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Investigación

Viral Infection and Immunity

Líneas de investigación

Content with Investigacion Resistencia a Antibióticos e IRAS .

Resistencia a Antibióticos

Nuestro objetivo general es aportar conocimiento precoz sobre cualquier mecanismo de resistencia a antibióticos emergente en nuestro país. Dicho aporte de conocimiento se fundamenta en unos objetivos transversales clave:

  1) La capacidad de adaptar la investigación a los problemas de resistencia emergentes

  2) La promoción de estudios de investigación cooperativos y multidisciplinares con diferentes centros españoles y extranjeros

  3) La transferencia ágil de los resultados de la investigación a la práctica clínica del Sistema Nacional de Salud

  4) El fomento de la interrelación de la investigación con la referencia, la asesoría, la formación y la divulgación.

Nuestros principales objetivos científicos son la caracterización de las bases moleculares de la resistencia a antibióticos en bacterias patógenas, el estudio de la epidemiología molecular y la estructura poblacional de las bacterias resistentes, la caracterización de los elementos genéticos móviles que portan los genes de resistencia, y el desarrollo de técnicas diagnósticas y alternativas terapéuticas frente a bacterias con resistencia extensa, basado en nuevas tecnologías como la secuenciación de genomas bacterianos. La investigación en las vías de diseminación de enterobacterias, Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa productores de carbapenemasas es uno de nuestros objetivos prioritarios.


Algunas iniciativas en las que participamos son la red europea de vigilancia de la resistencia a antibióticos (EARS-Net), el  sistema de la OMS desarrollado para apoyar el plan de acción mundial sobre la resistencia a los antimicrobianos (GLASS), la red española de investigación en patología infecciosa (REIPI), el Plan nacional contra la resistencia a antibióticos (PRAN), el Comité Coordinador de la red de laboratorios para la vigilancia de microorganismos resistentes, y la coordinación nacional de los proyectos CARBA-ES-2019 (nacional) y CCRE-survey (ECDC).

Líneas de investigación

- Detección y caracterización de mecanismos de resistencia a antibióticos emergentes, sobre todo a antibióticos de última línea como los antibióticos carbapenémicos y la colistina.


- Caracterización y trazabilidad interregional, mediante el análisis de secuencias de genomas completos (WGS), de clones de alto riesgo con múltiple resistencia a antibióticos, y de plásmidos epidémicos portadores de genes de resistencia.


- Identificación mediante recursos bio-informáticos de posibles dianas para el desarrollo de nuevos productos o moléculas relacionadas con el control de la resistencia a antibióticos (vacunas, pruebas diagnósticas, atenuantes de virulencia y otros).


- Análisis de las tendencias evolutivas de la resistencia a antibióticos en patógenos bacterianos productores de bacteriemia; European Antimicrobial Resistance Surveillance Net (EARS-Net) del ECDC y Global Antimicrobial Resistance Surveillance System (GLASS) de la OMS.


- Análisis del microbioma y resistoma del tracto gastrointestinal humano y su relación con la colonización por bacterias multi-resistentes y desarrollo de infecciones (metagenómica).

Investigación en infecciones multirresistentes

 

La emergencia y diseminación global de cepas bacterianas de diferentes especies con resistencia a distintas clases de antibióticos (cepas multirresistentes) supone una amenaza para la eficacia del tratamiento antibiótico. El Antibiotic Resistance Global Report publicado por la Organización Mundial de la Salud en 2014 destacó altas tasas de resistencia en varias especies de bacterias patógenas en cada una de las seis regiones incluidas en el estudio (WHO; 2014). Las infecciones causadas por bacterias resistentes están asociadas a una mortalidad significativa, produciendo más de 700.000 muertes al año, y se estima que esta cifra llegará a 10 millones de muertes anuales en 2050, si no cambia la tendencia actual (Antimicrobial Resistance Rev; 2015). En 2017, la Organización Mundial de la Salud identificó las especies bacterianas frente a las que deberían implementarse nuevas medidas de tratamiento y prevención (WHO 2017). En este informe se clasificaron las especies Gram negativas multirresistentes.

Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Klebsiella pneumoniae con la prioridad más alta (Priority 1: Critical). Las tasas de resistencia a los antimicrobianos de primera línea de estas bacterias Gram-negativas multirresistentes se han incrementado a nivel global durante la última década, complicando significativamente el manejo clínico de las infecciones producidas por estos microorganismos. En este contexto, nuestro grupo está desarrollando las siguientes líneas de investigación:

1. Desarrollo de vacunas para infecciones multirresistentes

Esta línea de investigación tiene como objetivo del desarrollo preclínico de vacunas profilácticas y anticuerpos monoclonales terapéuticos para infecciones producidas por bacterias Gram negativas multirresistentes de difícil manejo clínico debido a la resistencia antimicrobiana. La investigación realizada en esta línea tiene como objetivo identificar y caracterizar antígenos de las bacterias multirresistentes (Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae y Pseudomonas aeruginosa) que sirvan para el desarrollo de anticuerpos monoclonales y vacunas a través de estudios epidemiológicos, genómicos y proteómicos.

2. Caracterización de tratamientos novedosos para infecciones multirresistentes

Esta línea de investigación tiene como objetivo identificar y caracterizar nuevos tratamientos basados en moléculas novedosas y/o combinaciones de antibióticos existentes para infecciones producidas por bacterias Gram negativas multirresistentes.  También se emplean técnicas moleculares y "omicas" para la identificación de nuevas dianas para el desarrollo de antibióticos novedosas. 

3. Desarrollo de vacunas frente a SARS-CoV-2

Debido la situación producida por la propagación del SARS-CoV-2 urge la realización de estudios que tienen como objetvo el desarrollo de vacunas profilácticas.  Nuestro grupo lidera el desarrollo de un prototipo de vacuna basado en ADN plasmídico que expresa antígenos de SARS-CoV-2 y la caracterización de la respuesta inmune inducida por esta vacuna en un modelo murino de inmunización.

Caracterización molecular de los estafilococcus

​El Laboratorio de Referencia e investigación en Infecciones Relacionadas con la Asistencia Sanitaria dispone de un Programa de Vigilancia de Staphylococcus aureus y Estafilococos coagulasa negativa y de la siguiente cartera de servicios:

Estafilococos coagulasa negativa

Identificación:

Por secuencia del gen 16S del ARN ribosómico

Por secuencia del gen rpoB

Por secuencia del gen tuf

 

Marcadores moleculares

Perfil por PFGE

SSC

mec

MLST

 

Detección de genes

Genes mec

Genes de resistencia

Mecanismos de resistencia al linezolid

Dominio V del gen 23S ARNr

Gen rplC (riboproteína L3)

Gen rplD (riboproteína L4)

Gen rplV (riboproteína L22)

 

 

Staphylococcus aureus

Identificación:

PCR del gen Sau

Por secuencia del gen 16S del ARN ribosómico

Por secuencia del gen rpoB

Por secuencia del gen tuf

 

Marcadores moleculares

PFGE

MLST

SSC

mec

Spa-tipo

 

Detección de genes

Genes mec

Gen PVL

Toxinas exfoliativas (SST)

Toxina del Shock Tóxico (TSST)

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Outbreak of brainstem encephalitis associated with enterovirus-A71 in Catalonia, Spain (2016): a clinical observational study in a children’s reference centre in Catalonia

6. D Casas-Alba, M de Sevilla, A Valero-Rello, C Fortuny, JJ Garcia, C Ortez, J Muchart, T Armangue, I Jordan, C Luaces-Cubells, I Barrabeig, R González-Sanz, M Cabrerizo, C Munoz-Almagro, C Launes. Outbreak of brainstem encephalitis associated with enterovirus-A71 in Catalonia, Spain (2016): a clinical observational study in a children’s reference centre in Catalonia. Clin Microbiol Infect 23: 874-881 (2017)

PUBMED DOI

Molecular epidemiology of enterovirus and parechovirus infections according to patient age over a 4-year period in Spain.

7. M Cabrerizo*, M Díaz-Cerio, C Muñoz-Almagro, N Rabella, D Tarragó, MP Romero, MJ Pena, C Calvo, S Rey-Cao, A Moreno-Docón, I Martínez-Rienda, A Otero, G Trallero. Molecular epidemiology of enterovirus and parechovirus infections according to patient age over a 4-year period in Spain. J Med Virol 89: 435-442 (2017).

