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Investigación

Genética Bacteriana

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Neisseria, Listeria y Bordetella .

  • Enfermedad Meningocócica Invasiva.
    • Vigilancia de laboratorio basada en secuenciación del genoma completo y su aplicación en Salud Pública.
    • Estudio y caracterización de mecanismos de resistencia a antimicrobianos.
    • Estudio y evaluación de vacunas convencionales (polisacarídicas) y de nueva generación (proteicas).
  • Infección gonocócica (Gonorrea).
    • Vigilancia de laboratorio basada en secuenciación del genoma completo y su aplicación en salud Pública.
    • Estudio y caracterización de mecanismos de resistencia a antimicrobianos.
  • Listeriosis.
    • Vigilancia de laboratorio basada en secuenciación del genoma completo y su aplicación en salud Pública.
  • Tosferina.
    • Desarrollo y aplicación de técnicas moleculares para el diagnóstico y caracterización de Bordetella pertussis, B. parapertussis, B. holmessi y B. bronchiseptica.

Proyectos de investigación

Contenidos con Investigacion Neisseria, Listeria y Bordetella .

1. Título del proyecto: Determinación del grado de identidad de antígenos comunes de N. meningitidis y N. gonorrhoeae mediante herramientas genómicas e inmunológicas.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII. Programa: Acción Estratégica en Salud Intramural
Referencia: PI23CIII/00040
Periodo: 2024-2026
Importe concedido: 68.500€

2. Título del proyecto: Meningococcal Disease and Molecular Epidemiology (MEMORY).
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca y Julio A. Vázquez Moreno
Entidad financiadora: Pfizer Inc
Referencia: MVP 352/21
Periodo: 2022-2024
Importe concedido: 82.834,50€

3. Título del proyecto: Modelling Approaches to Guide Intelligent surveillance for the sustainable Introduction of novel ANtibiotics. MAGIcIAN.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII / Acción Conjunta Internacional / Programa Joint Programming Initiatives (JPI)
Referencia: AC19CIII/00002
Periodo: 2020-2024
Importe concedido: 46.000€

4. Título del proyecto: Análisis epidemiológico, microbiológico y clínico del brote de listeriosis en Andalucía. Estudio LISMOAN.
Investigador Principal: José Miguel Cisneros Herreros
Entidad financiadora: FISEVI (Fundación Pública Andaluza para la gestión de la Investigación en Salud)/Convocatoria FPS2020
Referencia: PI-0001-2020
Periodo: 2020-2023
Importe concedido: 114.954€

5. Título del proyecto: Estructura poblacional de Neisseria meningitidis mediante secuenciación masiva ¿Una posible herramienta para estimar efectividad vacunal?
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII / Acción Estratégica en Salud Intramural
Referencia: PI19CIII/00030
Periodo: 2020-2023
Importe concedido: 67.153€.

6. Título del proyecto: Encomienda de gestión entre el Ministerio de Sanidad, Servicios Sociales e Igualdad (dirección general de salud pública, calidad e innovación) y el Instituto de Salud Carlos III, para las determinaciones de laboratorio correspondientes al 2º estudio de seroprevalencia en España.
Investigador Principal: Fernando de Ory y Julio A. Vázquez
Entidad financiadora: Dirección General de Salud Pública, Ministerio de Sanidad
Referencia: MEG151/17
Periodo: 2018-2020
Importe concedido: 565.663€

7. Título del proyecto: Efectividad de la vacuna frente al Meningococo B en niños inmunodeprimidos por drepanocitosis.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: Fundación de la Sociedad Española de Hematología y Oncología Pediátricas (SEHOP)
Referencia: MVP 199/18
Periodo: 2018-2020
Importe concedido: 18.285€

8. Título del proyecto: Aplicación de secuenciación masiva y aproximaciones inmunológicas en el análisis de expresión de nuevos antígenos vacunales en población de meningococo.
Investigador Principal: Raquel Abad Torreblanca
Entidad financiadora: ISCIII / Acción Estratégica en Salud Intramural
Referencia: PI16CIII/00023
Periodo: 2017-2020
Importe concedido: 115.084€

9. Título del proyecto: fHbp variability over time and potential coverage of the new meningococcal serogroup B vaccine (bivalent rLP2086/fHbp) in Spain.
Investigador Principal: Raquel Abad y Julio A. Vázquez
Entidad financiadora: Pfizer SLU
Referencia: MVP 1273/16
Periodo: 2017-2020
Importe concedido: 125.350€

10. Título del proyecto: Estimación de protección de vacuna conjugada frente a meningococo de serogrupo C basada en un modelo matemático.
Investigador Principal: Julio A. Vázquez y Javier Díez
Entidad financiadora: Centro Superior de Investigación en Salud Pública (CSISP)
Referencia: MVP 1116/11
Periodo: 2011-2017
Importe concedido: 143.750€
 

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Publicaciones destacadas

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Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation FRONTIERS IN IMMUNOLOGY.

