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Investigación
Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
El diagnóstico de la infección fúngica invasora (IFI) es complicado y con frecuencia se retrasa ya que en muchas ocasiones a la falta de sospecha clínica se le suma la falta de herramientas diagnósticas eficaces. Esta línea de investigación se inició en el año 2003, primero liderada por el Dr. Manuel Cuenca-Estrella y posteriormente por la Dra. María José Buitrago con el objetivo general de desarrollar nuevas herramientas, basadas en la PCR en tiempo Real, para un diagnóstico rápido de IFI. Los objetivos concretos que se han ido alcanzando a lo largo de estos años han sido los siguientes:
Detección precoz de hongos causantes de infecciones fúngicas oportunistas más frecuentes en pacientes inmunodeprimidos (Aspergilosis y Candidiasis invasoras)
Se han desarrollado y validado técnicas de PCR en tiempo Real en formato multiplex para el cribado de pacientes en riesgo de padecer estas infecciones, así como para el diagnóstico en pacientes con sospecha.
Detección de IFIs causadas por hongos emergentes (Escedosporiosis, Fusariosis etc...)
El aumento de especies raras o poco frecuentes causantes de IFI hizo necesario el desarrollo de técnicas para su detección
Detección “panfúngica”
Para aquellos casos en los que no exista evidencia clara del hongo causante de la infección se han desarrollado técnicas basadas en PCR en tiempo Real.
Mejora del diagnóstico y la identificación de los hongos causantes de micosis importadas (micosis endémicas)
Debido al aumento de la inmigración y los viajes a lugares exóticos en los últimos años se ha producido un incremento de las micosis importadas en España, en concreto de aquellas causadas por hongos endémicos de determinadas regiones, los cuales son además patógenos primarios. Este objetivo es relevante en el contexto de una región no-endémica ya que existe falta de experiencia en el manejo de estas infecciones y las técnicas diagnósticas disponibles son muy escasas. A lo largo de estos años se han desarrollado y validado distintas técnicas para el diagnóstico rápido de estas micosis y se han realizado diferentes trabajos encaminados a un mejor conocimiento de los hongos que las causan.
Las técnicas desarrolladas a lo largo de estos años se han incorporado a la Cartera de Servicios del Centro Nacional de Microbiología para ofrecerlas al Sistema Nacional de Salud. Además, algunas de ellas se han patentado.
Proyectos de investigación
Contenidos con Investigacion .
1. Nombre del proyecto: Mejora del pronóstico del paciente con riesgo de enfermedad fúngica invasora: estudio de susceptibilidad del huésped y desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico clínico. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2018 - 31/12/2020. Cuantía: 72.000 €. Investigadores principales (IP, Co-IP,...): María José Buitrago Serna/Laura Alcazar Fuoli
2. Nombre del proyecto: Red española de Investigación en Patologías infecciosas REIPI
Entidad/es financiadora/s: ISCIII-FEDER Fecha de inicio-fin: 01/01/2017 - 31/12/2021
Cuantía total: 195.612 €. Coordinador: Emilia Mellado
3. Nombre del proyecto: Desarrollo y validación de un método de detección de tipo “point of care”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2015 - 31/12/2017. Cuantía total: 46.000 €. Investigador principal: María José Buitrago.
4. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2(Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory). Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2016 - 01/06/2017. Cuantía total: 524.848 €. Cuantía subproyecto: 141.562 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.
5. Nombre del proyecto: Iberian network of laboratories of Biological Alert Acreditation of methods for detection of highly pathogenic agents/IB-BiOALERNET Entidad/es financiadora/s: DG-Home (Unión Europea). Fecha de inicio-fin: 2013 – 2015. Cuantía total: 629.382,67 €. Coordinador (IP): Carmen Cañavate
6. Nombre del proyecto: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad/es financiadora/s: ISCIII. Fecha de inicio-fin: 2012 – 2015. Cuantía total: 67.429,67 €. Investigador principal: María José Buitrago.
7. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2 (Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory. Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2010 - 31/12/2013. Cuantía total: 4.859.782,5 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.
8. Nombre del proyecto: RED iberoamericana de diagnóstico molecular de las infecciones endémicas y oportunistas. Entidad/es financiadora/s: CYTED-AECI. Fecha de inicio-fin: 2008 – 2009. Cuantía total: 70.000 €. Investigador principal: Luz-Elena Cano
9. Nombre del proyecto: “Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico en alertas biosanitarias relacionadas con la Micología”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 2007 – 2009. Cuantía total: 58.500 €. Investigador Principal: María José Buitrago
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Majumdar M, Sharif S, Klapsa D, Wilton T, Alam MM, Fernandez-Garcia MD, Rehman L, Mujtaba G, McAllister G, Harvala H, Templeton K, Mee ET, Asghar H, Ndiaye K, Minor PD, Martin J. Environmental Surveillance Reveals Complex Enterovirus Circulation Patterns in Human Populations. Open Forum Infect Dis. 2018 Oct 1;5(10):ofy250. doi: 10.1093/ofid/ofy250. PMID: 30377626; PMCID: PMC6201154.
