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Investigation
Hepatitis C and VIH/VHC coinfection
Research Lines
Content with Investigacion .
Hepatitis C y otros virus RNA
A) Respuesta de anticuerpos neutralizantes frente al virus de la Hepatitis C (VHC) en pacientes infectados.
Aproximadamente 58 millones de personas están infectadas crónicamente con el VHC en el mundo. Estas personas tienen un riesgo elevado de desarrollar cirrosis y carcinoma hepático. Diversos estudios apuntan a que los anticuerpos neutralizantes de amplio espectro frente al VHC tienen un papel importante en la protección frente a la infección.
El objetivo de esta línea es analizar las características (título, avidez, capacidad neutralizante, amplitud) de la respuesta de anticuerpos frente al VHC, tanto en personas infectadas solo con el VHC como en pacientes coinfectados con VHC y VIH. También estudiamos la duración de esa respuesta después de la eliminación del VHC mediante tratamiento antiviral. Determinar cuáles son los títulos, la amplitud y la duración de los anticuerpos neutralizantes después del tratamiento es esencial para diseñar estrategias encaminadas a proteger a las personas de la infección por VHC.
B) Desarrollo de pruebas diagnósticas rápidas para detectar la proteína “core" del VHC en sangre de individuos infectados.
En las etapas iniciales, la hepatitis C es asintomática, por lo que menos del 20% de las personas infectadas con el VHC a nivel mundial son conscientes de que lo están. Por lo tanto, es fundamental detectar esas personas infectadas para evitar que la enfermedad progrese y que contagien a otras.
El objetivo de esta línea es el desarrollo de una prueba de diagnóstico rápido para facilitar la detección y el control del VHC. Nuestro propósito es que sea un ensayo fácil de usar en el punto de atención, sensible, fiable, rápido y económico, y que detecte infección activa. Este ensayo se basará en la detección del antígeno “core" del VHC en sangre mediante ensayos de cromatografía de flujo lateral y nanosistemas dendríticos.
C) Regulación de la respuesta inmune innata frente al virus respiratorio sincitial (VRS) y al coronavirus tipo 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2) en pacientes infectados.
El VRS produce bronquiolitis y neumonía principalmente en niños pequeños y ancianos. A nivel mundial, aproximadamente 33 millones de niños sufren infecciones del tracto respiratorio inferior al año debidas a este virus. Una respuesta inmune caracterizada por un exceso de inflamación parece estar relacionada con la patología asociada a las infecciones graves.
El objetivo de esta línea es analizar cómo se inicia y cómo se regula esa respuesta inflamatoria en las células epiteliales respiratorias infectadas. Esta información puede ser relevante para desarrollar nuevos tratamientos que modulen la respuesta inmune frente al VRS y así evitar la inmunopatología asociada a la infección.
Estudios similares se están llevando a cabo en pacientes infectados con el SARS-CoV-2. El objetivo es analizar la respuesta inmune innata tanto en el tracto respiratorio superior como en sangre para encontrar biomarcadores que se asocien con gravedad.
D) Respuesta de anticuerpos frente al SARS-CoV-2 en pacientes infectados.
Los anticuerpos neutralizantes son fundamentales en la protección de numerosas infecciones, incluida la del SARS-CoV-2. Nuestro objetivo es estudiar la respuesta de anticuerpos (títulos, capacidad neutralizante, afinidad, duración, etc.) en diferentes cohortes de pacientes infectados con este virus (mujeres embarazadas, immunodeprimidos), lo que proporcionará una valiosa información sobre cuáles son los niveles y características de los anticuerpos que confieren protección frente al SARS-CoV-2.
Research projects
Content with Investigacion .
