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Investigación
Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora
Líneas de investigación
Contenidos con Investigacion .
El diagnóstico de la infección fúngica invasora (IFI) es complicado y con frecuencia se retrasa ya que en muchas ocasiones a la falta de sospecha clínica se le suma la falta de herramientas diagnósticas eficaces. Esta línea de investigación se inició en el año 2003, primero liderada por el Dr. Manuel Cuenca-Estrella y posteriormente por la Dra. María José Buitrago con el objetivo general de desarrollar nuevas herramientas, basadas en la PCR en tiempo Real, para un diagnóstico rápido de IFI. Los objetivos concretos que se han ido alcanzando a lo largo de estos años han sido los siguientes:
Detección precoz de hongos causantes de infecciones fúngicas oportunistas más frecuentes en pacientes inmunodeprimidos (Aspergilosis y Candidiasis invasoras)
Se han desarrollado y validado técnicas de PCR en tiempo Real en formato multiplex para el cribado de pacientes en riesgo de padecer estas infecciones, así como para el diagnóstico en pacientes con sospecha.
Detección de IFIs causadas por hongos emergentes (Escedosporiosis, Fusariosis etc...)
El aumento de especies raras o poco frecuentes causantes de IFI hizo necesario el desarrollo de técnicas para su detección
Detección “panfúngica”
Para aquellos casos en los que no exista evidencia clara del hongo causante de la infección se han desarrollado técnicas basadas en PCR en tiempo Real.
Mejora del diagnóstico y la identificación de los hongos causantes de micosis importadas (micosis endémicas)
Debido al aumento de la inmigración y los viajes a lugares exóticos en los últimos años se ha producido un incremento de las micosis importadas en España, en concreto de aquellas causadas por hongos endémicos de determinadas regiones, los cuales son además patógenos primarios. Este objetivo es relevante en el contexto de una región no-endémica ya que existe falta de experiencia en el manejo de estas infecciones y las técnicas diagnósticas disponibles son muy escasas. A lo largo de estos años se han desarrollado y validado distintas técnicas para el diagnóstico rápido de estas micosis y se han realizado diferentes trabajos encaminados a un mejor conocimiento de los hongos que las causan.
Las técnicas desarrolladas a lo largo de estos años se han incorporado a la Cartera de Servicios del Centro Nacional de Microbiología para ofrecerlas al Sistema Nacional de Salud. Además, algunas de ellas se han patentado.
Proyectos de investigación
Contenidos con Investigacion .
1. Nombre del proyecto: Mejora del pronóstico del paciente con riesgo de enfermedad fúngica invasora: estudio de susceptibilidad del huésped y desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico clínico. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2018 - 31/12/2020. Cuantía: 72.000 €. Investigadores principales (IP, Co-IP,...): María José Buitrago Serna/Laura Alcazar Fuoli
2. Nombre del proyecto: Red española de Investigación en Patologías infecciosas REIPI
Entidad/es financiadora/s: ISCIII-FEDER Fecha de inicio-fin: 01/01/2017 - 31/12/2021
Cuantía total: 195.612 €. Coordinador: Emilia Mellado
3. Nombre del proyecto: Desarrollo y validación de un método de detección de tipo “point of care”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 01/01/2015 - 31/12/2017. Cuantía total: 46.000 €. Investigador principal: María José Buitrago.
4. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2(Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory). Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2016 - 01/06/2017. Cuantía total: 524.848 €. Cuantía subproyecto: 141.562 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.
5. Nombre del proyecto: Iberian network of laboratories of Biological Alert Acreditation of methods for detection of highly pathogenic agents/IB-BiOALERNET Entidad/es financiadora/s: DG-Home (Unión Europea). Fecha de inicio-fin: 2013 – 2015. Cuantía total: 629.382,67 €. Coordinador (IP): Carmen Cañavate
6. Nombre del proyecto: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad/es financiadora/s: ISCIII. Fecha de inicio-fin: 2012 – 2015. Cuantía total: 67.429,67 €. Investigador principal: María José Buitrago.
7. Nombre del proyecto: European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents 2-ERINHA2 (Horizon2020). Nombre del programa: FP7-Infraestructuras-2015. Programa marco. THEME (INFRA-2010-2.2.8: High Security BLS4 Laboratory. Entidad financiadora: Unión Europea. Fecha de inicio-fin: 01/01/2010 - 31/12/2013. Cuantía total: 4.859.782,5 €. Coordinador (IP): Raoul Hervé.