Fernandez-Garcia MD, Majumdar M, Kebe O, Fall AD, Kone M, Kande M, Dabo M, Sylla MS, Sompare D, Howard W, Faye O, Martin J, Ndiaye K. Emergence of Vaccine-Derived Polioviruses during Ebola Virus Disease Outbreak, Guinea, 2014-2015.
Fernandez-Garcia MD, Majumdar M, Kebe O, Fall AD, Kone M, Kande M, Dabo M, Sylla MS, Sompare D, Howard W, Faye O, Martin J, Ndiaye K. Emergence of Vaccine-Derived Polioviruses during Ebola Virus Disease Outbreak, Guinea, 2014-2015. Emerg Infect Dis. 2018 Jan;24(1):65-74. doi: 10.3201/eid2401.171174. PMID:29260690; PMCID: PMC5749474.
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Tarragó, D.; Mateos, M.-L.; Avellón, A.; Pérez-Vázquez, M.-D.; Tenorio, A.2004. Quantitation of Cytomegalovirus DNA in Cerebrospinal Fluid and Serum Specimens from AIDS Patients Using a Novel Highly Sensitive Nested Competitive PCR and the Cobas Amplicor CMV Monitor™ Journal of Medical Virology. 72-2, pp.249-256. ISSN 01466615. 10. Tarragó, D.; Quereda, C.; Tenorio, A.2003. Different cytomegalovirus glycoprotein B genotype distribution in serum and cerebrospinal fluid specimens determined by a novel multiplex nested PCR Journal of Clinical Microbiology. 41-7, pp.2872-2877. ISSN 00951137.
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Fernandez-Garcia, Maria Dolores (AC); Kebe, Ousmane; Fall, Aichatou D.; Dia, Hamet; Diop, Ousmane M.; Delpeyroux, Francis; Ndiaye, Kader. (1/ 7). 2016. Enterovirus A71 Genogroups C and E in Children with Acute Flaccid Paralysis, West Africa EMERGING INFECTIOUS DISEASES. 22-4, pp.753-755. ISSN 1080-6040.
Molecular epidemiology of coxsackievirus B3 infection in Spain, 2004-2015.
K Calderón, M Díaz-de Cerio, C Muñoz-Almagro, N Rabella, I Martínez-Rienda, A Moreno-Docón, G Trallero, M Cabrerizo*. Molecular epidemiology of coxsackievirus B3 infection in Spain, 2004-2015. Arch Virol 161: 1365-1370 (2016).
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Development and Evaluation of a Serological Assay for the Diagnosis of Tuberculosis in Alpacas and Llamas. Infantes-Lorenzo, Jose A.; Whitehead, Claire E.; Moreno, Inmaculada; et ál..FRONTIERS IN VETERINARY SCIENCE Volumen: 5 Número de artículo: 189 Fecha de publicación: AUG 13 2018
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Influence of the Microenvironment in the Transcriptome of Leishmania infantum Promastigotes: Sand Fly versus Culture. Alcolea, Pedro J.; Alonso, Ana; Dominguez, Mercedes; et ál..PLOS NEGLECTED TROPICAL DISEASES Volumen: 10 Número: 5 Número de artículo: e0004693 Fecha de publicación: MAY 2016
PUBMED DOIFernandez-Garcia MD, Kebe O, Fall AD, Ndiaye K. Identification and molecular characterization of non-polio enteroviruses from children with acute flaccid paralysis in West Africa, 2013-2014.
Fernandez-Garcia MD, Kebe O, Fall AD, Ndiaye K. Identification and molecular characterization of non-polio enteroviruses from children with acute flaccid paralysis in West Africa, 2013-2014. Scientific Reports. 2017 Jun 19; 7(1):3808. doi: 10.1038/s41598-017-03835-1 ISSN 2045-2322 PMID 28630462
Fernandez-Garcia MD, Manasi Majumdar, Ousmane Kebe, Kader Ndiaye, Javier Martin. Identification and whole-genome characterization of a recombinant Enterovirus B69 isolated from a patient with Acute Flaccid Paralysis in Niger, 2015
Fernandez-Garcia MD, Manasi Majumdar, Ousmane Kebe, Kader Ndiaye, Javier Martin. Identification and whole-genome characterization of a recombinant Enterovirus B69 isolated from a patient with Acute Flaccid Paralysis in Niger, 2015. Scientific Reports. 2018 Feb; 8(1):2181. doi: 10.1038/s41598-018-20346-9. ISSN 2045-2322 PMID 29391547
Fernandez-Garcia MD, Majumdar M, Kebe O, Fall AD, Kone M, Kande M, Dabo M, Sylla MS, Sompare D, Howard W, Faye O, Martin J, Ndiaye K. Emergence of Vaccine- Derived Polioviruses during Ebola Virus Disease Outbreak, Guinea, 2014-2015.
