Hepatitis C and other RNA virus
Research Lines
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Hepatitis C y otros virus RNA
A) Respuesta de anticuerpos neutralizantes frente al virus de la Hepatitis C (VHC) en pacientes infectados.
Aproximadamente 58 millones de personas están infectadas crónicamente con el VHC en el mundo. Estas personas tienen un riesgo elevado de desarrollar cirrosis y carcinoma hepático. Diversos estudios apuntan a que los anticuerpos neutralizantes de amplio espectro frente al VHC tienen un papel importante en la protección frente a la infección.
El objetivo de esta línea es analizar las características (título, avidez, capacidad neutralizante, amplitud) de la respuesta de anticuerpos frente al VHC, tanto en personas infectadas solo con el VHC como en pacientes coinfectados con VHC y VIH. También estudiamos la duración de esa respuesta después de la eliminación del VHC mediante tratamiento antiviral. Determinar cuáles son los títulos, la amplitud y la duración de los anticuerpos neutralizantes después del tratamiento es esencial para diseñar estrategias encaminadas a proteger a las personas de la infección por VHC.
B) Desarrollo de pruebas diagnósticas rápidas para detectar la proteína “core" del VHC en sangre de individuos infectados.
En las etapas iniciales, la hepatitis C es asintomática, por lo que menos del 20% de las personas infectadas con el VHC a nivel mundial son conscientes de que lo están. Por lo tanto, es fundamental detectar esas personas infectadas para evitar que la enfermedad progrese y que contagien a otras.
El objetivo de esta línea es el desarrollo de una prueba de diagnóstico rápido para facilitar la detección y el control del VHC. Nuestro propósito es que sea un ensayo fácil de usar en el punto de atención, sensible, fiable, rápido y económico, y que detecte infección activa. Este ensayo se basará en la detección del antígeno “core" del VHC en sangre mediante ensayos de cromatografía de flujo lateral y nanosistemas dendríticos.
C) Regulación de la respuesta inmune innata frente al virus respiratorio sincitial (VRS) y al coronavirus tipo 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2) en pacientes infectados.
El VRS produce bronquiolitis y neumonía principalmente en niños pequeños y ancianos. A nivel mundial, aproximadamente 33 millones de niños sufren infecciones del tracto respiratorio inferior al año debidas a este virus. Una respuesta inmune caracterizada por un exceso de inflamación parece estar relacionada con la patología asociada a las infecciones graves.
El objetivo de esta línea es analizar cómo se inicia y cómo se regula esa respuesta inflamatoria en las células epiteliales respiratorias infectadas. Esta información puede ser relevante para desarrollar nuevos tratamientos que modulen la respuesta inmune frente al VRS y así evitar la inmunopatología asociada a la infección.
Estudios similares se están llevando a cabo en pacientes infectados con el SARS-CoV-2. El objetivo es analizar la respuesta inmune innata tanto en el tracto respiratorio superior como en sangre para encontrar biomarcadores que se asocien con gravedad.
D) Respuesta de anticuerpos frente al SARS-CoV-2 en pacientes infectados.
Los anticuerpos neutralizantes son fundamentales en la protección de numerosas infecciones, incluida la del SARS-CoV-2. Nuestro objetivo es estudiar la respuesta de anticuerpos (títulos, capacidad neutralizante, afinidad, duración, etc.) en diferentes cohortes de pacientes infectados con este virus (mujeres embarazadas, immunodeprimidos), lo que proporcionará una valiosa información sobre cuáles son los niveles y características de los anticuerpos que confieren protección frente al SARS-CoV-2.
