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Investigación

Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora .

​El diagnóstico de la infección fúngica invasora (IFI) es complicado y con frecuencia se retrasa ya que en muchas ocasiones a la falta de sospecha clínica se le suma la falta de herramientas diagnósticas eficaces. Esta línea de investigación se inició en el año 2003, primero liderada por el Dr. Manuel Cuenca-Estrella y posteriormente por la Dra. María José Buitrago con el objetivo general de desarrollar nuevas herramientas, basadas en la PCR en tiempo Real, para un diagnóstico rápido de IFI. Los objetivos concretos que se han ido alcanzando a lo largo de estos años han sido los siguientes:

Detección precoz de hongos causantes de infecciones fúngicas oportunistas más frecuentes en pacientes inmunodeprimidos (Aspergilosis y Candidiasis invasoras)

Se han desarrollado y validado técnicas de PCR en tiempo Real en formato multiplex para el cribado de pacientes en riesgo de padecer estas infecciones, así como para el diagnóstico en pacientes con sospecha.

Detección de IFIs causadas por hongos emergentes (Escedosporiosis, Fusariosis etc...)

El aumento de especies raras o poco frecuentes causantes de IFI hizo necesario el desarrollo de técnicas para su detección

Detección “panfúngica”

Para aquellos casos en los que no exista evidencia clara del hongo causante de la infección se han desarrollado técnicas basadas en PCR en tiempo Real.   

Mejora del diagnóstico y la identificación de los hongos causantes de micosis importadas (micosis endémicas)

Debido al aumento de la inmigración y los viajes a lugares exóticos en los últimos años se ha producido un incremento de las micosis importadas en España, en concreto de aquellas causadas por hongos endémicos de determinadas regiones, los cuales son además patógenos primarios. Este objetivo es relevante en el contexto de una región no-endémica ya que existe falta de experiencia en el manejo de estas infecciones y las técnicas diagnósticas disponibles son muy escasas. A lo largo de estos años se han desarrollado y validado distintas técnicas para el diagnóstico rápido de estas micosis y se han realizado diferentes trabajos encaminados a un mejor conocimiento de los hongos que las causan.

 

Las técnicas desarrolladas a lo largo de estos años se han incorporado a la Cartera de Servicios del Centro Nacional de Microbiología para ofrecerlas al Sistema Nacional de Salud. Además, algunas de ellas se han patentado.

Proyectos de investigación

Contenidos con Investigacion Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora .

1. Nombre del proyecto: Mejora del pronóstico del paciente con riesgo de enfermedad fúngica invasora: estudio de susceptibilidad del huésped y desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico clínico. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2018 - 31/12/2020. Cuantía: 72.000 €. Investigadores principales (IP, Co-IP,...): María José Buitrago Serna/Laura Alcazar Fuoli

2. Nombre del proyecto: Red española de Investigación en Patologías infecciosas REIPI
Entidad/es financiadora/s: ISCIII-FEDER Fecha de inicio-fin: 01/01/2017 - 31/12/2021
Cuantía total: 195.612 €. Coordinador: Emilia Mellado

3. Nombre del proyecto: Desarrollo y validación de un método de detección de tipo “point of care”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2015 - 31/12/2017. Cuantía total: 46.000 €. Investigador principal: María José Buitrago.

4. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2(Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory). Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2016 - 01/06/2017. Cuantía total: 524.848 €. Cuantía subproyecto: 141.562 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.

5. Nombre del proyecto: Iberian network of laboratories of Biological Alert Acreditation of methods for detection of highly pathogenic agents/IB-BiOALERNET Entidad/es financiadora/s: DG-Home (Unión Europea). Fecha de inicio-fin: 2013 – 2015. Cuantía total: 629.382,67 €. Coordinador (IP): Carmen Cañavate

6. Nombre del proyecto: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad/es financiadora/s: ISCIII. Fecha de inicio-fin: 2012 – 2015. Cuantía total: 67.429,67 €. Investigador principal: María José Buitrago.

7. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2 (Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory. Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2010 - 31/12/2013. Cuantía total: 4.859.782,5 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.

8. Nombre del proyecto: RED iberoamericana de diagnóstico molecular de las infecciones endémicas y oportunistas. Entidad/es financiadora/s: CYTED-AECI. Fecha de inicio-fin: 2008 – 2009. Cuantía total: 70.000 €. Investigador principal: Luz-Elena Cano

9. Nombre del proyecto: “Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico en alertas biosanitarias relacionadas con la Micología”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 2007 – 2009. Cuantía total: 58.500 €. Investigador Principal: María José Buitrago

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PUBMED DOI

Are Reduced Levels of Coagulation Proteins Upon Admission Linked to COVID-19 Severity and Mortality? Front Med (Laussane).

Ceballos FC; Ryan P; Blancas R; et al; Jiménez-Sousa MÁ (20/20). Are Reduced Levels of Coagulation Proteins Upon Admission Linked to COVID-19 Severity and Mortality? Front Med (Laussane). 2021; 8:718053. PMID: 34660629. doi: 10.3389/fmed.2021.718053.

T allele was linked to non-AIDS progression in ART-naïve HIV-infected patients: a retrospective study.

Jiménez-Sousa MA; Jiménez JL; Bellón JM; et al (1/10). CYP27B1 rs10877012 T allele was linked to non-AIDS progression in ART-naïve HIV-infected patients: a retrospective study. J Acquir Immune Defic Syndr 2020 ;85(5):659-664. doi: 10.1097/QAI.0000000000002485.

Alcazar-Fuoli L, Clavaud C, Lamarre C, Aimanianda V, Seidl-Seiboth V, Mellado E, Latgé JP. Functional analysis of the fungal/plant class chitinase family in Aspergillus fumigatus.

Alcazar-Fuoli L, Clavaud C, Lamarre C, Aimanianda V, Seidl-Seiboth V, Mellado E, Latgé JP. Functional analysis of the fungal/plant class chitinase family in Aspergillus fumigatus. Fungal Genet Biol. 2011 Apr;48(4):418-29. doi: 10.1016/j.fgb.2010.12.007. Epub 2010 Dec 22. PMID: 21184840.

PUBMED DOI

Impact of DARC rs12075 Variants on Liver Fibrosis Progression in Patients with Chronic Hepatitis C: A Retrospective Study.

Jiménez-Sousa MA (AC); Gómez-Moreno AZ; Pineda-Tenor D; et al. (1/9) Impact of DARC rs12075 Variants on Liver Fibrosis Progression in Patients with Chronic Hepatitis C: A Retrospective Study. Biomolecules 2019; 9(4).​

DBP rs16846876 and rs12512631 polymorphisms are associated with progression to AIDS naïve HIV-infected patients: a retrospective study.

Jiménez-Sousa MA (AC); Jiménez JL; Fernández-Rodríguez A; et al. (1/10). DBP rs16846876 and rs12512631 polymorphisms are associated with progression to AIDS naïve HIV-infected patients: a retrospective study. Journal of Biomedical Science. 2019; 23;26(1):83. doi: 10.1186/s12929-019-0577-y.

TRPM5 rs886277 Polymorphism Predicts Hepatic Fibrosis Progression in Non-Cirrhotic HCV-Infected Patients.Journal of Clinical Medicine.

Resino S; Fernández-Rodríguez A; Pineda-Tenor D; et al; Jiménez-Sousa MA. (11/11). 2021. TRPM5 rs886277 Polymorphism Predicts Hepatic Fibrosis Progression in Non-Cirrhotic HCV-Infected Patients.Journal of Clinical Medicine. 10-3, pp.483. ISSN 2077-0383. https://doi.org/10.3390/jcm10030483.