PUBMED DOI

Molecular epidemiology of enterovirus 71, coxsackievirus A16 and A6 associated with hand, foot and mouth disease in Spain

9. M Cabrerizo*, D Tarragó, C Muñóz-Almagro, E del Amo, M Domínguez-Gil, JM Eiros, I López-Miragaya, C Pérez, J Reina, A Otero, I González, JE Echevarría, G Trallero. Molecular epidemiology of enterovirus 71, coxsackievirus A16 and A6 associated with hand, foot and mouth diease in Spain. Clin Microbiol Infect; 20: O150–O156 (2014).

PUBMED DOI

Going beyond serology for stratifying the risk of CMV infection in transplant recipients

Navarro D, Fernández-Ruiz M, Aguado JM, Sandonís V, Pérez-Romero P*. Going beyond serology for stratifying the risk of CMV infection in transplant recipients. Rev Med Virol. 2019 Jan;29(1):e2017.

PUBMED DOI

Impact of pretransplant CMV-specific T-cell immune response in the control of CMV infection after solid organ transplantation: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect.

Molina-Ortega A, Martín-Gandul C, Mena-Romo JD, Rodríguez-Hernández MJ, Suñer M, Bernal C, Sánchez M, Sánchez-Céspedes J, Pérez Romero P*, Cordero E. Impact of pretransplant CMV-specific T-cell immune response in the control of CMV infection after solid organ transplantation: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect. 2019 Jun;25(6):753-758.

PUBMED DOI

Kinetic of the CMV-specific T-cell immune response and CMV infection in CMV-seropositive kidney transplant recipients receiving rabbit anti-thymocyte globulin induction therapy: A pilot study.

Martín-Gandul C, Pérez-Romero P*, Mena-Romo D, Molina-Ortega A, González-Roncero FM, Suñer M, Bernal G, Cordero E; Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI). Kinetic of the CMV-specific T-cell immune response and CMV infection in CMV-seropositive kidney transplant recipients receiving rabbit anti-thymocyte globulin induction therapy: A pilot study. Transpl Infect Dis. 2018 Jun;20(3):e12883.

PUBMED DOI

CMV-specific T-cell immunity in solid organ transplant recipients at low risk of CMV infection. Chronology and applicability in preemptive therapy.

Mena-Romo JD, Pérez Romero P*, Martín-Gandul C, Gentil MÁ, Suárez-Artacho G, Lage E, Sánchez M, Cordero E. CMV-specific T-cell immunity in solid organ transplant recipients at low risk of CMV infection. Chronology and applicability in preemptive therapy. J Infect. 2017 Oct;75(4):336-345.

PUBMED DOI

Two Doses of Inactivated Influenza Vaccine Improve Immune Response in Solid Organ Transplant Recipients: Results of TRANSGRIPE 1-2, a Randomized Controlled Clinical Trial.

Cordero E, Roca-Oporto C, Bulnes-Ramos A, Aydillo T, Gavaldà J, Moreno A, Torre-Cisneros J, Montejo JM, Fortun J, Muñoz P, Sabé N, Fariñas MC, Blanes-Julia M, López-Medrano F, Suárez-Benjumea A, Martinez-Atienza J, Rosso-Fernández C, Pérez-Romero P*. Two Doses of Inactivated Influenza Vaccine Improve Immune Response in Solid Organ Transplant Recipients: Results of TRANSGRIPE 1-2, a Randomized Controlled Clinical Trial. Clin Infect Dis. 2017 Apr 1;64(7):829-838.

PUBMED DOI

Applying lessons learned from cytomegalovirus infection in transplant patients to vaccine design.

Blanco-Lobo P, Bulnes-Ramos Á, McConnell MJ, Navarro D, Pérez-Romero P*. Applying lessons learned from cytomegalovirus infection in transplant patients to vaccine design. Drug Discov Today. 2016 Apr;21(4):674-81.

PUBMED DOI

Use of antibodies neutralizing epithelial cell infection to diagnose patients at risk for CMV Disease after transplantation.

Blanco-Lobo P, Cordero E, Martín-Gandul C, Gentil MA, Suárez-Artacho G, Sobrino M, Aznar J, Pérez-Romero P*. Use of antibodies neutralizing epithelial cell infection to diagnose patients at risk for CMV Disease after transplantation. J Infect. 2016 May;72(5):597-607.

