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Investigación
Genética Bacteriana
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
- Enfermedad Meningocócica Invasiva.
- Vigilancia de laboratorio basada en secuenciación del genoma completo y su aplicación en Salud Pública.
- Estudio y caracterización de mecanismos de resistencia a antimicrobianos.
- Estudio y evaluación de vacunas convencionales (polisacarídicas) y de nueva generación (proteicas).
- Infección gonocócica (Gonorrea).
- Vigilancia de laboratorio basada en secuenciación del genoma completo y su aplicación en salud Pública.
- Estudio y caracterización de mecanismos de resistencia a antimicrobianos.
- Listeriosis.
- Vigilancia de laboratorio basada en secuenciación del genoma completo y su aplicación en salud Pública.
- Tosferina.
- Desarrollo y aplicación de técnicas moleculares para el diagnóstico y caracterización de Bordetella pertussis, B. parapertussis, B. holmessi y B. bronchiseptica.
Proyectos de investigación
Contenidos con Investigacion .
1. Título del proyecto: Determinación del grado de identidad de antígenos comunes de N. meningitidis y N. gonorrhoeae mediante herramientas genómicas e inmunológicas.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII. Programa: Acción Estratégica en Salud Intramural
Referencia: PI23CIII/00040
Periodo: 2024-2026
Importe concedido: 68.500€
2. Título del proyecto: Meningococcal Disease and Molecular Epidemiology (MEMORY).
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca y Julio A. Vázquez Moreno
Entidad financiadora: Pfizer Inc
Referencia: MVP 352/21
Periodo: 2022-2024
Importe concedido: 82.834,50€
3. Título del proyecto: Modelling Approaches to Guide Intelligent surveillance for the sustainable Introduction of novel ANtibiotics. MAGIcIAN.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII / Acción Conjunta Internacional / Programa Joint Programming Initiatives (JPI)
Referencia: AC19CIII/00002
Periodo: 2020-2024
Importe concedido: 46.000€
4. Título del proyecto: Análisis epidemiológico, microbiológico y clínico del brote de listeriosis en Andalucía. Estudio LISMOAN.
Investigador Principal: José Miguel Cisneros Herreros
Entidad financiadora: FISEVI (Fundación Pública Andaluza para la gestión de la Investigación en Salud)/Convocatoria FPS2020
Referencia: PI-0001-2020
Periodo: 2020-2023
Importe concedido: 114.954€
5. Título del proyecto: Estructura poblacional de Neisseria meningitidis mediante secuenciación masiva ¿Una posible herramienta para estimar efectividad vacunal?
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII / Acción Estratégica en Salud Intramural
Referencia: PI19CIII/00030
Periodo: 2020-2023
Importe concedido: 67.153€.
6. Título del proyecto: Encomienda de gestión entre el Ministerio de Sanidad, Servicios Sociales e Igualdad (dirección general de salud pública, calidad e innovación) y el Instituto de Salud Carlos III, para las determinaciones de laboratorio correspondientes al 2º estudio de seroprevalencia en España.
Investigador Principal: Fernando de Ory y Julio A. Vázquez
Entidad financiadora: Dirección General de Salud Pública, Ministerio de Sanidad
Referencia: MEG151/17
Periodo: 2018-2020
Importe concedido: 565.663€
7. Título del proyecto: Efectividad de la vacuna frente al Meningococo B en niños inmunodeprimidos por drepanocitosis.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: Fundación de la Sociedad Española de Hematología y Oncología Pediátricas (SEHOP)
Referencia: MVP 199/18
Periodo: 2018-2020
Importe concedido: 18.285€
8. Título del proyecto: Aplicación de secuenciación masiva y aproximaciones inmunológicas en el análisis de expresión de nuevos antígenos vacunales en población de meningococo.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII / Acción Estratégica en Salud Intramural
Referencia: PI16CIII/00023
Periodo: 2017-2020
Importe concedido: 115.084€
9. Título del proyecto: fHbp variability over time and potential coverage of the new meningococcal serogroup B vaccine (bivalent rLP2086/fHbp) in Spain.
