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Investigación

Viral Infection and Immunity

Líneas de investigación

Content with Investigacion Resistencia a Antibióticos e IRAS .

Resistencia a Antibióticos

Nuestro objetivo general es aportar conocimiento precoz sobre cualquier mecanismo de resistencia a antibióticos emergente en nuestro país. Dicho aporte de conocimiento se fundamenta en unos objetivos transversales clave:

  1) La capacidad de adaptar la investigación a los problemas de resistencia emergentes

  2) La promoción de estudios de investigación cooperativos y multidisciplinares con diferentes centros españoles y extranjeros

  3) La transferencia ágil de los resultados de la investigación a la práctica clínica del Sistema Nacional de Salud

  4) El fomento de la interrelación de la investigación con la referencia, la asesoría, la formación y la divulgación.

Nuestros principales objetivos científicos son la caracterización de las bases moleculares de la resistencia a antibióticos en bacterias patógenas, el estudio de la epidemiología molecular y la estructura poblacional de las bacterias resistentes, la caracterización de los elementos genéticos móviles que portan los genes de resistencia, y el desarrollo de técnicas diagnósticas y alternativas terapéuticas frente a bacterias con resistencia extensa, basado en nuevas tecnologías como la secuenciación de genomas bacterianos. La investigación en las vías de diseminación de enterobacterias, Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa productores de carbapenemasas es uno de nuestros objetivos prioritarios.


Algunas iniciativas en las que participamos son la red europea de vigilancia de la resistencia a antibióticos (EARS-Net), el  sistema de la OMS desarrollado para apoyar el plan de acción mundial sobre la resistencia a los antimicrobianos (GLASS), la red española de investigación en patología infecciosa (REIPI), el Plan nacional contra la resistencia a antibióticos (PRAN), el Comité Coordinador de la red de laboratorios para la vigilancia de microorganismos resistentes, y la coordinación nacional de los proyectos CARBA-ES-2019 (nacional) y CCRE-survey (ECDC).

Líneas de investigación

- Detección y caracterización de mecanismos de resistencia a antibióticos emergentes, sobre todo a antibióticos de última línea como los antibióticos carbapenémicos y la colistina.


- Caracterización y trazabilidad interregional, mediante el análisis de secuencias de genomas completos (WGS), de clones de alto riesgo con múltiple resistencia a antibióticos, y de plásmidos epidémicos portadores de genes de resistencia.


- Identificación mediante recursos bio-informáticos de posibles dianas para el desarrollo de nuevos productos o moléculas relacionadas con el control de la resistencia a antibióticos (vacunas, pruebas diagnósticas, atenuantes de virulencia y otros).


- Análisis de las tendencias evolutivas de la resistencia a antibióticos en patógenos bacterianos productores de bacteriemia; European Antimicrobial Resistance Surveillance Net (EARS-Net) del ECDC y Global Antimicrobial Resistance Surveillance System (GLASS) de la OMS.


- Análisis del microbioma y resistoma del tracto gastrointestinal humano y su relación con la colonización por bacterias multi-resistentes y desarrollo de infecciones (metagenómica).

Investigación en infecciones multirresistentes

 

La emergencia y diseminación global de cepas bacterianas de diferentes especies con resistencia a distintas clases de antibióticos (cepas multirresistentes) supone una amenaza para la eficacia del tratamiento antibiótico. El Antibiotic Resistance Global Report publicado por la Organización Mundial de la Salud en 2014 destacó altas tasas de resistencia en varias especies de bacterias patógenas en cada una de las seis regiones incluidas en el estudio (WHO; 2014). Las infecciones causadas por bacterias resistentes están asociadas a una mortalidad significativa, produciendo más de 700.000 muertes al año, y se estima que esta cifra llegará a 10 millones de muertes anuales en 2050, si no cambia la tendencia actual (Antimicrobial Resistance Rev; 2015). En 2017, la Organización Mundial de la Salud identificó las especies bacterianas frente a las que deberían implementarse nuevas medidas de tratamiento y prevención (WHO 2017). En este informe se clasificaron las especies Gram negativas multirresistentes.

Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Klebsiella pneumoniae con la prioridad más alta (Priority 1: Critical). Las tasas de resistencia a los antimicrobianos de primera línea de estas bacterias Gram-negativas multirresistentes se han incrementado a nivel global durante la última década, complicando significativamente el manejo clínico de las infecciones producidas por estos microorganismos. En este contexto, nuestro grupo está desarrollando las siguientes líneas de investigación:

1. Desarrollo de vacunas para infecciones multirresistentes

Esta línea de investigación tiene como objetivo del desarrollo preclínico de vacunas profilácticas y anticuerpos monoclonales terapéuticos para infecciones producidas por bacterias Gram negativas multirresistentes de difícil manejo clínico debido a la resistencia antimicrobiana. La investigación realizada en esta línea tiene como objetivo identificar y caracterizar antígenos de las bacterias multirresistentes (Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae y Pseudomonas aeruginosa) que sirvan para el desarrollo de anticuerpos monoclonales y vacunas a través de estudios epidemiológicos, genómicos y proteómicos.

2. Caracterización de tratamientos novedosos para infecciones multirresistentes

Esta línea de investigación tiene como objetivo identificar y caracterizar nuevos tratamientos basados en moléculas novedosas y/o combinaciones de antibióticos existentes para infecciones producidas por bacterias Gram negativas multirresistentes.  También se emplean técnicas moleculares y "omicas" para la identificación de nuevas dianas para el desarrollo de antibióticos novedosas. 

3. Desarrollo de vacunas frente a SARS-CoV-2

Debido la situación producida por la propagación del SARS-CoV-2 urge la realización de estudios que tienen como objetvo el desarrollo de vacunas profilácticas.  Nuestro grupo lidera el desarrollo de un prototipo de vacuna basado en ADN plasmídico que expresa antígenos de SARS-CoV-2 y la caracterización de la respuesta inmune inducida por esta vacuna en un modelo murino de inmunización.

Caracterización molecular de los estafilococcus

​El Laboratorio de Referencia e investigación en Infecciones Relacionadas con la Asistencia Sanitaria dispone de un Programa de Vigilancia de Staphylococcus aureus y Estafilococos coagulasa negativa y de la siguiente cartera de servicios:

Estafilococos coagulasa negativa

Identificación:

Por secuencia del gen 16S del ARN ribosómico

Por secuencia del gen rpoB

Por secuencia del gen tuf

 

Marcadores moleculares

Perfil por PFGE

SSC

mec

MLST

 

Detección de genes

Genes mec

Genes de resistencia

Mecanismos de resistencia al linezolid

Dominio V del gen 23S ARNr

Gen rplC (riboproteína L3)

Gen rplD (riboproteína L4)

Gen rplV (riboproteína L22)

 

 

Staphylococcus aureus

Identificación:

PCR del gen Sau

Por secuencia del gen 16S del ARN ribosómico

Por secuencia del gen rpoB

Por secuencia del gen tuf

 

Marcadores moleculares

PFGE

MLST

SSC

mec

Spa-tipo

 

Detección de genes

Genes mec

Gen PVL

Toxinas exfoliativas (SST)

Toxina del Shock Tóxico (TSST)

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HCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients.

10.1186/s40249-021-00894-5. 9. Brochado O, Martínez I (*), Berenguer J, Medrano L, González-García J, Jiménez-Sousa MA, Carrero A, Hontañón V, Navarro J, Guardiola JM, Pérez-Latorre L, Micán R, Fernández-Rodríguez A (‡), Resino S (* ‡). HCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients. J Biomed Sci 2021; 28:23 (A; FI= 12.77; D1, Medicine, Research & Experimental; JCR 2021). PMID: 33785040. DOI: 10.1186/s12929-021-00718-6.

PUBMED

Relationship of vitamin D status with advanced liver fibrosis and response to hepatitis C virus therapy: A meta-analysis.

12. García-Álvarez M, Pineda-Tenor D, Jiménez-Sousa Ma, Fernández-Rodríguez A, Guzmán-Fulgencio M; Resino S (*). Relationship of vitamin D status with advanced liver fibrosis and response to hepatitis C virus therapy: A meta-analysis. Hepatology. 2014, 6(5):1541-1550. (A; FI= 11.05; D1, Gastroenterology & Hepatology; JCR 2014). PMID: 24975775. DOI: 10.1002/hep.27281.

PUBMED

FTO rs9939609 polymorphism is associated with metabolic disturbances and response to HCV therapy in HIV/HCV-coinfected patients.

