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Investigación
Inmunobiología
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
Hepatitis
- Diseño de métodos diagnósticos para el estudio de los virus de las hepatitis (VH) A, B, C, D, E: Diseñamos sistemas de PCR para su detección y caracterización.
- Evaluación de métodos diagnósticos de los VH. Colaboramos con empresas para estudios de sensibilidad y especificidad de equipos diagnósticos.
- Estudios de Seroprevalencia de los virus de las hepatitis.
- Epidemiología genómica de genomas completos de VHA, VHB, VHC, VHD y VHE en colaboración con el ECDC. Estudios de trazabilidad del VHE.
- Caracterización molecular de virus de las hepatitis mediante secuenciación masiva: a) VHB: mutantes de escape HBsAg (prevalencia y efectos en la detección del HBsAg). Estudio de mutaciones en epítopos de estimulación inmune y mutaciones asociadas a evolución clínica desfavorable.
- b) VHC: resistencias a los antivirales de acción directa. Análisis molecular de subtipos poco frecuentes.
c) Estudios filogenéticos del VHD.
d) Análisis genómico del VHE.
e) Investigación etiológica de hepatitis no filiadas mediante estudios de metagenómica.
- b) VHC: resistencias a los antivirales de acción directa. Análisis molecular de subtipos poco frecuentes.
Proyectos de investigación
Contenidos con Investigacion .
1. Proyecto CIBEREPS 2022. Microbiological and genomic investigation of hepatitis in children by metagenomic approach in case and control subjects (IP: Ana Avellón).
2023-2024. En colaboración con el Hospital San Joan de Deu de Barcelona.
2. MPY 501-19: Tracking hepatitis E virus infection by means of epidemiological research and whole genome sequencing. Project TrazHE. (IP: Ana Avellón). 2020-2024.
3. Proyecto CIBEREPS 2021 Metagenomic sequencing to identify viral aetiologies in undiagnosed paediatric cases of meningitis and encephalitis (IP: D. Tarragó). 2021-2022.
4. MPY 383/19 (PEJ2018-004446-A). Ayudas para la promoción de empleo joven e implantación de la garantía juvenil en I+D+I. análisis de la complejidad de secuencias de los virus de la hepatitis A, B, C; D y E (VHA, VHB, VHC, VHD y VHE) mediante técnicas de secuenciación masiva. (IP: Ana Avellón). 2020-2021.
5. MPY 1285/16 Movilidad "Salvador de Madariaga" programa estatal de promoción de talento y su empleabilidad. (IP: Ana Avellón). 2016.
Publicaciones destacadas
Characterization of an enhanced antigenic change in the pandemic 2009 H1N1 influenza virus haemagglutinin
Garcia-Barreno B, Delgado T, Benito S, Casas I, Pozo F, Cuevas MT, et al. Characterization of an enhanced antigenic change in the pandemic 2009 H1N1 influenza virus haemagglutinin. J Gen Virol. 2014;95(Pt 5):1033-42.
PUBMED DOIEpidemic history of hepatitis C virus genotypes and subtypes in Portugal.
Palladino C, Ezeonwumelu IJ, Marcelino R, Briz V, Moranguinho I, Serejo F, Velosa JF, Tato Marinho R, Borrego P, Taveira N. 2018. Epidemic history of hepatitis C virus genotypes and subtypes in Portugal. Sci Rep. 2018; 8:12266. (A; FI= 4.12; Q1 Multidisciplinary Sciences; DOI:10.1038/s41598-018-30528-0).
PUBMED DOILow frequency of NS5A relevant resistance-associated substitutions to Elbasvir among hepatitis C virus genotype 1a in Spain: a cross-sectional study.
Palladino C, Sanchez-Carrillo M, Mate-Cano I, Vazquez-Morón S, Jiménez-Sousa MA, Gutiérrez-Rivas M, Resino S, Briz V. Low frequency of NS5A relevant resistance-associated substitutions to Elbasvir among hepatitis C virus genotype 1a in Spain: a cross-sectional study. Sci Rep. 2017; 7(1):2892. (A; FI= 4.12; Q1 Multidisciplinary Sciences).
