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Investigación

Neumococos

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Neumococos .

Vigilancia epidemiológica de los serotipos y genotipos que causan enfermedad neumocócica invasiva (ENI) en España. Caracterización molecular de factores de virulencia de neumococo. Identificación y caracterización de proteínas de neumococo candidatas a vacuna. Evaluación de mecanismos de evasión de la respuesta inmune en Streptococcus pneumoniae. Impacto de los biofilms bacterianos en la persistencia del tracto respiratorio. Mecanismos de cronicidad de aislados clínicos de neumococo en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica.

Vigilancia epidemiológica

Un pilar del laboratorio consiste en la vigilancia epidemiológica de los serotipos y genotipos que causan enfermedad neumocócica invasiva (ENI) en España. Nuestro laboratorio aporta información al Sistema Nacional de Salud procedente de la caracterización de las cepas circulantes, indicando el serotipo, genotipo y la sensibilidad antibiótica. La identificación de muestras con cultivo negativo (LCR y líquido pleural) se determina por PCR a tiempo real. El serotipado se realiza mediante la técnica de Dot-blot y PCR-secuenciación. El genotipado para el estudio de brotes y caracterización de clones asociados a cepas hipervirulentas y/o multirresistentes, se realiza mediante la técnica de MLST y análisis de genomas completos. Además, se determina la susceptibilidad antibiótica siguiendo los criterios EUCAST.

Caracterización molecular de factores de virulencia de neumococo e identificación y caracterización de proteínas de neumococo candidatas a vacuna

La cápsula polisacarídica del neumococo es el principal factor de virulencia, y la base de las actuales vacunas disponibles contra este patógeno. Debido a la elevada variabilidad de la cápsula, que diferencia actualmente a 100 serotipos, así como la existencia de cepas no capsuladas y al fenómeno del reemplazamiento de serotipos vacunales por serotipos no vacunales, es necesario un nuevo enfoque en cuanto al diseño de las vacunas dirigidas contra entre patógeno. Para ello, el laboratorio trabaja en la identificación de factores de virulencia y la caracterización del papel protector de proteínas conservadas en el neumococo que sirvan para el diseño de una vacuna universal contra este patógeno.

Evaluación de mecanismos de evasión de la respuesta inmune en Streptococcus pneumoniae

El proceso infeccioso de esta enfermedad requiere de una colonización del tracto respiratorio superior, posterior establecimiento en los pulmones, causando la neumonía, y su diseminación produciendo las patologías invasivas. Para ello emplea diversas estrategias de evasión del sistema inmune. Nuestro laboratorio estudia los diferentes mecanismos de evasión que se pueden producir en cada una de las etapas. Desde el punto de vista del patógeno se emplean mutantes de diferentes factores de virulencia, líneas celulares epiteliales y fagocitarias mientras que, para estudiar la respuesta inmune del huésped, se emplean modelos experimentales de colonización, neumonía y sepsis. Las principales técnicas analíticas son la citometría de flujo y la microscopía confocal.

Importancia del humo de tabaco y de la formación de los biofilms en la patogénesis bacteriana

El humo del tabaco es la principal causa de la Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica (EPOC) caracterizada por una disminución de la función pulmonar y una serie de patologías asociadas. Una de las complicaciones recurrentes es la infección y reinfección por microorganismos, siendo el neumococo uno de los más habituales. El hecho de que neumococo, bajo estas condiciones, tenga la capacidad de persistir produciendo neumonías repetitivas, y se asocie a la aparición de multirresistencias a antibióticos, en muchos casos asociado a su capacidad de formación de biofilms, lo convierte en uno de nuestros objetivos de investigación.

  

                           

Proyectos de investigación

Contenidos con Investigacion Neumococos .

1: Título del proyecto: Desarrollo de enzibióticos para combatir infecciones en pacientes con fibrosis quística provocadas por los patógenos Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus: CF-TREAT

Referencia: CPP2022-009574 / MPY 375/23

Agencia Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. MICINN.

