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Investigación
Virología Molecular
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
Investigación
La investigación del grupo de Virología Molecular está centrada en el estudio de la variación genética del VIH-1 y la evolución viral tanto por enfoques "in vitro" como "ex vivo" enfocado en las siguientes líneas:
- Pacientes no progresores. Estos pacientes mantienen el control de la enfermedad en ausencia de tratamiento antirretroviral por lo que se han propuesto como un modelo de cura funcional. Nuestro objetivo es estudiar la contribución de los factores virales en el control de la enfermedad mediante la caracterización biológica y la evolución viral en individuos con cargas virales indetectables (controladores de élite, CE), en comparación con individuos que presentan otros patrones de control viral.
- Envoltura viral: esta proteína viral es clave para determinar la eficacia viral. Por ello, su funcionalidad afecta de forma significativa a la progresión de la infección. En colaboración con Dr. Blanco y Dr. Valenzuela estudiamos qué eventos concretos (unión a CD4, fusogenicidad, etc) están relacionados con la funcionalidad de la envoltura. Para ello, hemos analizado envueltas de individuos con distintos patrones de progresión. Parte de ellas han sido cedidas al biobanco de envueltas de la Red de Investigación en SIDA para su uso.
- Doble infección: La infección por más de una variante viral (ya sea mediante co o superinfección) puede tener consecuencias en la patogénesis de la infección. En este sentido en nuestro grupo se han analizado diferentes aspectos de la DI, su detección en pacientes no progresores, su prevalencia e incidencia en España, así como la influencia de la DI sobre la respuesta neutralizante.
- Epidemiología Molecular: En el grupo de VM hemos analizado la evolución del virus a lo largo de la epidemia en España y en otros países (Holanda, Italia, Alemania, Uruguay, Panamá, Brasil, etc).
- Estudio del papel de distintos residuos aminoacídicos de la retrotranscriptasa del VIH-1 en la función enzimática y en la capacidad de replicación utilizando un clon molecular infeccioso obtenido previamente por el grupo.
- Variabilidad "in vitro". El estudio de pases seriados se ha empleado detectar los mecanismos responsables de la ganancia o pérdida de eficacia viral.
- Estudios sobre antivirales. Se ha analizado la selección de mutaciones de resistencia “in vitro” frente a distintos antivirales, así como el efecto de estas mutaciones sobre la eficacia viral, y la actividad de nuevos antivirales como los inhibidores de ATR.
Diagnóstico y Referencia Virológica en Infecciones Producidas por VIH y VLTH
El grupo de investigación ofrece y realiza actividades de diagnóstico y referencia a través de la cartera de servicios del Centro Nacional de Microbiología a todo el sistema nacional de salud.
Estos servicios incluyen:
- Diagnóstico y Referencia de la infección por el VIH (1 y 2) mediante detección de anticuerpos específicos y detección del ADN proviral mediante PCR.
- Diagnóstico y Referencia de la infección por el HTLVI/II mediante la detección de anticuerpos específicos y la detección del ADN proviral mediante PCR. Cuantificación de la carga proviral del HTLV-1 mediante PCR a tiempo real.
Laboratorio de Referencia de la Unión Europea en el ámbito de los productos sanitarios para diagnóstico in vitro Laboratorio de Referencia de la Unión Europea (EURL) en el ámbito de los productos sanitarios para diagnóstico microbiológico in vitro (IVD) de VIH y HTLV (Reglamento 2023/2713 de 5 de diciembre de 2023.) Nuestra labor es confirmar la fiabilidad y eficacia de los dispositivos para la detección de estos patógenos y garantizar sus requisitos específicos de funcionamiento mediante pruebas de laboratorio antes de que puedan ser comercializados en el mercado europeo.
Proyectos de investigación
Contenidos con Investigacion .
-Hacia una cura funcional: implicaciones de la terapia antirretroviral temprana y los cambios hormonales sobre el reservorio del VIH en adolescentes infectados perinatalmente. Fondo de Investigación Sanitaria (FIS) - Instituto de Salud Carlos III (01/01/2026 - 31/12/2028). 72.000 €. IP: María Pernas, Concepción Casado.
- Determination of factors associated with protection against Human Immunodeficiency Virus type 1 Reinfection: Identification of protection correlates. IX Convocatoria de Becas Gilead a la Investigación Biomédica, Gilead Sciences, S.L. (01/07/2023-31/06/2025). 16.330 €. IP: María Pernas.
- Impacto de la envuelta en la replicación viral del VIH: Nuevas vías para el desarrollo de vacunas. Fondo de Investigación Sanitaria (FIS) - Instituto de Salud Carlos III (01/01/2020 - 31/12/2023). 53.000 €. IP: María Pernas, Concepción Casado.