Investigador Principal: Raquel Abad y Julio A. Vázquez
Entidad financiadora: Pfizer SLU
Referencia: MVP 1273/16
Periodo: 2017-2020
Importe concedido: 125.350€
10. Título del proyecto: Estimación de protección de vacuna conjugada frente a meningococo de serogrupo C basada en un modelo matemático.
Investigador Principal: Julio A. Vázquez y Javier Díez
Entidad financiadora: Centro Superior de Investigación en Salud Pública (CSISP)
Referencia: MVP 1116/11
Periodo: 2011-2017
Importe concedido: 143.750€
Publicaciones destacadas
Programa de Legionelosis. En Echevarría Mayo JE y Oteo Iglesias J (Editores) Programas de Vigilancia Microbiológica Centro Nacional de Microbiología.
Fernando González-Camacho y Almudena Cascajero. Programa de Legionelosis. En Echevarría Mayo JE y Oteo Iglesias J (Editores) Programas de Vigilancia Microbiológica Centro Nacional de Microbiología. Volumen 2:77-89. 2021-2022 Majadahonda (Madrid); Instituto de Salud Carlos III, Centro Nacional de Microbiología: 2023.
Chikungunya virus infections among travellers returning to Spain, 2008 to 2014
3. Maria Dolores Fernandez Garcia; Mathieu Bangert; Fernando de Ory; Arantxa Potente; Lourdes Hernandez; Fatima Lasala; Laura Herrero; Francisca Molero; Anabel Negredo; Ana Vázquez; Teodora Minguito; Pilar Balfagón; Jesus de la Fuente; Sabino Puente; Eva Ramírez de Arellano; Mar Lago; Miguel Martinez; Joaquim Gascón; Francesca Norman; Rogelio Lopez Velez; Elena Sulleiro; Diana Pou; Nuria Serre; Ricardo Fernández Roblas; Antonio Tenorio; Leticia Franco; Maria Paz Sanchez Seco. Chikungunya virus infections among travellers returning to Spain, 2008 to 2014. Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin. 21 - 36, (Sweden): 08/09/2016. ISSN 1560-7917
PUBMED DOILegionella feeleii: Ubiquitous Pathogen in the Environment and Causative Agent of Pneumonia
Vaccaro L, Gomes TS, Izquierdo F, Magnet A, Llorens Berzosa S, Ollero D, Salso S, Alhambra A, Gómez C, López Cano M, Pelaz C, Bellido Samaniego B, Del Aguila C, Fenoy S, Hurtado-Marcos C. Front Microbiol. 2021;12:707187.
DOIImmunogenicity of a third dose with mRNA-vaccines in the ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination regimen against SARS-CoV-2 variants.
García-Pérez J, Borobia AM, Pérez-Olmeda M, Portolés A, Castaño L, Campins-Artí M, Bertrán MJ, Bermejo M, Arribas JR, López A, Ascaso-Del-Rio A, Arana-Arri E, Fuentes Camps I, Vilella A, Cascajero A, García-Morales MT, Castillo de la Osa M, Pérez Ingidua C, Lora D, Jiménez-Santana P, Pino-Rosa S, Gómez de la Cámara A, De La Torre-Tarazona E, Calonge E, Cruces R, Belda-Iniesta C, Alcamí J, Frías J, Carcas AJ, Díez-Fuertes F. iScience. 2024; 27(9):110728
PUBMED DOILonger intervals between SARS-CoV-2 infection and mRNA-1273 doses improve the neutralization of different variants of concern
García-Pérez J, Bermejo M, Ramírez-García A, De La Torre-Tarazona HE, Cascajero A, Castillo de la Osa M, Jiménez P, Aparicio Gómez M, Calonge E, Sancho-López A, Payares-Herrera C, Layunta Acero R, Vicente-Izquierdo L, Avendaño-Solá C, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, Díez-Fuertes F. J Med Virol. 2023; 95(3):e28679
PUBMED DOIImmune response and reactogenicity after immunization with two-doses of an experimental COVID-19 vaccine (CVnCOV) followed by a third-fourth shot with a standard mRNA vaccine (BNT162b2): RescueVacs multicenter cohort study
Ascaso-Del-Rio A, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Arana-Arri E, Vergara I, Pérez-Ingidua C, Bermejo M, Castillo de la Osa M, Imaz-Ayo N, Riaño Fernández I, Astasio González O, Díez-Fuertes F, Meijide S, Arrizabalaga J, Hernández Gutiérrez L, de la Torre-Tarazona HE, Mariano Lázaro A, Vargas-Castrillón E, Alcamí J, Portolés A; RescueVac study Group. EClinicalMedicine. 2022; 51:101542
