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Investigation
Transcriptomic tools applied to the diagnosis and prognosis of infectious diseases
Research Lines
Content with Investigacion .
Líneas de investigación prioritarias
1. Estudio de los procesos de latencia y reactivación del VIH-1: principales mecanismos homeostáticos responsables de la latencia proviral y la generación de los reservorios virales que imposibilitan la erradicación de la enfermedad.
2. Estudio de dianas terapéuticas para impedir la replicación viral activa durante la infección aguda o primaria y para interferir con la renovación del reservorio viral: análisis de fármacos inhibidores de las kinasas de linfocitos PKC o kinasas de la familia Src como p56Lck.
3. Análisis de los mecanismos de transactivación responsables de la replicación viral activa en linfocitos T CD4+: mecanismos virales implicados en reactivación del provirus.
4. Estudio de mecanismos que impidan la infección y replicación viral eficaz en células del reservorio viral secundario como son los monocitos/macrófagos.
5. Análisis de la resistencia a la infección por VIH-1 en linfocitos T CD4+ aislados de pacientes con distrofia muscular de cintura escapulohumeral/pélvica 1F (LGMD1F), que portan un defecto en el gen de la transportina-3 (tnpo3).
6. Estudio de la sinergia NF-B/Tat para la identificación de nuevas dianas terapéuticas.
7. Estudio de cambios de expresión en el transcriptoma y modificaciones postraduccionales en el proteoma de linfocitos T CD4+ que expresan Tat intracelular y su impacto sobre la estructura del citoesqueleto celular: mecanismo potencial de supervivencia de los reservorios virales.
8. Análisis de los mecanismos de degradación de p65/RelA (NF-B) y su importancia en la infección por VIH-1.
9. Estudio de las modificaciones en el metabolismo del RNA inducidas por la expresión intracelular de Tat y su papel en los mecanismos de supervivencia celular y aumento de la replicación viral.
Otras líneas de investigación
1. Estudio de la respuesta humoral y celular desarrollada en pacientes con Long COVID o COVID persistente.
2. Análisis de biomarcadores predictivos de gravedad en pacientes con distintas presentaciones de COVID-19.
3. Estudio de la respuesta inmune frente a la infección natural por SARS-CoV-2 o por la vacunación frente al COVID-19 desarrollada por pacientes con enfermedades oncohematológicas en estado de inmunodeficiencia.
4. Definición de biomarcadores predictivos de recaída en pacientes con leucemia mieloide crónica que hayan interrumpido el tratamiento con inhibidores de tirosina kinasas.
Research projects
Content with Investigacion .
1. Título del proyecto: Estudio del efecto de la inmunoterapia y el tratamiento antirretroviral a largo plazo sobre la evolución del reservorio del VIH durante la infección crónica: Búsqueda de nuevas estrategias para una cura funcional.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Plan Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación 2021-2023.
Financiación: 275.000€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/09/2023 – 31/08/2027
Expediente contrato/proyecto: PID2022-141317OB-I00 (MPY 345/23)
2. Título del proyecto: Estudio longitudinal de la evolución de parámetros inmunológicos en personas con COVID persistente: definición de biomarcadores de persistencia.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Acción Estratégica en Salud Intramural.
Financiación: 92.000€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/01/2023 – 31/12/2025
Expediente contrato/proyecto: PI22CIII/00059 (MPY 354/22)
3. Título del proyecto: Nuevas estrategias terapéuticas basadas en inhibidores de tirosina kinasas para la eliminación del reservorio latente del VIH-1.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, Convocatoria del Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad.
Financiación: 157.300€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/06/2020 – 31/05/2023
Contratación de personal: 1 licenciado en prácticas (2 años)
Expediente contrato/proyecto: PID2019-110275RB-I00 (MPY 274/20)
4. Título del proyecto: Identification of predictive biomarkers associated with immune responses against SARS-CoV-2 (Work Package 4, dentro de la Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora frente a la pandemia por SARS-CoV2 en España).
Investigadoras principales: María Teresa Coiras López (Investigadora principal Work package 4); Inmaculada Casas Flecha (coordinadora proyecto general).
