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Investigación
Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
El diagnóstico de la infección fúngica invasora (IFI) es complicado y con frecuencia se retrasa ya que en muchas ocasiones a la falta de sospecha clínica se le suma la falta de herramientas diagnósticas eficaces. Esta línea de investigación se inició en el año 2003, primero liderada por el Dr. Manuel Cuenca-Estrella y posteriormente por la Dra. María José Buitrago con el objetivo general de desarrollar nuevas herramientas, basadas en la PCR en tiempo Real, para un diagnóstico rápido de IFI. Los objetivos concretos que se han ido alcanzando a lo largo de estos años han sido los siguientes:
Detección precoz de hongos causantes de infecciones fúngicas oportunistas más frecuentes en pacientes inmunodeprimidos (Aspergilosis y Candidiasis invasoras)
Se han desarrollado y validado técnicas de PCR en tiempo Real en formato multiplex para el cribado de pacientes en riesgo de padecer estas infecciones, así como para el diagnóstico en pacientes con sospecha.
Detección de IFIs causadas por hongos emergentes (Escedosporiosis, Fusariosis etc...)
El aumento de especies raras o poco frecuentes causantes de IFI hizo necesario el desarrollo de técnicas para su detección
Detección “panfúngica”
Para aquellos casos en los que no exista evidencia clara del hongo causante de la infección se han desarrollado técnicas basadas en PCR en tiempo Real.
Mejora del diagnóstico y la identificación de los hongos causantes de micosis importadas (micosis endémicas)
Debido al aumento de la inmigración y los viajes a lugares exóticos en los últimos años se ha producido un incremento de las micosis importadas en España, en concreto de aquellas causadas por hongos endémicos de determinadas regiones, los cuales son además patógenos primarios. Este objetivo es relevante en el contexto de una región no-endémica ya que existe falta de experiencia en el manejo de estas infecciones y las técnicas diagnósticas disponibles son muy escasas. A lo largo de estos años se han desarrollado y validado distintas técnicas para el diagnóstico rápido de estas micosis y se han realizado diferentes trabajos encaminados a un mejor conocimiento de los hongos que las causan.
Las técnicas desarrolladas a lo largo de estos años se han incorporado a la Cartera de Servicios del Centro Nacional de Microbiología para ofrecerlas al Sistema Nacional de Salud. Además, algunas de ellas se han patentado.
Proyectos de investigación
Contenidos con Investigacion .
1. Nombre del proyecto: Mejora del pronóstico del paciente con riesgo de enfermedad fúngica invasora: estudio de susceptibilidad del huésped y desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico clínico. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2018 - 31/12/2020. Cuantía: 72.000 €. Investigadores principales (IP, Co-IP,...): María José Buitrago Serna/Laura Alcazar Fuoli
2. Nombre del proyecto: Red española de Investigación en Patologías infecciosas REIPI
Entidad/es financiadora/s: ISCIII-FEDER Fecha de inicio-fin: 01/01/2017 - 31/12/2021
Cuantía total: 195.612 €. Coordinador: Emilia Mellado
3. Nombre del proyecto: Desarrollo y validación de un método de detección de tipo “point of care”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2015 - 31/12/2017. Cuantía total: 46.000 €. Investigador principal: María José Buitrago.
4. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2(Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory). Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2016 - 01/06/2017. Cuantía total: 524.848 €. Cuantía subproyecto: 141.562 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.
5. Nombre del proyecto: Iberian network of laboratories of Biological Alert Acreditation of methods for detection of highly pathogenic agents/IB-BiOALERNET Entidad/es financiadora/s: DG-Home (Unión Europea). Fecha de inicio-fin: 2013 – 2015. Cuantía total: 629.382,67 €. Coordinador (IP): Carmen Cañavate
6. Nombre del proyecto: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad/es financiadora/s: ISCIII. Fecha de inicio-fin: 2012 – 2015. Cuantía total: 67.429,67 €. Investigador principal: María José Buitrago.
7. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2 (Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory. Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2010 - 31/12/2013. Cuantía total: 4.859.782,5 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.
