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Laboratorio de Referencia e Investigación en Infecciones Bacterianas Inmunoprevenibles

Información general

El laboratorio de Referencia e Investigación en Infecciones Bacterianas Inmuno-Prevenibles está formado por varios grupos independientes que desarrollan actividades de referencia y/o investigación en bacterias patógenas prevenibles por vacunación como Streptococcus, Neisseria y Bordetella. Como parte de sus funciones de referencia da soporte al Sistema Nacional de Salud a través de diferentes programas de vigilancia microbiológica, diagnóstico molecular y evaluación de vacunas, proporcionando a su vez datos de laboratorio al Centro Europeo para el Control de Enfermedades (ECDC). Por otro lado, todos los grupos llevan a cabo actividades de investigación tanto básica como traslacional sobre estos patógenos y las enfermedades asociadas, destacando la caracterización de compuestos con actividad antimicrobiana, el estudio de la topología del DNA, resistencia antibiótica, vacunas, y factores de virulencia.


Además, el laboratorio mantienen una extensa actividad en redes y consorcios nacionales e internacionales coordinadas y/o financiadas por el ECDC, centros de investigación en red o sociedades científicas, y están implicados en actividades formativas participando como miembros del equipo docente en varios másteres de especialización y formando a personal investigador mediante la tutorización de alumnos en prácticas, la dirección de TFGs y TFMs y de tesis doctorales. ​​​​​​​

Investigación

Este Área de Infecciones Bacterianas Inmuno-Prevenibles está formado por los siguientes grupos/unidades:

Genética bacteriana

Mediante un análisis multidisciplinar que incluye genómica, transcriptómica, RNomica y proteómica, esta unidad investiga los mecanismos de resistencia a antibióticos en Streptococcus pneumoniae caracterizando las bases moleculares de su acción (levofloxacina, moxifloxacina y seconeolitsina), identificando nuevas dianas terapéuticas (proteínas y RNAs no codificantes implicados en la organización del cromosoma bacteriano) y estudiando terapias alternativas basadas en la tecnología CRISPR.

Neisserias, Listeria y Bordetella
Esta unidad da apoyo al Sistema Nacional de Salud con el objetivo de mejorar la salud y el bienestar de los ciudadanos, a través del desarrollo y aplicación de técnicas diagnósticas y de caracterización molecular, generando datos de laboratorio imprescindibles para la vigilancia de las enfermedades infecciosas cubiertas por la Unidad, así como manteniendo líneas de investigación para evaluación microbiológica e inmunológica de vacunas.
Neumococo
La Unidad de Neumococos se encarga de dos aspectos muy importantes relacionados con la enfermedad neumocócia invasiva, como son la vigilancia epidemiológica, caracterizando serotipos, genotipos y susceptibilidad antibiótica de los neumococos invasivos circulantes, y la investigación básica y traslacional de las enfermedades producidas por este patógeno, estudiando mecanismos moleculares de patogenicidad y protección relacionados con la infección neumocócica (factores de virulencia, proteínas candidatas a vacunas, impacto del humo de tabaco y la formación de biofilms en la colonización del tracto respiratorio).

Servicios

Actividades de Servicio de la Unidad de Neumococos

Responsable: José Yuste Lobo (jyuste@isciii.es)

La unidad de Neumococos da soporte al Sistema Nacional de Salud actuando como laboratorio de referencia para Streptococcus pneumoniae. En este sentido, se han implementado técnicas moleculares para su diagnóstico y caracterización, manteniendo activo el programa de vigilancia microbiológica de la enfermedad neumocócica invasiva (ENI).

La siguiente tabla resumen las actividades de servicio relacionadas con la caracterización de Streptococcus pneumoniae

Además, participa en programas de vigilancia epidemiológica, que pueden consultarse pulsando AQUÍ.
Actividades de Servicio de la Unidad de Neisseria, Listeria y Bordetella

Responsables:
- Julio Vázquez Moreno (jvazquez@isciii.es)
- Raquel Abad Torreblanca (rabad@isciii.es)

La Unidad de NeisseriaListeria y Bordetella da soporte al Sistema Nacional de Salud actuando como laboratorio de referencia para Neisseria meningitidisNeisseria gonorrhoeaeListeria monocytogenes y Bordetella pertussis. En este sentido, trabajamos en el desarrollo y la aplicación de técnicas moleculares para su diagnóstico y caracterización, manteniendo activos los programas de vigilancia microbiológica de enfermedad meningocócica invasiva (EMI), infección gonocócica (IG) y listeriosis.