PUBMED DOIImmunogenic dynamics and SARS-CoV-2 variant neutralisation of the heterologous ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination: Secondary analysis of the randomised CombiVacS study
García-Pérez J, González-Pérez M, Castillo de la Osa M, Borobia AM, Castaño L, Bertrán MJ, Campins M, Portolés A, Lora D, Bermejo M, Conde P, Hernández-Gutierrez L, Carcas A, Arana-Arri E, Tortajada M, Fuentes I, Ascaso A, García-Morales MT, Erick de la Torre-Tarazona H, Arribas JR, Imaz-Ayo N, Mellado-Pau E, Agustí A, Pérez-Ingidua C, Gómez de la Cámara A, Ochando J, Belda-Iniesta C, Frías J, Alcamí J, Pérez-Olmeda M; CombiVacS study Group. EClinicalMedicine. 2022; 50:101529
PUBMED DOITranscriptomic Evidence of the Immune Response Activation in Individuals With Limb Girdle Muscular Dystrophy Dominant 2 (LGMDD2) Contributes to Resistance to HIV-1 Infection
Diez-Fuertes F, López-Huertas MR, García-Pérez J, Calonge E, Bermejo M, Mateos E, Martí P, Muelas N, Vílchez JJ, Coiras M, Alcamí J, Rodríguez-Mora S. Front Cell Dev Biol. 2022; 10:839813
PUBMED DOIImmunogenicity and reactogenicity of BNT162b2 booster in ChAdOx1-S-primed participants (CombiVacS): a multicentre, open-label, randomised, controlled, phase 2 trial
Borobia AM, Carcas AJ, Pérez-Olmeda M, Castaño L, Bertran MJ, García-Pérez J, Campins M, Portolés A, González-Pérez M, García Morales MT, Arana-Arri E, Aldea M, Díez-Fuertes F, Fuentes I, Ascaso A, Lora D, Imaz-Ayo N, Barón-Mira LE, Agustí A, Pérez-Ingidua C, Gómez de la Cámara A, Arribas JR, Ochando J, Alcamí J, Belda-Iniesta C, Frías J; CombiVacS Study Group. Lancet. 2021; 398(10295):121-130
PUBMED DOIFirst Insight into the Genome Sequences of Two Linezolid-Resistant Nocardia farcinica Strains Isolated from Patients with Cystic Fibrosis
2: Valdezate S, Monzón S, Garrido N, Zaballos A, Medina-Pascual MJ, Azcona-Gutiérrez JM, Vilar B, Cuesta I. First Insight into the Genome Sequences of Two Linezolid-Resistant Nocardia farcinica Strains Isolated from Patients with Cystic Fibrosis. Genome Announc. 2017 Nov 16;5(46).
PUBMED DOIApoptosis, Toll-like, RIG-I-like and NOD-like Receptors Are Pathways Jointly Induced by Diverse Respiratory Bacterial and Viral Pathogens.
3: Martínez I, Oliveros JC, Cuesta I, de la Barrera J, Ausina V, Casals C, de Lorenzo A, García E, García-Fojeda B, Garmendia J, González-Nicolau M, Lacoma A, Menéndez M, Moranta D, Nieto A, Ortín J, Pérez-González A, Prat C, Ramos-Sevillano E, Regueiro V, Rodriguez-Frandsen A, Solís D, Yuste J, Bengoechea JA, Melero JA. Apoptosis, Toll-like, RIG-I-like and NOD-like Receptors Are Pathways Jointly Induced by Diverse Respiratory Bacterial and Viral Pathogens. Front Microbiol. 2017 Mar 1;8:276
PUBMED DOIMolecular identification, antifungal resistance and virulence of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans isolated in Seville, Spain
Gago S, Serrano C, Alastruey-Izquierdo A, Cuesta I, Martín-Mazuelos E, Aller AI, Gómez-López A, Mellado E. Molecular identification, antifungal resistance and virulence of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus deneoformans isolated in Seville, Spain. Mycoses. 2017 Jan;60(1):40-50
PUBMED DOIHigh-Quality Draft Genome Sequence of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis
7: Cuesta I, González LM, Estrada K, Grande R, Zaballos A, Lobo CA, Barrera J, Sanchez-Flores A, Montero E. High-Quality Draft Genome Sequence of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis. Genome Announc. 2014 Nov 13;2(6).