8. Nombre del proyecto: RED iberoamericana de diagnóstico molecular de las infecciones endémicas y oportunistas. Entidad/es financiadora/s: CYTED-AECI. Fecha de inicio-fin: 2008 – 2009. Cuantía total: 70.000 €. Investigador principal: Luz-Elena Cano
9. Nombre del proyecto: “Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico en alertas biosanitarias relacionadas con la Micología”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 2007 – 2009. Cuantía total: 58.500 €. Investigador Principal: María José Buitrago
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Ramos-Sevillano E, Urzainqui A, de Andrés B, González-Tajuelo R, Domenech M, González-Camacho F, Sánchez-Madrid F, Brown JS, García E, Yuste J. PSGL-1 on Leukocytes is a Critical Component of the Host Immune Response against Invasive Pneumococcal Disease. PLoS Pathog. 2016 Mar 14;12(3):e1005500. doi: 10.1371/journal.ppat.1005500. PMID: 26975045; PMCID: PMC4790886.
DOIComparison of methods and characterization of small RNAs from plasma extracellular vesicles of HIV/HCV coinfected patients
Martínez-González E; Brochado-Kith O; Gómez-Sanz A; et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (9/9). 2020. Small RNA sequencing from plasma extracellular vesicles of HIV/HCV coinfected patients: a protocol comparison SCIENTIFIC REPORTS. 9. ISSN 2045-2322.
DOIRelative telomere length impact on mortality of COVID-19: Sex differences
Virseda-Berdices A; Concostrina-Martinez L; Martínez-González O;et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (14/14). 2022. Relative telomere length impact on mortality of COVID-19: Sex differences.Journal of medical virology. 95, pp.e28368. ISSN 0146-6615.
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PUBMED DOIHepatitis C Virus Influences HIV-1 Viral Splicing in Coinfected Patients
Martínez-Román P; López-Huertas MR; Crespo-Bermejo C; et al; Briz V (AC). (16/15). 2020. Hepatitis C virus influences HIV-1 viral splicing in coinfected patients JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE. MDPI. ISSN 2077-0383.
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PUBMED DOIHCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients
Brochado-Kith; Martínez I; Berenguer J; et al; Fernández-Rodríguez A (AC); Resino S. (11/12). 2021. HCV eradication with IFN-based therapy does not completely restore gene expression in PBMCs from HIV/HCV-coinfected patients. Journal of Biomedical Sciences. Springer Nature. 28-1.
DOIDynamics of HIV Reservoir and HIV-1 Viral Splicing in HCV-Exposed Individuals after Elimination with DAAs or Spontaneous Clearance
Martínez-Román P; Crespo-Bermejo C; Valle-Millares D; et al; Fernández-Rodríguez A (AC); On Behalf Of The Covihep Network. (12/15). 2022. Dynamics of HIV Reservoir and HIV-1 Viral Splicing in HCV-Exposed Individuals after Elimination with DAAs or Spontaneous Clearance. Journal of clinical medicine. 11. ISSN 2077-0383. WOS (52)
DOIOLFM4 polymorphisms predict septic shock survival after major surgery. Eur J Clin Invest.
Pérez-García F; Resino S; Gómez-Sánchez E; et al; Jiménez-Sousa MÁ (10/10). OLFM4 polymorphisms predict septic shock survival after major surgery. Eur J Clin Invest. 2021. 51(4):e13416. doi: 10.1111/eci.13416.
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Alcazar-Fuoli L, Mellado E, Garcia-Effron G, Buitrago MJ, Lopez JF, Grimalt JO, Cuenca-Estrella JM, Rodriguez-Tudela JL. Aspergillus fumigatus C-5 sterol desaturases Erg3A and Erg3B: role in sterol biosynthesis and antifungal drug susceptibility. Antimicrob Agents Chemother. 2006 Feb;50(2):453-60. doi: 10.1128/AAC.50.2.453-460.2006. PMID: 16436696; PMCID: PMC1366924.
PUBMED14. Alcazar-Fuoli L, Mellado E, Alastruey-Izquierdo A, Cuenca-Estrella M, Rodriguez-Tudela JL. Aspergillus section Fumigati: antifungal susceptibility patterns and sequence-based identification. Antimicrob Agents Chemother. 2008 Apr
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PUBMED DOIAlcazar-Fuoli L, Mellado E, Alastruey-Izquierdo A, Cuenca-Estrella M, Rodriguez-Tudela JL. Species identification and antifungal susceptibility patterns of species belonging to Aspergillus section Nigri. Antimicrob Agents Chemother. 2009 Oct
Alcazar-Fuoli L, Mellado E, Alastruey-Izquierdo A, Cuenca-Estrella M, Rodriguez-Tudela JL. Species identification and antifungal susceptibility patterns of species belonging to Aspergillus section Nigri. Antimicrob Agents Chemother. 2009 Oct;53(10):4514-7. doi: 10.1128/AAC.00585-09. Epub 2009 Jul 27. PMID: 19635955; PMCID: PMC2764190.