Agencia financiadora: FONDO–COVID19, en el marco del Real Decreto-ley 8/2020, de 17 de marzo, de medidas urgentes extraordinarias para hacer frente al impacto económico y social de la enfermedad COVID-19
Financiación: 23.000€ (WP4); 325.909€ (proyecto general)
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/03/2020 – 01/11/2021
Contratación de personal: 1 licenciado por obra y servicio (6 meses)
Expediente contrato/proyecto: COV20_00679 (MPY 222/20)
5. Título del proyecto: Identification of predictive biomarkers associated with immune responses against SARS-CoV-2 (Work Package 4, dentro de la Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora frente a la pandemia por SARS-CoV2 en España).
Investigadoras principales: María Teresa Coiras López (Investigadora principal Work package 4); Inmaculada Casas Flecha (coordinadora proyecto general).
Agencia financiadora: CHIESI ESPAÑA, S.A.U.
Financiación: 50.000€ (donación específica al WP4, aceptada por el ISCIII el 09/07/2020)
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 09/07/20 – 01/11/2021
Expediente contrato/proyecto: COV20_00679 (MPY 222/20)
6. Título del proyecto: Tyrosine Kinase inhibition: The New Front in HIV Cure Efforts
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: NIH Research Project Grant Program (R01).
Financiación: 598.181,47€
Entidades participantes: ISCIII/Universidad de Utah
Duración: 31/10/2018 - 31/10/2024
Contratación de personal: 1 contrato de doctor por la Ley de la Ciencia (4,5 años); 1 contrato de licenciado por obra y servicio (3 años)
Expediente contrato/proyecto: R01-AI143567 (MPY 230/19)
7. Título del proyecto: Estudio de compuestos inhibidores de tirosina kinasas para impedir la formación del reservorio latente del VIH-1 en linfocitos T CD4+
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Convocatoria del Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad.
Financiación: 157.300€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/12/2016 - 31/12/2019
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (2,5 años)
Expediente contrato/proyecto: SAF2016-78480-R (MPY 1361/16)
8. Título del proyecto: PKC theta y Lck como potenciales dianas terapéuticas para la disminución del reservorio viral durante la infección aguda por VIH-1 en linfocitos T CD4.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Convocatoria del Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad.
Financiación: 163.350€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/01/2014 - hasta: 30/09/2017
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (2 años)
Expediente contrato/proyecto: SAF2013-44677-R (MPY 1250/14)
9. Título del proyecto: Dasatinib preserves the activity of the antiviral factor SAMHD1 in human CD4+ T cells: potential use for the control of HIV-1 replication in patients with acute (primary) infection and prevention of the establishment of viral reservoirs.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Bristol-Myers Squibb (BMS). Non-Clinical Research Proposal
Financiación: 74.000€
Entidades participantes: ISCIII, BMS
Duración: 01-01-14 - 31-12-14
Expediente contrato/proyecto: AI471-041
10. Título del proyecto: Análisis de fármacos inhibidores selectivos de la protein kinasa C (PKC) theta para el bloqueo de la replicación del VIH durante la infección primaria.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: ISCIII
Financiación: 63.104€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/12/2012 - hasta: 30/09/2015
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (2 años)
Expediente contrato/proyecto: MPY 1371/12
11. Título del proyecto: Análisis de fármacos inhibidores selectivos de la protein kinasa C (PKC) theta para el bloqueo de la replicación del VIH durante la infección primaria.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Sanidad, Servicios Sociales e Igualdad.
Financiación: 51.510€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/03/2012 - hasta: 01/10/2013
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (1 año)
Expediente contrato/proyecto: EC11-285 (MPY 1046/12)
12. Título del proyecto: Papel de PKC theta en la infección por VIH-1 y búsqueda de nuevas dianas terapéuticas.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Fundación para la Investigación y Prevención del SIDA en España (FIPSE), convocatoria XI. Premio FIPSE como joven investigadora del año, (30/05/11)
Financiación: 129.746€
Entidades participantes: ISCIII/Universidad Rey Juan Carlos (URJC)
Duración: 15/01/2011 - 15/07/2014
Contratación de personal: un técnico de laboratorio por obra y servicio (3 años)
Expediente contrato/proyecto: 360924/10 (MPY 1044/11)
13. Título del proyecto: Análisis de las modificaciones postraduccionales inducidas por la expresión intracelular de la proteina Tat del VIH-1 en linfocitos T y efecto sobre el metabolismo del RNA.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, convocatoria 2010.