PUBMED DOIPlasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality.
Fernández-Pato A; Virseda-Berdices A, Ryan P; Martínez-González O, Peréz-García F, Resino S, Martin-Vicente M, Valle-Millares D, Brochado-Kith O; Blancas R; Ceballos FC; Bartolome-Sánchez S; Vidal-Alcántara EJ; Alonso-Menchén D, Blanca-López N; Ramirez Martinez-Acitores I, Rava M, Jiménez-Sousa MA (‡ *), Amanda Fernández-Rodríguez (‡ *). Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality. Emerg Microbes Infect 2022; 11(1):676-688 (A; FI= 19.57; D1, Infectious Diseases; JCR 2021).
PUBMED DOIMild profile improvement of immune biomarkers in HIV/HCV-coinfected patients who removed hepatitis C after HCV treatment: a prospective study.
García-Broncano P, Medrano LM, Berenguer J, Brochado O, González-García J, Jiménez-Sousa MA, Quereda C, Sanz J, Téllez MJ, Díaz L, Jiménez JL, Muñoz-Fernández MA, Resino S (*). Mild profile improvement of immune biomarkers in HIV/HCV-coinfected patients who removed hepatitis C after HCV treatment: a prospective study. J Infect 2020; 80(1):99-110. (A; FI= 6.07; Q1, Infectious Diseases; JCR 2020).
PUBMED DOIEfficacy of DNA amplification in tissue biopsy samples to improve the detection of invasive fungal disease
Buitrago MJ, Aguado JM, Ballen A, Bernal-Martinez L, Prieto M, Garcia-Reyne A, Garcia-Rodriguez J, Rodriguez-Tudela JL, Cuenca-Estrella M. Efficacy of DNA amplification in tissue biopsy samples to improve the detection of invasive fungal disease. Clin Microbiol Infect. 2013 Jun;19(6):E271-7. doi: 10.1111/1469-0691.12110. Epub 2013 Mar 7. PMID: 23464751.
PUBMED DOIPotent Induction of Envelope-Specific Antibody Responses by Virus-Like Particle Immunogens Based on HIV-1 Envelopes from Patients with Early Broadly Neutralizing Responses
Beltran-Pavez C, Bontjer I, Gonzalez N, Pernas M, Merino-Mansilla A, Olvera A, Miro JM, Brander C, Alcami J, Sanders RW, Sanchez-Merino V, Yuste E. J Virol. 2022 Jan 12, 96(1): e0134321
PUBMED DOIHIV-1 envelope glycoproteins isolated from Viremic Non-Progressor individuals are fully functional and cytopathic
Cabrera-Rodríguez R, Hebmann V, Marfil S, Pernas M, Marrero-Hernández S, Cabrera C, Urrea V, Casado C, Olivares I, Márquez-Arce D, Pérez-Yanes S, Estévez-Herrera J, Clotet B, Espert L, López-Galíndez C, Biard-Piechaczyk M, Valenzuela-Fernández A, Blanco J. Sci Rep. 2019 Apr 3,9(1):5544
PUBMED DOIViral Characteristics Associated with the Clinical Nonprogressor Phenotype Are Inherited by Viruses from a Cluster of HIV-1 Elite Controllers
Casado C, Marrero-Hernández S, Márquez-Arce D, Pernas M, Marfil S, Borràs-Grañana F, Olivares I, Cabrera-Rodríguez R, Valera MS, de Armas-Rillo L, Lemey P, Blanco J, Valenzuela-Fernández A, Lopez-Galíndez C. mBio. 2018 Apr 10,9(2): e02338-17
PUBMED DOIViral and Cellular Factors Leading to the Loss of CD4 Homeostasis in HIV-1 Viremic Nonprogressors.
Colomer-Lluch M, Kilpelainen A, Pernas M, Peña R, Ouchi D, Jimenez-Moyano E, Dalmau J, Casado C, López-Galíndez C, Clotet B, Martinez-Picado J, Prado JG. J Virol. 2022 Jan 12, 96(1): e0149921. doi: 10.1128/JVI.01499-21. Epub 2021 Oct 20.