Proyectos como investigador principal
1.- Título del proyecto: Desarrollo de un ensayo de diagnóstico rápido para el cribado de la infección activa del virus de la hepatitis C basado en la detección del “core" (VHCAgc). Duración: 01/01/2020 - 31/12/2022. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (PI19CIII/00009). Cuantía de la subvención: 53.000 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
2.- Título del proyecto: Ubiquitinación/deubiquitinación: control del equilibrio entre inflamación y replicación viral en infecciones por el virus respiratorio sincitial humano. Duración: 01/01/2016 - 31/12/2019. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (PI15CIII/00024). Cuantía de la subvención: 81.500 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
3.- Título del proyecto: Regulación por deubiquitinasas de la respuesta inflamatoria inducida por el virus respiratorio sincitial humano. Duración: 01/01/2012 - 31/12/ 2015. Entidad financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI11/00590). Cuantía de la subvención: 86.212 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
4.- Título del proyecto: Interacciones entre el virus respiratorio sincitial humano y la célula huésped: El sistema del activador del plasminógeno (uroquinasa) y su receptor. Duración: 01/01/2009 - 31/12/2012. Entidad financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI08/0702). Cuantía de la subvención: 114.950 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
5.- Título del proyecto: Cambios en la expresión de genes celulares tras la infección por el virus respiratorio sincitial humano: Relevancia patológica. Duración: 01/01/2005 - 31/12/ 2007. Entidad financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI04/0864). Cuantía de la subvención: 97.750 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
6.- Título del proyecto: Cambios en la expresión de genes celulares tras la infección por el virus respiratorio sincitial humano: Relevancia patológica. Duración: 01/11/2003 - 30/09/ 2007. Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia y Tecnología (Progama Ramón y Cajal). Cuantía de la subvención: 135.697,59 €. Investigador responsable: Isidoro Martínez
Proyectos como investigador asociado
1.- Título del proyecto: CIBER de Enfermedades Infecciosas. Duración: 5 años (2022-2026). Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (CB21/13/00044). Cuantía de la subvención: 300.000 €. Investigador responsable: Salvador Resino.
2.- Título del proyecto: Identification of Biomarkers that Predict Severity in COVID-19 patients. Duración: 3 años 1 mes (1 marzo 2020-31 marzo 2023). Entidad financiadora: Canadian Institutes of Health Research (CIHR) (OV2-170357). Cuantía de la subvención: 1.000.000 $. Investigador responsable: David Kelvin.
3.- Título del proyecto: Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora de actividades frente a la pandemia por SARS-COV2 en España. Duración: 12 meses. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (COV20_00679). Cuantía de la subvención: 325.909,46 €. Investigador responsable: Inmaculada Casas.
4.- Título del proyecto: Infección por COVID-19 en pacientes infectados por VIH incluídos en CoRIS. Duración: 12 meses. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (COV20_00108). Cuantía de la subvención: 67.885,00 €. Investigador responsable: Juan Berenguer
5.- Título del proyecto: Factores de riesgo, pronóstico personalizados y seguimiento a un año de los enfermos ingresados en las unidades de Cuidados Intensivos Españolas infectados por el virus COVID19: CIBERESUCICOVID. Duración: 12 meses. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (COV20_00110). Cuantía de la subvención: 1.750.000,00 €. Investigador responsable: Antoni Torres Martí
Publications
Potential implication of azole persistence in the treatment failure of two haematological patients infected with Aspergillus fumigatus
Peláez-García de la Rasilla T, Mato-López A, Pablos-Puertas CE, González-Huerta AJ, Gómez-López A, Mellado E, Amich J. Journal of Fungi, 2023 Jul 30;9(8):805.
PUBMED DOIAspergillus fumigatus can exhibit persistence to the fungicidal drug voriconazole
Valero C., Á Mato-López, I J. Donaldson, A. Roldán, H. Chown, N. Van-Rhijn, S. Gago, T. Furukawa, A. Mogorovsky, R. Ben Ami, P. Bowyer, N. Osherov, T. Fontaine, G.H. Goldman, E. Mellado, M. Bromley and J. Amich. Microbiology Spectrum.2023 13;11(2):e0477022
PUBMED DOICOVID-19 Associated Pulmonary Aspergillosis (CAPA): Hospital or Home Environment as a source of life-threatening Aspergillus fumigatus infection?
Peláez-García de la Rasilla T, González-Jiménez I, García-Fernández Arroyo A, Roldán A, Carretero-Ares JL, Clemente-García M,, Martínez-Suarez M, Vázquez Valdés F, Melón-Garcia S, Mellado E, Sánchez-Nuñez ML on behalf HUCAPA group. Journal of Fungi, 2022 Mar 19;8(3):316.
PUBMED DOIThe sulfur-related metabolic status of Aspergillus fumigatus during infection reveals cytosolic serine hydroxymethyltransferase as a promising antifungal target
Alharthi R, Sueiro-Olivares M, Storer I, Bin Shuraym H, Scott J, Al-Shidhani R, Fortune-Grant R, Bignell E, Tabernero L, Bromley M and Amich J. 2025. Virulence, 16(1):2449075
PUBMED DOIGuasp, P., E. Lorente, A. Martín-Esteban, E. Barnea, P. Romania, D. Fruci, J. J. W. Kuiper, A. Admon, and J. A. López de Castro. 2019. Redundancy and Complementarity between ERAP1 and ERAP2 Revealed by their Effects on the Behcet's Disease-Associated HLA-B*51 Peptidome. Mol.Cell Proteomics.