- Estudio de la virulencia del VIH-1 en pacientes recién infectados y de su contribución junto a factores clínico-epidemiológicos a la progresión clínica. Ministerio de Economía y Competitividad. Programa Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación (30/12/2016 - 30/06/2021). 145.000 €. IP: Concepción Casado, Cecilio López-Galíndez
- Contribución de la doble infección con el VIH-1 a la evolución virológica y clínica en hombres homo/bisexuales. Fondo de Investigación Sanitaria (FIS) Instituto de Salud Carlos III (01/01/2014- 31/01/2016.). 74.410 €. IP: Cecilio López-Galíndez.
- Caracterización de variantes no patogénicos del VIH obtenidos “ex vivo” e “in vitro” para el estudio de la patogenia de la enfermedad. Ministerio de Ciencia e Innovación (01/01/2011-31/01/2014). 169.400 €. IP: Cecilio López-Galíndez
- Red española de Investigación en SIDA (RIS-RETIC) Instituto de Salud Carlos III (02/01/2017-02/01/2022). 195.212 €. IP: Cecilio López-Galíndez, Concepción Casado
Publicaciones destacadas
Programa de Legionelosis. En Echevarría Mayo JE y Oteo Iglesias J (Editores) Programas de Vigilancia Microbiológica Centro Nacional de Microbiología.
Fernando González-Camacho y Almudena Cascajero. Programa de Legionelosis. En Echevarría Mayo JE y Oteo Iglesias J (Editores) Programas de Vigilancia Microbiológica Centro Nacional de Microbiología. Volumen 2:77-89. 2021-2022 Majadahonda (Madrid); Instituto de Salud Carlos III, Centro Nacional de Microbiología: 2023.
Chikungunya virus infections among travellers returning to Spain, 2008 to 2014
3. Maria Dolores Fernandez Garcia; Mathieu Bangert; Fernando de Ory; Arantxa Potente; Lourdes Hernandez; Fatima Lasala; Laura Herrero; Francisca Molero; Anabel Negredo; Ana Vázquez; Teodora Minguito; Pilar Balfagón; Jesus de la Fuente; Sabino Puente; Eva Ramírez de Arellano; Mar Lago; Miguel Martinez; Joaquim Gascón; Francesca Norman; Rogelio Lopez Velez; Elena Sulleiro; Diana Pou; Nuria Serre; Ricardo Fernández Roblas; Antonio Tenorio; Leticia Franco; Maria Paz Sanchez Seco. Chikungunya virus infections among travellers returning to Spain, 2008 to 2014. Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin. 21 - 36, (Sweden): 08/09/2016. ISSN 1560-7917
PUBMED DOILegionella feeleii: Ubiquitous Pathogen in the Environment and Causative Agent of Pneumonia
Vaccaro L, Gomes TS, Izquierdo F, Magnet A, Llorens Berzosa S, Ollero D, Salso S, Alhambra A, Gómez C, López Cano M, Pelaz C, Bellido Samaniego B, Del Aguila C, Fenoy S, Hurtado-Marcos C. Front Microbiol. 2021;12:707187.
DOIImmunogenicity of a third dose with mRNA-vaccines in the ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination regimen against SARS-CoV-2 variants.
García-Pérez J, Borobia AM, Pérez-Olmeda M, Portolés A, Castaño L, Campins-Artí M, Bertrán MJ, Bermejo M, Arribas JR, López A, Ascaso-Del-Rio A, Arana-Arri E, Fuentes Camps I, Vilella A, Cascajero A, García-Morales MT, Castillo de la Osa M, Pérez Ingidua C, Lora D, Jiménez-Santana P, Pino-Rosa S, Gómez de la Cámara A, De La Torre-Tarazona E, Calonge E, Cruces R, Belda-Iniesta C, Alcamí J, Frías J, Carcas AJ, Díez-Fuertes F. iScience. 2024; 27(9):110728
PUBMED DOILonger intervals between SARS-CoV-2 infection and mRNA-1273 doses improve the neutralization of different variants of concern
García-Pérez J, Bermejo M, Ramírez-García A, De La Torre-Tarazona HE, Cascajero A, Castillo de la Osa M, Jiménez P, Aparicio Gómez M, Calonge E, Sancho-López A, Payares-Herrera C, Layunta Acero R, Vicente-Izquierdo L, Avendaño-Solá C, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, Díez-Fuertes F. J Med Virol. 2023; 95(3):e28679
PUBMED DOIImmune response and reactogenicity after immunization with two-doses of an experimental COVID-19 vaccine (CVnCOV) followed by a third-fourth shot with a standard mRNA vaccine (BNT162b2): RescueVacs multicenter cohort study
Ascaso-Del-Rio A, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Arana-Arri E, Vergara I, Pérez-Ingidua C, Bermejo M, Castillo de la Osa M, Imaz-Ayo N, Riaño Fernández I, Astasio González O, Díez-Fuertes F, Meijide S, Arrizabalaga J, Hernández Gutiérrez L, de la Torre-Tarazona HE, Mariano Lázaro A, Vargas-Castrillón E, Alcamí J, Portolés A; RescueVac study Group. EClinicalMedicine. 2022; 51:101542