PUBMED DOIContribution of the HIV-1 Envelope Glycoprotein to AIDS Pathogenesis and Clinical Progression
Valenzuela-Fernández A, Cabrera-Rodríguez R, Casado C, Pérez-Yanes S, Pernas M, García-Luis J, Marfil S, Olivares I, Estévez-Herrera J, Trujillo-González R, Blanco J, Lopez-Galindez C. Biomedicines. 2022 Sep 2,10(9):2172.
PUBMED DOIPrevalence of HIV-1 dual infection in LTNP-Elite Controllers
María Pernas, Concepción Casado, Virginia Sandonis, Carolina Arcones, Carmen Rodríguez , Ezequiel Ruiz-Mateos , Eva Ramírez de Arellano , Norma Rallón , Margarita Del Val , Eulalia Grau, Mariola López-Vazquez , Manuel Leal , Jorge del Romero , Cecilio López Galíndez . (2013). J.of AIDS. 64, 3, 225-231. IF 4.262
PUBMED DOIA Genome-to-Genome Analysis of Associations between Human Genetic Variation, HIV-1 Sequence Diversity, and Retroviral Control.
Istvan Bartha Jonathan M Carlson, Chanson J Brumme, Paul J McLaren, Zabrina L Brumme, Mina John, David W Haas, Javier Martinez-Picado, Cecilio López Galíndez, Andri Rauch, Huldrych F Günthard, Enos Bernasconi, Pietro Vernazza, Thomas Klimkait, Sabine Yerly, Jennifer Listgarten, Nico Pfeifer, Zoltan Kutalik, Todd M Allen, Viktor Müller, P Richard Harrigan, David Heckerman, Amalio Telenti, and Jacques Fellay, for the HIV Genome-to-Genome Study and the Swiss HIV Cohort Study. (2013). Elife. 2013;2:e01123
PUBMED DOIFactors Leading to the Loss of Natural Elite Control of HIV-1 Infection
Pernas M, Tarancón-Diez L, Rodríguez-Gallego E, Gómez J, Prado JG, Casado C, Dominguez-Molina B, Olivares I, Coiras M, León A, Rodriguez C, Benito JM, Rallón N, Plana M, Martinez-Madrid O, Dapena M, Iribarren JA, Del Romero J, García F, Alcamí J, Muñoz-Fernández M, Vidal F, Leal M, Lopez-Galindez C, Ruiz-Mateos E. J Virol. 2018 Feb 12,92(5): e01805-17
PUBMED DOIInformación adicional
Tesis doctorales
“Expresión y funcionalidad de tlr2 y tlr4 en las poblaciones linfomieloides presentes en el pulmón y órganos linfoides durante la vida embrionaria y neonatal en modelos de ratón”. Carolina Ruiz Sánchez. Universidad Complutense de Madrid, 2022
Trabajos de fin de máster
Detección y caracterización de vesículas extracelulares de origen plaquetario en sobrenadantes de pulmón de animales infectados por SPN. Marta París, Universidad Alcalá, 2024
Estudio de la activación TLR-dependiente en la línea de macrófagos RAW 264.7. Iñigo Merino de Saracho, Universidad Alcalá, 2023
Estudio de la funcionalidad de los receptores TLRs en el pulmón y en otros órganos linfoides en poblaciones de células B utilizando el modelo neonatal de ratón. Yolanda Campanero, Universidad Alcalá, 2023
Estudio exploratorio de progenitores linfoides T en el pulmón neonatal de ratón. Alejandro Arrabal, Universidad Complutense de Madrid, 2022
Estudio de la diferenciación linfoide B en ratones deficientes para las moléculas CD5 y CD6. Cristina Martín, Universidad Alcalá, 2022
Papel de las plaquetas y sus células progenitoras en dos modelos animales de infección: SPN y RSV. Ana de Lucas Rius, Universidad Alcalá, 2020
Estudio piloto de la infección por RSV en el modelo de ratón: fenotipo celular de poblaciones mieloides y linfoides en el pulmón en dos modelos animales de infección: SPN y RSV. Juan Antonio Martín Quesada, Universidad Alcalá, 2020
Respuesta de las células B durante la infección por Streptococcus pneumoniae. Eva Castro, 2020
Estudio del potencial hematopoyético de células neonatales de pulmón en el modelo de ratón. Ana Cogollo García, Universidad Alcalá, 2018
