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Investigación

Biología y Variabilidad del VIH

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Inmunobiología .

El grupo de Inmunobiología lleva años trabajando en las siguientes líneas de investigación:

1) Los mecanismos de generación de células hematopoyéticas a lo largo de la ontogenia y en la influencia que las primeras células hematopoyéticas ejercen sobre el sistema inmunitario, innato y adaptativo, presente en el individuo adulto. Hemos identificado y caracterizado una nueva población de linfocitos B denominados B1-Rel (B220lo), que producen altos niveles de anticuerpos naturales IgG/IgA. Intentamos entender su papel en la respuesta inmune en modelos animales de infección, analizando su impacto sobre las poblaciones celulares inmunitarias y sobre la producción de mediadores solubles (citoquinas e inmunoglobulinas). En relación con esta temática hemos evaluado la generación de los megacariocitos embrionarios (y sus nichos de diferenciación), su funcionalidad y de las plaquetas, y su influencia en el desarrollo hematopoyético. En cuanto a las poblaciones linfoides, hemos llevado a cabo una caracterización extensa por citometría de flujo y por la metodología de secuenciación de RNA de célula única (scRNAseq). Para la realización de estos estudios celómicos hemos diseñado de paneles complejos para su utilización en el análisis fenotípico multiparamétrico, y tecnologías ómicas de citometría de célula única y RNAseq sobre poblaciones celulares purificadas.

En paralelo, nos interesa entender las respuestas inmunitarias locales en infecciones respiratorias en momentos de especial susceptibilidad por fragilidad del sistema inmunitario (la infancia y la vejez), tanto en modelos animales de ratón, que permiten su manipulación, como en seres humanos. 

 

2) Modelos de ratón estudiados durante la vida neonatal, en los que evaluamos el efecto del tratamiento con antibióticos (AB) y abordamos el papel de receptores TLR en las poblaciones celulares inmunitarias de tipo innato, pseudoinnato y adaptativas. En estos modelos observamos que la administración de AB era capaz de modular las poblaciones linfoides B, así como su capacidad de secretar en cultivo citoquinas proinflamatorias y su diferenciación hasta células plasmáticas, con repertorios de inmunoglobulinas diferenciados. Además. Estos efectos eran mediados a través del receptor Toll-like-2 (TLR2).

3) Modelos de ratón con senescencia acelerada (SAMP8) y animales senescentes (mayores de 20 meses de edad) para trazar las poblaciones linfoides y mediadores solubles de la repuesta inmunitaria (inmunoglobulinas y citoquinas). En estos modelos se observa que las poblaciones B linfoides (B1Rel y linfocitos B de zona marginal) están alteradas, acompañándose de un aumento de IgG1 con gran restricción de sus repertorios VDJ.


4) Papel de la población B1Rel en modelos animales de infección local o sistémica. Analizamos la respuesta frente a Streptoccoccus pneumoniae (SPN) a nivel local en el pulmón y a nivel sistémico en el bazo, así como el papel de TLR4 en estas respuestas

5) En humanos estamos estudiando las respuestas inmunitarias en niños con primoinfección viral por virus respiratorio sincitial (VRS). En este caso estudiamos la respuesta inmunitaria que se produce localmente en la mucosa nasal (mediante el análisis de lavados nasales, LN) en una cohorte de niños infectados frente a controles sanos, estratificados por edad. Hemos encontrado que en estos LN se acumulan células linfomieloides en los pacientes con poblaciones diversas de linfocitos, así como citoquinas e inmunoglobulinas.

6) Análisis y caracterización de las vesículas extracelulares que se producen durante la infección respiratoria tanto en sobrenadantes de pulmón de los modelos de infección por SPN, como en los LN en el caso de los niños con infección por VRS.

7) En paralelo llevamos a cabo estudios de los reordenamientos genéticos de las inmunoglobulinas y su utilización en la generación de receptores quiméricos para su posible uso en inmunoterapia. 

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Viruses from a cluster of HIV-1 Elite controllers inherit viral characteristics associated with the clinical non-progressor phenotype

Casado C, Marrero-Hernández S, Márquez-Arce D, Pernas M, Marfil S, Borràs-Grañana F, Olivares I, Cabrera-Rodríguez R, Valera M-S, de Armas-Rillo L, Lemey P, Blanco J, Valenzuela-Fernández A, Lopez-Galíndez C. 2018. mBio 9:e02338-17.