3 Ceballos, Francisco C.; Virseda-Berdices, Ana; Resino, Salvador; et al; Jimenez-Sousa, Maria Angeles. (19/19). 2022. Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation FRONTIERS IN IMMUNOLOGY. ISSN 1664-3224.

Metabolomic changes after DAAs therapy are related to the improvement of cirrhosis and inflammation in HIV/HCV-coinfected patients.

4 Virseda-Berdices, Ana; Rojo, David; Martinez, Isidoro; et al; Jimenez-Sousa, Maria Angeles. (14/14). 2022. Metabolomic changes after DAAs therapy are related to the improvement of cirrhosis and inflammation in HIV/HCV-coinfected patients. BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY. 147:112623. ISSN 1950-6007.

HCV Cure With Direct-Acting Antivirals Improves Liver and Immunological Markers in HIV/HCV-Coinfected Patients FRONTIERS IN IMMUNOLOGY.

7 Brochado-Kith, Oscar; Martinez, Isidoro; Berenguer, Juan; et al; Jiménez-Sousa, Maria Angeles (‡, AC); Resino, Salvador (‡, AC). (13/13). 2021. HCV Cure With Direct-Acting Antivirals Improves Liver and Immunological Markers in HIV/HCV-Coinfected Patients FRONTIERS IN IMMUNOLOGY. 12:723196. ISSN 1664-3224.

Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality

3. Fernández-Pato A; Virseda-Berdices A; Resino S; et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (20/20). 2022. Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality Emerging Microbes and Infections. Taylor & Francis Online. ISSN 2222-1751.

DOI

Diagnostic Performance of the HCV Core Antigen Test To Identify Hepatitis C in HIV-Infected Patients: a Systematic Review and Meta-Analysis

4. Sepúlveda-Crespo D; Treviño-Nakoura A; Bellon JM; Jiménez-Sousa MA; Ryan P; Martínez I; Fernández-Rodríguez A (AC); Resino S. (7/8). 2022. Diagnostic Performance of the HCV Core Antigen Test To Identify Hepatitis C in HIV-Infected Patients: a Systematic Review and Meta-Analysis.Journal of clinical microbiology. pp.e0133122. ISSN 0095-1137.

DOI

Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation

6. Ceballos FC; Virseda-Berdices A; Resino S; et al; Jiménez-Sousa MÁ (AC). (19/19). 2022. Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation.Frontiers in immunology. 13, pp.925558. WOS (78)

DOI

Novel genes and sex differences in COVID-19 severity

7. Cruz R; Almeida SD; Heredia ML; et al; Fernández-Rodríguez A; Carracedo Á. (51/168). 2022. Novel genes and sex differences in COVID-19 severity. Human molecular genetics. ISSN 0964-6906.

DOI

Different HCV Exposure Drives Specific miRNA Profile in PBMCs of HIV Patients

8. Valle-Millares D; Brochado-Kith O; Martín-Carbonero L; et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (22/22). 2021. Different HCV exposure drives specific miRNA profile in PBMCs of HIV patients Biomedicines. MDPI. 9-11, pp.1627.

DOI

Are Reduced Levels of Coagulation Proteins Upon Admission Linked to COVID-19 Severity and Mortality?

9. Ceballos F; Ryan P; Blancas R; et al; Fernández-Rodríguez A (AC); Jiménez-Sousa MA. (19/20). 2021. Are Reduced Levels of Coagulation Proteins Upon Admission Linked to COVID-19 Severity and Mortality? Frontiers in Medicine. Frontiers. 8-718053.

DOI

Telomere Length Increase in HIV/HCV-Coinfected Patients with Cirrhosis after HCV Eradication with Direct-Acting Antivirals

12 . Molina-Carrión S; Brochado-Kith, Oscar; González-García J; et al; Angeles Jimenez-Sousa, Maria. (16/16). 2020. Telomere length increase in HIV/HCV-coinfected patients with cirrhosis after HCV eradication with direct acting antivirals. JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE. MDPI. ISSN 2077-0383.