Research projects
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Proyectos como investigador principal
1.- Título del proyecto: Desarrollo de un ensayo de diagnóstico rápido para el cribado de la infección activa del virus de la hepatitis C basado en la detección del “core" (VHCAgc). Duración: 01/01/2020 - 31/12/2022. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (PI19CIII/00009). Cuantía de la subvención: 53.000 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
2.- Título del proyecto: Ubiquitinación/deubiquitinación: control del equilibrio entre inflamación y replicación viral en infecciones por el virus respiratorio sincitial humano. Duración: 01/01/2016 - 31/12/2019. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (PI15CIII/00024). Cuantía de la subvención: 81.500 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
3.- Título del proyecto: Regulación por deubiquitinasas de la respuesta inflamatoria inducida por el virus respiratorio sincitial humano. Duración: 01/01/2012 - 31/12/ 2015. Entidad financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI11/00590). Cuantía de la subvención: 86.212 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
4.- Título del proyecto: Interacciones entre el virus respiratorio sincitial humano y la célula huésped: El sistema del activador del plasminógeno (uroquinasa) y su receptor. Duración: 01/01/2009 - 31/12/2012. Entidad financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI08/0702). Cuantía de la subvención: 114.950 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
5.- Título del proyecto: Cambios en la expresión de genes celulares tras la infección por el virus respiratorio sincitial humano: Relevancia patológica. Duración: 01/01/2005 - 31/12/ 2007. Entidad financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI04/0864). Cuantía de la subvención: 97.750 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
6.- Título del proyecto: Cambios en la expresión de genes celulares tras la infección por el virus respiratorio sincitial humano: Relevancia patológica. Duración: 01/11/2003 - 30/09/ 2007. Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia y Tecnología (Progama Ramón y Cajal). Cuantía de la subvención: 135.697,59 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
Proyectos como investigador asociado
1.- Título del proyecto: CIBER de Enfermedades Infecciosas. Duración: 5 años (2022-2026). Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (CB21/13/00044). Cuantía de la subvención: 300.000 €. Investigador responsable: Salvador Resino.
2.- Título del proyecto: Identification of Biomarkers that Predict Severity in COVID-19 patients. Duración: 3 años 1 mes (1 marzo 2020-31 marzo 2023). Entidad financiadora: Canadian Institutes of Health Research (CIHR) (OV2-170357). Cuantía de la subvención: 1.000.000 $. Investigador responsable: David Kelvin.
3.- Título del proyecto: Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora de actividades frente a la pandemia por SARS-COV2 en España. Duración: 12 meses. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (COV20_00679). Cuantía de la subvención: 325.909,46 €. Investigador responsable: Inmaculada Casas.
4.- Título del proyecto: Infección por COVID-19 en pacientes infectados por VIH incluídos en CoRIS. Duración: 12 meses. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (COV20_00108). Cuantía de la subvención: 67.885,00 €. Investigador responsable: Juan Berenguer
5.- Título del proyecto: Factores de riesgo, pronóstico personalizados y seguimiento a un año de los enfermos ingresados en las unidades de Cuidados Intensivos Españolas infectados por el virus COVID19: CIBERESUCICOVID. Duración: 12 meses. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (COV20_00110). Cuantía de la subvención: 1.750.000,00 €. Investigador responsable: Antoni Torres Martí
Publications
Outbreak of invasive meningococcal disease caused by a meningococcus serogroup B expressing a rare porA genosubtype (19-54, 15), Spain, March to April 2024.
Abad R, Navarro C, García-Amil C, Montes M, Castañeda-García A, Cuadros JA, Galar A, Martin F, Mena E, Pérez de Madrid S, Román C, Soler M, Vázquez JA. Euro Surveill. 2025 Nov;30(44):2500222
PUBMED DOITrends in invasive bacterial diseases during the first 2 years of the COVID-19 pandemic: analyses of prospective surveillance data from 30 countries and territories in the IRIS Consortium
Shaw D, Abad R, Amin-Chowdhury Z, Bautista A, Bennett D, Broughton K, Cao B, Casanova C, Choi EH, Chu YW, Claus H, Coelho J, Corcoran M, Cottrell S, Cunney R, Cuypers L, Dalby T, Davies H, de Gouveia L, Deghmane AE, Demczuk W, Desmet S, Domenech M, Drew R, du Plessis M, Duarte C, Erlendsdóttir H, Fry NK, Fuursted K, Hale T, Henares D, Henriques-Normark B, Hilty M, Hoffmann S, Humphreys H, Ip M, Jacobsson S, Johnson C, Johnston J, Jolley KA, Kawabata A, Kozakova J, Kristinsson KG, Krizova P, Kuch A, Ladhani S, Lâm TT, León ME, Lindholm L, Litt D, Maiden MCJ, Martin I, Martiny D, Mattheus W, McCarthy ND, Meehan M, Meiring S, Mölling P, Morfeldt E, Morgan J, Mulhall R, Muñoz-Almagro C, Murdoch D, Murphy J, Musilek M, Mzabi A, Novakova L, Oftadeh S, Perez-Argüello A, Pérez-Vázquez M, Perrin M, Perry M, Prevost B, Roberts M, Rokney A, Ron M, Sanabria OM, Scott KJ, Sheppard C, Siira L, Sintchenko V, Skoczyńska A, Sloan M, Slotved HC, Smith AJ, Steens A, Taha MK, Toropainen M, Tzanakaki G, Vainio A, van der Linden MPG, van Sorge NM, Varon E, Vohrnova S, von Gottberg A, Yuste J, Zanella R, Zhou F, Brueggemann AB. Lancet Digit Health. 2023 Sep;5(9):e582-e593.