PUBMED DOI

Timing of CMV-specific effector memory T cells predicts viral replication and survival after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation.

Espigado I, de la Cruz-Vicente F, BenMarzouk-Hidalgo OJ, Gracia-Ahufinger I, Garcia-Lozano JR, Aguilar-Guisado M, Cisneros JM, Urbano-Ispizua A, Perez-Romero P*. Timing of CMV-specific effector memory T cells predicts viral replication and survival after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Transpl Int. 2014 Dec;27(12):1253-62.

PUBMED DOI

Clinical impact of neutropenia related with the preemptive therapy of CMV infection in solid organ transplant recipients.

Martín-Gandul C, Pérez-Romero P*, González-Roncero FM, Berdaguer S, Gómez MA, Lage E, Sánchez M, Cisneros JM, Cordero E; Spanish Network for Research in Infectious Diseases REIPI. Clinical impact of neutropenia related with the preemptive therapy of CMV infection in solid organ transplant recipients. J Infect. 2014 Nov;69(5):500-6.

PUBMED DOI

Viral load, CMV-specific T-cell immune response and cytomegalovirus disease in solid organ transplant recipients at higher risk for cytomegalovirus infection during preemptive therapy.

Martín-Gandul C, Pérez-Romero P*, Blanco-Lobo P, Benmarzouk-Hidalgo OJ, Sánchez M, Gentil MA, Bernal C, Sobrino JM, Rodríguez-Hernández MJ, Cordero E; Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI). Viral load, CMV-specific T-cell immune response and cytomegalovirus disease in solid organ transplant recipients at higher risk for cytomegalovirus infection during preemptive therapy. Transpl Int. 2014 Oct;27(10):1060-8.

PUBMED DOI

What is responsible for a large and unusual outbreak of leishmaniasis in Madrid?

8. Carrillo E, Moreno J, Cruz I. What is responsible for a large and unusual outbreak of leishmaniasis in Madrid? Trends Parasitol. 2013 Dec;29(12):579-80.

PUBMED DOI

HCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients.

9. Brochado O, Martínez I (*), Berenguer J, Medrano L, González-García J, Jiménez-Sousa MA, Carrero A, Hontañón V, Navarro J, Guardiola JM, Pérez-Latorre L, Micán R, Fernández-Rodríguez A (‡), Resino S (* ‡). HCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients. J Biomed Sci 2021; 28:23 (A; FI= 12.77; D1, Medicine, Research & Experimental; JCR 2021).

PUBMED DOI

Dynamics of HIV Reservoir and HIV-1 Viral Splicing in HCV-Exposed Individuals after Elimination with DAAs or Spontaneous Clearance.

Martínez-Román P, Crespo-Bermejo C, Valle-Millares D, Lara-Aguilar V, Arca-Lafuente S, Martín-Carbonero, Ryan P, De los Santos I, López-Huertas MR, Palladino C, Muñoz-Muñoz M, Fernández-Rodríguez A*, Coiras M, Briz V, on behalf of COVIHEP network. Dynamics of HIV Reservoir and HIV-1 Viral Splicing in HCV-Exposed Individuals after Elimination with DAAs or Spontaneous Clearance. Journal of Clinical Medicine 2022, 11: 3579.

PUBMED DOI

Protein Saver® cards: the best alternative for DBS storage at room temperature for HCV RNA.

Arca-Lafuente S, Casanueva-Benítez C, Crespo-Bermejo C, Lara-Aguilar V, Martín-Carbonero L, De los Santos I, Madrid R, Briz V*. Protein Saver® cards: the best alternative for DBS storage at room temperature for HCV RNA. 903 Scientific Report 2022, 12: 10124.

PUBMED DOI

Diarrhoea-causing enteric protist species in intensively and extensively raised pigs (Sus scrofa domesticus) in Southern Spain. Part II: Association with Hepatitis E virus susceptibility.

Rivero-Juarez A, Dashti A, Santín M, George, Köster PC, Lopez-Lopez P, Risalde MA, García-Bocanegra I, Gomez-Villamandos JC, Caballero-Gómez J, Frías M, Bailo B, Ortega S, Muadica AS, Calero-Bernal R, González-Barrio D, Rivero A, Briz V*, Carmena D. Diarrhoea-causing enteric protist species in intensively and extensively raised pigs (Sus scrofa domesticus) in Southern Spain. Part II: Association with Hepatitis E virus susceptibility. Transboundary and Emerging Diseases 2021, 69: e1172-e1178.