Financiación: 67.760€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 31/12/2010 - 31/12/2013
Expediente contrato/proyecto: SAF2010-18388 (MPY 1401/10)
14. Título del proyecto: Papel de PKC theta en la infección por VIH-1 y búsqueda de nuevas dianas terapéuticas
Investigadoras principales: María Teresa Coiras López (ISCIII); Gema Díaz Gil (URJC)
Agencia financiadora: CAM-URJC (Programa de creación y consolidación de grupos de investigación cofinanciada por la Universidad Rey Juan Carlos y la Comunidad de Madrid, convocatoria 2009)
Financiación: 18.900€
Entidades participantes: ISCIII y URJC
Duración: 01/01/2011 - 31/12/2011
Expediente contrato/proyecto: CCG10-URJC/SAL-5020.
15. Título del proyecto: Estudio de la degradación de p65/RelA en linfocitos T humanos.
Investigadora principal: María Teresa Coiras López
Agencia financiadora: Fundación para la Investigación y Prevención del SIDA en España (FIPSE), convocatoria VIII.
Financiación: 36.139€
Entidades participantes: ISCIII
Duración: 01/01/2008 – 01/01/2011
Expediente contrato/proyecto: 36633/07 (MPY 1471/07)
Publications
Mycobacterium mageritense meningitis in an immunocompetent patient with an intrathecal catheter.
9. Muñoz-Sanz A, Rodríguez Vidigal FF, Vera-Tome A, Jimenez MS. Mycobacterium mageritense meningitis in an immunocompetent patient with an intrathecal catheter. Enfer Infecc Microbiol Clin. 2013; 31:59-6
PUBMED DOIMeasles virus genotype D4 strains with non-standard length M-F non-coding region circulated during the major outbreaks of 2011-2012 in Spain.
2. Gil H, Fernández-García A*, Mosquera MM, Hübschen JM, Castellanos AM, de Ory F, Masa-Calles J, Echevarría JE.Measles virus genotype D4 strains with non-standard length M-F non-coding region circulated during the major outbreaks of 2011-2012 in Spain. PLoS One. 2018 Jul. 16;13(7):e0199975. * Corresponding author.
PUBMED DOIIsolation, antigenicity and immunogenicity of Lleida Bat Lyssavirus
3. Banyard AC, Selden D, Wu G; Thorne L, Jennings D, Marston D, Finke S, Freuling CM, Mueller T, Echevarria JE, Fooks AR. Isolation, antigenicity and immunogenicity of Lleida Bat Lyssavirus. Journal of General Virology, 2018. 99(12):1590-1599
PUBMED DOIShift within age-groups of mumps incidence, hospitalizations and severe complications in a highly vaccinated population
6. López-Perea N, Masa-Callesa J, Torres de Miera MV, Fernández-García A, Echevarría JE, de Ory F, Martínez de Aragón MV. Shift within age-groups of mumps incidence, hospitalizations and severe complications in a highly vaccinated population. Spain, 1998–2014. Vaccine, 2017, 35(34): 4339-4345.
PUBMED DOIThe Complexity of Antibody Responses Elicited against the Respiratory Syncytial Virus Glycoproteins in Hospitalized Children Younger than 2 Years
2. Trento A, Rodriguez-Fernandez R, Gonzalez-Sanchez MI, Gonzalez-Martinez F, Mas V, Vazquez M, et al. The Complexity of Antibody Responses Elicited against the Respiratory Syncytial Virus Glycoproteins in Hospitalized Children Younger than 2 Years. Front Microbiol. 2017;8:2301.
PUBMED DOIPotent single-domain antibodies that arrest respiratory syncytial virus fusion protein in its prefusion state.
3. Rossey I, Gilman MS, Kabeche SC, Sedeyn K, Wrapp D, Kanekiyo M, et al. Potent single-domain antibodies that arrest respiratory syncytial virus fusion protein in its prefusion state. Nat Commun. 2017;8:14158.
PUBMED DOIRapid profiling of RSV antibody repertoires from the memory B cells of naturally infected adult donors
6. Gilman MS, Castellanos CA, Chen M, Ngwuta JO, Goodwin E, Moin SM, et al. Rapid profiling of RSV antibody repertoires from the memory B cells of naturally infected adult donors. Sci Immunol. 2016;1(6).
PUBMED DOICharacterization of a Prefusion-Specific Antibody That Recognizes a Quaternary, Cleavage-Dependent Epitope on the RSV Fusion Glycoprotein.