Fecha Inicio:    01/12/2023
Fecha Fin:    30/11/2026
Financiación: 238.938 Euros
Investigadores principales: Roberto Díez Martínez, José E. Yuste Lobo y Pilar García Suárez

 

2: Título del proyecto: Desarrollo de enzibióticos para combatir infecciones humanas producidas por Enterococcus faecium resistente a vancomicina (ANTI‐VRE).
Proyecto CPP2021-009054 financiado por MICIU/AEI /10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/ PRTR

Investigadores principales: Roberto Díez Martínez, Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech

Periodo: 18/11/2022 - 17/11/2025

Cuantía total: 231.455 €

3: Título del proyecto: Mecanismos de virulencia en patógenos respiratorios.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación, Agencia Estatal de Investigación (Convocatoria «Proyectos I+D+I» 2020 - Modalidades «Retos Investigación» y «Generación de Conocimiento»). Referencia: PID2020-119298RB-I00

Investigador principal: Jose Yuste Lobo

Periodo: 01/09/2021 - 30/08/2024

Cuantía total: 121.000 €

4: Título del proyecto: Efectividad de la vacuna antineumocócica conjugada 13-valente frente a la hospitalización por neumonía adquirida en la comunidad en adultos de 60 años o mayores, mediante un estudio de casos y controles modificado. Estudio CIBELES.

Investigadores principales: Jose Yuste Lobo y Ángel Gil de Miguel
Entidad financiadora: PFIZER. Referencia: MVP 249/20
Periodo: 23/02/2021 - 22/02/2025
Cuantía total: 168.000 €

5: Título del proyecto: Evolution of Invasive Pneumococcal Disease in Spain with special focus on the pathogenesis of serotypes 3, 8, 11A, 19A, 22F and 33F. Investigadores principales: Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech.
Entidad financiadora: Merck Sharp & Dohme USA. Referencia: MVP 132/21
Período: 16/06/2021 - 15/12/2023
Cuantía total: 157.448€

6: Título del proyecto: Mecanismos de patogenicidad y protección en bacterias Gram-positivas causantes de enfermedad respiratoria y bacteriemia
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Entidad financiadora: MINECO. Referencia: SAF2017-83388-R
Periodo: 31/12/2017 - 30/06/2021
Cuantía total: 145.200 €

7: Título del proyecto: Characterization of susceptibility to cefditoren investigating penicillin resistant clinical isolates of Streptococcus pneumoniae.
Investigadores: Jose Yuste Lobo y Mirian Domenech Lucas
Entidad financiadora: Tedec Meiji Farma, S.A. Referencia: MVP 119/20
Periodo: 11/07/2020 – 10-07-2022
Cuantía total: 76.517 €

8: Título del proyecto: Impact of clinical isolates of serotypes 22F and 33F in the epidemiology and pathogenesis of Streptococcus pneumoniae.
Investigador principal: Jose Yuste Lobo
Entidad financiadora: Merck Sharp & Dohme España, S.A. Referencia: MVE 213/18
Periodo: 10/05/2018 - 30/05/2021
Cuantía total: 157.604 €

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Antimicrobial-resistant Neisseria gonorrhoeae in Europe in 2020 compared with in 2013 and 2018: a retrospective genomic surveillance study.

Golparian D, Cole MJ, Sánchez-Busó L, Day M, Jacobsson S, Uthayakumaran T, Abad R, Bercot B, Caugant DA, Heuer D, Jansen K, Pleininger S, Stefanelli P, Aanensen DM, Bluemel B, Unemo M; Euro-GASP study group. Lancet Microbe. 2024 May;5(5):e478-e488.

PUBMED DOI

Immunogenicity of the Conjugate Meningococcal ACWY-TT Vaccine in Children and Adolescents Living with HIV

Berzosa A, Guillen S, Epalza C, Escosa L, Navarro ML, Prieto LM, Sainz T, de Ory SJ, Montes M, Abad R, Vázquez JA, García IS, Ramos-Amador JT. Microorganisms. 2023 Dec 23;12(1):30

PUBMED DOI

Outbreak of invasive meningococcal disease caused by a meningococcus serogroup B expressing a rare porA genosubtype (19-54, 15), Spain, March to April 2024.

Abad R, Navarro C, García-Amil C, Montes M, Castañeda-García A, Cuadros JA, Galar A, Martin F, Mena E, Pérez de Madrid S, Román C, Soler M, Vázquez JA. Euro Surveill. 2025 Nov;30(44):2500222

PUBMED DOI

Trends in invasive bacterial diseases during the first 2 years of the COVID-19 pandemic: analyses of prospective surveillance data from 30 countries and territories in the IRIS Consortium