PUBMED DOI

Hepatitis C virus influences HIV-1 viral splicing in coinfected patients.

Martínez-Román P, López-Huertas MR, Crespo-Bermejo C, Arca-Lafuente S, Cortegano I, Valle-Millares D, Gaspar ML, Martín-Carbonero, Domínguez-Domínguez L, Ryan P, De los Santos I, De la Fuente Moral S, Fernández-Rodríguez A, Coiras M, Briz V, on behalf of COVIHEP. Hepatitis C virus influences HIV-1 viral splicing in coinfected patients. J Clin Med 2020, 9 (7): 2091.

PUBMED DOI

rotist enteroparasites in wild boar (Sus scrofa ferus) and black Iberian pig (Sus scrofa domesticus) in southern Spain: a protective effect on hepatitis E acquisition?

Rivero-Juárez A, Dashti A, López-López P, Salimo Muadica A, Risalde MA, Köster PC, Machuca I, Bailo B, Hernández de Mingo M, Dacal E, García-Bocanegra I, Saugar JM, Calero-Bernal R, González-Barrio D, Rivero A, Briz V, Carmena D. Protist enteroparasites in wild boar (Sus scrofa ferus) and black Iberian pig (Sus scrofa domesticus) in southern Spain: a protective effect on hepatitis E acquisition? Parasites & Vectors 2020, 13: 281

PUBMED DOI

Epidemiological trend of hepatitis C-related liver events in Spain (2000-2015): A nationwide population-based study.

7. Rivero-Juárez A, Dashti A, López-López P, Salimo Muadica A, Risalde MA, Köster PC, Machuca I, Bailo B, Hernández de Mingo M, Dacal E, García-Bocanegra I, Saugar JM, Calero-Bernal R, González-Barrio D, Rivero A, Briz V, Carmena D. Protist enteroparasites in wild boar (Sus scrofa ferus) and black Iberian pig (Sus scrofa domesticus) in southern Spain: a protective effect on hepatitis E acquisition? Parasites & Vectors 2020, 13: 281

PUBMED DOI

Nanotechnology: A reality for diagnosis of HCV infectious disease.

Arca-Lafuente S, Martínez-Román P, Mate-Cano I, Madrid R, Briz V. Nanotechnology: A reality for diagnosis of HCV infectious disease. Journal of Infection 2020, 80 (1); 8-15.

PUBMED DOI

Multidisciplinary Group of viral coinfection HIV/Hepatitis (COVIHEP). HCV-coinfection is related to an increased HIV-1 reservoir size in cART-treated HIV patients: a cross-sectional study.

López-Huertas MR, Palladino C, Garrido-Arquero M, Esteban-Cartelle B, Sánchez-Carrillo M, Martínez-Román P, Martín-Carbonero L, Ryan P, Domínguez-Domínguez L, Santos ID, Moral SDLF, Benito JM, Rallón N, Alcamí J, Resino S, Fernández-Rodríguez A, Coiras M, Briz V*, on behalf of the Multidisciplinary Group of viral coinfection HIV/Hepatitis (COVIHEP). HCV-coinfection is related to an increased HIV-1 reservoir size in cART-treated HIV patients: a cross-sectional study. Sci Rep 2019: 9 (1); 5606.

PUBMED DOI

Persistent Low-Level Viremia in treatment HIV infection: An unresolved status.

3. Crespo-Bermejo C, Ramírez de Arellano E, Lara-Aguilar V, Martínez-Román P, Arca Lafuente S, Gómez-Lus ML, Martín-Carbonero L, Briz V. Persistent Low-Level Viremia in treatment HIV infection: An unresolved status. Virulencia 2021, 12: 2919-2931.

PUBMED DOI

Full coding hepatitis E virus genotype 3 genome amplification method.

Muñoz-Chimeno M, Forero JE, Echevarría JM, Muñoz-Bellido JL, Vázquez-López L, Morago L, García-Galera MC, Avellón A. Full coding hepatitis E virus genotype 3 genome amplification method. J Virol Methods. 2016 Apr;230:18-23.