8. Nombre del proyecto: RED iberoamericana de diagnóstico molecular de las infecciones endémicas y oportunistas. Entidad/es financiadora/s: CYTED-AECI. Fecha de inicio-fin: 2008 – 2009. Cuantía total: 70.000 €. Investigador principal: Luz-Elena Cano
9. Nombre del proyecto: “Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico en alertas biosanitarias relacionadas con la Micología”. Entidad/es financiadora/s: Instituto de Salud Carlos III. Fecha de inicio-fin: 2007 – 2009. Cuantía total: 58.500 €. Investigador Principal: María José Buitrago
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Grammatico JP, Cuevas L (Edits.) y Grupo de expertos de la Organización Panamericana de la Salud OPS/OMS. Curso de Gestión de Calidad y Buenas Prácticas de Laboratorio. Ed. 3. OPS/OMS;. Washington, D.C., 2016. Disponible en: “http://iris.paho.org/xmlui/handle/123456789/31168”. ISBN: 978-92-75-11906-8
Gestión de la Calidad para laboratorios de ensayo. 1ª ed.
Grammatico JP, Cuevas L (Edits.). Gestión de la Calidad para laboratorios de ensayo. 1ª ed. Conicet-Madri+d; Buenos Aires, 2011. Disponible en: “http://www.madrimasd.org/Laboratorios/Documentos/Red-Laboratorios/documentos/Gest_Calidad_Ensayo.pdf”. ISBN: 978-950-692-095-1
Curso de Gestión de Calidad y Buenas Prácticas de Laboratorio.
Grupo de expertos de la Organización Panamericana de la Salud OPS/OMS. Curso de Gestión de Calidad y Buenas Prácticas de Laboratorio. OPS; Documentos Técnicos THR/HT 2009/001. Washington, D.C., 2009. ISBN: 978-92-75-32977-1
Guía Latinoamericana para la implementación de Código de Ética en los laboratorios de salud.
Grupo de expertos de la Organización Panamericana de la Salud (OPS/OMS). Guía Latinoamericana para la implementación de Código de Ética en los laboratorios de salud. Organización Panamericana de la Salud. Documentos Técnicos. Políticas y Regulación. THS/EV-2007/001; 2007. ISBN: 92-7-532702-5
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Characterization of broadly neutralizing antibody responses to HIV-1 in a cohort of long term non-progressors. González N, McKee K, Lynch RM, Georgiev IS, Jimenez L, Grau E, Yuste E, Kwong PD, Mascola JR, Alcamí J. PLoS One. 2018;13:e0193773.
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Delgado E, Benito S, Montero V, Cuevas MT, Fernández-García A, Sánchez-Martínez M, García-Bodas E, Díez-Fuertes F, Gil H, Cañada J, Carrera C, Martínez-López J, Sintes M, Pérez-Álvarez L, Thomson MM; Spanish Group for the Study of New HIV Diagnoses. Diverse large HIV-1 non-subtype B clusters are spreading among men who have sex with men in Spain. Front Microbiol. 2019; 3;10:655.
PUBMED DOIImprovement of HIV-1 coreceptor tropism prediction by employing selected nucleotide positions of the env gene in a Bayesian network classifier.
Díez-Fuertes F, Delgado E, Vega Y, Fernández-García A, Cuevas MT, Pinilla M, García V, Pérez-Álvarez L, Thomson MM. Improvement of HIV-1 coreceptor tropism prediction by employing selected nucleotide positions of the env gene in a Bayesian network classifier. J Antimicrob Chemother. 2013; 68:1471-1485.
PUBMED DOIPredominance of CXCR4 tropism in HIV-1 CRF14_BG strains from newly diagnosed infections.
Pérez-Álvarez L, Delgado E, Vega Y, Montero V, Cuevas T, Fernández-García A, García-Riart B, Pérez-Castro S, Rodríguez-Real R, López-Álvarez MJ, Fernández-Rodríguez R, Lezaun MJ, Ordóñez P, Ramos C, Bereciartua E, Calleja S, Sánchez-García AM, Thomson MM. Predominance of CXCR4 tropism in HIV-1 CRF14_BG strains from newly diagnosed infections. J Antimicrob Chemother. 2014; 69:246-253.
PUBMED DOIMolecular epidemiology, phylogeny, and phylodynamics of CRF63_02A1, a recently originated HIV-1 circulating recombinant form spreading in Siberia.
Shcherbakova NS, Shalamova LA, Delgado E, Fernández-García A, Vega Y, Karpenko LI, Ilyichev AA, Sokolov YV, Shcherbakov DN, Pérez-Álvarez L, Thomson MM. Molecular epidemiology, phylogeny, and phylodynamics of CRF63_02A1, a recently originated HIV-1 circulating recombinant form spreading in Siberia. AIDS Res Hum Retroviruses. 2014; 30:912-919.
PUBMED DOIEpidemiological surveillance of HIV-1 transmitted drug resistance in Spain in 2004-2012: relevance of transmission clusters in the propagation of resistance mutations.
Vega Y, Delgado E, Fernández-García A, Cuevas MT, Thomson MM, Montero V, Sánchez M, Sánchez AM, Pérez-Álvarez L; Spanish Group for the Study of New HIV-1 Diagnoses in Galicia and Basque Country. Epidemiological surveillance of HIV-1 transmitted drug resistance in Spain in 2004-2012: relevance of transmission clusters in the propagation of resistance mutations. PLoS One. 2015; 10:e0125699.