PUBMED DOIEffectiveness of a Meningococcal Group B Vaccine (4CMenB) in Children
Castilla J, García Cenoz M, Abad R, Sánchez-Cambronero L, Lorusso N, Izquierdo C, Cañellas Llabrés S, Roig J, Malvar A, González Carril F, Boone ALD, Pérez Martín J, Rodríguez Recio MJ, Galmés A, Caballero A, García Rojas A, Juanas F, Nieto M, Viloria Raymundo LJ, Martínez Ochoa E, Rivas AI, Castrillejo D, Moreno Pérez D, Martínez A, Borràs E, Sánchez Gómez A, Pastor E, Nartallo V, Arteagoitia JM, Álvarez-Fernández B, García Pina R, Fernández Arribas S, Vanrell J, García Hernández S, Mendoza RM, Méndez M, López-Tercero MM, Fernández-Rodríguez Á, Blanco Á, Carrillo de Albornoz FJ, Ruiz Olivares J, Ruiz-Montero R, Limia A, Navarro-Alonso JA, Vázquez JA, Barricarte A. N Engl J Med. 2023 Feb 2;388(5):427-438
PUBMED DOIPertactin-Deficient Bordetella pertussis with Unusual Mechanism of Pertactin Disruption, Spain, 1986-2018
14. Mir-Cros A, Moreno-Mingorance A, Martín-Gómez MT, Abad R, Bloise I, Campins M, González-Praetorius A, Gutiérrez MN, Martín-González H, Muñoz-Almagro C, Orellana MÁ, de Pablos M, Roca-Grande J, Rodrigo C, Rodríguez ME, Uriona S, Vidal MJ, Pumarola T, Larrosa MN, González-López JJ. Emerg Infect Dis. 2022 May;28(5):967-976
PUBMED DOIHigh susceptibility to zoliflodacin and conserved target (GyrB) for zoliflodacin among 1209 consecutive clinical Neisseria gonorrhoeae isolates from 25 European countries, 2018.
Unemo M, Ahlstrand J, Sánchez-Busó L, Day M, Aanensen D, Golparian D, Jacobsson S, Cole MJ, Torreblanca RA, Ásmundsdóttir LR, Balla E, De Baetselier I, Bercot B, Carannante A, Caugant D, Borrego MJ, Buder S, Cassar R, Cole M, Dam A, Eder C, Hoffmann S, Hunjak B, Jeverica S, Kirjavainen V, Maikanti-Charalambous P, Miriagou V, Mlynarczyk-Bonikowska B, Pakarna G, Patterson L, Pavlik P, Perrin M, Shepherd J, Stefanelli P, Unemo M, Jelena V, Zákoucká H. J Antimicrob Chemother. 2021 Feb 10:dkab024
PUBMED DOIFirst Insight into the Genome Sequences of Two Linezolid-Resistant Nocardia farcinica Strains Isolated from Patients with Cystic Fibrosis
2: Valdezate S, Monzón S, Garrido N, Zaballos A, Medina-Pascual MJ, Azcona-Gutiérrez JM, Vilar B, Cuesta I. First Insight into the Genome Sequences of Two Linezolid-Resistant Nocardia farcinica Strains Isolated from Patients with Cystic Fibrosis. Genome Announc. 2017 Nov 16;5(46).
PUBMED DOIApoptosis, Toll-like, RIG-I-like and NOD-like Receptors Are Pathways Jointly Induced by Diverse Respiratory Bacterial and Viral Pathogens.