DOI

MicroRNA Profile of HCV Spontaneous Clarified Individuals, Denotes Previous HCV Infection

15. Brochado-Kith, Oscar; Gomez-Sanz, Alicia; Real LM; et al; Fernandez-Rodriguez, Amanda (AC). (16/16). 2019. MicroRNA Profile of HCV Spontaneous Clarified Individuals, Denotes Previous HCV Infection JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE. MDPI. 7. ISSN 2077-0383.

DOI

​​Persistent Immunity against SARS-CoV-2 in Individuals with Oncohematological Diseases Who Underwent Autologous or Allogeneic Stem Cell Transplantation after Vaccination

​​Persistent Immunity against SARS-CoV-2 in Individuals with Oncohematological Diseases Who Underwent Autologous or Allogeneic Stem Cell Transplantation after Vaccination. Rodríguez-Mora S, Pérez-Lamas L, Solera Sainero M, Torres M, Sánchez-Menéndez C, Corona M, Mateos E, Casado-Fernández G, Alcamí J, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Murciano-Antón A, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). Cancers 2023, 15(8), 2344. doi: 10.3390/cancers15082344. PMID: 37190272.

PUBMED DOI

Sustained Cytotoxic Response of Peripheral Blood Mononuclear Cells from Unvaccinated Individuals Admitted to the ICU Due to Critical COVID-19 Is Essential to Avoid a Fatal Outcome

Sustained Cytotoxic Response of Peripheral Blood Mononuclear Cells from Unvaccinated Individuals Admitted to the ICU Due to Critical COVID-19 Is Essential to Avoid a Fatal Outcome. Casado-Fernández G, Corona M, Torres M, Saez AJ, Ramos-Martín F, Manzanares M, Vigón L, Mateos E, Pozo F, Casas I, García-Gutierrez V, Rodríguez-Mora S, Coiras M (AC). Int J Environ Res Public Health. 2023 Jan20;20(3):1947. doi: 10.3390/ijerph20031947. PMID: 36767310.

PUBMED DOI

Dasatinib: effects on the macrophage phospho proteome with a focus on SAMHD1 and HIV-1 infection

Dasatinib: effects on the macrophage phospho proteome with a focus on SAMHD1 and HIV-1 infection. Williams ESCP, Szaniawski MA, Martins LJ, Innis EA, Alcamí J, Hanley TM, Spivak AM, Coiras M, Planelles V. Clin Res HIV AIDS.2022;8(1):1053. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36589263/. PMID: 36589263.

PUBMED

Early Cellular and Humoral Responses Developed in Oncohematological Patients after Vaccination with One Dose against COVID-19

Early Cellular and Humoral Responses Developed in Oncohematological Patients after Vaccination with One Dose against COVID-19. Rodríguez-Mora S, Corona M, Torres M, Casado-Fernández G, García-Pérez J, Ramos-Martín F, Vigón L, Manzanares M, Mateos E, Martín-Moro F, Zurdo-Castronuño A, Murciano-Antón MA, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). J Clin Med. 2022 May 16;11(10):2803. doi: 10.3390/jcm11102803. PMID: 35628927.

PUBMED DOI

Changes in the immune response against SARS-CoV-2 in individuals with severe COVID-19 treated with high dose of vitamin D

Changes in the immune response against SARS-CoV-2 in individuals with severe COVID-19 treated with high dose of vitamin D. Torres M, Casado G, Vigón L, Rodríguez-Mora S, Mateos E, Ramos-Martín F, López-Wolf D, Sanz-Moreno J, Ryan-Murua P, Taboada-Martínez ML, López-Huertas MR, Cervero M, Coiras M (AC). Biomed Pharmacother. 2022 Apr 14;150:112965. doi: 10.1016/j.biopha.2022.112965. PMID: 35468580.

PUBMED DOI

Strong Cellular Immune Response, but Not Humoral, against SARS-CoV-2 in Oncohematological Patients with Autologous Stem Cell Transplantation after Natural Infection.