Shaw D, Abad R, Amin-Chowdhury Z, Bautista A, Bennett D, Broughton K, Cao B, Casanova C, Choi EH, Chu YW, Claus H, Coelho J, Corcoran M, Cottrell S, Cunney R, Cuypers L, Dalby T, Davies H, de Gouveia L, Deghmane AE, Demczuk W, Desmet S, Domenech M, Drew R, du Plessis M, Duarte C, Erlendsdóttir H, Fry NK, Fuursted K, Hale T, Henares D, Henriques-Normark B, Hilty M, Hoffmann S, Humphreys H, Ip M, Jacobsson S, Johnson C, Johnston J, Jolley KA, Kawabata A, Kozakova J, Kristinsson KG, Krizova P, Kuch A, Ladhani S, Lâm TT, León ME, Lindholm L, Litt D, Maiden MCJ, Martin I, Martiny D, Mattheus W, McCarthy ND, Meehan M, Meiring S, Mölling P, Morfeldt E, Morgan J, Mulhall R, Muñoz-Almagro C, Murdoch D, Murphy J, Musilek M, Mzabi A, Novakova L, Oftadeh S, Perez-Argüello A, Pérez-Vázquez M, Perrin M, Perry M, Prevost B, Roberts M, Rokney A, Ron M, Sanabria OM, Scott KJ, Sheppard C, Siira L, Sintchenko V, Skoczyńska A, Sloan M, Slotved HC, Smith AJ, Steens A, Taha MK, Toropainen M, Tzanakaki G, Vainio A, van der Linden MPG, van Sorge NM, Varon E, Vohrnova S, von Gottberg A, Yuste J, Zanella R, Zhou F, Brueggemann AB. Lancet Digit Health. 2023 Sep;5(9):e582-e593.

PUBMED DOI

Meningococcal carriage in men who have sex with men presenting at a sexual health unit in Spain

Pérez-González A, Carballo R, Araújo-Ameijeiras A, Abad R, Navarro C, Ocampo A, Poveda E, Potel C. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2023 Mar;42(3):287-296

PUBMED DOI

Effectiveness of a Meningococcal Group B Vaccine (4CMenB) in Children

Castilla J, García Cenoz M, Abad R, Sánchez-Cambronero L, Lorusso N, Izquierdo C, Cañellas Llabrés S, Roig J, Malvar A, González Carril F, Boone ALD, Pérez Martín J, Rodríguez Recio MJ, Galmés A, Caballero A, García Rojas A, Juanas F, Nieto M, Viloria Raymundo LJ, Martínez Ochoa E, Rivas AI, Castrillejo D, Moreno Pérez D, Martínez A, Borràs E, Sánchez Gómez A, Pastor E, Nartallo V, Arteagoitia JM, Álvarez-Fernández B, García Pina R, Fernández Arribas S, Vanrell J, García Hernández S, Mendoza RM, Méndez M, López-Tercero MM, Fernández-Rodríguez Á, Blanco Á, Carrillo de Albornoz FJ, Ruiz Olivares J, Ruiz-Montero R, Limia A, Navarro-Alonso JA, Vázquez JA, Barricarte A. N Engl J Med. 2023 Feb 2;388(5):427-438

PUBMED DOI

Listeriosis outbreak caused by contaminated stuffed pork, Andalusia, Spain, July to October 2019

Fernández-Martínez NF, Ruiz-Montero R, Briones E, Baños E, García San Miguel Rodríguez-Alarcón L, Chaves JA, Abad R, Varela C; LISMOAN team; Lorusso N. Euro Surveill . 2022 Oct;27(43):2200279

PUBMED DOI

Pertactin-Deficient Bordetella pertussis with Unusual Mechanism of Pertactin Disruption, Spain, 1986-2018

14. Mir-Cros A, Moreno-Mingorance A, Martín-Gómez MT, Abad R, Bloise I, Campins M, González-Praetorius A, Gutiérrez MN, Martín-González H, Muñoz-Almagro C, Orellana MÁ, de Pablos M, Roca-Grande J, Rodrigo C, Rodríguez ME, Uriona S, Vidal MJ, Pumarola T, Larrosa MN, González-López JJ. Emerg Infect Dis. 2022 May;28(5):967-976

PUBMED DOI

Large Increase in Azithromycin-Resistant Neisseria gonorrhoeae in Northern Spain

Carballo R, Povoa MC, Abad R, Navarro C, Martin E, Alvarez M, Salgado A, Potel C. Microb Drug Resist. 2022 Jan;28(1):81-86

PUBMED DOI

High susceptibility to zoliflodacin and conserved target (GyrB) for zoliflodacin among 1209 consecutive clinical Neisseria gonorrhoeae isolates from 25 European countries, 2018.