PUBMED DOI

Comparative sensitivity of commercial tests for hepatitis E genotype 3 virus antibody detection.

• Avellón A, Morago L, García-Galera del Carmen M, Muñoz M, Jose-Manuel Echevarría JM. Comparative sensitivity of commercial tests for hepatitis E genotype 3 virus antibody detection. J Med Virol. 2015 Nov;87(11):1934-9.

PUBMED DOI

Epidemiology and predictive factors for early and late mortality in Candida bloodstream infections: a population-based surveillance in Spain

11: Puig-Asensio M, Padilla B, Garnacho-Montero J, Zaragoza O, Aguado JM, Zaragoza R, Montejo M, Muñoz P, Ruiz-Camps I, Cuenca-Estrella M, Almirante B; CANDIPOP Project; GEIH-GEMICOMED (SEIMC); REIPI. Epidemiology and predictive factors for early and late mortality in Candida bloodstream infections: a population-based surveillance in Spain. Clin Microbiol Infect. 2014 Apr;20(4):O245-54.

PUBMED DOI

B Pérez de Val, B Romero, MT Tórtola, L Herrera-León, P Pozo, I Mercader, JL Sáez, M Domingo, E Vidal. Poly-resistant Mycobacterium bovis infection in a human and sympatric sheep, Spain, 2017-2018

B Pérez de Val, B Romero, MT Tórtola, L Herrera-León, P Pozo, I Mercader, JL Sáez, M Domingo, E Vidal. Poly-resistant Mycobacterium bovis infection in a human and sympatric sheep, Spain, 2017-2018. Emerg Infect Dis. 2021 Apr;27(4):1241-1243. doi: 10.3201/eid2704.204467. PMID: 33755008.

DOI

L Bernal-Martínez; L Herrera-Leon; C Valero; P de la Cruz; L Ghimpu; AC Mesa-Arango; G Santoni; L Goterris; R Millán; MJ Buitrago. Differential Diagnosis of Fungal Pneumonias vs.Tuberculosis in AIDS Patients by Using Two New Molecular Methods.

L Bernal-Martínez; L Herrera-Leon; C Valero; P de la Cruz; L Ghimpu; AC Mesa-Arango; G Santoni; L Goterris; R Millán; MJ Buitrago. Differential Diagnosis of Fungal Pneumonias vs.Tuberculosis in AIDS Patients by Using Two New Molecular Methods. J. Fungi 2021, 7, 336. doi.org: 10.3390/jof7050336. PMID: 33925404.

DOI

E Tagliani, RAnthony, TA Kohl, A de Neeling, V Nikolayevskyy, C Ködmön, FP Maurer, S Niemann, D van Soolingen, MJ van der Werf, D Cirillo, ECDC molecular surveillance project participants. Use of a whole genome sequencing-based approach for Mycobacterium tuberculosis surveillance in Europe in 2017-2019: an ECDC pilot study

E Tagliani, RAnthony, TA Kohl, A de Neeling, V Nikolayevskyy, C Ködmön, FP Maurer, S Niemann, D van Soolingen, MJ van der Werf, D Cirillo, ECDC molecular surveillance project participants. Use of a whole genome sequencing-based approach for Mycobacterium tuberculosis surveillance in Europe in 2017-2019: an ECDC pilot study. Eur Respir J. 2021 Jan 5;57(1):2002272. doi: 10.1183/13993003.02272-2020. Print 2021 Jan. PMID: 32732329.

DOI

MJ Iglesias, D Ibarz, A Cebollada, J Comín, MS Jiménez, MC Vázquez, S Samper, Spanish Working Group on MDRTB. The value of the continuous genotyping of multidrug resistant tuberculosis over 20 years in Spain.

MJ Iglesias, D Ibarz, A Cebollada, J Comín, MS Jiménez, MC Vázquez, S Samper, Spanish Working Group on MDRTB. The value of the continuous genotyping of multidrug resistant tuberculosis over 20 years in Spain. Sci Rep. 2020 Nov 24;10(1):20433. doi: 10.1038/s41598-020-77249-x. PMID: 33235225.

DOI

S Campos-Gutierrez, MJ Ramos-Real, R Abreu, MS Jimenez, M Lecuona. Pseudo-ourbreak of Mycobacterium fortuitum, in a hospital bronchoscopy unit.