Innate immune response to S. pneumoniae in the lung. Rodrigo Sánchez, Universidad Complutense de Madrid, 2018
Inmunidad neonatal en el modelo de ratón: localización y función de la respuesta innata y adaptativa. Alba Ezequiel Fernández, Universidad Alcalá, 2017
Caracterización de la diversidad de genes de inmunoglobulinas en el modelo de ratón en homeostasis y activación de TLR4 por lipopolisacárido bacteriano. Cristina García Caballero, Universidad Alcalá, 2017
Altered lymphopoiesis and splenic B cell subsets on Telomerase Activity Deficient Mice (TERC-/-). Juliana Manosalva, Universidad Complutense de Madrid, 2017
Estudio de la Respuesta Inmunitaria en Lavados Nasofaríngeos de Lactantes con bronquiolitis. Isabel Martín Barrios, Universidad Complutense de Madrid, 2016
Dinámica de los linfocitos B1-REL en el modelo de inmunización in vivo con DNP-LPS. Inmaculada Sanz Ramos Universidad Alcalá, 2015
Vías de diferenciación de megacariocitos en el modelo de ratón. Marta Cobos Briz, Universidad Alcalá, 2015
Papel de los megacariocitos en procesos infecciosos. Melania Guerrero Hue, Universidad Complutense de Madrid, 2015
Trabajos de fin de grado
Estudio de nuevas vacunas bacterianas en el modelo de infección en ratón (Mus musculus) por Streptococcus pneumoniae. Alejandro Arrabal, Universidad Politécnica de Madrid, 2021
Megacariocitos y plaquetas en infección respiratoria por SPN: Papel del TLR4. Óscar González Hervás, Universidad Complutense de Madrid, 2021
Estudio de la respuesta inmune mediada por linfocitos B pseudo-innatos frente a modelos de inmunización TLR4-dependientes. Rodrigo Sánchez, Universidad Complutense de Madrid, 2017.
Estudio de la diversidad en el repertorio de Inmunoglobulinas en individuos sanos. Isabel Martín, Universidad Francisco de Vitoria, 2015.
Dinámica de las poblaciones hematopoyéticas en el bazo perinatal. Inmaculada Sanz, Universidad Alcalá, 2014
Docencia en cursos de formación
Curso de formación: Iniciación a la Citometría de Flujo (desde 2015 hasta la actualidad)
Curso de formación: Análisis de datos de Citometría de Flujo (desde 2018 hasta la actualidad)
Divulgación / Ciencia Ciudadana
• Colaboración en programa de la CAM de 4º+Empresa.
• Colaboración con la Unidad de Cultura Científica del ISCIII en La Semana de la Ciencia en el ISCIII
• Proyecto de Divulgación Científica "Hablando de Ciencia", realizado en los centros docentes de Majadahonda de primaria, ESO y Bachillerato, desde el año 2015 en colaboración con la Concejalía de Educación y Juventud del Ayuntamiento de Majadahonda: “Cómo Funciona tu Sistema Inmunitario y hábitos de vida saludables para cuidarlo”
Tesis doctorales
“Expresión y funcionalidad de tlr2 y tlr4 en las poblaciones linfomieloides presentes en el pulmón y órganos linfoides durante la vida embrionaria y neonatal en modelos de ratón”. Carolina Ruiz Sánchez. Universidad Complutense de Madrid, 2022
Trabajos de fin de máster
Detección y caracterización de vesículas extracelulares de origen plaquetario en sobrenadantes de pulmón de animales infectados por SPN. Marta París, Universidad Alcalá, 2024
Estudio de la activación TLR-dependiente en la línea de macrófagos RAW 264.7. Iñigo Merino de Saracho, Universidad Alcalá, 2023
Estudio de la funcionalidad de los receptores TLRs en el pulmón y en otros órganos linfoides en poblaciones de células B utilizando el modelo neonatal de ratón. Yolanda Campanero, Universidad Alcalá, 2023