3: Martínez I, Oliveros JC, Cuesta I, de la Barrera J, Ausina V, Casals C, de Lorenzo A, García E, García-Fojeda B, Garmendia J, González-Nicolau M, Lacoma A, Menéndez M, Moranta D, Nieto A, Ortín J, Pérez-González A, Prat C, Ramos-Sevillano E, Regueiro V, Rodriguez-Frandsen A, Solís D, Yuste J, Bengoechea JA, Melero JA. Apoptosis, Toll-like, RIG-I-like and NOD-like Receptors Are Pathways Jointly Induced by Diverse Respiratory Bacterial and Viral Pathogens. Front Microbiol. 2017 Mar 1;8:276
PUBMED DOIMolecular identification, antifungal resistance and virulence of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans isolated in Seville, Spain
Gago S, Serrano C, Alastruey-Izquierdo A, Cuesta I, Martín-Mazuelos E, Aller AI, Gómez-López A, Mellado E. Molecular identification, antifungal resistance and virulence of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans isolated in Seville, Spain. Mycoses. 2017 Jan;60(1):40-50
PUBMED DOIHigh-Quality Draft Genome Sequence of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis
7: Cuesta I, González LM, Estrada K, Grande R, Zaballos A, Lobo CA, Barrera J, Sanchez-Flores A, Montero E. High-Quality Draft Genome Sequence of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis. Genome Announc. 2014 Nov 13;2(6).
PUBMED DOISerum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis
8: Duarte RF, Sánchez-Ortega I, Cuesta I, Arnan M, Patiño B, Fernández de Sevilla A, Gudiol C, Ayats J, Cuenca-Estrella M. Serum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis. Clin Infect Dis. 2014 Dec 15;59(12):1696-702.
PUBMED DOIAnalysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets.
9: Barrera A, Alastruey-Izquierdo A, Martín MJ, Cuesta I, Vizcaíno JA. Analysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets. PLoS Comput Biol. 2014 Jul 17;10(7):e1003733.
PUBMED DOICryptococcus neoformans can form titan-like cells in vitro in response to multiple signals
2. Trevijano-Contador N, de Oliveira HC, García-Rodas R, Rossi SA, Llorente I, Zaballos Á, Janbon G, Ariño J, Zaragoza Ó. Cryptococcus neoformans can form titan-like cells in vitro in response to multiple signals. PLoS Pathog. 2018 May 18;14(5):e1007007.
PUBMED DOIReclassification of the Candida haemulonii complex as Candida haemulonii (C. haemulonii group I), C. duobushaemulonii sp. nov. (C. haemulonii group II), and C. haemulonii var. vulnera var. nov.: three multiresistant human pathogenic yeasts
4. Cendejas-Bueno E, Kolecka A, Alastruey-Izquierdo A, Theelen B, Groenewald M, Kostrzewa M, Cuenca-Estrella M, Gómez-López A, Boekhout T. Reclassification of the Candida haemulonii complex as Candida haemulonii (C. haemulonii group I), C. duobushaemulonii sp. nov. (C. haemulonii group II), and C. haemulonii var. vulnera var. nov.: three multiresistant human pathogenic yeasts. J Clin Microbiol.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
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María Cabrerizo Sanz
Tenure Scientist and Group Leader
ORCID code: 0000-0001-7054-5696
Doctor in Chemistry, specializing in Biochemistry and Molecular Biology, Universidad Autónoma de Madrid (2000). Except for a postdoctoral period of 2 years at the Hospital de La Princesa, in which her research was related to onco-hematological diseases, the rest of her scientific career has focused on the study of infectious diseases caused by viruses and their surveillance. She joined the Instituto de Salud Carlos III in 2003, first in the Laboratory of Arbovirus and Imported Viral Diseases, then in the Laboratory of Viral Hepatitis and finally, in the Laboratory of Enterovirus (which is accredited as a National Polio Laboratory -LNP- for the WHO since 1998). She obtained the position of Tenure Scientist in 2016, at the same time she assumed the responsibility of the laboratory, currently of Enteric Viruses: Poliovirus/Enterovirus, Parechovirus and Gastroenteritis-producing Viruses, of the CNM. She has 4 scientific sexennials and 4 quinquennials recognized.