13. Pineda-Tenor D, Berenguer J, Jiménez-Sousa MA, García-Álvarez M, Aldamiz-Echevarría T, Carrero A, Vázquez-Morón S, García-Broncano P, Diez C, Tejerina F, Guzmán-Fulgencio M, Resino S (*). FTO rs9939609 polymorphism is associated with metabolic disturbances and response to HCV therapy in HIV/HCV-coinfected patients. BMC Med. 2014, 12:198. (A; FI= 7.34; D1, Medicine, General & Internal; JCR 2014). PMID: 25367448. DOI: 10.1186/s12916-014-0198-y.

PUBMED

HLA-E variants are associated with sustained virological response in HIV/hepatitis C virus-coinfected patients on hepatitis C virus therapy.

14. Guzmán-Fulgencio M, Berenguer J; Rallón N, Fernández-Rodríguez A, Miralles P, Soriano V, Jiménez-Sousa MA, Cosin J, Medrano J, García-Álvarez M, López JC, Benito JM, Resino S (*). HLA-E variants are associated with sustained virological response in HIV/hepatitis C virus-coinfected patients on hepatitis C virus therapy. AIDS 2013; 27(8):1231-1238. (A; FI= 6.55; D1, Infectious Diseases; JCR 2013). PMID: 23811951. DOI: 10.1097/QAD.0b013e32835f5b9c.

PUBMED

Eva Orviz, Anabel Negredo, Oskar Ayerdi, Ana Vázquez, Ana Muñoz-Gomez, Sara Monzón, Petunia Clavo, Angel Zaballos, Mar Vera, Patricia Sánchez, Noemi Cabello, Pilar Jiménez, Jorge A Pérez-García, Sarai Varona, Jorge Del Romero, Isabel Cuesta, Alberto Delgado-Iribarren, Montse Torres, Iñigo Sagastagoitia, Gustavo Palacios, Vicente Estrada, Maria Paz Sánchez-Seco, Grupo Viruela del Simio Madrid CNM/ISCIII/HCSC/Sandoval.

Eva Orviz, Anabel Negredo, Oskar Ayerdi, Ana Vázquez, Ana Muñoz-Gomez, Sara Monzón, Petunia Clavo, Angel Zaballos, Mar Vera, Patricia Sánchez, Noemi Cabello, Pilar Jiménez, Jorge A Pérez-García, Sarai Varona, Jorge Del Romero, Isabel Cuesta, Alberto Delgado-Iribarren, Montse Torres, Iñigo Sagastagoitia, Gustavo Palacios, Vicente Estrada, Maria Paz Sánchez-Seco, Grupo Viruela del Simio Madrid CNM/ISCIII/HCSC/Sandoval. Monkeypox outbreak in Madrid (Spain): Clinical and virological aspects. J Infect. 2022 Jul 10;S0163-4453(22)00415-7. doi: 10.1016/j.jinf.2022.07.005.

DOI

European mitochondrial haplogroups are associated with CD4+ T-cell recovery in HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy.

15. ​Guzmán-Fulgencio M; Berenguer J, Micheloud D, Fernández-Rodríguez A; García–Álvarez M, Jiménez-Sousa MA, Bellón JM, Campos Y, Cosin J, Aldámiz-Echevarría T, Catalán P, López JC, Resino S (*). European mitochondrial haplogroups are associated with CD4+ T-cell recovery in HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy. J Antimicrob Chemoth 2013; 68 (10): 2349–2357 (A; FI= 5.44; D1, Infectious Diseases; JCR 2013). PMID: 23749950. DOI: 10.1093/jac/dkt206.

PUBMED

María Paz Sánchez-Seco, María José Sierra, Agustín Estrada-Peña, Félix Valcárcel, Ricardo Molina, Eva Ramírez de Arellano, Angeles Sonia Olmeda, Lucía García San Miguel, Maribel Jiménez, Luis J Romero, Anabel Negredo; Group for CCHFv Research. Widespread Detection of Multiple Strains of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus in Ticks, Spain.

María Paz Sánchez-Seco, María José Sierra, Agustín Estrada-Peña, Félix Valcárcel, Ricardo Molina, Eva Ramírez de Arellano, Angeles Sonia Olmeda, Lucía García San Miguel, Maribel Jiménez, Luis J Romero, Anabel Negredo; Group for CCHFv Research. Widespread Detection of Multiple Strains of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus in Ticks, Spain. Emerg Infect Dis. 2022 Feb;28(2):394-402. doi: 10.3201/eid2802.211308.

