Providencia stuartii in Europe linked to patients transferred from Ukraine, March 2022 to March 2023. Autores: Witteveen S, Hans JB, Izdebski R, Hasman H, Samuelsen Ø, Dortet L, Pfeifer Y, Delappe N, Oteo-Iglesias J, Żabicka D, Cormican M, Sandfort M, Reichert F, Pöntinen AK, Fischer MA, Verkaik N, Pérez-Vazquez M, Pfennigwerth N, Hammerum AM, Hallstrøm S, Biedrzycka M, Räisänen K, Wielders CC, Urbanowicz P, de Haan A, Westmo K, Landman F, van der Heide HG, Lansu S, Zwittink RD, Notermans DW, Guzek A, Kondratiuk V, Salmanov A, Haller S, Linkevicius M, Gatermann S, Kohlenberg A, Gniadkowski M, Werner G, Hendrickx AP. Revista: Euro Surveill. 2024 Jun;29(23):2300616.

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Characterization of Carbapenemase-Producing Klebsiella oxytoca in Spain, 2016-2017.

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The global meningitis genome partnership

Rodgers E, Bentley SD, Borrow R, Bratcher HB, Brisse S, Brueggemann AB, Caugant DA, Findlow J, Fox L, Glennie L, Harrison LH, Harrison OB, Heyderman RS, van Rensburg MJ, Jolley KA, Kwambana-Adams B, Ladhani S, LaForce M, Levin M, Lucidarme J, MacAlasdair N, Maclennan J, Maiden MCJ, Maynard-Smith L, Muzzi A, Oster P, Rodrigues CMC, Ronveaux O, Serino L, Smith V, van der Ende A, Vázquez J, Wang X, Yezli S, Stuart JM. J Infect. 2020; 81(4): 510-520

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Spread of the FAR-MRSA clone, a fusidic acid- and meticillin-resistant Staphylococcus aureus ST121, Europe, 2014 to 2024.

19. Spread of the FAR-MRSA clone, a fusidic acid- and meticillin-resistant Staphylococcus aureus ST121, Europe, 2014 to 2024. Autores: Roer L, Yin N, Denis O, Vendrik KE, Zwittink RD, Notermans DW, Perrin M, Khonyongwa K, Tristan A, Youenou B, Layer-Nicolaou F, Werner G, Enger H, Eikrem ECH, Darenberg J, Mäkitalo B, Paulsson M, Björkman J, Fang H, Hallbäck ET, Sundqvist M, Lindholm L, Moganeradj K, García-Cobos S, Cañada-García JE, Holzknecht BJ, Eriksen HB, Hoppe M, Bartels MD, Samaniego Castruita JA, Urth TR, Larsen AR, Petersen A. Revista: Euro Surveill. 2025 Jul;30(28):2500452.

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Modulation of Env content in virions of simian immunodeficiency virus: correlation with cell surface expression and virion infectivity

Yuste E, Reeves JD, Doms RW, Desrosiers RC*. 2004. J Virol 78:6775-85.

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Epidemiology, molecular characterisation and antimicrobial susceptibility of Neisseria gonorrhoeae isolates in Madrid, Spain, in 2016

María D. Guerrero-Torres, María B. Menéndez, Carmen S. Guerras, Estela Tello, Juan Ballesteros, Petunia Clavo, Teresa Puerta, Mar Vera, Oskar Ayerdi, Juan C. Carrio, Inmaculada Monzo, Jorge del Romero, Julio A. Vázquez, Raquel Abad. 20. María D. Guerrero-Torres, María B. Menéndez, Carmen S. Guerras, Estela Tello, Juan Ballesteros, Petunia Clavo, Teresa Puerta, Mar Vera, Oskar Ayerdi, Juan C. Carrio, Inmaculada Monzo, Jorge del Romero, Julio A. Vázquez, Raquel Abad. Epidemiol Infect. 2019 Sep 24;147:e274

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El Laboratorio de Referencia e Investigación en Micología del Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III es el laboratorio de referencia de Micología para toda España. Además, mantiene varias líneas de investigación, entre las que destacan: Identificación de levaduras y hongos filamentosos, estudio de los mecanismos de resistencia de los hongos a los antifúngicos, estandarización de las pruebas de sensibilidad a los antifúngicos de los hongos patógenos, correlación in vivo-in vitro con modelos experimentales y pacientes, epidemiología molecular de la infección fúngica nosocomial, determinación de niveles de antifúngicos y diagnóstico rápido de las micosis invasoras mediante técnicas de diagnóstico rápido como PCR en Tiempo Real. El grupo de Investigadores constituye un equipo multidisciplinar con capacidad de formar y producir conocimiento científico de calidad, en el área de micología médica. Durante los últimos años se han leído 5 tesis doctorales en el departamento y actualmente el laboratorio cuenta con tres becarios pre-doctorales y dos postdoctorales. Además, cada año acogemos 3-5 estudiantes que desarrollan sus proyectos fin de Master o Grado y rotantes de la especialidad de Microbiología Clínica de distinta procedencia Nacional. Todos ellos participan en un programa de formación que comprende sesiones bibliográficas, teóricas y reuniones científicas que les permiten adquirir una formación global de la micología.

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