Fernandez-Garcia MD, Majumdar M, Kebe O, Fall AD, Kone M, Kande M, Dabo M, Sylla MS, Sompare D, Howard W, Faye O, Martin J, Ndiaye K. Emergence of Vaccine- Derived Polioviruses during Ebola Virus Disease Outbreak, Guinea, 2014-2015. Emerg Infect Dis. 2018 Jan;24(1):65-74. doi: 10.3201/eid2401.171174. PMID: 29260690; PMCID: PMC5749474.
Cabrerizo M, García-Iñiguez JP, Munell F, Amado A, Madurga-Revilla P, Rodrigo C, Pérez S, Martínez-Sapiña A, Antón A, Suárez G, Rabella N, Del Campo V, Otero A, Masa-Calles J. First Cases of Severe Flaccid Paralysis Associated With Enterovirus D68 Infection in Spain, 2015-2016.
Cabrerizo M, García-Iñiguez JP, Munell F, Amado A, Madurga-Revilla P, Rodrigo C, Pérez S, Martínez-Sapiña A, Antón A, Suárez G, Rabella N, Del Campo V, Otero A, Masa-Calles J. First Cases of Severe Flaccid Paralysis Associated With Enterovirus D68 Infection in Spain, 2015-2016. Pediatr Infect Dis J. 2017 Dec;36(12):1214-1216. doi: 10.1097/INF.0000000000001668. PMID: 28661963.
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van Beek J, de Graaf M, Al-Hello H, Allen DJ, Ambert-Balay K, Botteldoorn N, Brytting M, Buesa J, Cabrerizo M, Chan M, Cloak F, Di Bartolo I, Guix S, Hewitt J, Iritani N, Jin M, Johne R, Lederer I, Mans J, Martella V, Maunula L, McAllister G, Niendorf S, Niesters HG, Podkolzin AT, Poljsak-Prijatelj M, Rasmussen LD, Reuter G, Tuite G, Kroneman A, Vennema H, Koopmans MPG; NoroNet. Molecular surveillance of norovirus, 2005-16: an epidemiological analysis of data collected from the NoroNet network. Lancet Infect Dis. 2018 May;18(5):545-553. doi: 10.1016/S1473-3099(18)30059-8. Epub 2018 Jan 26. PMID: 29396001.
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González-Serrano L, Muñoz-Algarra M, González-Sanz R, Portero-Azorín MF, Amaro MJ, Higueras P, Cabrerizo M. Viral gastroenteritis in hospitalized patients: Evaluation of immunochromatographic methods for rapid detection in stool samples. J Clin Virol. 2020 Jul; 128:104420. doi: 10.1016/j.jcv.2020.104420. Epub 2020 May 15. PMID: 32454428.
Bubba L, Broberg EK, Jasir A, Simmonds P, Harvala H; Enterovirus study collaborators. Circulation of non-polio enteroviruses in 24 EU and EEA countries between 2015 and 2017
Bubba L, Broberg EK, Jasir A, Simmonds P, Harvala H; Enterovirus study collaborators. Circulation of non-polio enteroviruses in 24 EU and EEA countries between 2015 and 2017: a retrospective surveillance study. Lancet Infect Dis. 2020 Mar;20(3):350-361. doi: 10.1016/S1473-3099(19)30566-3. Epub 2019 Dec 20. PMID: 31870905.
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Leticia Bernal Martínez
Contratada Indefinida
Código ORCID: 0000-0002-1694-5522
Leticia Bernal Martínez es contratada doctor indefinida del Instituto de Salud Carlos III y tiene más de quince años de experiencia en Micología molecular. Su investigación se ha centrado en el desarrollo de nuevas técnicas diagnósticas de infección fúngica invasora.
Listado de personal
Información adicional
COLABORACIONES RECIENTES
1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil
PATENTES
a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997
DIRECCION DE TESIS DOCTORALES
1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010
COLABORACIONES RECIENTES
1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil
PATENTES
a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997
DIRECCION DE TESIS DOCTORALES
1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010