DOI

Negredo A, Sánchez-Ledesma M, Llorente F, Pérez-Olmeda M, Belhassen-García M, González-Calle D, Sánchez-Seco MP, Jiménez-Clavero MÁ. Retrospective Identification of Early Autochthonous Case of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever, Spain, 2013

Negredo A, Sánchez-Ledesma M, Llorente F, Pérez-Olmeda M, Belhassen-García M, González-Calle D, Sánchez-Seco MP, Jiménez-Clavero MÁ. Retrospective Identification of Early Autochthonous Case of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever, Spain, 2013. Emerg Infect Dis. 2021 Jun;27(6):1754-1756. doi: 10.3201/eid2706.204643.

DOI

Negredo A, Sánchez-Arroyo R, Díez-Fuertes F, de Ory F, Budiño MA, Vázquez A, Garcinuño Á, Hernández L, la Hoz González C, Gutiérrez-Arroyo A, Grande C, Sánchez-Seco P. Fatal Case of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Caused by Reassortant Virus, Spain, 2018.

Negredo A, Sánchez-Arroyo R, Díez-Fuertes F, de Ory F, Budiño MA, Vázquez A, Garcinuño Á, Hernández L, la Hoz González C, Gutiérrez-Arroyo A, Grande C, Sánchez-Seco P. Fatal Case of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Caused by Reassortant Virus, Spain, 2018. Emerg Infect Dis. 2021 Apr;27(4):1211-1215. doi: 10.3201/eid2704.203462.

DOI

Laura Davó, Laura Herrero, Maria Paz Sánchez-Seco, Nuria Labiod, David Roiz, Elena Gómez-Díaz, Lourdes Hernandez, Jordi Figuerola and Ana Vázquez. Real-time PCR assay to detect Granada virus and the related Massilia and Arrabida phleboviruses

Laura Davó, Laura Herrero, Maria Paz Sánchez-Seco, Nuria Labiod, David Roiz, Elena Gómez-Díaz, Lourdes Hernandez, Jordi Figuerola and Ana Vázquez. Real-time PCR assay to detect Granada virus and the related Massilia and Arrabida phleboviruses. Davó et al. Parasit Vectors. 2020 May 29;13(1):270. doi: 10.1186/s13071-020-04110-5.

DOI

María Velasco, María Paz Sánchez-Seco, Carolina Campelo, Fernando de Ory, Oriol Martin, Laura Herrero, Octavio J. Salmerón Béliz, Teodora Minguito, Mª Carmen Campos, Francisca Molero, Alejandro Algora and Ana Vázquez. Imported Human West Nile Virus Lineage 2 Infection in Spain

María Velasco, María Paz Sánchez-Seco, Carolina Campelo, Fernando de Ory, Oriol Martin, Laura Herrero, Octavio J. Salmerón Béliz, Teodora Minguito, Mª Carmen Campos, Francisca Molero, Alejandro Algora and Ana Vázquez. Imported Human West Nile Virus Lineage 2 Infection in Spain: Neurological and Gastrointestinal Complications. Viruses 2020 Jan 29;12(2):156. doi: 10.3390/v12020156.

DOI

Negredo A, Habela MÁ, Ramírez de Arellano E, Diez F, Lasala F, López P, Sarriá A, Labiod N, Calero-Bernal R, Arenas M, Tenorio A, Estrada-Peña A, Sánchez-Seco MP. Survey of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Enzootic Focus, Spain, 2011-2015

Negredo A, Habela MÁ, Ramírez de Arellano E, Diez F, Lasala F, López P, Sarriá A, Labiod N, Calero-Bernal R, Arenas M, Tenorio A, Estrada-Peña A, Sánchez-Seco MP. Survey of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Enzootic Focus, Spain, 2011-2015. Emerg Infect Dis. 2019 Jun;25(6):1177-1184. doi: 10.3201/eid2506.180877.

DOI

Ramírez de Arellano E, Sanchez-Lockhart M, Perteguer MJ, Bartlett M, Ortiz M, Campioli P, Hernández A, Gonzalez J, Garcia K, Ramos M, Jiménez-Clavero MÁ, Tenorio A, Sánchez-Seco MP, González F, Echevarría JE, Palacios G, Negredo A. First Evidence of Antibodies Against Lloviu Virus in Schreiber's Bent-Winged Insectivorous Bats Demonstrate a Wide Circulation of the Virus in Spain

Ramírez de Arellano E, Sanchez-Lockhart M, Perteguer MJ, Bartlett M, Ortiz M, Campioli P, Hernández A, Gonzalez J, Garcia K, Ramos M, Jiménez-Clavero MÁ, Tenorio A, Sánchez-Seco MP, González F, Echevarría JE, Palacios G, Negredo A. First Evidence of Antibodies Against Lloviu Virus in Schreiber's Bent-Winged Insectivorous Bats Demonstrate a Wide Circulation of the Virus in Spain. Viruses. 2019 Apr 19;11(4):360. doi: 10.3390/v11040360.