Estudio exploratorio de progenitores linfoides T en el pulmón neonatal de ratón. Alejandro Arrabal, Universidad Complutense de Madrid, 2022
Estudio de la diferenciación linfoide B en ratones deficientes para las moléculas CD5 y CD6. Cristina Martín, Universidad Alcalá, 2022
Papel de las plaquetas y sus células progenitoras en dos modelos animales de infección: SPN y RSV. Ana de Lucas Rius, Universidad Alcalá, 2020
Estudio piloto de la infección por RSV en el modelo de ratón: fenotipo celular de poblaciones mieloides y linfoides en el pulmón en dos modelos animales de infección: SPN y RSV. Juan Antonio Martín Quesada, Universidad Alcalá, 2020
Respuesta de las células B durante la infección por Streptococcus pneumoniae. Eva Castro, 2020
Estudio del potencial hematopoyético de células neonatales de pulmón en el modelo de ratón. Ana Cogollo García, Universidad Alcalá, 2018
Innate immune response to S. pneumoniae in the lung. Rodrigo Sánchez, Universidad Complutense de Madrid, 2018
Inmunidad neonatal en el modelo de ratón: localización y función de la respuesta innata y adaptativa. Alba Ezequiel Fernández, Universidad Alcalá, 2017
Caracterización de la diversidad de genes de inmunoglobulinas en el modelo de ratón en homeostasis y activación de TLR4 por lipopolisacárido bacteriano. Cristina García Caballero, Universidad Alcalá, 2017
Altered lymphopoiesis and splenic B cell subsets on Telomerase Activity Deficient Mice (TERC-/-). Juliana Manosalva, Universidad Complutense de Madrid, 2017
Estudio de la Respuesta Inmunitaria en Lavados Nasofaríngeos de Lactantes con bronquiolitis. Isabel Martín Barrios, Universidad Complutense de Madrid, 2016
Dinámica de los linfocitos B1-REL en el modelo de inmunización in vivo con DNP-LPS. Inmaculada Sanz Ramos Universidad Alcalá, 2015
Vías de diferenciación de megacariocitos en el modelo de ratón. Marta Cobos Briz, Universidad Alcalá, 2015
Papel de los megacariocitos en procesos infecciosos. Melania Guerrero Hue, Universidad Complutense de Madrid, 2015
Trabajos de fin de grado
Estudio de nuevas vacunas bacterianas en el modelo de infección en ratón (Mus musculus) por Streptococcus pneumoniae. Alejandro Arrabal, Universidad Politécnica de Madrid, 2021
Megacariocitos y plaquetas en infección respiratoria por SPN: Papel del TLR4. Óscar González Hervás, Universidad Complutense de Madrid, 2021
Estudio de la respuesta inmune mediada por linfocitos B pseudo-innatos frente a modelos de inmunización TLR4-dependientes. Rodrigo Sánchez, Universidad Complutense de Madrid, 2017.
Estudio de la diversidad en el repertorio de Inmunoglobulinas en individuos sanos. Isabel Martín, Universidad Francisco de Vitoria, 2015.
Dinámica de las poblaciones hematopoyéticas en el bazo perinatal. Inmaculada Sanz, Universidad Alcalá, 2014
Docencia en cursos de formación
Curso de formación: Iniciación a la Citometría de Flujo (desde 2015 hasta la actualidad)
Curso de formación: Análisis de datos de Citometría de Flujo (desde 2018 hasta la actualidad)
Divulgación / Ciencia Ciudadana
• Colaboración en programa de la CAM de 4º+Empresa.
• Colaboración con la Unidad de Cultura Científica del ISCIII en La Semana de la Ciencia en el ISCIII
• Proyecto de Divulgación Científica "Hablando de Ciencia", realizado en los centros docentes de Majadahonda de primaria, ESO y Bachillerato, desde el año 2015 en colaboración con la Concejalía de Educación y Juventud del Ayuntamiento de Majadahonda: “Cómo Funciona tu Sistema Inmunitario y hábitos de vida saludables para cuidarlo”