Guasp, P., E. Lorente, A. Martín-Esteban, E. Barnea, P. Romania, D. Fruci, J. J. W. Kuiper, A. Admon, and J. A. López de Castro. 2019. Redundancy and Complementarity between ERAP1 and ERAP2 Revealed by their Effects on the Behcet's Disease-Associated HLA-B*51 Peptidome. Mol.Cell Proteomics.
PUBMED DOIProteomics analysis reveals that structural proteins of the virion core and involved in gene expression are the main source for HLA class II ligands in vaccinia virus-infected cells.
Lorente, E., Martin-Galiano, A. J., Barnea, E., Barriga, A., Palomo, C., Garcia-Arriaza, J., Mir, C., Lauzurica, P., Esteban, M., Admon, A., and Lopez, D. (2019) Proteomics analysis reveals that structural proteins of the virion core and involved in gene expression are the main source for HLA class II ligands in vaccinia virus-infected cells. J.Proteome.Res. 18(9):3512-3520
PUBMED DOIComputational characterization of the peptidome in transporter associated with antigen processing (TAP)-deficient cells.
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PUBMED DOILorente, E., A. Barriga, E. Barnea, C. Palomo, J. Garcia-Arriaza, C. Mir, M. Esteban, A. Admon, and D. López. 2019. Immunoproteomic analysis of a Chikungunya poxvirus-based vaccine reveals high HLA class II immunoprevalence. PLoS.Negl.Trop.Dis. 13:e0007547.
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PUBMED DOILópez, D., A. Barriga, E. Lorente, and C. Mir. 2019. Immunoproteomic Lessons for Human Respiratory Syncytial Virus Vaccine Design. J.Clin.Med. 8.
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PUBMED DOIBrait, V. H., F. Miro-Mur, I. Perez-de-Puig, L. Notario, B. Hurtado, J. Pedragosa, M. Gallizioli, F. Jimenez-Altayo, M. Arbaizar-Rovirosa, A. Otxoa-de-Amezaga, J. Monteagudo, M. Ferrer-Ferrer, l. R. de, X, E. Bonfill-Teixidor, A. Salas-Perdomo, A. Hernandez-Vidal, P. Garcia-de-Frutos, P. Lauzurica, and A. M. Planas. 2019. CD69 Plays a Beneficial Role in Ischemic Stroke by Dampening Endothelial Activation. Circ.Res. 124:279-291.
Brait, V. H., F. Miro-Mur, I. Perez-de-Puig, L. Notario, B. Hurtado, J. Pedragosa, M. Gallizioli, F. Jimenez-Altayo, M. Arbaizar-Rovirosa, A. Otxoa-de-Amezaga, J. Monteagudo, M. Ferrer-Ferrer, l. R. de, X, E. Bonfill-Teixidor, A. Salas-Perdomo, A. Hernandez-Vidal, P. Garcia-de-Frutos, P. Lauzurica, and A. M. Planas. 2019. CD69 Plays a Beneficial Role in Ischemic Stroke by Dampening Endothelial Activation. Circ.Res. 124:279-291.
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Lorente, E., J. Redondo-Anton, A. Martín-Esteban, P. Guasp, E. Barnea, P. Lauzurica, A. Admon, and J. A. López de Castro. 2019. Substantial Influence of ERAP2 on the HLA-B*40:02 Peptidome: Implications for HLA-B*27-Negative Ankylosing Spondylitis. Mol.Cell Proteomics. 18:2298-2309.
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PUBMEDLorente, E., M. G. Fontela, E. Barnea, A. J. Martín-Galiano, C. Mir, B. Galocha, A. Admon, P. Lauzurica, and D. López. 2020. Modulation of Natural HLA-B*27:05 Ligandome by Ankylosing Spondylitis-associated Endoplasmic Reticulum Aminopeptidase 2 (ERAP2). Mol.Cell Proteomics. 19:994-1004.
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PUBMED DOIRedondo-Anton, J., M. G. Fontela, L. Notario, R. Torres-Ruiz, S. Rodriguez-Perales, E. Lorente, and P. Lauzurica. 2020. Functional Characterization of a Dual Enhancer/Promoter Regulatory Element Leading Human CD69 Expression. Front Genet. 11:552949.
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PUBMED DOIFontela, M. G., L. Notario, E. Alari-Pahissa, E. Lorente, and P. Lauzurica. 2019
Fontela, M. G., L. Notario, E. Alari-Pahissa, E. Lorente, and P. Lauzurica. 2019. The Conserved Non-Coding Sequence 2 (CNS2) Enhances CD69 Transcription through Cooperation between the Transcription Factors Oct1 and RUNX1. Genes (Basel) 10.
PUBMED DOI