Plasma metabolomic fingerprint of advanced cirrhosis stages among HIV/HCV-coinfected and HCV-monoinfected patients

Salguero, Sergio; Rojo, David; Berenguer, Juan; et al; Jimenez-Sousa, Maria A. (AC) (15/15). 2020. Plasma metabolomic fingerprint of advanced cirrhosis stages among HIV/HCV-coinfected and HCV-monoinfected patients LIVER INTERNATIONAL. 40-9, pp.2215-2227. ISSN 1478-3223. https://doi.org/10.1111/liv.14580 3

Telomere Length Increase in HIV/HCV-Coinfected Patients with Cirrhosis after HCV Eradication with Direct-Acting Antivirals JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE.

Molina-Carrion, Silvia; Brochado-Kith, Oscar; Gonzalez-Garcia, Juan; et al; Jimenez-Sousa, Maria Angeles. (12/12). 2020. Telomere Length Increase in HIV/HCV-Coinfected Patients with Cirrhosis after HCV Eradication with Direct-Acting Antivirals JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE. 9. ISSN 2077-0383. https://doi.org/10.3390/jcm9082407.

PBMCs gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for clinically significant portal hypertension in HIV/HCV coinfected patients

Salguero, Sergio; Brochado-Kith, Oscar; Verdices, Ana Virseda; et al; Jiménez-Sousa María A (‡, AC); Resino, Salvador (‡, AC). (12/12). 2023. PBMCs gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for clinically significant portal hypertension in HIV/HCV coinfected patients: A cross-control study. Biomedicine & pharmacotherapy. 159, pp.114220. ISSN 1950-6007.

Relative telomere length impact on mortality of COVID-19: Sex differences.Journal of medical virology.

Virseda-Berdices, Ana; Concostrina-Martinez, Leyre; Martinez-Gonzalez, Oscar; et al; Fernandez-Rodriguez, Amanda (‡), Jiménez-Sousa María A (‡). (14/14). 2023. Relative telomere length impact on mortality of COVID-19: Sex differences.Journal of medical virology. 95-1, pp.e28368. ISSN 1096-9071.

Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality.

Fernandez-Pato, Asier; Virseda-Berdices, Ana; Resino, Salvador; et al; Jiménez-Sousa María A (‡, AC); Fernandez-Rodriguez, Amanda (‡). (20/20). 2022. Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality. EMERGING MICROBES & INFECTIONS. 11(1):676-688. doi: 10.1080/22221751.2022.2038021.

Blood microbiome is associated with changes in portal hypertension after successful direct-acting antiviral therapy in patients with HCV-related cirrhosis.The Journal of antimicrobial chemotherapy.

Virseda-Berdices, Ana; Brochado-Kith, Oscar; Diez, Cristina; et al; Jimenez-Sousa, Maria Angeles. (16/16). 2021. Blood microbiome is associated with changes in portal hypertension after successful direct-acting antiviral therapy in patients with HCV-related cirrhosis.The Journal of antimicrobial chemotherapy. 77(3):719-726. doi: 10.1093/jac/dkab444. ISSN 1460-2091.

Chronic pulmonary aspergillosis update: A year in review. Med Mycol. 2019 Apr 1

Barac A, Kosmidis C, Alastruey-Izquierdo A, Salzer HJF; CPAnet. Chronic pulmonary aspergillosis update: A year in review. Med Mycol. 2019 Apr 1;57(Supplement_2):S104-S109. doi: 10.1093/mmy/myy070. PMID: 30816975.

PUBMED DOI

Laursen CB, Davidsen JR, Van Acker L, Salzer HJF, Seidel D, Cornely OA, Hoenigl M, Alastruey-Izquierdo A, Hennequin C, Godet C, Barac A, Flick H, Munteanu O, Van Braeckel E. CPAnet Registry-An International Chronic Pulmonary Aspergillosis Registry. J Fungi (Basel). 2020 Jun

Laursen CB, Davidsen JR, Van Acker L, Salzer HJF, Seidel D, Cornely OA, Hoenigl M, Alastruey-Izquierdo A, Hennequin C, Godet C, Barac A, Flick H, Munteanu O, Van Braeckel E. CPAnet Registry-An International Chronic Pulmonary Aspergillosis Registry. J Fungi (Basel). 2020 Jun 29;6(3):E96. doi: 10.3390/jof6030096. PMID: 32610566.