PUBMED DOI

Permanent control of HIV-1 pathogenesis in exceptional elite controllers: a model of spontaneous cure

Casado C, Galvez C, Pernas M, Tarancon-Diez L, Rodriguez C, Sanchez-Merino V, Vera M, Olivares I, De Pablo-Bernal R, Merino-Mansilla A, Del Romero J, Lorenzo-Redondo R, Ruiz-Mateos E, Salgado M, Martinez-Picado J, Lopez-Galindez C. Sci Rep. 2020 Feb 5,10(1):1902

PUBMED DOI

High-Risk Sexual Practices Contribute to HIV-1 Double Infection Among Men Who Have Sex with Men in Madrid

Casado C, Pernas M, Rava M, Ayerdi O, Vera M, Alenda R, Jiménez P, Docando F, Olivares I, Zaballos A, Vicario JL, Rodríguez C, Del Romero J, Lopez-Galindez C. AIDS Res Hum Retroviruses. 2020 Nov, 36(11):896-904

PUBMED DOI

Identification of a Spanish HIV-1 Long Term Non-Progressor cluster infected with a low replicating virus

Concepción Casado, Maria Pernas, Virginia Sandonis, Tamara Alvaro-Cifuentes, Isabel Olivares, Rosa Fuentes, Lorena Martínez Prats, Eulalia Grau, Lidia Ruiz, Rafael Delgado, Carmen Rodríguez, Jorge del Romero, and Cecilio López-Galíndez. (2013). PLoS One. 8 (10):e77663.

PUBMED DOI

Evidence of Ongoing Replication in a Human Immunodeficiency Virus Type 1 Persistently Infected Cell Line

Isabel Olivares, Carmen Sánchez-Jiménez, Catarina Reis Vieira, Víctor Toledano, Mónica Gutiérrez-Rivas, and Cecilio López-Galíndez. Journal of General Virology. 94, 944-954.

PUBMED DOI

Immunoescape of HIV-1 in Env-EL9 CD8 + T cell response restricted by HLA-B*14:02 in a Non progressor who lost twenty-seven years of HIV-1 control

Moyano A, Blanch-Lombarte O, Tarancon-Diez L, Pedreño-Lopez N, Arenas M, Alvaro T, Casado C, Olivares I, Vera M, Rodriguez C, Del Romero J, López-Galíndez C, Ruiz-Mateos E, Prado JG, Pernas M. Retrovirology. 2022 Mar 26,19(1):6

PUBMED DOI

The Characteristics of the HIV-1 Env Glycoprotein Are Linked with Viral Pathogenesis

Pérez-Yanes S, Pernas M, Marfil S, Cabrera-Rodríguez R, Ortiz R, Urrea V, Rovirosa C, Estévez-Herrera J, Olivares I, Casado C, Lopez-Galindez C, Blanco J, Valenzuela-Fernández A. Front Microbiol. 2022 Mar 24, 3:763039.

PUBMED DOI

Analysis of HIV-1 “in vitro” evolution through 3D real fitness landscapes constructed by Self Organizing Maps.

Ramón Lorenzo‐Redondo, Soledad Delgado, Federico Morán, and Cecilio Lopez‐Galindez. Analysis of HIV-1 “in vitro” evolution through 3D real fitness landscapes constructed by Self Organizing Maps. (2014) PLoS One. 9(2): e88579.

PUBMED DOI

Influence of Mutation and Recombination on HIV-1 in vitro Fitness Recovery

Ramón Lorenzo-Redondo, Miguel Arenas, and Cecilio Lopez-Galindez. (2015) Mol Phylogenet Evol. Sep 7. pii: S1055-7903(15)00259-6

PUBMED DOI

Phenotypic and molecular characterization of IMP-producing Enterobacterales in Spain: Predominance of IMP-8 in Klebsiella pneumoniae and IMP-22 in Enterobacter roggenkampii.

5. Phenotypic and molecular characterization of IMP-producing Enterobacterales in Spain: Predominance of IMP-8 in Klebsiella pneumoniae and IMP-22 in Enterobacter roggenkampii. Autores: Cañada-García JE, Grippo N, de Arellano ER, Bautista V, Lara N, Navarro AM, Cabezas T, Martínez-Ramírez NM, García-Cobos S, Calvo J, Cercenado E, Aracil B, Pérez-Vázquez M, Oteo-Iglesias J; Spanish IMP Study Group. Revista: Front Microbiol. 2022 Sep 28;13:1000787.

DOI

HCV eradication with DAAs differently affects HIV males and females: A whole miRNA sequencing characterization

Valle-Millares D; Brochado-Kith O; Gómez-Sanz A; et al; Fernández-Rodríguez A (AC). (17/17). 2021. Biomedicine and Pharmacotherapy. Elsevier.

DOI

Antiretroviral Therapy with Ritonavir-Boosted Atazanavir- and Lopinavir-Containing Regimens Correlates with Diminished HIV-1 Neutralization.

Yuste E, Gil H, Garcia F, Sanchez-Merino V; Vaccines (Basel). 2024 Oct 17;12(10):1176.

PUBMED DOI

Toward the consensus of definitions for the phenomena of antifungal tolerance and persistence in filamentous fungi.