S Campos-Gutierrez, MJ Ramos-Real, R Abreu, MS Jimenez, M Lecuona. Pseudo-ourbreak of Mycobacterium fortuitum, in a hospital bronchoscopy unit. Am J Infect Control. 2020 Jul;48(7):765-769. doi: 10.1016/j.ajic.2019.11.019. Epub 2019 Dec 24. PMID: 31882175.

DOI

Gascha , Y Meijeb, M Espasac, B Fonta, MS Jiménez, N Fernández-Hidalgo. Disseminated Infection Due to Mycobacterium chimaera After Aortic Valve Replacement.

Gascha , Y Meijeb, M Espasac, B Fonta, MS Jiménez, N Fernández-Hidalgo. Disseminated Infection Due to Mycobacterium chimaera After Aortic Valve Replacement. Revista Española de cardiología. 2019. Vol 72 (6):502-503. DOI: 10.1016/j.rec.2018.06.026. PMID: 30029979

DOI

PBMCs gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for clinically significant portal hypertension in HIV/HCV coinfected patients: A cross-control study

2. Salgüero S, Brochado-Kith O, Virseda Verdices A, Berenguer J, González-García J, Martínez I, Díez C, Hontañón V, Pérez-Latorre L, Fernández-Rodríguez A (‡), Jiménez-Sousa MA (‡,*), and Resino S (‡, *). PBMCs gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for clinically significant portal hypertension in HIV/HCV coinfected patients: A cross-control study. Biomed Pharmacother 2023, 159:114220. (A; FI= 7.42; D1, Pharmacology & Pharmacy; JCR 2021). PMID: 36628818. DOI: 10.1016/j.biopha.2023.114220.

PUBMED

Low anti-SARS-CoV-2 S antibody levels predict increased mortality and dissemination of viral components in the blood of critical COVID-19 patients

4. Martin-Vicente M, Almansa R, Martínez I, Tedim AP, Bustamante E, Tamayo L, Aldecoa C, Gómez JM, Renedo G, Berezo JA, Cedeño JA, Mamolar N, García Olivares P, Herrán-Monge R, Cicuendez R, Enríquez P, Ortega A, Jorge N, Doncel C, Fuente A, Bustamante-Munguira J, Muñoz-Gómez MJ, González-Rivera M, Puertas C, Más V, Vázquez M, Pérez-García F, Rico-Feijoo J, Martín S, Motos A, Fernandez-Barat L, Eiros JM, Domínguez-Gil M, Ferrer R, Barbé F, Trapiello W, Kelvin DJ (¥), Bermejo-Martin JF (* ¥), Resino S (¥), Torres A (* ¥). Low anti-SARS-CoV-2 S antibody levels predict increased mortality and dissemination of viral components in the blood of critical COVID-19 patients. J Intern Med. 2022, 291(2):232–240. (A; FI= 13.07; D1, Medicine, General & Internal; JCR 2021). PMID: 34611927. DOI: 10.1111/joim.13386.

PUBMED

Prevalence and factors associated with SARS-CoV-2 seropositivity in the Spanish HIV Research Network Cohort

5. Berenguer J (*), Díez C, Martín-Vicente M, Mican R, Pérez-Elías MJ, García-Fraile LJ, Vidal F, Suárez-García I, Podzamcer D, Del Romero J, Pulido F, Iribarren JA, Gutiérrez F, Poveda E, Galera C, Izquierdo R, Asensi V, Portilla J, López JC, Arribas JR, Moreno S, González-García J, Resino S (‡), Jarrín I (‡). Prevalence and factors associated with SARS-CoV-2 seropositivity in the Spanish HIV Research Network Cohort. Clin Microbiol Infect. 2021, 27(11):1678-1684. (A; FI= 13.31; D1, Microbiology; JCR 2021). PMID: 34186209 DOI: 10.1016/j.cmi.2021.06.023.

PUBMED

Environmental factors linked to hospital admissions in young children due to acute viral lower respiratory infections: A bidirectional case-crossover study

6. Álvaro-Meca A, Goez MC, Resino R, Matías V, Sepúlveda-Crespo D; Martínez I, Resino S (*). Environmental factors linked to hospital admissions in young children due to acute viral lower respiratory infections: a bidirectional case-crossover study. Environ Res. 2022. 212(Pt B), 113319. (A; FI= 8.43; D1, Public, Environmental & Occupational Health; JCR 2021). PMID: 35447151. DOI: 10.1016/j.envres.2022.113319.