Unemo M, Ahlstrand J, Sánchez-Busó L, Day M, Aanensen D, Golparian D, Jacobsson S, Cole MJ, Torreblanca RA, Ásmundsdóttir LR, Balla E, De Baetselier I, Bercot B, Carannante A, Caugant D, Borrego MJ, Buder S, Cassar R, Cole M, Dam A, Eder C, Hoffmann S, Hunjak B, Jeverica S, Kirjavainen V, Maikanti-Charalambous P, Miriagou V, Mlynarczyk-Bonikowska B, Pakarna G, Patterson L, Pavlik P, Perrin M, Shepherd J, Stefanelli P, Unemo M, Jelena V, Zákoucká H. J Antimicrob Chemother. 2021 Feb 10:dkab024

PUBMED DOI

Molecular characterization of invasive serogroup B Neisseria meningitidis isolates from Spain during 2015-2018: Evolution of the vaccine antigen factor H binding protein (FHbp)

Abad R, García-Amil C, Navarro C, Martín E, Martín-Díaz A, Vázquez JA. J Infect. 2021 Apr;82(4):37-44

PUBMED DOI

Meningococcal Serogroup B Disease in Vaccinated Children

Soler-Garcia A, Fernández de Sevilla M, Abad R, Esteva C, Alsina L, Vázquez J, Muñoz-Almagro C, Noguera-Julian A. J Pediatric Infect Dis Soc. 2020 Sep 17;9(4):454-459

PUBMED DOI

Distribution of DNA gyrase cleavage sites across the Streptococcus pneumoniae genome: relation to transcription and methylation at GATC sites

Ferrándiz MJ, Hernández P, de la Campa AG. Nucleic Acids Res. 2025; 53(21):gkaf1183.

PUBMED DOI

Characterizing carbapenemase-producing Escherichia coli isolates from Spain: high genetic heterogeneity and wide geographical spread.

1. Characterizing carbapenemase-producing Escherichia coli isolates from Spain: high genetic heterogeneity and wide geographical spread. Dahdouh E, Gómez-Marcos L, Cañada-García JE, de Arellano ER, Sánchez-García A, Sánchez-Romero I, López-Urrutia L, de la Iglesia P, Gonzalez-Praetorius A, Sotelo J, Valle-Millares D, Alonso-González I, Bautista V, Lara N, García-Cobos S, Cercenado E, Aracil B, Oteo-Iglesias J, Pérez-Vázquez M; Spanish Eco-Carba Study Group. Revista: Front Cell Infect Microbiol 2024 May 16;14:1390966.

PUBMED DOI

Clinical, microbiological, and molecular characterization of pediatric invasive infections by Streptococcus pyogenes in Spain in a context of global outbreak.

2. Clinical, microbiological, and molecular characterization of pediatric invasive infections by Streptococcus pyogenes in Spain in a context of global outbreak. Autores: Ramírez de Arellano E, Saavedra-Lozano J, Villalón P, Jové-Blanco A, Grandioso D, Sotelo J, Gamell A, González-López JJ, Cervantes E, Gónzalez MJ, Rello-Saltor V, Esteva C, Sanz-Santaeufemia F, Yagüe G, Manzanares Á, Brañas P, Ruiz de Gopegui E, Carrasco-Colom J, García F, Cercenado E, Mellado I, Del Castillo E, Pérez-Vazquez M, Oteo-Iglesias J, Calvo C; Spanish PedGAS-Net/CIBERINFEC GAS Study Group. Revista: mSphere. 2024 Mar 26;9(3):e0072923.

PUBMED DOI

Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae in COVID-19 Intensive Care Patients: Identification of IncL-VIM-1 Plasmid in Previously Non-Predominant Sequence Types.

3. Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae in COVID-19 Intensive Care Patients: Identification of IncL-VIM-1 Plasmid in Previously Non-Predominant Sequence Types. Autores: Cañada-García JE, Ramírez de Arellano E, Jiménez-Orellana M, Viedma E, Sánchez A, Alhambra A, Villa J, Delgado-Iribarren A, Bautista V, Lara N, García-Cobos S, Aracil B, Cercenado E, Pérez-Vázquez M, Oteo-Iglesias J. Revista: Antibiotics (Basel). 2023 Jan 6;12(1):107.

DOI

An increase in erythromycin resistance in methicillin-susceptible Staphylococcus aureus from blood correlates with the use of macrolide/lincosamide/streptogramin antibiotics. EARS-Net Spain (2004-2020).