PUBMED DOI

Treatment of Chronic Pulmonary Aspergillosis: Current Standards and Future Perspectives. Respiration. 2018 Jul

Alastruey-Izquierdo A, Cadranel J, Flick H, Godet C, Hennequin C, Hoenigl M, Kosmidis C, Lange C, Munteanu O, Page I, Salzer HJF; on behalf of CPAnet. Treatment of Chronic Pulmonary Aspergillosis: Current Standards and Future Perspectives. Respiration. 2018 Jul 6:1-12. doi: 10.1159/000489474. [Epub ahead of print] Review. PMID: 29982245.

PUBMED DOI

The Diagnostic Laboratory Hub: A New Health Care System Reveals the Incidence and Mortality of Tuberculosis, Histoplasmosis, and Cryptococcosis of PWH in Guatemala. Open Forum Infect Dis. 2019 Dec

Samayoa B, Aguirre L, Bonilla O, Medina N, Lau-Bonilla D, Mercado D, Moller A, Perez JC, Alastruey-Izquierdo A, Arathoon E, Denning DW, Rodríguez-Tudela JL; “Fungired”. The Diagnostic Laboratory Hub: A New Health Care System Reveals the Incidence and Mortality of Tuberculosis, Histoplasmosis, and Cryptococcosis of PWH in Guatemala. Open Forum Infect Dis. 2019 Dec 15;7(1):ofz534. doi: 10.1093/ofid/ofz534. PMID: 31915715.

PUBMED DOI

Fungired. Comparative performance of the laboratory assays used by a Diagnostic Laboratory Hub for opportunistic infections in people living with HIV. AIDS. 2020 Sep 1

Medina N, Alastruey-Izquierdo A, Mercado D, Bonilla O, Pérez JC, Aguirre L, Samayoa B, Arathoon E, Denning DW, Rodriguez-Tudela JL; Fungired. Comparative performance of the laboratory assays used by a Diagnostic Laboratory Hub for opportunistic infections in people living with HIV. AIDS. 2020 Sep 1;34(11):1625-1632. doi: 10.1097/QAD.0000000000002631. PMID: 32694415.

PUBMED DOI

Population-Based Program of filamentous fungi and Antifungal Resistance in Spain (FILPOP STUDY). Antimicrob Agents Chemother. 2013 Jul

Ana Alastruey-Izquierdo*, Emilia Mellado, Teresa Pelaez, Javier Pemán, Soledad Zapico, María Álvarez, Juan L Rodriguez-Tudela, Manuel Cuenca-Estrella Population-Based Program of filamentous fungi and Antifungal Resistance in Spain (FILPOP STUDY). Antimicrob Agents Chemother. 2013 Jul;57(7):3380-7. doi: 10.1128/AAC.01287-13. PMID: 28319466

PUBMED DOI

The global problem of antifungal resistance: prevalence, mechanisms, and management. Lancet Infect Dis. 2017 Dec

Perlin DS, Rautemaa-Richardson R, Alastruey-Izquierdo A. The global problem of antifungal resistance: prevalence, mechanisms, and management. Lancet Infect Dis. 2017 Dec;17(12. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30316-X. PMID: 28774698.

PUBMED DOI

Contenidos con Investigacion Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora .

Listado de personal

Información adicional

COLABORACIONES RECIENTES

1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil​

PATENTES

a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997

DIRECCION DE TESIS DOCTORALES

1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010

COLABORACIONES RECIENTES

1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil​

PATENTES

a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997

DIRECCION DE TESIS DOCTORALES

1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010

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