PUBMED DOISerum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis
8: Duarte RF, Sánchez-Ortega I, Cuesta I, Arnan M, Patiño B, Fernández de Sevilla A, Gudiol C, Ayats J, Cuenca-Estrella M. Serum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis. Clin Infect Dis. 2014 Dec 15;59(12):1696-702.
PUBMED DOIAnalysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets.
9: Barrera A, Alastruey-Izquierdo A, Martín MJ, Cuesta I, Vizcaíno JA. Analysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets. PLoS Comput Biol. 2014 Jul 17;10(7):e1003733.
PUBMED DOIContenidos con Investigacion .
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Julio Vázquez Moreno
Profesor de Investigación OPIs. Personal Ad Honorem
Código ORCID: 0000-0003-2175-5237
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Carmen Navarro Rivas
Ayudante de Investigación
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Cristina García Amil
Ayudante de Investigación
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Andrea López Moreno
Ayudante de Investigación
Listado de personal
Información adicional
Streptococcus pneumoniae es un patógeno humano que, a pesar del desarrollo de vacunas, continúa siendo una importante causa de mortalidad y morbilidad. Nosotros investigamos los mecanismos de resistencia a antibióticos en esta bacteria. Por una parte identificando nuevas dianas terapéuticas y por otra investigando las bases moleculares de la acción de antibióticos ya utilizados en clínica (las fluoroquinolonas levofloxacina y moxifloxacina) o todavía no utilizados (seconeolitsina). Para ello utilizamos un análisis multidisciplinar implicando genómica, transcriptómica y proteómica para conocer la organización del cromosoma de S. pneumoniae y la identificación de los factores que estabilizan dicha organización, incluyendo ncRNAs. Cambios en el nivel de superenrollamiento global, bien por inhibición de la girasa (disminución) o por inhibición de la topoisomerasa I (incremento) altera el transcriptoma. Los genes modulados se localizan en dominios, cuyos genes muestran características funcionales específicas. Se pretende identificar nuevos factores esenciales para la fisiología de S. pneumoniae y caracterizar la regulación de la transcripción en respuesta a estrés topológico. Además, se utilizará la tecnología del RNA de interferencia y sistemas CRISPR como nuevos antibacterianos. Estos estudios sentarán las bases para una investigación translacional dirigida al desarrollo de nuevas dianas terapéuticas para el tratamiento de enfermedades neumocócicas.
Streptococcus pneumoniae es un patógeno humano que, a pesar del desarrollo de vacunas, continúa siendo una importante causa de mortalidad y morbilidad. Nosotros investigamos los mecanismos de resistencia a antibióticos en esta bacteria. Por una parte identificando nuevas dianas terapéuticas y por otra investigando las bases moleculares de la acción de antibióticos ya utilizados en clínica (las fluoroquinolonas levofloxacina y moxifloxacina) o todavía no utilizados (seconeolitsina). Para ello utilizamos un análisis multidisciplinar implicando genómica, transcriptómica y proteómica para conocer la organización del cromosoma de S. pneumoniae y la identificación de los factores que estabilizan dicha organización, incluyendo ncRNAs. Cambios en el nivel de superenrollamiento global, bien por inhibición de la girasa (disminución) o por inhibición de la topoisomerasa I (incremento) altera el transcriptoma. Los genes modulados se localizan en dominios, cuyos genes muestran características funcionales específicas. Se pretende identificar nuevos factores esenciales para la fisiología de S. pneumoniae y caracterizar la regulación de la transcripción en respuesta a estrés topológico. Además, se utilizará la tecnología del RNA de interferencia y sistemas CRISPR como nuevos antibacterianos. Estos estudios sentarán las bases para una investigación translacional dirigida al desarrollo de nuevas dianas terapéuticas para el tratamiento de enfermedades neumocócicas.