Strong Cellular Immune Response, but Not Humoral, against SARS-CoV-2 in Oncohematological Patients with Autologous Stem Cell Transplantation after Natural Infection. Vigón L, Sánchez-Tornero A, Rodríguez-Mora S, García-Pérez J, Corona de Lapuerta M, Pérez-Lamas L, Casado-Fernández G, Moreno G, Torres M, Mateos E, Murciano-Antón MA, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). J Clin Med. 2022 Apr 11;11(8):2137. doi: 10.3390/jcm11082137. PMID: 35456230.

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Persistent overactive cytotoxic immune response in a Spanish cohort of individuals with Long-COVID: Identification of diagnostic biomarkers. Galán M, Vigón L, Fuertes D, Murciano-Antón MA, Casado-Fernández G, Domínguez-Mateos S, Mateos E, Ramos-Martín F, Planelles V, Torres M, Rodríguez-Mora S, López-Huertas MR, Coiras M (CA). Front Immunol. 2022 Mar 25;13:848886. doi: 10.3389/fimmu.2022.848886. PMID: 35401523

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PUBMED DOI

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Impaired Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity in a Spanish Cohort of Patients With COVID-19 Admitted to the ICU. Vigón L, García-Pérez J, Rodríguez-Mora S, Torres M, Mateos E, Castillo de la Osa M, Cervero M, Malo De Molina R, Navarro C, Murciano-Antón MA, García-Gutiérrez V, Planelles V, Alcamí J, Pérez-Olmeda M, López-Huertas MR, Coiras M (AC). Front Immunol. 2021 Sep 20;12:742631. doi: 10.3389/fimmu.2021.742631. eCollection 2021. PMID: 34616404.

PUBMED DOI

Contenidos con Investigacion Neisseria, Listeria y Bordetella .

Listado de personal

Información adicional

Streptococcus pneumoniae es un patógeno humano que, a pesar del desarrollo de vacunas, continúa siendo una importante causa de mortalidad y morbilidad. Nosotros investigamos los mecanismos de resistencia a antibióticos en esta bacteria. Por una parte identificando nuevas dianas terapéuticas y por otra investigando las bases moleculares de la acción de antibióticos ya utilizados en clínica (las fluoroquinolonas levofloxacina y moxifloxacina) o todavía no utilizados (seconeolitsina). Para ello utilizamos un análisis multidisciplinar implicando genómica, transcriptómica y proteómica para conocer la organización del cromosoma de S. pneumoniae y la identificación de los factores que estabilizan dicha organización, incluyendo ncRNAs. Cambios en el nivel de superenrollamiento global, bien por inhibición de la girasa (disminución) o por inhibición de la topoisomerasa I (incremento) altera el transcriptoma. Los genes modulados se localizan en dominios, cuyos genes muestran características funcionales específicas. Se pretende identificar nuevos factores esenciales para la fisiología de S. pneumoniae y caracterizar la regulación de la transcripción en respuesta a estrés topológico. Además, se utilizará la tecnología del RNA de interferencia y sistemas CRISPR como nuevos antibacterianos. Estos estudios sentarán las bases para una investigación translacional dirigida al desarrollo de nuevas dianas terapéuticas para el tratamiento de enfermedades neumocócicas.

Streptococcus pneumoniae es un patógeno humano que, a pesar del desarrollo de vacunas, continúa siendo una importante causa de mortalidad y morbilidad. Nosotros investigamos los mecanismos de resistencia a antibióticos en esta bacteria. Por una parte identificando nuevas dianas terapéuticas y por otra investigando las bases moleculares de la acción de antibióticos ya utilizados en clínica (las fluoroquinolonas levofloxacina y moxifloxacina) o todavía no utilizados (seconeolitsina). Para ello utilizamos un análisis multidisciplinar implicando genómica, transcriptómica y proteómica para conocer la organización del cromosoma de S. pneumoniae y la identificación de los factores que estabilizan dicha organización, incluyendo ncRNAs. Cambios en el nivel de superenrollamiento global, bien por inhibición de la girasa (disminución) o por inhibición de la topoisomerasa I (incremento) altera el transcriptoma. Los genes modulados se localizan en dominios, cuyos genes muestran características funcionales específicas. Se pretende identificar nuevos factores esenciales para la fisiología de S. pneumoniae y caracterizar la regulación de la transcripción en respuesta a estrés topológico. Además, se utilizará la tecnología del RNA de interferencia y sistemas CRISPR como nuevos antibacterianos. Estos estudios sentarán las bases para una investigación translacional dirigida al desarrollo de nuevas dianas terapéuticas para el tratamiento de enfermedades neumocócicas.

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