DOI

Meta-analysis: diagnostic accuracy of hepatitis C core antigen detection during therapy with direct-acting antivirals.

3. Sepúlveda-Crespo D, Treviño-Nakoura A, Bellon JM, Ardizone Jiménez B, Jiménez‑Sousa MA, Fernández-Rodríguez A, Martínez I (‡), Resino S (*‡). Meta-analysis: diagnostic accuracy of hepatitis C core antigen detection during therapy with direct-acting antivirals. Aliment Pharmacol Ther 2022; 56 (8): 1224-1234 (A; FI= 9.52; D1, Pharmacology & Pharmacy; JCR 2021).

PUBMED DOI

Antibody levels to SARS-CoV-2 spike protein in mothers and children from delivery to six months later.

4. Martin-Vicente M, Carrasco I, Muñoz-Gomez MJ, Lobo AH, Mas V, Vigil-Vázquez S, Vázquez M, Manzanares A, Cano O, Alonso R, Sepúlveda-Crespo D, Tarancón-Díez L, Muñoz-Fernández MÁ, Muñoz-Chapuli M, Resino S#*, Navarro ML#, Martinez I#*. Antibody levels to SARS-CoV-2 spike protein in mothers and children from delivery to six months later. Birth. 2022 Jul 8:10.1111/birt.12667. doi: 10.1111/birt.12667. Online ahead of print. PMID: 35802776.

PUBMED

Hepatitis E virus seroprevalence is associated with neurodegenerative disorders in older people with dementia: a case-control study.

5. Pérez-García F, Vázquez-Morón S, Burgueño-García I, José Muñoz-Gómez M, Zea-Sevilla MA, Calero M, Martínez I#, Rábano A#, Resino S#. Hepatitis E virus seroprevalence is associated with neurodegenerative disorders in older people with dementia: a case-control study. J Infect Dis. 2022 Jun 27:jiac268. doi: 10.1093/infdis/jiac268. Online ahead of print. PMID: 35759220 (A; FI= 7.759; Q1 Microbiology; JCR 2021).

PUBMED

Negative impact of HIV infection on broad-spectrum anti-HCV neutralizing antibody titers in HCV-infected patients with advanced HCV-related cirrhosis.

6. Sepúlveda-Crespo D, Yélamos MB, Díez C, Gómez J, Hontañón V, Torresano-Felipe F, Berenguer J, González-García J, Ibañez-Samaniego L, Llop E, Olveira A, Martínez J, Resino S (‡ *), Martínez I (‡ *). Negative impact of HIV infection on broad-spectrum anti-HCV neutralizing antibody titers in HCV-infected patients with advanced HCV-related cirrhosis. Biomed Pharmacother 2022, 150: 113024. (A; FI= 7.42; D1, Pharmacology & Pharmacy; JCR 2021).

PUBMED DOI

. Environmental factors linked to hospital admissions in young children due to acute viral lower respiratory infections: A bidirectional case-crossover study.

7. Álvaro-Meca A, Goez MDC, Resino R, Matías V, Sepúlveda-Crespo D, Martínez I#, Resino S#. Environmental factors linked to hospital admissions in young children due to acute viral lower respiratory infections: A bidirectional case-crossover study. Environ Res. 2022 Sep; 212(Pt B):113319. doi: 10.1016/j.envres.2022.113319. PMID: 35447151. (A; FI= 8.431; D1 Public, Environmental & Occupational Health; JCR 2021).

PUBMED

Misdiagnosis rate of among negative COVID-19 patients in real-life with Panbio COVID-19 Antigen Rapid Test during 2021.

8. Ryan P, Pérez-García F, Torres-Macho J, Bibiano C, Ignacio Lazo J, Castaño-Ochoa G, Vidal-Alcántara EJ, Muñoz-Gómez MJ, Martínez I#, Resino S#. Misdiagnosis rate of among negative COVID-19 patients in real-life with Panbio COVID-19 Antigen Rapid Test during 2021. J Infect. 2022 May; 84(5):e42-e44. doi: 10.1016/j.jinf.2022.03.013. PMID: 35306106 (L; FI= 38.637; D1 Infectious Diseases; JCR 2021).