PUBMED DOIPhylogeny and phylogeography of a recent HIV-1 subtype F outbreak among men who have sex with men in Spain deriving from a cluster with a wide geographic circulation in Western Europe.
Delgado E, Cuevas MT, Domínguez F, Vega Y, Cabello M, Fernández-García A, Pérez-Losada M, Castro MÁ, Montero V, Sánchez M, Mariño A, Álvarez H, Ordóñez P, Ocampo A, Miralles C, Pérez-Castro S, López-Álvarez MJ, Rodríguez R, Trigo M, Diz-Arén J, Hinojosa C, Bachiller P, Hernáez-Crespo S, Cisterna R, Garduño E, Pérez-Álvarez L, Thomson MM. Phylogeny and phylogeography of a recent HIV-1 subtype F outbreak among men who have sex with men in Spain deriving from a cluster with a wide geographic circulation in Western Europe. PLoS One. 2015; 10:e0143325.
PUBMED DOIContenidos con Investigacion .
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Leticia Bernal Martínez
Contratada Indefinida
Código ORCID: 0000-0002-1694-5522
Leticia Bernal Martínez es contratada doctor indefinida del Instituto de Salud Carlos III y tiene más de quince años de experiencia en Micología molecular. Su investigación se ha centrado en el desarrollo de nuevas técnicas diagnósticas de infección fúngica invasora.
Listado de personal
Información adicional
COLABORACIONES RECIENTES
1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil
PATENTES
a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997
DIRECCION DE TESIS DOCTORALES
1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010
COLABORACIONES RECIENTES
1. Dr. Marcus Teixeira. Visiting Professor at University of Brasília (UnB). Affiliated Researcher at Northern Arizona University (NAU)
2. Dr. Alexander Alanio. Researcher at the Hôpital St. Louis, Paris. Francia
3. Dra. Dunja Wilmes. Researcher at the Robert Koch Institut. Berlín. Alemania.
4. Dra. Paula Sampaio. Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA), Department of Biology, University of Minho, Braga, Portugal
5. Dra. Rosely Zancope-Oliveira. Professor at Fundación Oswaldo Cruz. Río de Janeiro, Brasil.
6. Dra. Ana Cecilia Mesa Arango. Profesor titular Universidad de Antioquia. Medellín. Colombia
7. Dr. Nestor Pakasa. Professor at University of Kinshasa Hospital, Kinshasa, Democratic Republic of the Congo
8. Dr. David Aka. Researcher at University Félix Houphouët-Boigny, Abiyán, Costa de Marfil
PATENTES
a) Título propiedad industrial registrada: “Desarrollo de un método rápido para el diagnóstico de histoplasmosis y/o paracoccidioidomicosis mediante PCR multiplex en Tiempo Real con iniciadores sondas de tipo Molecular Beacon”. Inventores: María José Buitrago Serna; Manuel Cuenca Estrella; Juan Luis RodriguezTudela; Alicia Gómez López. Entidad titular de derechos: Instituto de Salud Carlos III. Nº de solicitud: P200802665. País de inscripción: España. Fecha de registro: 19/09/2008. Fecha de concesión: 14/09/2011
b) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-synthese in Ashbya gossypii. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; María José Buitrago Serna; Maria de los Angeles Santos García. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: CA 2186403. Fecha de registro: 25/03/1994. Fecha de concesión: 24/01/2006
c) Título propiedad industrial registrada: Riboflavin-Synthese in Hefen. Inventores/autores/obtentores: Jose Luis Revuelta Doval; Jose Javier García Ramírez; Maria de Los Angeles Santos García; Gloria Angélica González; María José Buitrago Serna. Entidad titular de derechos: BASF Aktiengesellschaft. Nº de solicitud: EP19940901793. Fecha de registro: 19/11/199. Fecha de concesión: 07/05/1997
DIRECCION DE TESIS DOCTORALES
1. Título: Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico e identificación de especies fúngicas causantes de neumonías oportunistas. Entidad de realización: Universidad Complutense-ISCIII. Alumno/a: Clara Valero Fernández. Calificación obtenida: Sobresaliente Cum Laude. Fecha de defensa: 19/05/2017
2. Título: Desarrollo y Validación de técnicas de diagnóstico de infección fúngica invasora. Entidad de realización: Universidad Complutense de Madrid-ISCIII. Alumno/a: Sara Gago Prieto. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 18/07/2014
3. Título: Desarrollo de técnicas basadas en la PCR en tiempo real para el diagnóstico de las infecciones fúngicas invasoras. Entidad de realización: Universidad Complutense de
Madrid-ISCIII. Alumno/a: Leticia Bernal Martinez. Calificación obtenida: Sobresaliente cum laude. Fecha de defensa: 2010