PUBMED

Detection of active hepatitis C in a single visit and linkage to care among marginalized people using a mobile unit in Madrid, Spain

7. Ryan P, Valencia J, Cuevas G, Torres-Macho J, Troya J, Pueyo A, Muñoz-Gómez MJ, Muñoz-Rivas N, Vázquez-Morón S, Martínez, I, Lazarus JV, Resino S (*). Detection of active hepatitis C in a single visit and link-to-care among excluded people using a mobile unit in Madrid, Spain. Int J Drug Policy. 2021, 96:103424. (A; FI= 5.93; Q1, Substance Abuse; JCR 2021). PMID: 34429222 DOI: 10.1016/j.drugpo.2021.103424.

PUBMED

María José Ruiz-Lopéz, Milagros Muñoz-Chimeno, Jordi Figuerola, Ana M. Gavilán, Sarai Varona, Isabel Cuesta, Josué Martínez-de la Puente, Angel Zaballos, Francisca Molero, Ramón C. Soriguer, Mª Paz Sánchez-Seco, Santiago Ruiz, Ana Vázquez. Genomic analysis of West Nile virus lineage 1 isolated from mosquitoes

María José Ruiz-Lopéz, Milagros Muñoz-Chimeno, Jordi Figuerola, Ana M. Gavilán, Sarai Varona, Isabel Cuesta, Josué Martínez-de la Puente, Angel Zaballos, Francisca Molero, Ramón C. Soriguer, Mª Paz Sánchez-Seco, Santiago Ruiz, Ana Vázquez. Genomic analysis of West Nile virus lineage 1 isolated from mosquitoes from 2020-2021 outbreak occurred in Andalusia, Spain. Viruses 2023, 15, 266. https://doi.org/10.3390/v15020266

DOI

Jordi Figuerola, Miguel Ángel Jiménez-Clavero, María José Ruíz-López, Francisco Llorente, Santiago Ruiz, Andreas Hoefer, Pilar Aguilera-Sepúlveda, Jéssica Jiménez Peñuela1, Olaya García-Ruiz, Laura Herrero, Ramón C. Soriguer, Raúl Fernández Delgado, Mari Paz Sánchez-Seco, Josué Martínez-de la Puente, Ana Vázquez. A One Health view of the West Nile virus outbreak in Andalusía (Spain) in 2020

Jordi Figuerola, Miguel Ángel Jiménez-Clavero, María José Ruíz-López, Francisco Llorente, Santiago Ruiz, Andreas Hoefer, Pilar Aguilera-Sepúlveda, Jéssica Jiménez Peñuela1, Olaya García-Ruiz, Laura Herrero, Ramón C. Soriguer, Raúl Fernández Delgado, Mari Paz Sánchez-Seco, Josué Martínez-de la Puente, Ana Vázquez. A One Health view of the West Nile virus outbreak in Andalusía (Spain) in 2020. Emerg Microbes Infect. 2022 Dec;11(1):2570-2578. doi: 10.1080/22221751.2022.2134055.

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The researchers of the Viral Infection and Immunity Unit (UIVI) are part of the CIBER de Infectious Diseases (CIBERINFEC) as an independent group (https://www.ciberinfec.es/grupos/grupo-de-investigacion?id=27501).  The UIVI studies the immunopathology of clinically relevant infections in humans, such as chronic viral hepatitis (Hepatitis B, C and D), HIV, and SARS-CoV-2, and their impact on the clinical evolution of infected patients. We also analyse the evolution of the patient after controlling viral replication or after eliminating the virus spontaneously or by antiviral treatment.

The group focuses mainly on translational research in which collaborating clinical groups also participate. On the one hand, ‘omics’ techniques such as genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, epigenetics and metagenomics are used, which, depending on the type of study, are targeted or not. On the other hand, specific laboratory assays designed in-house, such as PCR, RT-PCR, immunoassays for virus titration and neutralisation, production of monoclonal antibodies, among others, are carried out. With the molecular data obtained from patient samples, we perform bioinformatics/statistical analyses, analysing their association with the clinical condition of the patients and their subsequent evolution. 

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