PUBMED

Similar humoral immune responses against the SARS-CoV-2 spike protein in HIV and non-HIV individuals after COVID-19.

11. Martín-Vicente M, Berenguer J, Muñoz-Gómez MJ, Díez C, Micán R, Pérez-Elías MJ, García-Fraile LJ, Peraire J, Suárez-García I, Jiménez-Sousa MÁ, Fernández-Rodríguez A, Vázquez M, Ryan P, González-García J, Jarrín I, Mas V, Martínez I#, Resino S#. Similar humoral immune responses against the SARS-CoV-2 spike protein in HIV and non-HIV individuals after COVID-19. J Infect. 2022 Mar;84(3):418-467. doi: 10.1016/j.jinf.2021.11.002. PMID: 34752819 (L; FI= 38.637; D1 Infectious Diseases; JCR 2021).

PUBMED

Low anti-SARS-CoV-2 S antibody levels predict increased mortality and dissemination of viral components in the blood of critical COVID-19 patients.

12. Martin-Vicente M#, Almansa R#, Martínez I#, Tedim AP, Bustamante E, Tamayo L, Aldecoa C, Gómez JM, Renedo G, Berezo JÁ, Cedeño JA, Mamolar N, García Olivares P, Herrán-Monge R, Cicuendez R, Enríquez P, Ortega A, Jorge N, Doncel C, de la Fuente A, Bustamante-Munguira J, Muñoz-Gómez MJ, González-Rivera M, Puertas C, Más V, Vázquez M, Pérez-García F, Rico-Feijoo J, Martín S, Motos A, Fernandez-Barat L, Eiros JM, Dominguez-Gil M, Ferrer R, Barbé F, Trapiello W, Kelvin DJ, Bermejo-Martin JF, Resino S, Torres A. Low anti-SARS-CoV-2 S antibody levels predict increased mortality and dissemination of viral components in the blood of critical COVID-19 patients. J Intern Med. 2022 Feb; 291(2):232-240. doi: 10.1111/joim.13386. PMID: 34611927 (A; FI= 13.068; D1 Medicine, General & Internal; JCR 2021).

PUBMED

Strategies Targeting the Innate Immune Response for the Treatment of Hepatitis C Virus-Associated Liver Fibrosis.

13. Sepulveda-Crespo D, Resino S*, Martinez I*. Strategies Targeting the Innate Immune Response for the Treatment of Hepatitis C Virus-Associated Liver Fibrosis. Drugs. 2021 Drugs. 2021 Mar; 81(4):419-443. doi: 10.1007/s40265-020-01458-x. PMID: 33400242. (R; FI= 11.431; D1 Pharmacology & Pharmacy; JCR 2021).

PUBMED

Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation FRONTIERS IN IMMUNOLOGY.

3 Ceballos, Francisco C.; Virseda-Berdices, Ana; Resino, Salvador; et al; Jimenez-Sousa, Maria Angeles. (19/19). 2022. Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation FRONTIERS IN IMMUNOLOGY. ISSN 1664-3224.

Metabolomic changes after DAAs therapy are related to the improvement of cirrhosis and inflammation in HIV/HCV-coinfected patients.

4 Virseda-Berdices, Ana; Rojo, David; Martinez, Isidoro; et al; Jimenez-Sousa, Maria Angeles. (14/14). 2022. Metabolomic changes after DAAs therapy are related to the improvement of cirrhosis and inflammation in HIV/HCV-coinfected patients. BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY. 147:112623. ISSN 1950-6007.

HCV Cure With Direct-Acting Antivirals Improves Liver and Immunological Markers in HIV/HCV-Coinfected Patients FRONTIERS IN IMMUNOLOGY.

7 Brochado-Kith, Oscar; Martinez, Isidoro; Berenguer, Juan; et al; Jiménez-Sousa, Maria Angeles (‡, AC); Resino, Salvador (‡, AC). (13/13). 2021. HCV Cure With Direct-Acting Antivirals Improves Liver and Immunological Markers in HIV/HCV-Coinfected Patients FRONTIERS IN IMMUNOLOGY. 12:723196. ISSN 1664-3224.

Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality

3. Fernández-Pato A; Virseda-Berdices A; Resino S; et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (20/20). 2022. Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality Emerging Microbes and Infections. Taylor & Francis Online. ISSN 2222-1751.

DOI

Diagnostic Performance of the HCV Core Antigen Test To Identify Hepatitis C in HIV-Infected Patients: a Systematic Review and Meta-Analysis

4. Sepúlveda-Crespo D; Treviño-Nakoura A; Bellon JM; Jiménez-Sousa MA; Ryan P; Martínez I; Fernández-Rodríguez A (AC); Resino S. (7/8). 2022. Diagnostic Performance of the HCV Core Antigen Test To Identify Hepatitis C in HIV-Infected Patients: a Systematic Review and Meta-Analysis.Journal of clinical microbiology. pp.e0133122. ISSN 0095-1137.

DOI

Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation

6. Ceballos FC; Virseda-Berdices A; Resino S; et al; Jiménez-Sousa MÁ (AC). (19/19). 2022. Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation.Frontiers in immunology. 13, pp.925558. WOS (78)

DOI

Novel genes and sex differences in COVID-19 severity

7. Cruz R; Almeida SD; Heredia ML; et al; Fernández-Rodríguez A; Carracedo Á. (51/168). 2022. Novel genes and sex differences in COVID-19 severity. Human molecular genetics. ISSN 0964-6906.

DOI

Different HCV Exposure Drives Specific miRNA Profile in PBMCs of HIV Patients

8. Valle-Millares D; Brochado-Kith O; Martín-Carbonero L; et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (22/22). 2021. Different HCV exposure drives specific miRNA profile in PBMCs of HIV patients Biomedicines. MDPI. 9-11, pp.1627.

DOI

Are Reduced Levels of Coagulation Proteins Upon Admission Linked to COVID-19 Severity and Mortality?

9. Ceballos F; Ryan P; Blancas R; et al; Fernández-Rodríguez A (AC); Jiménez-Sousa MA. (19/20). 2021. Are Reduced Levels of Coagulation Proteins Upon Admission Linked to COVID-19 Severity and Mortality? Frontiers in Medicine. Frontiers. 8-718053.

DOI

Telomere Length Increase in HIV/HCV-Coinfected Patients with Cirrhosis after HCV Eradication with Direct-Acting Antivirals

12 . Molina-Carrión S; Brochado-Kith, Oscar; González-García J; et al; Angeles Jimenez-Sousa, Maria. (16/16). 2020. Telomere length increase in HIV/HCV-coinfected patients with cirrhosis after HCV eradication with direct acting antivirals. JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE. MDPI. ISSN 2077-0383.

DOI

MicroRNA Profile of HCV Spontaneous Clarified Individuals, Denotes Previous HCV Infection

15. Brochado-Kith, Oscar; Gomez-Sanz, Alicia; Real LM; et al; Fernandez-Rodriguez, Amanda (AC). (16/16). 2019. MicroRNA Profile of HCV Spontaneous Clarified Individuals, Denotes Previous HCV Infection JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE. MDPI. 7. ISSN 2077-0383.

DOI

​​Persistent Immunity against SARS-CoV-2 in Individuals with Oncohematological Diseases Who Underwent Autologous or Allogeneic Stem Cell Transplantation after Vaccination

​​Persistent Immunity against SARS-CoV-2 in Individuals with Oncohematological Diseases Who Underwent Autologous or Allogeneic Stem Cell Transplantation after Vaccination. Rodríguez-Mora S, Pérez-Lamas L, Solera Sainero M, Torres M, Sánchez-Menéndez C, Corona M, Mateos E, Casado-Fernández G, Alcamí J, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Murciano-Antón A, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). Cancers 2023, 15(8), 2344. doi: 10.3390/cancers15082344. PMID: 37190272.

PUBMED DOI

Sustained Cytotoxic Response of Peripheral Blood Mononuclear Cells from Unvaccinated Individuals Admitted to the ICU Due to Critical COVID-19 Is Essential to Avoid a Fatal Outcome

Sustained Cytotoxic Response of Peripheral Blood Mononuclear Cells from Unvaccinated Individuals Admitted to the ICU Due to Critical COVID-19 Is Essential to Avoid a Fatal Outcome. Casado-Fernández G, Corona M, Torres M, Saez AJ, Ramos-Martín F, Manzanares M, Vigón L, Mateos E, Pozo F, Casas I, García-Gutierrez V, Rodríguez-Mora S, Coiras M (AC). Int J Environ Res Public Health. 2023 Jan20;20(3):1947. doi: 10.3390/ijerph20031947. PMID: 36767310.