PUBMED DOIAlcazar-Fuoli L, Mellado E, Cuenca-Estrella M, Sanglard D. Probing the role of point mutations in the cyp51A gene from Aspergillus fumigatus in the model yeast Saccharomyces cerevisiae. Med Mycol. 2011 Apr
Alcazar-Fuoli L, Mellado E, Cuenca-Estrella M, Sanglard D. Probing the role of point mutations in the cyp51A gene from Aspergillus fumigatus in the model yeast Saccharomyces cerevisiae. Med Mycol. 2011 Apr;49(3):276-84. doi: 10.3109/13693786.2010.512926. Epub 2010 Sep 10. PMID: 20831364.
PUBMED DOIAlcazar-Fuoli L, Cuesta I, Rodriguez-Tudela JL, Cuenca-Estrella M, Sanglard D, Mellado E. Three-dimensional models of 14α-sterol demethylase (Cyp51A) from Aspergillus lentulus and Aspergillus fumigatus: an insight into differences in voriconazole interaction. Int J Antimicrob Agents. 2011 Nov
Alcazar-Fuoli L, Cuesta I, Rodriguez-Tudela JL, Cuenca-Estrella M, Sanglard D, Mellado E. Three-dimensional models of 14α-sterol demethylase (Cyp51A) from Aspergillus lentulus and Aspergillus fumigatus: an insight into differences in voriconazole interaction. Int J Antimicrob Agents. 2011 Nov;38(5):426-34. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2011.06.005. Epub 2011 Aug 25. PMID: 21871783.
PUBMED DOIAlcazar-Fuoli L, Mellado E. Ergosterol biosynthesis in Aspergillus fumigatus: its relevance as an antifungal target and role in antifungal drug resistance.
Alcazar-Fuoli L, Mellado E. Ergosterol biosynthesis in Aspergillus fumigatus: its relevance as an antifungal target and role in antifungal drug resistance. Front Microbiol. 2013 Jan 10;3:439. doi: 10.3389/fmicb.2012.00439. PMID: 23335918; PMCID: PMC3541703.
PUBMED DOIBernal-Martínez L, Alcazar Fuoli L, Miguel-Revilla B, Carvalho A, Cuétara Garcia MS, Garcia-Rodriguez J, Cunha C, Gómez-García de la Pedrosa E, Gomez-Lopez A. High-Resolution Melting Assay for Genotyping Variants of the CYP2C19 Enzyme and Predicting Voriconazole Effectiveness. Antimicrob Agents Chemother. 2019 May 24
Bernal-Martínez L, Alcazar Fuoli L, Miguel-Revilla B, Carvalho A, Cuétara Garcia MS, Garcia-Rodriguez J, Cunha C, Gómez-García de la Pedrosa E, Gomez-Lopez A. High-Resolution Melting Assay for Genotyping Variants of the CYP2C19 Enzyme and Predicting Voriconazole Effectiveness. Antimicrob Agents Chemother. 2019 May 24;63(6):e02399-18. doi: 10.1128/AAC.02399-18. PMID: 30910893; PMCID:PMC6535561.
PUBMED DOIContenidos con Investigacion .
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Leticia Bernal Martínez
Contratada Indefinida
Código ORCID: 0000-0002-1694-5522
Leticia Bernal Martínez es contratada doctor indefinida del Instituto de Salud Carlos III y tiene más de quince años de experiencia en Micología molecular. Su investigación se ha centrado en el desarrollo de nuevas técnicas diagnósticas de infección fúngica invasora.
Listado de personal
Información adicional
COLABORACIONES RECIENTES
1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil
PATENTES
a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997
DIRECCION DE TESIS DOCTORALES
1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010
COLABORACIONES RECIENTES
1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil
PATENTES
a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997
DIRECCION DE TESIS DOCTORALES
1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010