8. Gilman MS, Moin SM, Mas V, Chen M, Patel NK, Kramer K, et al. Characterization of a Prefusion-Specific Antibody That Recognizes a Quaternary, Cleavage-Dependent Epitope on the RSV Fusion Glycoprotein. PLoS Pathog. 2015;11(7):e1005035.
PUBMED DOIPolyclonal and monoclonal antibodies specific for the six-helix bundle of the human respiratory syncytial virus fusion glycoprotein as probes of the protein post-fusion conformation.
9. Palomo C, Mas V, Vazquez M, Cano O, Luque D, Terron MC, et al. Polyclonal and monoclonal antibodies specific for the six-helix bundle of the human respiratory syncytial virus fusion glycoprotein as probes of the protein post-fusion conformation. Virology. 2014;460-461:119-27.
PUBMED DOIBiophysical properties of single rotavirus particles account for the functions of protein shells in a multilayered virus
Jiménez-Zaragoza M., Yubero M.L., Martín-Forero E., Castón J.R., Reguera D., Luque D.*, de Pablo P.J., Rodríguez J.M. 2018. Biophysical properties of single rotavirus particles account for the functions of protein shells in a multilayered virus. eLife 7: e37295. *Corresponding author.
PUBMED DOIAcquisition of functions on the outer capsid surface during evolution of double-stranded RNA fungal viruses
Mata C.P., Luque D., Gómez-Blanco J., Rodríguez J.M., González J.M., Suzuki N., Ghabrial S.A., Carrascosa J.L., Trus B.L., Castón J.R. 2017. Acquisition of functions on the outer capsid surface during evolution of double-stranded RNA fungal viruses. PLoS Pathog. 13(12):e1006755.
PUBMED DOIStructural Insights into the Assembly and Regulation of Distinct Viral Capsid Complexes
Sarker S., C. Terrón M., Khandokar Y., Aragão D., Hardy J.M., Radjainia M., Jiménez-Zaragoza M., de Pablo P.J., Coulibaly F., Luque D., Raidal D.R., Forwood J.K. 2016. Structural Insights into the Assembly and Regulation of Distinct Viral Capsid Complexes. Nat. Commun. 7:13014. IF: 12.124; D1.
PUBMED DOIHeterodimers as the structural unit of the T=1 capsid of the fungal dsRNA Rosellinia necatrix quadrivirus 1
Luque D., Mata C.P., González-Camacho F., González J.M., Gómez-Blanco J., Alfonso C., Rivas G., Havens W.M., Kanematsu S., Suzuki N., Ghabrial S.A., Trus B.L., Castón J.R. 2016. Heterodimers as the structural unit of the T=1 capsid of the fungal dsRNA Rosellinia necatrix quadrivirus 1. J Virol. 90(24):11220-11230. IF: 4.666, Q1.
PUBMED DOISelf-assembly and characterization of small and monodisperse dye nanospheres in a protein cage
Luque D., de la Escosura A., Snijder J., Brasch M., Burnley R.J, Koay M.S.T., Carrascosa J.L., Wuite G.J.L., Roos W.H., Heck A.J.R., J.J.L.M Cornelissen, Torres T., Castón J.R. 2014. Self-assembly and characterization of small and monodisperse dye nanospheres in a protein cage. Chem. Sci.,5, 575-581. IF: 9.211, D1.
DOICryo-EM near-atomic structure of a dsRNA fungal virus shows ancient structural motifs preserved in the dsRNA viral lineage.
Luque D., Gómez-Blanco J., Garriga D., Brilot A.F., González J.M., Havens W.M., Carrascosa J.L., Trus B.L., Verdaguer N., Ghabrial S.A., Castón J.R. 2014. Cryo-EM near-atomic structure of a dsRNA fungal virus shows ancient structural motifs preserved in the dsRNA viral lineage. Proc Natl Acad Sci U S A 111(21):7641-7646. IF: 9.674, D1
PUBMED DOINew insights into rotavirus entry machinery: stabilization of rotavirus spike conformation is independent of trypsin cleavage
Rodríguez J.M., Chichón F.J., Martín-Forero E., González-Camacho F., Carrascosa J.L., Castón J.R., Luque D*. 2014. New insights into rotavirus entry machinery: stabilization of rotavirus spike conformation is independent of trypsin cleavage. PLoS Pathog. 10(5):e1004157. IF: 7.562, D1. * Corresponding autor.
PUBMED DOI