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Dasatinib: effects on the macrophage phospho proteome with a focus on SAMHD1 and HIV-1 infection

Dasatinib: effects on the macrophage phospho proteome with a focus on SAMHD1 and HIV-1 infection. Williams ESCP, Szaniawski MA, Martins LJ, Innis EA, Alcamí J, Hanley TM, Spivak AM, Coiras M, Planelles V. Clin Res HIV AIDS.2022;8(1):1053. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36589263/. PMID: 36589263.

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Early Cellular and Humoral Responses Developed in Oncohematological Patients after Vaccination with One Dose against COVID-19

Early Cellular and Humoral Responses Developed in Oncohematological Patients after Vaccination with One Dose against COVID-19. Rodríguez-Mora S, Corona M, Torres M, Casado-Fernández G, García-Pérez J, Ramos-Martín F, Vigón L, Manzanares M, Mateos E, Martín-Moro F, Zurdo-Castronuño A, Murciano-Antón MA, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). J Clin Med. 2022 May 16;11(10):2803. doi: 10.3390/jcm11102803. PMID: 35628927.

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Changes in the immune response against SARS-CoV-2 in individuals with severe COVID-19 treated with high dose of vitamin D

Changes in the immune response against SARS-CoV-2 in individuals with severe COVID-19 treated with high dose of vitamin D. Torres M, Casado G, Vigón L, Rodríguez-Mora S, Mateos E, Ramos-Martín F, López-Wolf D, Sanz-Moreno J, Ryan-Murua P, Taboada-Martínez ML, López-Huertas MR, Cervero M, Coiras M (AC). Biomed Pharmacother. 2022 Apr 14;150:112965. doi: 10.1016/j.biopha.2022.112965. PMID: 35468580.

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Strong Cellular Immune Response, but Not Humoral, against SARS-CoV-2 in Oncohematological Patients with Autologous Stem Cell Transplantation after Natural Infection.

Strong Cellular Immune Response, but Not Humoral, against SARS-CoV-2 in Oncohematological Patients with Autologous Stem Cell Transplantation after Natural Infection. Vigón L, Sánchez-Tornero A, Rodríguez-Mora S, García-Pérez J, Corona de Lapuerta M, Pérez-Lamas L, Casado-Fernández G, Moreno G, Torres M, Mateos E, Murciano-Antón MA, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). J Clin Med. 2022 Apr 11;11(8):2137. doi: 10.3390/jcm11082137. PMID: 35456230.

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Persistent overactive cytotoxic immune response in a Spanish cohort of individuals with Long-COVID: Identification of diagnostic biomarkers

Persistent overactive cytotoxic immune response in a Spanish cohort of individuals with Long-COVID: Identification of diagnostic biomarkers. Galán M, Vigón L, Fuertes D, Murciano-Antón MA, Casado-Fernández G, Domínguez-Mateos S, Mateos E, Ramos-Martín F, Planelles V, Torres M, Rodríguez-Mora S, López-Huertas MR, Coiras M (CA). Front Immunol. 2022 Mar 25;13:848886. doi: 10.3389/fimmu.2022.848886. PMID: 35401523

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Información adicional

The researchers of the Viral Infection and Immunity Unit (UIVI) are part of the CIBER de Infectious Diseases (CIBERINFEC) as an independent group (https://www.ciberinfec.es/grupos/grupo-de-investigacion?id=27501).  The UIVI studies the immunopathology of clinically relevant infections in humans, such as chronic viral hepatitis (Hepatitis B, C and D), HIV, and SARS-CoV-2, and their impact on the clinical evolution of infected patients. We also analyse the evolution of the patient after controlling viral replication or after eliminating the virus spontaneously or by antiviral treatment.

The group focuses mainly on translational research in which collaborating clinical groups also participate. On the one hand, ‘omics’ techniques such as genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, epigenetics and metagenomics are used, which, depending on the type of study, are targeted or not. On the other hand, specific laboratory assays designed in-house, such as PCR, RT-PCR, immunoassays for virus titration and neutralisation, production of monoclonal antibodies, among others, are carried out. With the molecular data obtained from patient samples, we perform bioinformatics/statistical analyses, analysing their association with the clinical condition of the patients and their subsequent evolution. 

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