PUBMED DOIImmunogenic dynamics and SARS-CoV-2 variant neutralisation of the heterologous ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination: Secondary analysis of the randomised CombiVacS study
García-Pérez J, González-Pérez M, Castillo de la Osa M, Borobia AM, Castaño L, Bertrán MJ, Campins M, Portolés A, Lora D, Bermejo M, Conde P, Hernández-Gutierrez L, Carcas A, Arana-Arri E, Tortajada M, Fuentes I, Ascaso A, García-Morales MT, Erick de la Torre-Tarazona H, Arribas JR, Imaz-Ayo N, Mellado-Pau E, Agustí A, Pérez-Ingidua C, Gómez de la Cámara A, Ochando J, Belda-Iniesta C, Frías J, Alcamí J, Pérez-Olmeda M; CombiVacS study Group. EClinicalMedicine. 2022; 50:101529
PUBMED DOITranscriptomic Evidence of the Immune Response Activation in Individuals With Limb Girdle Muscular Dystrophy Dominant 2 (LGMDD2) Contributes to Resistance to HIV-1 Infection
Diez-Fuertes F, López-Huertas MR, García-Pérez J, Calonge E, Bermejo M, Mateos E, Martí P, Muelas N, Vílchez JJ, Coiras M, Alcamí J, Rodríguez-Mora S. Front Cell Dev Biol. 2022; 10:839813
PUBMED DOIImmunogenicity and reactogenicity of BNT162b2 booster in ChAdOx1-S-primed participants (CombiVacS): a multicentre, open-label, randomised, controlled, phase 2 trial
Borobia AM, Carcas AJ, Pérez-Olmeda M, Castaño L, Bertran MJ, García-Pérez J, Campins M, Portolés A, González-Pérez M, García Morales MT, Arana-Arri E, Aldea M, Díez-Fuertes F, Fuentes I, Ascaso A, Lora D, Imaz-Ayo N, Barón-Mira LE, Agustí A, Pérez-Ingidua C, Gómez de la Cámara A, Arribas JR, Ochando J, Alcamí J, Belda-Iniesta C, Frías J; CombiVacS Study Group. Lancet. 2021; 398(10295):121-130
PUBMED DOIFirst Insight into the Genome Sequences of Two Linezolid-Resistant Nocardia farcinica Strains Isolated from Patients with Cystic Fibrosis
2: Valdezate S, Monzón S, Garrido N, Zaballos A, Medina-Pascual MJ, Azcona-Gutiérrez JM, Vilar B, Cuesta I. First Insight into the Genome Sequences of Two Linezolid-Resistant Nocardia farcinica Strains Isolated from Patients with Cystic Fibrosis. Genome Announc. 2017 Nov 16;5(46).
PUBMED DOIApoptosis, Toll-like, RIG-I-like and NOD-like Receptors Are Pathways Jointly Induced by Diverse Respiratory Bacterial and Viral Pathogens.
3: Martínez I, Oliveros JC, Cuesta I, de la Barrera J, Ausina V, Casals C, de Lorenzo A, García E, García-Fojeda B, Garmendia J, González-Nicolau M, Lacoma A, Menéndez M, Moranta D, Nieto A, Ortín J, Pérez-González A, Prat C, Ramos-Sevillano E, Regueiro V, Rodriguez-Frandsen A, Solís D, Yuste J, Bengoechea JA, Melero JA. Apoptosis, Toll-like, RIG-I-like and NOD-like Receptors Are Pathways Jointly Induced by Diverse Respiratory Bacterial and Viral Pathogens. Front Microbiol. 2017 Mar 1;8:276
PUBMED DOIMolecular identification, antifungal resistance and virulence of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans isolated in Seville, Spain
Gago S, Serrano C, Alastruey-Izquierdo A, Cuesta I, Martín-Mazuelos E, Aller AI, Gómez-López A, Mellado E. Molecular identification, antifungal resistance and virulence of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans isolated in Seville, Spain. Mycoses. 2017 Jan;60(1):40-50
PUBMED DOIHigh-Quality Draft Genome Sequence of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis
7: Cuesta I, González LM, Estrada K, Grande R, Zaballos A, Lobo CA, Barrera J, Sanchez-Flores A, Montero E. High-Quality Draft Genome Sequence of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis. Genome Announc. 2014 Nov 13;2(6).
PUBMED DOISerum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis
8: Duarte RF, Sánchez-Ortega I, Cuesta I, Arnan M, Patiño B, Fernández de Sevilla A, Gudiol C, Ayats J, Cuenca-Estrella M. Serum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis. Clin Infect Dis. 2014 Dec 15;59(12):1696-702.
PUBMED DOIAnalysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets.
9: Barrera A, Alastruey-Izquierdo A, Martín MJ, Cuesta I, Vizcaíno JA. Analysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets. PLoS Comput Biol. 2014 Jul 17;10(7):e1003733.
PUBMED DOIContenidos con Investigacion .
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Virginia Sandonís Martín
Técnico Superior Especializado de los OPIS
Código ORCID: 0000-0001-5762-7531
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Rosa Fuentes Fernández
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Listado de personal