Programas de vigilancia
El objetivo de estos programas es llevar a cabo la vigilancia microbiológica de EMI, IG y Listeriosis y en España, proporcionando datos de laboratorio tanto al Sistema Nacional de Vigilancia como al European Center for Diseases Control (ECDC).
La información generada a través de este programa permite llevar a cabo medidas de control y prevención frente a la enfermedad meningocócica invasiva (EMI) basadas en la evidencia, resultando clave a la hora de enfocar estrategias en el desarrollo y la aplicación de vacunas.
El programa incluye:
  • Diagnóstico y caracterización molecular en muestras clínicas en las que no ha sido posible llevar a cabo un aislamiento.
  • Caracterización de aislamientos clínicos de Neisseria meningitidis.
Para ver los detalles de este programa de vigilancia, pulse AQUÍ
Esta vigilancia reviste un especial interés en el aspecto concreto de la resistencia antimicrobiana, ya que N. gonorrhoeae ha desarrollado un elevado número de mecanismos de resistencia a antimicrobianos a medida que estos han sido incluidos en las correspondientes guías nacionales para su tratamiento.
El programa incluye la caracterización fenotípica y molecular de aislamientos clínicos de N. gonorrhoeae, así como pruebas de sensibilidad antimicrobiana.

Para ver los detalles de este programa de vigilancia, pulse AQUÍ
Este programa de vigilancia cobra especial relevancia a la hora de llevar a cabo la identificación y caracterización de brotes, permitiendo además dar respuesta a las diferentes alertas o consultas realizadas tanto a nivel nacional como internacional.
El programa incluye:
  • Diagnóstico molecular en muestras clínicas en las que no ha sido posible llevar a cabo un aislamiento, mediante PCR tiempo real basada en la utilización de sondas (diana: hly).
  • Caracterización molecular de aislamientos clínicos de L. monocytogenes, así como de aislamientos alimentarios y ambientales en el contexto de la investigación de un brote.
Para ver los detalles de este programa de vigilancia, pulse AQUÍ.
Otras actividades incluídas en la cartera de servicios
  • Diagnóstico molecular de Streptococcus pneumoniae en muestras clínicas en las que no ha sido posible llevar a cabo un aislamiento (PCR tiempo real basada en la utilización de sondas, diana: ply).
  • Diagnóstico molecular de Haemophilus influenzae en muestras clínicas en las que no ha sido posible llevar a cabo un aislamiento (PCR tiempo real basada en la utilización de sondas, diana: omp2). Identificación de la capsula en aquellos casos positivos (PCR tiempo real basada en la utilización de sondas, diana: bexA).
  • Diagnóstico molecular de Tos ferina en muestras clínicas en las que no ha sido posible llevar a cabo un aislamiento (PCR tiempo real basada en la utilización de sondas, dianas: IS481ptxP, IS1001, por, BhIS1001).
  • Caracterización fenotípica y molecular de aislamientos clínicos de Bordetella pertussis (serotipo, MLST, antígenos vacunales).
  • Diagnóstico de Chlamydia trachomatis (IFD).
  • Diagnóstico y caracterización molecular de Linfogranuloma Venéreo (PCR tiempo real basada en la utilización de sondas, dianas: omp1, pmpH). En el caso de obtenerse un genotipo L2 determinación de la variante mediante secuenciación.
  • Determinación de anticuerpos bactericidas frente a Neisseria meningitidis de serogrupo C (ensayo de actividad bactericida del suero usando como fuente de complemento exógeno complemento de conejo (rSBA)).
  • Identificación de Neisseria spp (pruebas bioquímicas y secuenciación del gen 16S rRNA).