Amich J, Bromley M, Goldman GH, Valero C. mBio. 2025 Feb 25:e0347524

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Outbreak of invasive meningococcal disease caused by a meningococcus serogroup B expressing a rare porA genosubtype (19-54, 15), Spain, March to April 2024.

Abad R, Navarro C, García-Amil C, Montes M, Castañeda-García A, Cuadros JA, Galar A, Martin F, Mena E, Pérez de Madrid S, Román C, Soler M, Vázquez JA. Euro Surveill. 2025 Nov;30(44):2500222

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Distribution of DNA gyrase cleavage sites across the Streptococcus pneumoniae genome: relation to transcription and methylation at GATC sites

Ferrándiz MJ, Hernández P, de la Campa AG. Nucleic Acids Res. 2025; 53(21):gkaf1183.

PUBMED DOI

T-Cell-Specific Loss of the PI-3-Kinase p110α Catalytic Subunit Results in Enhanced Cytokine Production and Antitumor Response.

1. Aragoneses-Fenoll L, Ojeda G, Montes-Casado M, Acosta-Ampudia Y, Dianzani U, Portolés P, Rojo JM. T-Cell-Specific Loss of the PI-3-Kinase p110α Catalytic Subunit Results in Enhanced Cytokine Production and Antitumor Response. Front. Immunol. 2018 Feb 27;9:332.

PUBMED DOI

Essential in vitro diagnostics for advanced HIV and serious fungal diseases: international experts' consensus recommendations. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2019 Sep

Bongomin F, Govender NP, Chakrabarti A, Robert-Gangneux F, Boulware DR, Zafar A, Oladele RO, Richardson MD, Gangneux JP, Alastruey-Izquierdo A, Bazira J, Boyles TH, Sarcarlal J, Nacher M, Obayashi T, Worodria W, Pasqualotto AC, Meya DB, Cheng B, Sriruttan C, Muzoora C, Kambugu A, Rodriguez Tudela JL, Jordan A, Chiller TM, Denning DW. Essential in vitro diagnostics for advanced HIV and serious fungal diseases: international experts' consensus recommendations. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2019 Sep;38(9):1581-1584. doi: 10.1007/s10096-019-03600-4. PMID: 31175479.

PUBMED DOI

Pneumoviridae fusion proteins as immunogens to induce cross-neutralizing antibody responses

Olmedillas E, Cano O, Martinez I, Luque D, Terron MC, McLellan JS, et al. Chimeric Pneumoviridae fusion proteins as immunogens to induce cross-neutralizing antibody responses. EMBO Mol Med. 2018;10(2):175-87.

PUBMED DOI

High-Quality Draft Genome of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis.

8. Cuesta I; González LM; Estrada K; Grande R; Zaballos A; Lobo CA; Barrera J; Sanchez-Flores A; Montero E. 2014. High-Quality Draft Genome of Babesia divergens, the Etiological Agent of Cattle and Human Babesiosis. Genome Announcement. 2: e01194-14.

PUBMED DOI

Emergence of linezolid-resistant coagulase-negative staphylococci in an intensive care unit.

Emergence of linezolid-resistant coagulase-negative staphylococci in an intensive care unit. Balandin B, Lobo B, Orden B, Román F, García E, Martínez R, Valdivia M, Ortega A, Fernández I, Galdos P. Infect Dis (Lond). 2016;48(5):343-9.

PUBMED

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Información adicional

Las actividades de la UBVVIH incluyen investigación, servicio al Sistema Nacional de Salud (SNS) y a la administración de Justicia y docencia.

Sus principales líneas de investigación son la epidemiología molecular y la filogenia del VIH-1, en las que la UBVVIH ha realizado numerosas colaboraciones nacionales e internacionales, centradas en la identificación de formas genéticas virales y el estudio de sus correlaciones con variables epidemiológicas.

Líneas relacionadas son la filodinámica y la filogeografía, que estudian el origen y la dinámica de crecimiento y propagación de las variantes del VIH-1. Dichos estudios pueden servir para conocer mejor la evolución de la epidemia y planificar actuaciones de salud pública. La UBVVIH también produce y caracteriza aislados primarios y clones funcionales de la envuelta de diversas formas genéticas del VIH-1, depositados en repositorios y utilizados por numerosos grupos internacionales.

Otras líneas de investigación están descritas en el apartado correspondiente.

En cuanto al servicio al SNS, la UBVVIH realiza tests de resistencia a antirretrovirales y predicción del tropismo como guía terapéutica en pacientes infectados por el VIH-1.

En cuanto a su colaboración con la administración de Justicia, la UBVVIH realiza peritajes mediante estudios filogenéticos de secuencias para casos judiciales de posibles transmisiones del VIH.

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