4. An increase in erythromycin resistance in methicillin-susceptible Staphylococcus aureus from blood correlates with the use of macrolide/lincosamide/streptogramin antibiotics. EARS-Net Spain (2004-2020). Autores: El Mammery A, Ramírez de Arellano E, Cañada-García JE, Cercenado E, Villar-Gómara L, Casquero-García V, García-Cobos S, Lepe JA, Ruiz de Gopegui Bordes E, Calvo-Montes J, Larrosa Escartín N, Cantón R, Pérez-Vázquez M, Aracil B, Oteo-Iglesias J. Revista: Front Microbiol. 2023 Sep 26;14:1220286.

PUBMED DOI

Phenotypic and molecular characterization of IMP-producing Enterobacterales in Spain: Predominance of IMP-8 in Klebsiella pneumoniae and IMP-22 in Enterobacter roggenkampii.

5. Phenotypic and molecular characterization of IMP-producing Enterobacterales in Spain: Predominance of IMP-8 in Klebsiella pneumoniae and IMP-22 in Enterobacter roggenkampii. Autores: Cañada-García JE, Grippo N, de Arellano ER, Bautista V, Lara N, Navarro AM, Cabezas T, Martínez-Ramírez NM, García-Cobos S, Calvo J, Cercenado E, Aracil B, Pérez-Vázquez M, Oteo-Iglesias J; Spanish IMP Study Group. Revista: Front Microbiol. 2022 Sep 28;13:1000787.

DOI

CARB-ES-19 Multicenter Study of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli From All Spanish Provinces Reveals Interregional Spread of High-Risk Clones Such as ST307/OXA-48 and ST512/KPC-3.

6. CARB-ES-19 Multicenter Study of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli From All Spanish Provinces Reveals Interregional Spread of High-Risk Clones Such as ST307/OXA-48 and ST512/KPC-3. Autores: Cañada-García JE, Moure Z, Sola-Campoy PJ, Delgado-Valverde M, Cano ME, Gijón D, González M, Gracia-Ahufinger I, Larrosa N, Mulet X, Pitart C, Rivera A, Bou G, Calvo J, Cantón R, González-López JJ, Martínez-Martínez L, Navarro F, Oliver A, Palacios-Baena ZR, Pascual Á, Ruiz-Carrascoso G, Vila J, Aracil B, Pérez-Vázquez M, Oteo-Iglesias J; GEMARA/GEIRAS-SEIMC/REIPI CARB-ES-19 Study Group. Revista: Front Microbiol. 2022 Jun 30;13:918362.

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Interregional spread in Spain of linezolid-resistant Enterococcus spp. isolates carrying the optrA and poxtA genes.

7. Interregional spread in Spain of linezolid-resistant Enterococcus spp. isolates carrying the optrA and poxtA genes. Autores: Moure Z, Lara N, Marín M, Sola-Campoy PJ, Bautista V, Gómez-Bertomeu F, Gómez-Dominguez C, Pérez-Vázquez M, Aracil B, Campos J, Cercenado E, Oteo-Iglesias J; Spanish Linezolid-Resistant Enterococci Collaborating Group. Revista: Int J Antimicrob Agents. 2020 Jun;55(6):105977.

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Listado de personal

Información adicional

La Unidad de Neumococos se encarga de dos aspectos muy importantes relacionados con las infecciones por neumococo como son la vigilancia epidemiológica y la investigación básica y traslacional de las enfermedades producidas por este patógeno. Nuestra unidad contribuye a la vigilancia epidemiológica de la enfermedad neumocócica invasiva (ENI), caracterizando los serotipos y genotipos de neumococos invasivos que circulan en España, así como la evolución de la resistencia antibiótica en este patógeno. Se realiza identificación de muestras de cultivo negativo (LCR y líquidos pleurales) mediante PCR a tiempo real. El serotipado se realiza mediante la técnica de Dot-blot y PCR-secuenciación. El genotipado para el estudio de brotes y caracterización de clones asociados a cepas hipervirulentas y/o multirresistentes, se realiza mediante la técnica de MLST y el análisis de genomas completos por secuenciación masiva. Además, se determina la susceptibilidad antibiótica siguiendo los criterios EUCAST. Nuestra unidad pertenece a la red IBD-labnet del ECDC y notifica anualmente todos los casos de ENI al ECDC y también a la red IRIS (Invasive Respiratory Infection Surveillance) A nivel de investigación básica y traslacional, nuestra unidad se encarga de estudiar y caracterizar diferentes mecanismos moleculares de patogenicidad y protección relacionados con la infección neumocócica. Entre los principales objetivos destacan la caracterización molecular de factores de virulencia, el estudio de diferentes proteínas candidatas a vacunas y determinar el posible impacto que tiene el humo de tabaco y la formación de biofilms en la colonización del tracto respiratorio.

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