She has been and is PI of 4 consecutive research projects and 3 service contracts, from 2012 to the present, participating, in addition, in other 20 projects. As head of the LNP, she is part of the Working Group of the National Plan for the Eradication of Poliomyelitis and of the WHO European Polio Laboratory Network. She is also a member of the European Non-Polio Enterovirus Network (ENPEN), and of the national cooperation networks CIBERESP and RITIP (IdiPAZ). Since 2023 she is a Council Member from Spain of the European Society.
In total she has published 98 articles in WoS indexed journals (23 Q1 and 22 D1), being first author, senior author or correspondence author in 43 of them (H=27). She has supervised 1 PhD Thesis (2017) and 12 TFM. She is currently supervising another doctoral thesis (IMIENS-UNED). She participates as a teacher in three university masters (UCM, UAH and UV), being coordinator of the subject H2 of the Master of Virology at UCM.
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Mª Dolores Fernández García
Tenure Scientist
ORCID code: 0000-0003-0336-6596
Degree in Pharmacy (2005) and PhD from the University VII Paris Diderot in Microbiology (2010). She completed her doctoral thesis at the Pasteur Institute in Paris characterizing the molecular and cellular basis of flavivirus entry into cells. Specialist in Public Health Microbiology (European Program EUPHEM coordinated by ECDC). She has worked 3 years for the French Ministry of Foreign Affairs as a researcher at the Pasteur Institute in Dakar (Senegal) carrying out microbiological surveillance activities and research on polioviruses and non-polio enteroviruses in West Africa. She has obtained two Miguel Servet contracts: one to work at IMIBIC in Cordoba (2019) and an intramural one to work at CNM (2020). Both were awarded for the study of neurotropic viruses applying massive sequencing for their diagnosis. In 2021 he joined the CNM-ISCIII as a Tenure Research Scientist at the Enterovirus and Viral Gastroenteritis Unit of the CNM-ISCIII. Since then, she combines her scientific activity with the assistance to the National Health System in the microbiological research of outbreaks and in the Genomic Surveillance of Enteroviruses and Gastroenteritis-producing Viruses.
She is a researcher in the Epidemiology and Public Health Area of the Centro de Investigación Biomédica en Red (CIBERESP-ISCIII). In addition, she is an evaluator and panelist for the HORIZON health program projects of the European Commission, the French National Agency ANRS-Emerging Infectious Diseases, R&D&I in HEALTH of the Strategic Action in Health (ISCIII) and the Andalusian Public Foundation Progreso y Salud. She has worked as scientific advisor to the Spanish Ministry of Health on Rotavirus and Polio. Since 2020 she has been teaching virology in different Spanish universities.
She has worked for WHO in the investigation of numerous outbreaks caused by viruses (Ebola, Zika, Yellow Fever, Dengue, etc.) in African and Asian countries strengthening laboratory capacities through technology transfer of diagnostic methods, training of laboratory personnel in these countries and scientific advisory tasks to the Ministries of Health. She has been the Health Coordinator of the START Project (Spanish Technical Aid Response Team) of the AECID, framed in the “Emergency Medical Teams” initiative of the WHO, participating in the establishment for Spain of a field hospital classified by the WHO as EMT Level 2 for interventions in humanitarian emergencies.
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Nerea García Ibáñez
Ayudante de Investigación de OPI. Técnico de laboratorio
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Vanesa Recio Huertas
Ayudante de Investigación de OPI. Técnico de laboratorio (apoyo)
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Ana Donoso Almenara
Contratada predoctoral pFIS
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Rubén González Sanz
Técnico Superior Especializado OPI
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Juan Camacho Padilla
Investigador predoctoral (PFIS)
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Clara Martín Martín
Investigador predoctoral (PFIS)
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Nazaret Díaz Sánchez
Técnico Superior Especializado OPI (apoyo)
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Carmen Serrano Risquez
Investigador predoctoral (CAM)
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Yasmin Biya Assiry
Técnico de laboratorio en formación (PEJ-CAM)
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Estrella Ruiz de Pedro
Técnico de laboratorio (PTA para Infraestructuras de I+D+I)
List of staff